ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for ARID1A

Query protein: ARID1A
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX5089381 | MCF-7
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
ARID1A's Target genes

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◢ SRX10445306: Neural crest cells

◢ SRX11857202: Neural crest cells

◢ SRX11857211: Neural crest cells

◢ SRX8363485: NGP

◢ SRX3241379: RMG-I

◢ SRX3241380: RMG-I

◢ SRX4704621: RMG-I

◢ ARID1A: STRING
NCOA3 ↻ ≫
BCAS4 ↻ ≫
PARD6B ↻ ≫
BMP7 ↻ ≫
BCAS1 ↻ ≫
ZMYND8 ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
ZHX2 ↻ ≫
BANP ↻ ≫
TMEM229B ↻ ≫
CDH1 ↻ ≫
CLDN9 ↻ ≫
CLDN6 ↻ ≫
TNFRSF12A ↻ ≫
RMND5B ↻ ≫
C3orf14 ↻ ≫
KDM2A ↻ ≫
ANKRD35 ↻ ≫
TXNRD1 ↻ ≫
TMIGD3 ↻ ≫
ADORA3 ↻ ≫
MYOG ↻ ≫
IGSF3 ↻ ≫
CYP27C1 ↻ ≫
FBP1 ↻ ≫
PRKAG2 ↻ ≫
FAM217B ↻ ≫
SYCP2 ↻ ≫
USP32 ↻ ≫
YPEL3 ↻ ≫
GDPD3 ↻ ≫
NOTCH2NLC ↻ ≫
NOTCH2 ↻ ≫
OSBPL2 ↻ ≫
GPRC5A ↻ ≫
CERS2 ↻ ≫
ANXA9 ↻ ≫
GRAMD1A ↻ ≫
ENSA ↻ ≫
NIBAN2 ↻ ≫
DPRX ↻ ≫
TSG101 ↻ ≫
ZNF385B ↻ ≫
MTERF4 ↻ ≫
CD55 ↻ ≫
HEG1 ↻ ≫
MYO5C ↻ ≫
PHLDA3 ↻ ≫
SLC13A1 ↻ ≫
TUFT1 ↻ ≫
BRWD1 ↻ ≫
CAP2 ↻ ≫
RIN2 ↻ ≫
NBPF6 ↻ ≫
ANKH ↻ ≫
RDX ↻ ≫
EPS15L1 ↻ ≫
SIDT1 ↻ ≫
NOTCH2NLB ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
C16orf74 ↻ ≫
CSAD ↻ ≫
ELF3 ↻ ≫
ESR1 ↻ ≫
PLAAT2 ↻ ≫
ADCY5 ↻ ≫
TSKU ↻ ≫
SPRR2F ↻ ≫
ZNF385A ↻ ≫
CDH18 ↻ ≫
RAB15 ↻ ≫
NBPF4 ↻ ≫
VPS37C ↻ ≫
ARHGAP40 ↻ ≫
CACNG1 ↻ ≫
CALCR ↻ ≫
HDAC11 ↻ ≫
PFDN4 ↻ ≫
BATF ↻ ≫
TMEM205 ↻ ≫
CCDC159 ↻ ≫
RAB3D ↻ ≫
TMEM94 ↻ ≫
STX1A ↻ ≫
TRIB1 ↻ ≫
IQANK1 ↻ ≫
FAM83H ↻ ≫
KRT80 ↻ ≫
GPR37L1 ↻ ≫
SPINK1 ↻ ≫
DNASE1 ↻ ≫
TFF1 ↻ ≫
ATP6V0D2 ↻ ≫
KRT8 ↻ ≫
GPD1L ↻ ≫
SMARCD2 ↻ ≫
ABCC5 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
UHRF1BP1L ↻ ≫
SYT12 ↻ ≫
C11orf80 ↻ ≫
MESP2 ↻ ≫
TM4SF1 ↻ ≫
MB21D2 ↻ ≫
C7orf50 ↻ ≫
TMPRSS13 ↻ ≫
SGK3 ↻ ≫
RGS3 ↻ ≫
SSH3 ↻ ≫
PRICKLE2 ↻ ≫
MAMDC2 ↻ ≫
ARRDC1 ↻ ≫
EHMT1 ↻ ≫
FOXN1 ↻ ≫
NUDT19 ↻ ≫
RPEL1 ↻ ≫
LMCD1 ↻ ≫
LYPD3 ↻ ≫
IFRD1 ↻ ≫
C19orf33 ↻ ≫
XRN1 ↻ ≫
GRHL2 ↻ ≫
TBC1D2 ↻ ≫
SH3BGRL ↻ ≫
HMGN5 ↻ ≫
RXRA ↻ ≫
SRI ↻ ≫
KRT18 ↻ ≫
CST6 ↻ ≫
NHSL1 ↻ ≫
STARD10 ↻ ≫
EPHB3 ↻ ≫
RBBP8NL ↻ ≫
SPO11 ↻ ≫
KALRN ↻ ≫
CYB561 ↻ ≫
PDE4DIP ↻ ≫
SULF2 ↻ ≫
LYN ↻ ≫
CDH26 ↻ ≫
HOMER2 ↻ ≫
GSTA3 ↻ ≫
NT5C2 ↻ ≫
TRIQK ↻ ≫
ATP2A3 ↻ ≫
RERG ↻ ≫
MPP7 ↻ ≫
BHLHE40 ↻ ≫
DNPEP ↻ ≫
SLC25A24 ↻ ≫
CALML5 ↻ ≫
CIB3 ↻ ≫
PDZK1 ↻ ≫
CGN ↻ ≫
ATP9B ↻ ≫
SLC38A1 ↻ ≫
CAPN11 ↻ ≫
PDZRN3 ↻ ≫
KCNJ15 ↻ ≫
PPM1D ↻ ≫
SHISA9 ↻ ≫
SLC44A2 ↻ ≫
FOXN4 ↻ ≫
UBE2T ↻ ≫
TET3 ↻ ≫
GET4 ↻ ≫
SLC37A3 ↻ ≫
RAB19 ↻ ≫
PPL ↻ ≫
GNAS ↻ ≫
TNS3 ↻ ≫
ECH1 ↻ ≫
RUNX1T1 ↻ ≫
LY6D ↻ ≫
IGFBP4 ↻ ≫
PCDH1 ↻ ≫
RIPOR3 ↻ ≫
CAND1 ↻ ≫
TRIM37 ↻ ≫
HDGFL3 ↻ ≫
SH3GLB2 ↻ ≫
MIGA2 ↻ ≫
ABLIM1 ↻ ≫
CFAP45 ↻ ≫
G3BP1 ↻ ≫
ARFGEF2 ↻ ≫
LRATD2 ↻ ≫
CMTR2 ↻ ≫
RARRES1 ↻ ≫
ALDH3B2 ↻ ≫
NAP1L4 ↻ ≫
MESP1 ↻ ≫
TPD52L1 ↻ ≫
LIMA1 ↻ ≫
SALL4 ↻ ≫
CLIP4 ↻ ≫
KRT3 ↻ ≫
EVL ↻ ≫
SIGLEC5 ↻ ≫
GTSF1L ↻ ≫
DSG4 ↻ ≫
CD180 ↻ ≫
ZNF740 ↻ ≫
PRPS1 ↻ ≫
GREB1 ↻ ≫
KLF10 ↻ ≫
MS4A7 ↻ ≫
SCYL3 ↻ ≫
NR2F2 ↻ ≫
VEGFC ↻ ≫
CRIP2 ↻ ≫
TEDC1 ↻ ≫
CRIP1 ↻ ≫
TRH ↻ ≫
NFKBIZ ↻ ≫
IGSF5 ↻ ≫
IL24 ↻ ≫
KRT7 ↻ ≫
CHPT1 ↻ ≫
HDC ↻ ≫
DCLK2 ↻ ≫
UMODL1 ↻ ≫
FAM174B ↻ ≫
ST3GAL4 ↻ ≫
UFSP1 ↻ ≫
ACHE ↻ ≫
FEM1A ↻ ≫
ACP3 ↻ ≫
ZNF77 ↻ ≫
DYNLL1 ↻ ≫
SRSF9 ↻ ≫
PSG9 ↻ ≫
SRGAP2 ↻ ≫
ACP6 ↻ ≫
PLEKHM3 ↻ ≫
SMIM6 ↻ ≫
STK3 ↻ ≫
LCMT1 ↻ ≫
METRNL ↻ ≫
HOXB1 ↻ ≫
PALLD ↻ ≫
ANO6 ↻ ≫
PHF2 ↻ ≫
ADARB1 ↻ ≫
LSMEM1 ↻ ≫
SULT2B1 ↻ ≫
NECTIN4 ↻ ≫
MACROD1 ↻ ≫
ARHGAP10 ↻ ≫
SFXN2 ↻ ≫
ARL3 ↻ ≫
KLHL35 ↻ ≫
PKD1L2 ↻ ≫
KRTAP3-2 ↻ ≫
SUCO ↻ ≫
KRTAP3-1 ↻ ≫
BZW2 ↻ ≫
PRKAR1B ↻ ≫
PRSS22 ↻ ≫
POU5F1 ↻ ≫
CLDN4 ↻ ≫
MYO6 ↻ ≫
MAFK ↻ ≫
DDX47 ↻ ≫
ST8SIA6 ↻ ≫
IER3 ↻ ≫
FLOT1 ↻ ≫
ACOX3 ↻ ≫
ZBTB2 ↻ ≫
SPINK4 ↻ ≫
CHCHD5 ↻ ≫
P2RY2 ↻ ≫
UGT2B15 ↻ ≫
S100A16 ↻ ≫
S100A14 ↻ ≫
ZSWIM1 ↻ ≫
GSG1L ↻ ≫
ERVW-1 ↻ ≫
RAPGEF1 ↻ ≫
GOLM1 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
STX5 ↻ ≫
ZBTB43 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
QSOX1 ↻ ≫
ATXN7 ↻ ≫
ZNF398 ↻ ≫
THOC7 ↻ ≫
ZNF79 ↻ ≫
IL19 ↻ ≫
GSN ↻ ≫
EPS8 ↻ ≫
GSR ↻ ≫
ETV3 ↻ ≫
NAALADL2 ↻ ≫
CDS1 ↻ ≫
BRIP1 ↻ ≫
RARG ↻ ≫
SLAMF9 ↻ ≫
IGSF9 ↻ ≫
LFNG ↻ ≫
NTSR1 ↻ ≫
EREG ↻ ≫
FKBP1A ↻ ≫
IKZF3 ↻ ≫
TMEM220 ↻ ≫
CYP3A43 ↻ ≫
AGPAT3 ↻ ≫
CASTOR1 ↻ ≫
PRLH ↻ ≫
FAM214A ↻ ≫
NAV2 ↻ ≫
SPDEF ↻ ≫
UBE2H ↻ ≫
TAF13 ↻ ≫
GPC6 ↻ ≫
PMEL ↻ ≫
FREM2 ↻ ≫
OPA3 ↻ ≫
P2RX2 ↻ ≫
TCAF2 ↻ ≫
NXNL2 ↻ ≫
PPP2R2C ↻ ≫
RARA ↻ ≫
HSPB8 ↻ ≫
ROPN1B ↻ ≫
SPDYE2B ↻ ≫
SPDYE2 ↻ ≫
UPK3BL1 ↻ ≫
BCL3 ↻ ≫
SVIL ↻ ≫
PSRC1 ↻ ≫
DMRTA1 ↻ ≫
KYNU ↻ ≫
NEDD9 ↻ ≫
ZMYND11 ↻ ≫
SMYD3 ↻ ≫
BCL2L1 ↻ ≫
FAM151B ↻ ≫
ZNF217 ↻ ≫
SLC35A3 ↻ ≫
NPEPPS ↻ ≫
NOTCH3 ↻ ≫
MPP3 ↻ ≫
CD300LG ↻ ≫
VPS54 ↻ ≫
MRFAP1 ↻ ≫
ESRP2 ↻ ≫
JPT1 ↻ ≫
KRT39 ↻ ≫
KLF5 ↻ ≫
IDH2 ↻ ≫
OR10G2 ↻ ≫
SLC11A2 ↻ ≫
PRDM4 ↻ ≫
ASCL4 ↻ ≫
KRTAP5-6 ↻ ≫
ERBB4 ↻ ≫
PTPRF ↻ ≫
TC2N ↻ ≫
TPD52 ↻ ≫
IL27 ↻ ≫
LYPD6B ↻ ≫
SLC9A3 ↻ ≫
TFAP2C ↻ ≫
FGF1 ↻ ≫
SLC25A10 ↻ ≫
ZNF541 ↻ ≫
TMEM63A ↻ ≫
NBPF15 ↻ ≫
SYBU ↻ ≫
PLEKHS1 ↻ ≫
C16orf86 ↻ ≫
FAM240C ↻ ≫
CTNND2 ↻ ≫
TMEM104 ↻ ≫
NAT9 ↻ ≫
UBA5 ↻ ≫
ACAD11 ↻ ≫
PA2G4 ↻ ≫
FAM20B ↻ ≫
TBX6 ↻ ≫
NMNAT1 ↻ ≫
LZIC ↻ ≫
SLC4A8 ↻ ≫
AFTPH ↻ ≫
RALB ↻ ≫
CEP20 ↻ ≫
TPCN1 ↻ ≫
MLLT11 ↻ ≫
CDC42SE1 ↻ ≫
KLK13 ↻ ≫
FOXO6 ↻ ≫
AGR3 ↻ ≫
TACC1 ↻ ≫
ART1 ↻ ≫
RNF19A ↻ ≫
GSTP1 ↻ ≫
MACC1 ↻ ≫
TMEM184A ↻ ≫
TNRC18 ↻ ≫
LOC100129484 ↻ ≫
RBL2 ↻ ≫
CSF3R ↻ ≫
EOLA1 ↻ ≫
EOLA2 ↻ ≫
HSFX4 ↻ ≫
PRSS23 ↻ ≫
PSMD7 ↻ ≫
SLC22A5 ↻ ≫
ABHD11 ↻ ≫
FAM102A ↻ ≫
UNC13D ↻ ≫
WBP2 ↻ ≫
MIDEAS ↻ ≫
RIOK2 ↻ ≫
DOCK6 ↻ ≫
HAPLN2 ↻ ≫
SMARCA4 ↻ ≫
UPK3BL2 ↻ ≫
CEACAM16 ↻ ≫
SCARB1 ↻ ≫
LURAP1L ↻ ≫
MICALL2 ↻ ≫
AKAP9 ↻ ≫
OLFML2A ↻ ≫
NR6A1 ↻ ≫
ATP8B2 ↻ ≫
GSPT1 ↻ ≫
CAPN13 ↻ ≫
PRR15L ↻ ≫
SLC2A6 ↻ ≫
NAA25 ↻ ≫
PGF ↻ ≫
TMEM229A ↻ ≫
ARHGEF28 ↻ ≫
AFAP1 ↻ ≫
LOC389199 ↻ ≫
CCN5 ↻ ≫
SLC37A1 ↻ ≫
TMEM241 ↻ ≫
EHF ↻ ≫
CCDC125 ↻ ≫
PNPLA8 ↻ ≫
COMT ↻ ≫
TRMT12 ↻ ≫
SPATS2L ↻ ≫
FKBP4 ↻ ≫
CD36 ↻ ≫
SP1 ↻ ≫
ARHGEF10L ↻ ≫
PLEKHH2 ↻ ≫
RNF223 ↻ ≫
SULT1A4 ↻ ≫
SULT1A3 ↻ ≫
SLX1B ↻ ≫
SLX1A ↻ ≫
BOLA2B ↻ ≫
BOLA2 ↻ ≫
HID1 ↻ ≫
TRIM32 ↻ ≫
ASTN2 ↻ ≫
SLC7A2 ↻ ≫
PROSER2 ↻ ≫
JRK ↻ ≫
PSCA ↻ ≫
CSNK1A1 ↻ ≫
ARHGEF3 ↻ ≫
CELSR2 ↻ ≫
PPP1R13B ↻ ≫
OSER1 ↻ ≫
MTA3 ↻ ≫
TCF3 ↻ ≫
HEBP2 ↻ ≫
SLC34A3 ↻ ≫
ATP6AP2 ↻ ≫
RNF224 ↻ ≫
RNF208 ↻ ≫
CYSRT1 ↻ ≫
TSPO ↻ ≫
MCAT ↻ ≫
AHR ↻ ≫
B3GALNT1 ↻ ≫
SULT1C4 ↻ ≫
SLC1A5 ↻ ≫
B3GALT5 ↻ ≫
ABHD12 ↻ ≫
PPP2R5E ↻ ≫
LGI1 ↻ ≫
SMIM5 ↻ ≫
AP1B1 ↻ ≫
ERP27 ↻ ≫
POLD4 ↻ ≫
RAI1 ↻ ≫
CDC42EP3 ↻ ≫
MAST4 ↻ ≫
TACC2 ↻ ≫
VIRMA ↻ ≫
DOT1L ↻ ≫
ZBTB26 ↻ ≫
RABGAP1 ↻ ≫
CERK ↻ ≫
AP3D1 ↻ ≫
SEMA3E ↻ ≫
CLCC1 ↻ ≫
EHD1 ↻ ≫
MTMR11 ↻ ≫
GUCA2A ↻ ≫
SLC6A6 ↻ ≫
SNX31 ↻ ≫
POT1 ↻ ≫
KATNIP ↻ ≫
GTF3C1 ↻ ≫
MYEOV ↻ ≫
PHLPP2 ↻ ≫
GAS2 ↻ ≫
PACSIN3 ↻ ≫
RPS6KL1 ↻ ≫
TWF1 ↻ ≫
SURF4 ↻ ≫
ABCC3 ↻ ≫
EFHD1 ↻ ≫
MAGI3 ↻ ≫
EDARADD ↻ ≫
LDLRAD1 ↻ ≫
PPP1R15B ↻ ≫
ZNRF3 ↻ ≫
PRSS8 ↻ ≫
TM9SF3 ↻ ≫
AKAP1 ↻ ≫
SPARC ↻ ≫
PGLYRP2 ↻ ≫
OR2F1 ↻ ≫
CUEDC1 ↻ ≫
PDXK ↻ ≫
UQCRHL ↻ ≫
CLEC2D ↻ ≫
CLIP1 ↻ ≫
ALDH2 ↻ ≫
TSC22D3 ↻ ≫
MACROH2A1 ↻ ≫
TJP2 ↻ ≫
MLLT3 ↻ ≫
EVI2A ↻ ≫
TNFSF15 ↻ ≫
EVI2B ↻ ≫
ZNF316 ↻ ≫
IQSEC1 ↻ ≫
BRI3 ↻ ≫
MCEE ↻ ≫
LRCH4 ↻ ≫
FBXO24 ↻ ≫
MPHOSPH10 ↻ ≫
DMP1 ↻ ≫
ZASP ↻ ≫
SAP25 ↻ ≫
B4GALT1 ↻ ≫
MANBAL ↻ ≫
KMT2E ↻ ≫
S100A2 ↻ ≫
PRRT1B ↻ ≫
RNFT1 ↻ ≫
OLFML3 ↻ ≫
PIM3 ↻ ≫
DGKZ ↻ ≫
TBX2 ↻ ≫
TRIM46 ↻ ≫
KRTCAP2 ↻ ≫
SEPTIN9 ↻ ≫
PPCDC ↻ ≫
GIPC1 ↻ ≫
IKBKG ↻ ≫
G6PD ↻ ≫
IRF8 ↻ ≫
PRRT2 ↻ ≫
MAZ ↻ ≫
MTFR1 ↻ ≫
CA12 ↻ ≫
GLDN ↻ ≫
FILIP1L ↻ ≫
TBX4 ↻ ≫
PEDS1-UBE2V1 ↻ ≫
PEDS1 ↻ ≫
SMAGP ↻ ≫
GDF15 ↻ ≫
CEMIP2 ↻ ≫
SLC25A25 ↻ ≫
VIPR1 ↻ ≫
NAIF1 ↻ ≫
UPK3B ↻ ≫
RGPD6 ↻ ≫
RGPD8 ↻ ≫
RGPD5 ↻ ≫
SMIM28 ↻ ≫
MINDY4 ↻ ≫
BCL6 ↻ ≫
TNNT2 ↻ ≫
SLC19A3 ↻ ≫
C2CD2 ↻ ≫
SPAG4 ↻ ≫
ACER2 ↻ ≫
APOLD1 ↻ ≫
DNAJC5B ↻ ≫
RHOD ↻ ≫
SCIN ↻ ≫
HAUS1 ↻ ≫
ATP5F1A ↻ ≫
LATS1 ↻ ≫
AP5S1 ↻ ≫
STAT6 ↻ ≫
EIF2B5 ↻ ≫
CHKA ↻ ≫
PACSIN2 ↻ ≫
TTC3 ↻ ≫
PIGP ↻ ≫
CCDC186 ↻ ≫
DDX42 ↻ ≫
CCDC47 ↻ ≫
SDC1 ↻ ≫
PROM2 ↻ ≫
HS3ST6 ↻ ≫
ARHGEF6 ↻ ≫
ADAMTS12 ↻ ≫
MYBPC3 ↻ ≫
MARK2 ↻ ≫
TF ↻ ≫
CSRNP1 ↻ ≫
GRAMD2B ↻ ≫
CCDC33 ↻ ≫
AMTN ↻ ≫
TUBGCP3 ↻ ≫
KRT19 ↻ ≫
ALDOA ↻ ≫
LYRM1 ↻ ≫
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