ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for NELFE

Query protein: NELFE
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1758479 | MCF-7
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
NELFE's Target genes

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◢ SRX2378773: U2OS

◢ NELFE: STRING
NCOA3 ↻ ≫
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SIKE1 ↻ ≫
TUBD1 ↻ ≫
RPS6KB1 ↻ ≫
ID2 ↻ ≫
H3-3B ↻ ≫
HNRNPA2B1 ↻ ≫
CBX3 ↻ ≫
PABPC1 ↻ ≫
HNRNPH1 ↻ ≫
SRSF7 ↻ ≫
UBC ↻ ≫
BCAS2 ↻ ≫
TRA2B ↻ ≫
TRIM33 ↻ ≫
SRSF2 ↻ ≫
MFSD11 ↻ ≫
KRT8 ↻ ≫
RPLP0 ↻ ≫
NOTCH2NLC ↻ ≫
NOTCH2NLB ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
HNRNPAB ↻ ≫
HSPA1B ↻ ≫
IER5 ↻ ≫
CSRNP2 ↻ ≫
MYL12A ↻ ≫
NOTCH2 ↻ ≫
CTNNB1 ↻ ≫
JUNB ↻ ≫
TSC22D1 ↻ ≫
TUFT1 ↻ ≫
EGLN3 ↻ ≫
KANSL2 ↻ ≫
FUS ↻ ≫
TATDN1 ↻ ≫
NDUFB9 ↻ ≫
RHOB ↻ ≫
TFRC ↻ ≫
TMOD3 ↻ ≫
RMDN1 ↻ ≫
PRDX1 ↻ ≫
SKA3 ↻ ≫
MRPL57 ↻ ≫
POMP ↻ ≫
SRSF5 ↻ ≫
JPT1 ↻ ≫
TRAF7 ↻ ≫
FAM43A ↻ ≫
RPS3 ↻ ≫
KRT18 ↻ ≫
RPS2 ↻ ≫
CITED2 ↻ ≫
SLC1A5 ↻ ≫
LEMD3 ↻ ≫
PLK2 ↻ ≫
KITLG ↻ ≫
TPM3 ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
NXF1 ↻ ≫
INTS6 ↻ ≫
TRIM25 ↻ ≫
SLC3A2 ↻ ≫
TEX14 ↻ ≫
RAD51C ↻ ≫
GLS ↻ ≫
TUBB4B ↻ ≫
HEXIM1 ↻ ≫
CCSER1 ↻ ≫
MCL1 ↻ ≫
GABPB1 ↻ ≫
BTG1 ↻ ≫
CYCS ↻ ≫
C19orf48 ↻ ≫
H1-10 ↻ ≫
PPM1D ↻ ≫
SLC25A3 ↻ ≫
CALM2 ↻ ≫
DUSP1 ↻ ≫
TUBA1B ↻ ≫
VAMP1 ↻ ≫
RPL3 ↻ ≫
CSDE1 ↻ ≫
SELENOW ↻ ≫
AZIN1 ↻ ≫
HSPB1 ↻ ≫
TOB1 ↻ ≫
ATP5F1B ↻ ≫
RIDA ↻ ≫
POP1 ↻ ≫
RPS8 ↻ ≫
PLAG1 ↻ ≫
CHCHD7 ↻ ≫
SYAP1 ↻ ≫
C3orf14 ↻ ≫
FAM227B ↻ ≫
DTWD1 ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
ARFGEF2 ↻ ≫
RPLP1 ↻ ≫
CHMP1B ↻ ≫
PSMD6 ↻ ≫
SRSF6 ↻ ≫
RPL28 ↻ ≫
MYC ↻ ≫
CALM1 ↻ ≫
AFF1 ↻ ≫
SERTAD1 ↻ ≫
ZNF706 ↻ ≫
DALRD3 ↻ ≫
NDUFAF3 ↻ ≫
EIF1AX ↻ ≫
MAT2A ↻ ≫
EIF4A2 ↻ ≫
TMSB4X ↻ ≫
TXNDC16 ↻ ≫
RBM14-RBM4 ↻ ≫
RBM14 ↻ ≫
TM7SF2 ↻ ≫
HEATR5A ↻ ≫
RINT1 ↻ ≫
CKS2 ↻ ≫
ZFP36L1 ↻ ≫
GADD45B ↻ ≫
PTPN1 ↻ ≫
DDIT4 ↻ ≫
LEO1 ↻ ≫
ELF3 ↻ ≫
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EIF5 ↻ ≫
MTHFD2 ↻ ≫
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ARIH1 ↻ ≫
CCND1 ↻ ≫
USP8 ↻ ≫
KCTD5 ↻ ≫
MAP3K3 ↻ ≫
EEF1A1 ↻ ≫
EIF4A1 ↻ ≫
SESN2 ↻ ≫
ID3 ↻ ≫
FAM53C ↻ ≫
CDC25C ↻ ≫
ZBTB49 ↻ ≫
LYAR ↻ ≫
RBMX ↻ ≫
HMGB1 ↻ ≫
USPL1 ↻ ≫
SCFD1 ↻ ≫
RABIF ↻ ≫
ABCC5 ↻ ≫
H1-4 ↻ ≫
H2AX ↻ ≫
NCL ↻ ≫
PPIA ↻ ≫
RPS26 ↻ ≫
NBN ↻ ≫
CDH1 ↻ ≫
TPT1 ↻ ≫
GPR89A ↻ ≫
UBAP2 ↻ ≫
CLDN4 ↻ ≫
USP15 ↻ ≫
DDX3X ↻ ≫
TBC1D22A ↻ ≫
HEATR6 ↻ ≫
KRT19 ↻ ≫
POLR3B ↻ ≫
PDE4DIP ↻ ≫
RPL30 ↻ ≫
PPP1R12A ↻ ≫
H1-0 ↻ ≫
KRCC1 ↻ ≫
GPR89B ↻ ≫
HSP90AA1 ↻ ≫
ATAD2 ↻ ≫
TGOLN2 ↻ ≫
PCF11 ↻ ≫
GAPDH ↻ ≫
GOLGB1 ↻ ≫
RNF34 ↻ ≫
BAZ1A ↻ ≫
IER5L ↻ ≫
LRPAP1 ↻ ≫
RIPK2 ↻ ≫
ELF1 ↻ ≫
WBP4 ↻ ≫
RPL22L1 ↻ ≫
CCT2 ↻ ≫
GLCCI1 ↻ ≫
BCDIN3D ↻ ≫
NR4A1 ↻ ≫
CCDC61 ↻ ≫
GNAI3 ↻ ≫
ATP1B1 ↻ ≫
ATP23 ↻ ≫
RARS1 ↻ ≫
PSMD8 ↻ ≫
ZNF718 ↻ ≫
ZNF595 ↻ ≫
NAGK ↻ ≫
MYL12B ↻ ≫
DNAJA1 ↻ ≫
APTX ↻ ≫
ZAR1L ↻ ≫
BRCA2 ↻ ≫
RBBP7 ↻ ≫
MYNN ↻ ≫
TMX1 ↻ ≫
ZBTB4 ↻ ≫
POLR2A ↻ ≫
ARL6IP1 ↻ ≫
C12orf45 ↻ ≫
ANKRD46 ↻ ≫
GRHL2 ↻ ≫
ZNFX1 ↻ ≫
BRD2 ↻ ≫
EIF2S2 ↻ ≫
HSPA1L ↻ ≫
HSPA1A ↻ ≫
NPRL3 ↻ ≫
PSPC1 ↻ ≫
SFPQ ↻ ≫
TRIB1 ↻ ≫
FTL ↻ ≫
PIK3R3 ↻ ≫
LLPH ↻ ≫
POLG ↻ ≫
RBM34 ↻ ≫
EEF2 ↻ ≫
RPS20 ↻ ≫
NANS ↻ ≫
ZNF408 ↻ ≫
ARHGAP1 ↻ ≫
STIP1 ↻ ≫
B2M ↻ ≫
TRA2A ↻ ≫
RBM45 ↻ ≫
PTMA ↻ ≫
IMP3 ↻ ≫
PHTF1 ↻ ≫
CSKMT ↻ ≫
C11orf98 ↻ ≫
SLC25A19 ↻ ≫
G3BP1 ↻ ≫
S100A11 ↻ ≫
COG6 ↻ ≫
TOB2 ↻ ≫
LRATD2 ↻ ≫
ZBTB37 ↻ ≫
EIF4G2 ↻ ≫
UGP2 ↻ ≫
PCNA ↻ ≫
SPINT2 ↻ ≫
TMEM65 ↻ ≫
PDLIM7 ↻ ≫
THOC1 ↻ ≫
H4C11 ↻ ≫
RBM8A ↻ ≫
ANXA4 ↻ ≫
GTF2F2 ↻ ≫
FAM149B1 ↻ ≫
ECD ↻ ≫
ATP5IF1 ↻ ≫
PRRG2 ↻ ≫
NOSIP ↻ ≫
SAP18 ↻ ≫
RC3H1 ↻ ≫
POLR3D ↻ ≫
MAN2C1 ↻ ≫
TAF3 ↻ ≫
SLC39A10 ↻ ≫
IFRD1 ↻ ≫
NGRN ↻ ≫
AMZ2 ↻ ≫
TTC8 ↻ ≫
SPPL2A ↻ ≫
FBXO22 ↻ ≫
ENOX2 ↻ ≫
BTBD10 ↻ ≫
ZNF721 ↻ ≫
PIGG ↻ ≫
NQO1 ↻ ≫
TUBA1C ↻ ≫
NOL10 ↻ ≫
TOMM6 ↻ ≫
PNP ↻ ≫
DRG1 ↻ ≫
MAD2L1BP ↻ ≫
RPL13 ↻ ≫
CYB5R4 ↻ ≫
PKM ↻ ≫
DDX5 ↻ ≫
CEP95 ↻ ≫
RPAP2 ↻ ≫
GLMN ↻ ≫
PTPN13 ↻ ≫
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CHURC1 ↻ ≫
MYL6 ↻ ≫
PDRG1 ↻ ≫
GLUL ↻ ≫
LMNA ↻ ≫
COX14 ↻ ≫
KPNA2 ↻ ≫
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RLF ↻ ≫
HERPUD2 ↻ ≫
SLIRP ↻ ≫
ALKBH1 ↻ ≫
RAB21 ↻ ≫
RALBP1 ↻ ≫
KCTD7 ↻ ≫
SLC19A2 ↻ ≫
DPY19L3 ↻ ≫
ZNF468 ↻ ≫
TAF7 ↻ ≫
TSPYL2 ↻ ≫
PRPF4 ↻ ≫
CDC26 ↻ ≫
RPS9 ↻ ≫
SRSF3 ↻ ≫
STXBP3 ↻ ≫
ABHD10 ↻ ≫
FBXW2 ↻ ≫
WBP2 ↻ ≫
NUDT4B ↻ ≫
NUDT4 ↻ ≫
SLC38A2 ↻ ≫
EIF3L ↻ ≫
ANKRD54 ↻ ≫
C12orf66 ↻ ≫
GGCX ↻ ≫
RPS27 ↻ ≫
RABGEF1 ↻ ≫
MKNK1 ↻ ≫
S100A13 ↻ ≫
NUP58 ↻ ≫
S100A1 ↻ ≫
RPS12 ↻ ≫
H2AZ1 ↻ ≫
FBXO28 ↻ ≫
PIM2 ↻ ≫
FBXW11 ↻ ≫
PPP1R10 ↻ ≫
MRPS18B ↻ ≫
FAM91A1 ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
P4HA1 ↻ ≫
FER ↻ ≫
HLA-E ↻ ≫
RPS5 ↻ ≫
ATP1A1 ↻ ≫
YWHAQ ↻ ≫
ZNF622 ↻ ≫
OXR1 ↻ ≫
TPI1 ↻ ≫
TMEM170A ↻ ≫
TMEM41A ↻ ≫
RPL31 ↻ ≫
SRA1 ↻ ≫
TMBIM6 ↻ ≫
TRIM37 ↻ ≫
C12orf29 ↻ ≫
ARL15 ↻ ≫
FDXR ↻ ≫
DNAJC25-GNG10 ↻ ≫
DNAJC25 ↻ ≫
RPL11 ↻ ≫
PRPF38B ↻ ≫
C8orf76 ↻ ≫
H4-16 ↻ ≫
C2orf42 ↻ ≫
RBM12B ↻ ≫
PARPBP ↻ ≫
NUP37 ↻ ≫
RPL15 ↻ ≫
NKIRAS1 ↻ ≫
UBE2Z ↻ ≫
BRMS1L ↻ ≫
TIMELESS ↻ ≫
CDC5L ↻ ≫
C12orf65 ↻ ≫
RBM12 ↻ ≫
CPNE1 ↻ ≫
PNRC1 ↻ ≫
GNPNAT1 ↻ ≫
NUP160 ↻ ≫
DTD2 ↻ ≫
STC2 ↻ ≫
WDR4 ↻ ≫
FOXD1 ↻ ≫
LDLR ↻ ≫
MRPS25 ↻ ≫
ZNF23 ↻ ≫
USP1 ↻ ≫
SC5D ↻ ≫
SLC9A1 ↻ ≫
HSPA5 ↻ ≫
GADD45A ↻ ≫
SOD1 ↻ ≫
BORCS5 ↻ ≫
RNF103 ↻ ≫
TIMMDC1 ↻ ≫
RNF168 ↻ ≫
SLC25A30 ↻ ≫
RTN3 ↻ ≫
RPS7 ↻ ≫
HNRNPC ↻ ≫
GLO1 ↻ ≫
NTMT1 ↻ ≫
DBNL ↻ ≫
EIF1 ↻ ≫
KNTC1 ↻ ≫
RPS6 ↻ ≫
TOP1 ↻ ≫
TTPAL ↻ ≫
PRMT6 ↻ ≫
MESD ↻ ≫
TFIP11 ↻ ≫
CFL1 ↻ ≫
RBM25 ↻ ≫
NET1 ↻ ≫
MAPK6 ↻ ≫
RPAP3 ↻ ≫
ZNF761 ↻ ≫
H1-2 ↻ ≫
RNF139 ↻ ≫
CREBZF ↻ ≫
KDM3A ↻ ≫
UGDH ↻ ≫
SLC35A5 ↻ ≫
ATG3 ↻ ≫
PSME3 ↻ ≫
XPO5 ↻ ≫
POLH ↻ ≫
FOSL2 ↻ ≫
SIPA1L1 ↻ ≫
DAGLB ↻ ≫
CNIH4 ↻ ≫
FRS2 ↻ ≫
NAP1L1 ↻ ≫
BRAP ↻ ≫
ACAD10 ↻ ≫
ZNF397 ↻ ≫
NCEH1 ↻ ≫
OSR2 ↻ ≫
ZNF701 ↻ ≫
MTARC2 ↻ ≫
PELI1 ↻ ≫
THAP7 ↻ ≫
C1orf74 ↻ ≫
INTS8 ↻ ≫
ZCWPW1 ↻ ≫
MEPCE ↻ ≫
MARCHF6 ↻ ≫
TRPM7 ↻ ≫
EFHC1 ↻ ≫
DOP1B ↻ ≫
LMAN2 ↻ ≫
USP36 ↻ ≫
ZSCAN32 ↻ ≫
ZNF174 ↻ ≫
SDC4 ↻ ≫
BTG2 ↻ ≫
RAB5B ↻ ≫
USP42 ↻ ≫
PTPN2 ↻ ≫
SNRNP48 ↻ ≫
SLC2A1 ↻ ≫
ATP5MC3 ↻ ≫
SETD5 ↻ ≫
C1QTNF6 ↻ ≫
DNAJC9 ↻ ≫
THOC3 ↻ ≫
XRN2 ↻ ≫
ATP2C1 ↻ ≫
MRS2 ↻ ≫
EPB41L5 ↻ ≫
DERL1 ↻ ≫
ATF4 ↻ ≫
TENT5C ↻ ≫
TNPO1 ↻ ≫
LIN7C ↻ ≫
CANX ↻ ≫
TRIM24 ↻ ≫
BRK1 ↻ ≫
COPG1 ↻ ≫
SGF29 ↻ ≫
HOMER1 ↻ ≫
EHD1 ↻ ≫
LAP3 ↻ ≫
RPL36AL ↻ ≫
MGAT2 ↻ ≫
TERF2IP ↻ ≫
KARS1 ↻ ≫
TRIAP1 ↻ ≫
KCTD13 ↻ ≫
PIK3C2A ↻ ≫
SOX9 ↻ ≫
H3-3A ↻ ≫
MAN1A2 ↻ ≫
WDPCP ↻ ≫
MDH1 ↻ ≫
IQCB1 ↻ ≫
EAF2 ↻ ≫
CNPY3 ↻ ≫
DNM1L ↻ ≫
RAB9A ↻ ≫
IFT52 ↻ ≫
ATXN7L3B ↻ ≫
L2HGDH ↻ ≫
DMAC2L ↻ ≫
RWDD2B ↻ ≫
NUDCD1 ↻ ≫
INTS2 ↻ ≫
H3C13 ↻ ≫
SRSF1 ↻ ≫
TMEM260 ↻ ≫
RARS2 ↻ ≫
ORC3 ↻ ≫
TRMT61B ↻ ≫
LRCH3 ↻ ≫
PTDSS1 ↻ ≫
MTERF3 ↻ ≫
MOB4 ↻ ≫
RNASEH2C ↻ ≫
NDRG1 ↻ ≫
VMP1 ↻ ≫
PTRH2 ↻ ≫
TBCC ↻ ≫
BICRAL ↻ ≫
ZBED8 ↻ ≫
CEP78 ↻ ≫
MSX2 ↻ ≫
RABEPK ↻ ≫
NUDT1 ↻ ≫
MRM2 ↻ ≫
ZNF627 ↻ ≫
PSMA4 ↻ ≫
RPL12 ↻ ≫
LRSAM1 ↻ ≫
H4C5 ↻ ≫
PRPF40B ↻ ≫
DNAJC14 ↻ ≫
PRMT2 ↻ ≫
XKR9 ↻ ≫
LACTB2 ↻ ≫
ERCC3 ↻ ≫
SRRD ↻ ≫
HPS4 ↻ ≫
BEGAIN ↻ ≫
VCL ↻ ≫
RPL37A ↻ ≫
CCT7 ↻ ≫
IMPDH2 ↻ ≫
PRADC1 ↻ ≫
CDC42 ↻ ≫
TANK ↻ ≫
N6AMT1 ↻ ≫
SYNCRIP ↻ ≫
KIAA1191 ↻ ≫
DPY30 ↻ ≫
DYNC1H1 ↻ ≫
ZNF148 ↻ ≫
MTF1 ↻ ≫
TUBA1A ↻ ≫
MBD4 ↻ ≫
IFT122 ↻ ≫
GADD45G ↻ ≫
SDCBP ↻ ≫
ROMO1 ↻ ≫
SLC7A6OS ↻ ≫
PRMT7 ↻ ≫
ATG7 ↻ ≫
ISY1-RAB43 ↻ ≫
ISY1 ↻ ≫
ZDHHC4 ↻ ≫
ADSL ↻ ≫
SF3B4 ↻ ≫
PRR13 ↻ ≫
SETD3 ↻ ≫
CCNK ↻ ≫
RAE1 ↻ ≫
SEC23A ↻ ≫
ID1 ↻ ≫
TAX1BP3 ↻ ≫
EMC6 ↻ ≫
RPL6 ↻ ≫
PTPN11 ↻ ≫
CDC42EP4 ↻ ≫
PDCD4 ↻ ≫
TMEM14B ↻ ≫
BLCAP ↻ ≫
ID4 ↻ ≫
TEP1 ↻ ≫
NABP1 ↻ ≫
SEPHS2 ↻ ≫
PRPSAP1 ↻ ≫
YEATS4 ↻ ≫
UACA ↻ ≫
BZW2 ↻ ≫
ANKMY2 ↻ ≫
GRN ↻ ≫
HIPK1 ↻ ≫
BUB3 ↻ ≫
BRIP1 ↻ ≫
TRAPPC2 ↻ ≫
OFD1 ↻ ≫
LOC101928764 ↻ ≫
DDX19B ↻ ≫
AARS1 ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
KBTBD4 ↻ ≫
L3HYPDH ↻ ≫
JKAMP ↻ ≫
NEU1 ↻ ≫
YAE1 ↻ ≫
KDSR ↻ ≫
PFKFB3 ↻ ≫
DLD ↻ ≫
DYRK3 ↻ ≫
CCNL1 ↻ ≫
EMSY ↻ ≫
MAFB ↻ ≫
STK16 ↻ ≫
GLB1L ↻ ≫
EFNA4 ↻ ≫
LYSMD2 ↻ ≫
TMOD2 ↻ ≫
PYGB ↻ ≫
LUC7L ↻ ≫
GTF2B ↻ ≫
ASH1L ↻ ≫
PRKAG1 ↻ ≫
OS9 ↻ ≫
SPICE1 ↻ ≫
UBB ↻ ≫
PITRM1 ↻ ≫
RAB11A ↻ ≫
SDHAF4 ↻ ≫
STT3B ↻ ≫
ZNF544 ↻ ≫
KDM2A ↻ ≫
PLPP3 ↻ ≫
MAPK14 ↻ ≫
JUN ↻ ≫
GPATCH2L ↻ ≫
RPS27A ↻ ≫
CLHC1 ↻ ≫
POLR2F ↻ ≫
C22orf23 ↻ ≫
YOD1 ↻ ≫
PFKFB2 ↻ ≫
HTRA2 ↻ ≫
EEF1AKMT1 ↻ ≫
CA8 ↻ ≫
SMIM4 ↻ ≫
TRIP11 ↻ ≫
TCTA ↻ ≫
RHOA ↻ ≫
NOP2 ↻ ≫
ZFYVE27 ↻ ≫
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MTCH2 ↻ ≫
ULK3 ↻ ≫
RSL1D1 ↻ ≫
EPHB3 ↻ ≫
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MAP11 ↻ ≫
TTF2 ↻ ≫
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ELK4 ↻ ≫
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NDUFC2-KCTD14 ↻ ≫
NDUFC2 ↻ ≫
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APMAP ↻ ≫
C6orf226 ↻ ≫
TOR1AIP2 ↻ ≫
H2BC21 ↻ ≫
H2AC20 ↻ ≫
H2AC21 ↻ ≫
UQCC2 ↻ ≫
PSMD4 ↻ ≫
GCH1 ↻ ≫
ESR2 ↻ ≫
PAWR ↻ ≫
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RNF10 ↻ ≫
PARD6B ↻ ≫
HSP90AB1 ↻ ≫
DCXR ↻ ≫
MFAP3 ↻ ≫
FAM114A2 ↻ ≫
NDUFA12 ↻ ≫
PDP1 ↻ ≫
SWI5 ↻ ≫
GOLGA2 ↻ ≫
EEA1 ↻ ≫
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RASA1 ↻ ≫
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POLR1A ↻ ≫
SMARCC1 ↻ ≫
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ISCA1 ↻ ≫
GDE1 ↻ ≫
PNN ↻ ≫
TKFC ↻ ≫
DDB1 ↻ ≫
SFR1 ↻ ≫
NASP ↻ ≫
APLP2 ↻ ≫
PIP5K1A ↻ ≫
HMBS ↻ ≫
HADHB ↻ ≫
HADHA ↻ ≫
ENO1 ↻ ≫
TRAFD1 ↻ ≫
LETMD1 ↻ ≫
RASSF4 ↻ ≫
NUDT19 ↻ ≫
H4C3 ↻ ≫
TIMM23B ↻ ≫
PARG ↻ ≫
ATP6V1H ↻ ≫
PDCD6IP ↻ ≫
MED11 ↻ ≫
ZNF440 ↻ ≫
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