ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RNF2

Query protein: RNF2
Cell class: Breast
Sort key: SRX396573 | Breast cells
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RNF2's Colocalization partners

◢ RNF2: Average

◣ SRX396573: Breast cells

◢ SRX19321943: MCF-7

◢ SRX19321944: MCF-7

◢ SRX19321945: MCF-7

◢ SRX19321946: MCF-7

◢ SRX19321947: MCF-7

◢ SRX19321948: MCF-7

◢ SRX19321949: MCF-7

◢ SRX19321950: MCF-7

◢ SRX3410378: MDA-MB-231

◢ SRX10775017: T-47D

◢ SRX10775020: T-47D

◢ SRX10775023: T-47D

◢ SRX10775027: T-47D

◢ SRX10775029: T-47D

◢ SRX10775041: T-47D

◢ SRX10775045: T-47D

◢ SRX10775049: T-47D

◢ SRX10775053: T-47D

◢ SRX10775057: T-47D

◢ SRX3410396: T-47D

◢ SRX6860622: T-47D

◢ SRX6860634: T-47D

◢ SRX6860639: T-47D

◢ SRX6860645: T-47D

◢ SRX6860650: T-47D

◢ SRX6860689: T-47D

◢ SRX6860694: T-47D

◢ SRX6896410: T-47D

◢ SRX6896411: T-47D

◢ RNF2: STRING

Breast cells
 SRX396573
RNF2
T-47D
 SRX1012617
PGR
T-47D
 SRX1012615
PGR
T-47D
 SRX1012607
EP300
Breast cells
 SRX396570
CBX8
Breast cells
 SRX396569
CBX7
MCF 10A
 SRX143300
SNAPC4
MCF-7
 SRX673732
PRKDC
MCF-7
 SRX457213
ESR1
BPE
 SRX155763
HSF1
Breast cells
 SRX396568
CBX6
MDA-MB-468
 SRX1757997
MAX
Breast cells
 SRX396572
RING1
MDA-MB-468
 SRX1757999
MYC
MDA-MB-468
 SRX1757998
MYC
MDA-MB-468
 SRX1757994
FOXR2
T-47D
 SRX19662640
SIN3A
MCF-7
 SRX1012693
PGR
MCF-7
 SRX10024474
ESR1
MCF 10A
 SRX4192136
XRCC4
MCF-7
 SRX730438
NCAPG
MCF-7
 SRX1012741
ESR1
MCF-7
 SRX1012740
ESR1
MCF 10A
 SRX4192132
XRCC4
MCF 10A
 SRX4192137
XRCC4
ZR-75-1
 SRX5128107
AR
T-47D
 SRX5683086
ESR1
MCF-7
 SRX10971499
ESR1
MCF-7
 SRX10971495
ESR1
MCF-7
 SRX950756
TOP2B
MCF-7
 SRX673739
ESR1
MCF-7
 SRX278609
NR5A2
HMLE
 SRX2662143
SMARCE1
Breast cancer cells
 SRX155766
HSF1
T-47D
 SRX1012616
PGR
MCF 10A
 SRX481566
BRCA1
MCF-7
 SRX3993991
TRIM24
ZR-75-1
 SRX176887
ESR1
ZR-75-1
 SRX176886
ESR1
MCF-7
 SRX1212811
MED12
MCF-7
 SRX1212810
CARM1
MDA-MB-453
 SRX1070165
PIAS1
MDA-MB-453
 SRX1070164
PIAS1
MCF-7
 SRX673731
PRKDC
MCF-7
 SRX3993992
TRIM24
MCF-7
 SRX1012652
PGR
MCF-7
 SRX3010234
EZH2
CAL-51
 SRX2900092
BAP1
MCF-7
 SRX730440
HECTD1
MCF 10A
 SRX2944447
MYC
BT-474
 SRX285745
HOXB7
MCF-7
 SRX278610
MED12
MCF-7
 SRX262138
HSF1
MDA-MB-231
 SRX246862
MBD3
MCF-7
 SRX185910
FOXM1
HMEC
 SRX155764
HSF1
MCF-7
 SRX155748
HSF1
MDA-MB-453
 SRX1339016
AR
MCF-7
 SRX457212
ESR1
MCF-7
 SRX022741
TDRD3
MDA-MB-468
 SRX1757995
FOXR2
MCF 10A
 SRX143299
SNAPC1
MDA-MB-453
 SRX1339015
AR
MCF-7
 SRX039141
JUN
MCF-7
 SRX039140
FOS
MCF-7
 SRX1772415
NEDD4
MCF-7
 SRX4786537
ESR1
T-47D
 SRX5251427
ESR1
T-47D
 SRX5251430
ESR1
T-47D
 SRX1161197
NR3C1
T-47D
 SRX4060992
TRPS1
Breast cancer
 SRX186801
ESR1
MCF-7
 SRX5089540
ARID2
MCF-7
 SRX3322137
KLF4
MCF-7
 SRX11120872
AFF4
MCF-7
 SRX11120869
CREBBP
Breast cancer
 SRX186818
ESR1
MCF-7
 SRX176873
GATA3
Breast cancer cells
 SRX155770
HSF1
T-47D
 SRX1012608
EP300
MCF-7-LTED
 SRX042342
ESR1
T-47D
 SRX5323901
STAT3
MCF-7
 SRX730445
EP300
MCF-7
 SRX1772418
NEDD4
ZR-75-1
 SRX9688332
ESR1
T-47D
 SRX4060991
TRPS1
MCF-7
 SRX3011703
MED12
CAL-51
 SRX2900097
BAP1
CAL-51
 SRX2900096
BAP1
MCF-7
 SRX4931257
KMT2A
MCF-7
 SRX4931256
KMT2A
MCF-7
 SRX950754
TOP2B
MDA-MB-231
 SRX5511308
ESR1
MCF-7
 SRX457215
ESR1
MCF-7
 SRX4451205
ESR1
MCF-7
 SRX3428655
ESR1
MDA-MB-231
 SRX3080248
BRD4
MDA-MB-231
 SRX3080247
BRD4
MDA-MB-231
 SRX3080243
BRD4
MDA-MB-231
 SRX3080240
BRD4
MDA-MB-231
 SRX3080239
BRD4
CAL-51
 SRX2880132
KMT2C
MCF-7
 SRX176872
GATA3
MCF-7
 SRX1733714
ESR1
T-47D
 SRX1709987
PGR
MCF-7
 SRX1012651
PGR
MCF-7
 SRX1012650
PGR
HCC1428-LTED
 SRX042343
ESR1
MCF-7
 SRX730425
ESR1
MCF-7
 SRX3322521
ELF1
MCF-7
 SRX3322322
E2F4
Breast cancer cell line
 SRX10142202
CTCF
MCF-7
 SRX7366775
KDM5C
MDA-MB-231
 SRX9739056
NKRF
Breast cancer cells
 SRX899076
TP53
MCF-7
 SRX747776
ESR1
MCF-7
 SRX730435
NCAPG2
Breast cancer cells
 SRX7101366
TEAD1
Breast cancer cells
 SRX7101365
TEAD1
T-47D
 SRX5323897
STAT3
T-47D
 SRX5251424
ESR1
MCF-7
 SRX5251418
ESR1
MCF-7
 SRX5251414
ESR1
MCF-7
 SRX4786571
TET2
MCF-7
 SRX4786547
TET2
MCF-7
 SRX4786546
TET2
MCF-7
 SRX1772416
NEDD4
Mammary epithelial cells
 SRX14812502
TP53
MDA-MB-231
 SRX1143685
TP63
MCF 10A
 SRX155727
HSF1
MCF-7
 SRX8202281
CDK7
MCF-7
 SRX396819
ESR1
MCF-7
 SRX1497516
TRIM28
T-47D
 SRX6896411
RNF2
MCF-7
 SRX039142
JUN
T-47D
 SRX16341658
KDM1A
MCF 10A
 SRX7130718
TP53
MCF 10A
 SRX12008361
CTCF
T-47D
 SRX10775041
RNF2
MCF 10A
 SRX15929739
STAG2
T-47D
 SRX6860634
RNF2
T-47D
 SRX10775049
RNF2
T-47D
 SRX10775045
RNF2
T-47D
 SRX10775020
RNF2
T-47D
 SRX6860628
ESR1
T-47D
 SRX14612993
ESR1
T-47D
 SRX10775053
RNF2
MCF 10A
 SRX7130731
TP53
T-47D
 SRX10775018
ESR1
T-47D
 SRX6860639
RNF2
T-47D
 SRX6860622
RNF2
MCF 10A
 SRX15929735
STAG1
T-47D
 SRX6860650
RNF2
T-47D
 SRX6860645
RNF2
T-47D
 SRX6860652
ESR1
T-47D
 SRX14613009
JUN
T-47D
 SRX10775029
RNF2
MCF-7
 SRX4417026
TFAP2C
T-47D
 SRX6860694
RNF2
CAMA-1
 SRX8083086
FGFR1
T-47D
 SRX6860624
ESR1
MDA-MB-231
 SRX2425860
SMAD3
T-47D
 SRX15391846
ESR1
BT-549
 SRX10859418
SS18
MCF-7
 SRX8716243
AGO1
CAMA-1
 SRX8617942
FGFR1
CAMA-1
 SRX8617941
FGFR1
T-47D
 SRX6860647
ESR1
T-47D
 SRX6860641
ESR1
T-47D
 SRX6058764
RAD21
MCF-7
 SRX3025913
TP53
MCF 10A
 SRX15929730
STAG2
T-47D
 SRX14612962
JUN
BT-549
 SRX10859403
ARID2
MCF-7
 SRX8716242
AGO1
MDA-MB-231
 SRX2425863
SMAD1
MCF-7
 SRX8716245
AGO1
SUM 149PT
 SRX5574444
EN1
MDA-MB-231
 SRX2425861
SMAD1
MCF 10A
 SRX17834042
TP63
T-47D
 SRX16341657
KDM1A
T-47D
 SRX16341656
KDM1A
T-47D
 SRX15391845
ESR1
T-47D
 SRX14613002
SMARCC1
T-47D
 SRX14613001
SMARCC1
T-47D
 SRX14612999
RCOR1
T-47D
 SRX14612998
JUN
T-47D
 SRX14612997
JUN
T-47D
 SRX14612978
SMARCC1
T-47D
 SRX10775015
ESR1
T-47D
 SRX10306471
RCOR1
T-47D
 SRX10306462
KDM1A
T-47D
 SRX6860689
RNF2
CAMA-1
 SRX8617944
FGFR1
MCF 10A
 SRX8023128
TP53
MCF-7
 SRX6712594
MED26
SUM 159PT
 SRX5824557
BRD7
SUM 159PT
 SRX5824556
BRD7
SUM 149PT
 SRX4815190
CTNNB1
BT-549
 SRX10859401
ARID1A
MCF 10A
 SRX4896695
RUNX1
MCF 10A
 SRX4649667
TP53
T-47D
 SRX14612980
JUN
MCF-7
 SRX12813812
HEXIM1
MCF-7
 SRX13327995
CBX3
MCF 10A
 SRX4896696
RUNX1
T-47D
 SRX6860696
ESR1
MCF-7
 SRX4417025
GATA3
T-47D
 SRX10775057
RNF2
T-47D
 SRX10775027
RNF2
T-47D
 SRX10775023
RNF2
T-47D
 SRX10775017
RNF2
CAMA-1
 SRX8617945
FGFR1
CAMA-1
 SRX8083105
FGFR1
CAMA-1
 SRX8083102
FGFR1
CAMA-1
 SRX8083101
FGFR1
MCF 10A
 SRX8023122
TP53
T-47D
 SRX6058769
TOP2A
T-47D
 SRX6058765
RAD21
SUM 149PT
 SRX4815185
EN1
T-47D
 SRX14613015
JUN
BT-549
 SRX10859417
SS18
T-47D
 SRX6058766
RAD21
MCF-7
 SRX12813814
TRIM28
MCF 10A
 SRX8023134
TP53
MDA-MB-231
 SRX7865938
EN1
Breast cancer cells
 SRX7262856
AR
T-47D
 SRX6860691
ESR1
T-47D
 SRX6058768
TOP2A
T-47D
 SRX6058759
PGR
SUM 149PT
 SRX4815189
CTNNB1
MCF-7
 SRX3025917
TP53
T-47D
 SRX14613000
KDM1A
T-47D
 SRX1131572
BRD4
CAMA-1
 SRX8083104
FGFR1
HCC3153
 SRX4096871
GATAD2B
MCF-7
 SRX3285558
ESR1
Breast cancer cells
 SRX2897231
ESR1
T-47D
 SRX4714480
GTF3C2
SUM 159PT
 SRX4671310
RXRA
MCF-7
 SRX2007817
KMT2A
MCF 10A
 SRX8023111
TP53
MDA-MB-231
 SRX7865930
BRD4
Breast organoids
 SRX4017881
TP63
MDA-MB-231
 SRX3583255
HIF1A
Breast cancer
 SRX3229137
ESR1
Breast cancer cells
 SRX2897207
ESR1
MCF-7
 SRX2881008
ESR1
MCF-7
 SRX9045668
ESR1
T-47D
 SRX6639037
GTF3C2
HCC3153
 SRX4096872
GATAD2B
HCC3153
 SRX4096868
GATAD2B
HCC3153
 SRX4096867
GATAD2B
HCC3153
 SRX4096863
GATAD2A
MDA-MB-231
 SRX2578916
EP300
SUM 159PT
 SRX2194240
EP300
T-47D
 SRX14612977
SMARCC1
T-47D
 SRX14612963
JUN
MCF-7
 SRX11473186
TBX2
MDA-MB-231
 SRX2425862
SMAD3
MDA-MB-231
 SRX2578918
EP300
T-47D
 SRX10306474
JUN
SUM 159PT
 SRX5574445
EN1
MCF-7
 SRX2512920
FOXA1
MCF-7
 SRX13327975
CBX3
MCF-7
 SRX7030914
CBX5
MCF-7
 SRX7030879
CBX5
MCF-7
 SRX7030878
CBX5
MDA-MB-231
 SRX7865941
EN1
T-47D
 SRX6639038
GTF3C2
T-47D
 SRX6058761
PGR
SUM 159PT
 SRX5824554
BRD7
SUM 159PT
 SRX4815186
EN1
MB 157
 SRX4374899
NOTCH1
MCF-7
 SRX3025914
TP53
MCF-7
 SRX2881006
ESR1
MDA-MB-231
 SRX2578914
EP300
SUM 159PT
 SRX14091666
MYC
CAL-120
 SRX11650838
SMARCA4
T-47D
 SRX6860636
ESR1
T-47D
 SRX6058758
CEBPA
SUM 159PT
 SRX4671311
RXRA
MCF-7
 SRX13327976
CBX3
ZR-75-1
 SRX9688339
SP1
MDA-MB-231
 SRX7865931
BRD4
T-47D
 SRX7624160
NR2F2
MCF-7
 SRX6712589
MED1
SUM 159PT
 SRX5824555
BRD7
MCF-7
 SRX4417027
TFAP2C
Breast organoids
 SRX4017885
TP63
Breast organoids
 SRX4017880
TP63
MCF-7
 SRX3025916
TP53
MDA-MB-231
 SRX2578920
EP300
MCF 10A
 SRX17834043
TP63
CAL-120
 SRX11650842
SMARCA4
MCF-7
 SRX8716244
AGO1
MCF 10A
 SRX5089786
SATB1
MCF-7
 SRX11473188
TBX2
T-47D
 SRX10306465
KDM1A
MCF-7
 SRX6858247
HSF1
MCF 10A
 SRX4017887
TP63
Breast organoids
 SRX4017882
TP63
MCF-7
 SRX7030916
TRIM28
Breast organoids
 SRX4017883
TP63
MDA-MB-231
 SRX3583256
HIF1A
CAL-120
 SRX11650843
SMARCA4
SUM 1315M02
 SRX1131556
BRD4
MCF-7
 SRX7846776
ESR1
MDA-MB-231
 SRX3092922
EP300
MCF-7
 SRX14875685
ESR1
MCF-7
 SRX14875682
SET
MCF 10A
 SRX8023112
TP53
T-47D
 SRX14612984
JUN
T-47D
 SRX6058770
TOP2A
MCF 10A
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MEN1
T-47D
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JUN
T-47D
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JUN
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MCF-7
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T-47D
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T-47D
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T-47D
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T-47D
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Breast cancer cells
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SUM 159PT
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SUM 149PT
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T-47D
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T-47D
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JUN
SUM 159PT
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RARA
BT-549
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MCF-7
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BT-549
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SMARCE1
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FGFR1
MCF-7
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TRIM28
MDA-MB-231
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RAC1
ZR-75-1
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MDA-MB-231
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T-47D
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MEN1
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T-47D
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T-47D
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HCC3153
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Breast epithelium
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JUN
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TOP2B
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T-47D
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Breast cancer
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SUM 159PT
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Breast cancer
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T-47D
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MCF-7
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T-47D
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Breast cancer cells
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Breast cancer cells
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Breast cancer cells
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Breast cancer
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Breast cancer cells
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T-47D
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T-47D
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T-47D
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T-47D
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T-47D
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Breast cancer cells
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DNMT3B
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RELA
CAL-120
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T-47D
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T-47D
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T-47D
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Breast cancer cells
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AR
Breast cancer
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T-47D
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T-47D
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GATA3
MCF-7
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T-47D
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SMARCA4
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MCF-7
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T-47D
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T-47D
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T-47D
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POU2F1
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HMEC
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T-47D
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MCF-7
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MCF-7
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EP300
MCF-7
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T-47D
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PGR
T-47D
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NR3C1
T-47D
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YAP1
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SMARCA4
ZR-75-1
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SMARCB1
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SMARCB1
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SMARCB1
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SMARCB1
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NAMEC8
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NAMEC8
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BT-549
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T-47D
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Hs 578T
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XBP1
T-47D
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XBP1
MDA-MB-231
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XBP1
MCF 10A
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STAG1
MCF 10A
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STAG1
T-47D
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Breast cancer
 SRX3229128
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RBPJ
MCF 10A
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RAD51
SUM 159PT
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MCF-7
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TP53
Breast cancer
 SRX186798
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MDA-MB-231
 SRX1528428
USP7
MDA-MB-231
 SRX1489434
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MCF-7
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MCF-7
 SRX14875683
ESR1
T-47D
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T-47D
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MCF-7
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MCF-7
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T-47D
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MDA-MB-231
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RELA
MCF-7
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MCF-7
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MDA-MB-231
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Breast cancer cell line
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CTCF
T-47D
 SRX1012716
PGR
T-47D
 SRX1012715
PGR
MCF-7
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ESR1
T-47D
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ESR1
T-47D
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ESR1
MCF-7
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TOP2B
MCF-7
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MCF-7
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MED1
T-47D
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T-47D
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T-47D
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MCF-7
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T-47D
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PGR
T-47D
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T-47D
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T-47D
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Mammary epithelial cells
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KMT2A
Breast epithelium
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KMT2A
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EHMT2
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RUVBL2
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HCC3153
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T-47D
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MAX
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MAX
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HDAC2
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CHD8
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CHD8
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CDC16
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CDC16
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CDC16
T-47D
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T-47D
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TAF1
MCF-7
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TAF1
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TAF1
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Mammary epithelial cells
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CHD8
Mammary epithelial cells
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CHD8
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CHD8
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Mammary epithelial cells
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CHD8
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C17orf49
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MCF-7
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ANAPC1
MCF-7
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ANAPC1
MCF-7
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HCFC1
MCF-7
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HCFC1
CAL-51
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ASXL1
CAL-51
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ASXL1
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YY1
MB 157
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YY1
MB 157
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YY1
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YY1
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YY1
MB 157
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YY1
MCF-7
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JARID2
MCF-7
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JARID2
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JARID2
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JARID2
MCF-7
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MTF2
MCF-7
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MTF2
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MTF2
MCF-7
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MTF2
MCF-7
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KDM5C
ZR-75-30
 SRX1521315
KDM5C
ZR-75-30
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KDM5C
ZR-75-30
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KDM5C
ZR-75-30
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KDM5C
MCF-7
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CDYL2
MCF-7
 SRX8321653
CDYL2
MCF 10A
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CBX5
MCF-7
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CBX5
C70R
 SRX3285614
KDM5B
C70R
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KDM5B
MCF-7
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KDM5B
MCF-7
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KDM5B
FULR
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KDM5B
FULR
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KDM5B
FULR
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KDM5B
FULR
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KDM5B
TAMR
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KDM5B
TAMR
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KDM5B
MCF-7
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KDM5B
MCF-7
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KDM5B
FULR
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KDM5B
FULR
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KDM5B
C70R
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KDM5B
C70R
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KDM5B
TAMR
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KDM5B
MCF-7
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KDM5B
MCF-7
 SRX3285582
KDM5B
MCF-7
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KDM5B
MCF-7
 SRX3285578
KDM5B
FULR
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KDM5B
C70R
 SRX3285565
KDM5B
C49R
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KDM5B
MCF-7
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KDM5B
HCC2157
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KDM5B
MDA-MB-231
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SUM 159PT
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KDM5B
SUM 185PE
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SUM 185PE
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KDM5B
T-47D
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KDM5B
MCF-7
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KDM5B
MCF-7
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KDM5B
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HMGN2
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HMGN2
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HDAC6
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HDAC6
MCF-7
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HDAC6
MCF-7
 SRX9932072
HDAC6
MCF-7
 SRX9932071
HDAC6