ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for HMGA2

Query protein: HMGA2
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX11163461 | A549
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

Download: TSV (text)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
HMGA2's Target genes

◢ HMGA2: Average

◢ SRX11163460: A549

◣ SRX11163461: A549

◢ SRX13009119: iPS cells

◢ SRX13009120: iPS cells

◢ SRX10880532: MKN-45

◢ SRX10880533: MKN-45

◢ HMGA2: STRING
WDR74 ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
C12orf57 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
NPAS4 ↻ ≫
RPS9 ↻ ≫
DNAJB4 ↻ ≫
POLG2 ↻ ≫
ALDH3B1 ↻ ≫
ZC3H10 ↻ ≫
SETD5 ↻ ≫
POLDIP3 ↻ ≫
SCRIB ↻ ≫
CD68 ↻ ≫
FLOT1 ↻ ≫
SNAPC5 ↻ ≫
TRMT12 ↻ ≫
TTI2 ↻ ≫
OPLAH ↻ ≫
ZBTB4 ↻ ≫
POLR2A ↻ ≫
THOC6 ↻ ≫
HCFC1R1 ↻ ≫
SCAF1 ↻ ≫
RRAS ↻ ≫
USP17L5 ↻ ≫
USP17L30 ↻ ≫
USP17L29 ↻ ≫
USP17L28 ↻ ≫
USP17L27 ↻ ≫
USP17L26 ↻ ≫
USP17L25 ↻ ≫
USP17L24 ↻ ≫
P4HB ↻ ≫
PRKAG1 ↻ ≫
H4C5 ↻ ≫
ZNF574 ↻ ≫
VPS29 ↻ ≫
RAD9B ↻ ≫
IQSEC3 ↻ ≫
CAND1 ↻ ≫
DYRK1B ↻ ≫
POLD1 ↻ ≫
CCDC80 ↻ ≫
H2BC5 ↻ ≫
SECISBP2 ↻ ≫
NAT10 ↻ ≫
FAM83E ↻ ≫
ZDHHC4 ↻ ≫
HEXIM1 ↻ ≫
CHMP2A ↻ ≫
CCDC97 ↻ ≫
PLEKHG2 ↻ ≫
WRAP53 ↻ ≫
TP53 ↻ ≫
CHMP3 ↻ ≫
SUMO2 ↻ ≫
PDE4A ↻ ≫
H1-2 ↻ ≫
TLCD2 ↻ ≫
CYB561 ↻ ≫
SLC25A10 ↻ ≫
TMED1 ↻ ≫
ARNTL ↻ ≫
PPIA ↻ ≫
TAF1D ↻ ≫
C11orf54 ↻ ≫
PARP2 ↻ ≫
ABCA3 ↻ ≫
DDX42 ↻ ≫
CCDC47 ↻ ≫
ZCWPW1 ↻ ≫
MEPCE ↻ ≫
SEC24C ↻ ≫
ATXN7L3B ↻ ≫
HIRIP3 ↻ ≫
SPTY2D1 ↻ ≫
ITPKC ↻ ≫
COQ8B ↻ ≫
ZNF34 ↻ ≫
NR4A1 ↻ ≫
H3C13 ↻ ≫
H2BC18 ↻ ≫
TELO2 ↻ ≫
POLR3E ↻ ≫
PGP ↻ ≫
RAB11A ↻ ≫
CDK5RAP2 ↻ ≫
LEKR1 ↻ ≫
PIP4K2B ↻ ≫
EGLN2 ↻ ≫
NOP53 ↻ ≫
SBNO1 ↻ ≫
ZWILCH ↻ ≫
ZBTB45 ↻ ≫
RPL4 ↻ ≫
PMS2 ↻ ≫
AIMP2 ↻ ≫
SCAMP3 ↻ ≫
TXNRD1 ↻ ≫
PRAF2 ↻ ≫
C1orf74 ↻ ≫
SPAG9 ↻ ≫
B3GALT4 ↻ ≫
TBCB ↻ ≫
POLR2I ↻ ≫
KAT5 ↻ ≫
H2BC4 ↻ ≫
H2AC6 ↻ ≫
YWHAZ ↻ ≫
MCRIP1 ↻ ≫
H2BC12 ↻ ≫
H2AC12 ↻ ≫
PPP6R1 ↻ ≫
USP3 ↻ ≫
TRIP4 ↻ ≫
NFE2L1 ↻ ≫
TARBP2 ↻ ≫
NDUFB3 ↻ ≫
FAM126B ↻ ≫
SNRPB2 ↻ ≫
FLCN ↻ ≫
TOMM40 ↻ ≫
RAD23A ↻ ≫
GSE1 ↻ ≫
MFSD3 ↻ ≫
WIPF2 ↻ ≫
SRRT ↻ ≫
NARF ↻ ≫
CWC25 ↻ ≫
ZNF565 ↻ ≫
ZNF146 ↻ ≫
NAA38 ↻ ≫
CYB5D1 ↻ ≫
ERCC1 ↻ ≫
H4C2 ↻ ≫
ETV6 ↻ ≫
H4-16 ↻ ≫
KPTN ↻ ≫
CIC ↻ ≫
H2BC11 ↻ ≫
H2AC11 ↻ ≫
EPN1 ↻ ≫
CTU1 ↻ ≫
TIMELESS ↻ ≫
H3C15 ↻ ≫
H3C14 ↻ ≫
H2AC19 ↻ ≫
H2AC18 ↻ ≫
CSKMT ↻ ≫
C11orf98 ↻ ≫
TAGLN2 ↻ ≫
TACO1 ↻ ≫
SSBP1 ↻ ≫
EIF4A1 ↻ ≫
CDK12 ↻ ≫
NR1H2 ↻ ≫
CSRNP2 ↻ ≫
HES4 ↻ ≫
FIBP ↻ ≫
SUPV3L1 ↻ ≫
YJU2 ↻ ≫
AKT2 ↻ ≫
SFT2D2 ↻ ≫
TBC1D15 ↻ ≫
MYBBP1A ↻ ≫
CDC23 ↻ ≫
INAFM1 ↻ ≫
MRPS35 ↻ ≫
PSMD9 ↻ ≫
HPD ↻ ≫
TRIM37 ↻ ≫
DMAC2 ↻ ≫
DDAH2 ↻ ≫
TSPAN31 ↻ ≫
ADNP ↻ ≫
KRBA2 ↻ ≫
SMG9 ↻ ≫
SYNRG ↻ ≫
COPS4 ↻ ≫
POLR2M ↻ ≫
GPR19 ↻ ≫
TLCD1 ↻ ≫
TTC31 ↻ ≫
CCDC142 ↻ ≫
SEC23B ↻ ≫
RNASEH1 ↻ ≫
ZNF7 ↻ ≫
UBE2S ↻ ≫
SYVN1 ↻ ≫
DSTN ↻ ≫
BFSP1 ↻ ≫
BBS1 ↻ ≫
FUT11 ↻ ≫
C18orf32 ↻ ≫
FBRS ↻ ≫
FAM131A ↻ ≫
MSH4 ↻ ≫
CENPA ↻ ≫
B3GAT3 ↻ ≫
ANKRD40 ↻ ≫
GSTP1 ↻ ≫
TTLL10 ↻ ≫
IL15RA ↻ ≫
RGS12 ↻ ≫
RPS29 ↻ ≫
GSTA4 ↻ ≫
FAM90A1 ↻ ≫
PARVB ↻ ≫
HBB ↻ ≫
NLRP12 ↻ ≫
SYT17 ↻ ≫
SEMA3B ↻ ≫
C8B ↻ ≫
C12orf73 ↻ ≫
CXXC1 ↻ ≫
DGKB ↻ ≫
HBA1 ↻ ≫
TYW1 ↻ ≫
SBDS ↻ ≫
HBA2 ↻ ≫
DTD2 ↻ ≫
TMED10 ↻ ≫
DDX19A ↻ ≫
MYBPC3 ↻ ≫
FKBP7 ↻ ≫
ELP6 ↻ ≫
CRYGD ↻ ≫
CDK1 ↻ ≫
GOLGA8O ↻ ≫
CPN2 ↻ ≫
LDLR ↻ ≫
GOLGA8R ↻ ≫
PABPC1 ↻ ≫
POGLUT3 ↻ ≫
MTO1 ↻ ≫
NFILZ ↻ ≫
POT1 ↻ ≫
ANGPTL6 ↻ ≫
ASIP ↻ ≫
MS4A14 ↻ ≫
SPECC1L ↻ ≫
BORCS7 ↻ ≫
MEF2C ↻ ≫
GOLGA8M ↻ ≫
PTCRA ↻ ≫
ARHGAP24 ↻ ≫
GPR22 ↻ ≫
KRT6C ↻ ≫
IFNA21 ↻ ≫
PLA2G4C ↻ ≫
GOLGA8Q ↻ ≫
PDS5A ↻ ≫
GARS1 ↻ ≫
NDUFB4 ↻ ≫
GOLGA8K ↻ ≫
P4HTM ↻ ≫
DOLPP1 ↻ ≫
MRPL54 ↻ ≫
APBA3 ↻ ≫
ARMH4 ↻ ≫
IRAK1BP1 ↻ ≫
CRYZL1 ↻ ≫
GOLGA8H ↻ ≫
MAS1L ↻ ≫
RGS7 ↻ ≫
OR4F17 ↻ ≫
CD70 ↻ ≫
SPATA31A3 ↻ ≫
LAIR2 ↻ ≫
GTF2H5 ↻ ≫
ITGA10 ↻ ≫
SLC39A14 ↻ ≫
RBM42 ↻ ≫
PRRX2 ↻ ≫
BSDC1 ↻ ≫
ADD3 ↻ ≫
OSTC ↻ ≫
CEP97 ↻ ≫
RMI2 ↻ ≫
NF2 ↻ ≫
RBBP8 ↻ ≫
RRAD ↻ ≫
SPATA31A7 ↻ ≫
SPATA31A5 ↻ ≫
ANXA2R ↻ ≫
GOLGA8T ↻ ≫
CFAP298-TCP10L ↻ ≫
CFAP298 ↻ ≫
PVR ↻ ≫
ZNF317 ↻ ≫
GSR ↻ ≫
UGT2A1 ↻ ≫
MPND ↻ ≫
ILDR1 ↻ ≫
HNRNPH1 ↻ ≫
GOLGA8J ↻ ≫
AANAT ↻ ≫
TRMO ↻ ≫
GYPA ↻ ≫
RRAGB ↻ ≫
ZNF124 ↻ ≫
PNP ↻ ≫
CXCL11 ↻ ≫
SEMA6B ↻ ≫
PABPC3 ↻ ≫
LMNA ↻ ≫
KLHL36 ↻ ≫
TRPM8 ↻ ≫
IFNA14 ↻ ≫
OR7D2 ↻ ≫
HLA-E ↻ ≫
MED21 ↻ ≫
SAV1 ↻ ≫
HTR3A ↻ ≫
NAALADL2 ↻ ≫
CNTROB ↻ ≫
C2orf74 ↻ ≫
TYW1B ↻ ≫
ZNF430 ↻ ≫
H1-4 ↻ ≫
CCDC74B ↻ ≫
PPP6R3 ↻ ≫
USP14 ↻ ≫
NUDT11 ↻ ≫
GYPB ↻ ≫
CFAP251 ↻ ≫
BRD2 ↻ ≫
B3GNT6 ↻ ≫
FAM106A ↻ ≫
KRTAP6-3 ↻ ≫
KRTAP22-2 ↻ ≫
IL13RA2 ↻ ≫
TMEM225B ↻ ≫
SPATA31A1 ↻ ≫
ANKRD33 ↻ ≫
PCYOX1 ↻ ≫
ZBTB8OS ↻ ≫
RBBP4 ↻ ≫
BCKDHB ↻ ≫
PDE11A ↻ ≫
CFAP126 ↻ ≫
PLD3 ↻ ≫
C19orf47 ↻ ≫
GRIK2 ↻ ≫
ZMPSTE24 ↻ ≫
PLCXD1 ↻ ≫
ITGB3BP ↻ ≫
EFCAB7 ↻ ≫
AP3M2 ↻ ≫
MED25 ↻ ≫
RNF103-CHMP3 ↻ ≫
RMND5A ↻ ≫
NOL6 ↻ ≫
IFNA7 ↻ ≫
TMEM185B ↻ ≫
FAM106B ↻ ≫
SSX7 ↻ ≫
SLC14A1 ↻ ≫
LOC112694756 ↻ ≫
CCDC65 ↻ ≫
PTAR1 ↻ ≫
KPNB1 ↻ ≫
CPLX2 ↻ ≫
PRC1 ↻ ≫
ING4 ↻ ≫
RGPD8 ↻ ≫
RGPD6 ↻ ≫
RGPD5 ↻ ≫
PFDN4 ↻ ≫
SRSF7 ↻ ≫
LMCD1 ↻ ≫
SLAIN1 ↻ ≫
KMT2D ↻ ≫
IPO11 ↻ ≫
GPATCH4 ↻ ≫
WDR90 ↻ ≫
NDUFB7 ↻ ≫
SNRPA ↻ ≫
RNASE9 ↻ ≫
HAUS5 ↻ ≫
C19orf54 ↻ ≫
RCCD1 ↻ ≫
ANAPC10 ↻ ≫
ABCE1 ↻ ≫
RBBP5 ↻ ≫
CDC42 ↻ ≫
GALM ↻ ≫
DHX8 ↻ ≫
TTC1 ↻ ≫
RAP1GDS1 ↻ ≫
PRRC2A ↻ ≫
RNF225 ↻ ≫
NUMBL ↻ ≫
MTF2 ↻ ≫
ATAD2 ↻ ≫
ATP6V0A4 ↻ ≫
HNRNPL ↻ ≫
WDR36 ↻ ≫
REXO4 ↻ ≫
SPATC1L ↻ ≫
SERTAD3 ↻ ≫
NCOA7 ↻ ≫
GPSM3 ↻ ≫
CCNL1 ↻ ≫
CBWD6 ↻ ≫
CBWD5 ↻ ≫
CBWD3 ↻ ≫
CNOT1 ↻ ≫
SNRPD3 ↻ ≫
GUCD1 ↻ ≫
EIF1 ↻ ≫
FBXO22 ↻ ≫
OR4S1 ↻ ≫
LRRC37A3 ↻ ≫
EIF3CL ↻ ≫
EIF3C ↻ ≫
CDK5RAP1 ↻ ≫
ARIH1 ↻ ≫
RAB4B ↻ ≫
PSMD3 ↻ ≫
CHEK1 ↻ ≫
TSSC4 ↻ ≫
GLTPD2 ↻ ≫
CALM2 ↻ ≫
ZNF286A ↻ ≫
PYGO2 ↻ ≫
LOC101928120 ↻ ≫
CCR7 ↻ ≫
SPEF1 ↻ ≫
ZNF518A ↻ ≫
STX18 ↻ ≫
GBE1 ↻ ≫
BAX ↻ ≫
EIF4A2 ↻ ≫
SRSF3 ↻ ≫
SLC35E3 ↻ ≫
MCM7 ↻ ≫
AP4M1 ↻ ≫
NUP54 ↻ ≫
TIMM9 ↻ ≫
SELENOH ↻ ≫
KIAA0586 ↻ ≫
SLC35E2A ↻ ≫
TET1 ↻ ≫
LIN28A ↻ ≫
LOX ↻ ≫
IGF2 ↻ ≫
CDH1 ↻ ≫
CD44 ↻ ≫