ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for ZNF416

Query protein: ZNF416
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX13007615 | iPS cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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ZNF416's Target genes

◢ ZNF416: Average

◢ SRX3322209: 293

◢ SRX3322210: 293

◢ SRX9505510: IMR-90

◢ SRX9505511: IMR-90

◢ SRX13007614: iPS cells

◣ SRX13007615: iPS cells

◢ ZNF416: STRING
MTRNR2L1 ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
FAM86B1 ↻ ≫
POU3F3 ↻ ≫
PER3 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
PTPRR ↻ ≫
TMEM107 ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
ZC3H10 ↻ ≫
RPL41 ↻ ≫
UBAP2 ↻ ≫
POLDIP3 ↻ ≫
GTPBP6 ↻ ≫
H2AZ1 ↻ ≫
DNAJB14 ↻ ≫
NPAS4 ↻ ≫
PTPN6 ↻ ≫
C12orf57 ↻ ≫
LMNA ↻ ≫
ZC3H14 ↻ ≫
H4C11 ↻ ≫
SUMF2 ↻ ≫
MIER1 ↻ ≫
VEZF1 ↻ ≫
ELAVL3 ↻ ≫
RCC1 ↻ ≫
PLA2G2A ↻ ≫
PPP1R37 ↻ ≫
C6orf226 ↻ ≫
SMIM29 ↻ ≫
OR51H1 ↻ ≫
H2BC5 ↻ ≫
H1-4 ↻ ≫
IQSEC3 ↻ ≫
H4-16 ↻ ≫
H2AJ ↻ ≫
EGR1 ↻ ≫
GSTA4 ↻ ≫
RPS18 ↻ ≫
B3GALT4 ↻ ≫
SCAMP3 ↻ ≫
CCSER2 ↻ ≫
COL23A1 ↻ ≫
PHF23 ↻ ≫
DVL2 ↻ ≫
HTR5A ↻ ≫
TPM1 ↻ ≫
RPS11 ↻ ≫
RPL13A ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
NAT10 ↻ ≫
SNAPC5 ↻ ≫
KRBA2 ↻ ≫
CD320 ↻ ≫
PSMG1 ↻ ≫
NEUROD6 ↻ ≫
DNAJB4 ↻ ≫
DNAJC25-GNG10 ↻ ≫
DNAJC25 ↻ ≫
CELA3A ↻ ≫
H4C5 ↻ ≫
ZNF549 ↻ ≫
ZFP37 ↻ ≫
PPIA ↻ ≫
UBC ↻ ≫
OSGIN1 ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
SCRIB ↻ ≫
RPS23 ↻ ≫
ATP6AP1L ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
RALGDS ↻ ≫
CCDC34 ↻ ≫
AKAP8 ↻ ≫
H4C6 ↻ ≫
PYGO2 ↻ ≫
LOC101928120 ↻ ≫
NKX1-1 ↻ ≫
RPL17-C18orf32 ↻ ≫
RPL17 ↻ ≫
C18orf32 ↻ ≫
RPL13 ↻ ≫
ZNF34 ↻ ≫
RPL8 ↻ ≫
RAD23A ↻ ≫
CHD2 ↻ ≫
H4C8 ↻ ≫
UBE2M ↻ ≫
CHMP2A ↻ ≫
POU2F3 ↻ ≫
H3C13 ↻ ≫
H2BC18 ↻ ≫
SYCE2 ↻ ≫
ARNTL ↻ ≫
SPAAR ↻ ≫
PARP2 ↻ ≫
CUL7 ↻ ≫
CCDC97 ↻ ≫
PDE4A ↻ ≫
SLC3A2 ↻ ≫
CRYAA2 ↻ ≫
CRYAA ↻ ≫
MSH4 ↻ ≫
SETD5 ↻ ≫
IMPDH2 ↻ ≫
RPS2 ↻ ≫
NDUFB10 ↻ ≫
MRPS18B ↻ ≫
MTF2 ↻ ≫
H2BC4 ↻ ≫
H2AC6 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
H2BC12 ↻ ≫
H2AC12 ↻ ≫
FAM53C ↻ ≫
CDC25C ↻ ≫
EIF1 ↻ ≫
NXF1 ↻ ≫
NRAS ↻ ≫
CALM1 ↻ ≫
TBK1 ↻ ≫
SRCAP ↻ ≫
LOC730183 ↻ ≫
PPP1R3C ↻ ≫
C5orf24 ↻ ≫
H4C4 ↻ ≫
H2BC6 ↻ ≫
ABCB6 ↻ ≫
ATF4 ↻ ≫
H2BC8 ↻ ≫
H2AC8 ↻ ≫
COPS6 ↻ ≫
DNAJC9 ↻ ≫
H3C15 ↻ ≫
H3C14 ↻ ≫
H2AC19 ↻ ≫
H2AC18 ↻ ≫
EXOSC6 ↻ ≫
MPDU1 ↻ ≫
LOC100996842 ↻ ≫
CD68 ↻ ≫
PRDX1 ↻ ≫
H1-2 ↻ ≫
SPHK2 ↻ ≫
RPL18 ↻ ≫
FAM83E ↻ ≫
ZNF76 ↻ ≫
TULP3 ↻ ≫
SCGB1C2 ↻ ≫
ZNF43 ↻ ≫
ABCA3 ↻ ≫
TAF1D ↻ ≫
C11orf54 ↻ ≫
H1-5 ↻ ≫
H4C13 ↻ ≫
H3C11 ↻ ≫
H2BC21 ↻ ≫
H2AC21 ↻ ≫
H2AC20 ↻ ≫
DHRS13 ↻ ≫
H2AC16 ↻ ≫
SLC35B2 ↻ ≫
NDST2 ↻ ≫
H2BC11 ↻ ≫
H2AC11 ↻ ≫
POLG2 ↻ ≫
CPLX2 ↻ ≫
CHAC1 ↻ ≫
SYNRG ↻ ≫
TTYH2 ↻ ≫
DOCK8 ↻ ≫
WDR4 ↻ ≫
MRM1 ↻ ≫
KLF16 ↻ ≫
RPS29 ↻ ≫
TMEM230 ↻ ≫
MRTO4 ↻ ≫
EMC1 ↻ ≫
H1-3 ↻ ≫
POMZP3 ↻ ≫
VARS1 ↻ ≫
MTHFD2 ↻ ≫
SEPSECS ↻ ≫
SEC31A ↻ ≫
PDF ↻ ≫
RPL10 ↻ ≫
DYRK1B ↻ ≫
SLC35A2 ↻ ≫
SLC39A1 ↻ ≫
CRTC2 ↻ ≫
PMAIP1 ↻ ≫
MYADM ↻ ≫
MPV17 ↻ ≫
MRPL44 ↻ ≫
FBXW9 ↻ ≫
EIF4A1 ↻ ≫
ABCA7 ↻ ≫
MTG1 ↻ ≫
ADK ↻ ≫
PHF1 ↻ ≫
TMSB4X ↻ ≫
DCP1A ↻ ≫
SLC35E2B ↻ ≫
ZNF418 ↻ ≫
XRRA1 ↻ ≫
SPCS2 ↻ ≫
MAZ ↻ ≫
ARFGAP2 ↻ ≫
PDE7A ↻ ≫
HM13 ↻ ≫
AMOTL2 ↻ ≫
FAM136A ↻ ≫
STUB1 ↻ ≫
JMJD8 ↻ ≫
CAP1 ↻ ≫
CASC3 ↻ ≫
STAT6 ↻ ≫
CYP4F11 ↻ ≫
USP17L22 ↻ ≫
USP17L20 ↻ ≫
CNOT3 ↻ ≫
NPDC1 ↻ ≫
ENTPD2 ↻ ≫
IKBIP ↻ ≫
APAF1 ↻ ≫
WASF2 ↻ ≫
FCMR ↻ ≫
ZC3H7B ↻ ≫
RANGAP1 ↻ ≫
VPS52 ↻ ≫
EEF1A1 ↻ ≫
OPRL1 ↻ ≫
PLEC ↻ ≫
PARP10 ↻ ≫
ZNF233 ↻ ≫
ZNF829 ↻ ≫
ZNF568 ↻ ≫
TEX19 ↻ ≫
LINGO1 ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
SPDYE14 ↻ ≫
SPDYE10P ↻ ≫
GPR137 ↻ ≫
ZNF527 ↻ ≫
JUNB ↻ ≫
ARFGEF2 ↻ ≫
ZNF773 ↻ ≫
ELOVL2 ↻ ≫
NTN5 ↻ ≫
TLCD5 ↻ ≫
SOX8 ↻ ≫
LMF1 ↻ ≫
DGCR6L ↻ ≫
PROZ ↻ ≫
LKAAEAR1 ↻ ≫
ZKSCAN2 ↻ ≫
TP53I3 ↻ ≫
IGSF21 ↻ ≫
DMXL2 ↻ ≫
CDON ↻ ≫
WNT7B ↻ ≫
ZNF529 ↻ ≫
NUP210 ↻ ≫
ZNF571 ↻ ≫
ZNF540 ↻ ≫
NTNG2 ↻ ≫
NUF2 ↻ ≫
ZNF383 ↻ ≫
DLGAP3 ↻ ≫
TUBB ↻ ≫
SPSB1 ↻ ≫
ADARB1 ↻ ≫
EPB41 ↻ ≫
MAN2B2 ↻ ≫
MKNK2 ↻ ≫
FIS1 ↻ ≫
CLDN15 ↻ ≫
ZBTB4 ↻ ≫
TXLNB ↻ ≫
TNFRSF6B ↻ ≫
SLC35G6 ↻ ≫
POLR2A ↻ ≫
SRSF3 ↻ ≫
KDM4A ↻ ≫
TOB2 ↻ ≫
TAF8 ↻ ≫
SCFD1 ↻ ≫
CCND3 ↻ ≫
ARID5B ↻ ≫
ACTN2 ↻ ≫
ZNF71 ↻ ≫
GTF2A1 ↻ ≫
AGO3 ↻ ≫
NRSN2 ↻ ≫
AMDHD2 ↻ ≫
PXK ↻ ≫
LGR6 ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
VANGL1 ↻ ≫
ZNF790 ↻ ≫
ZNF565 ↻ ≫
ZNF146 ↻ ≫
FOXK1 ↻ ≫
TNFRSF12A ↻ ≫
THOC6 ↻ ≫
HCFC1R1 ↻ ≫
GBA ↻ ≫
HNRNPA3 ↻ ≫
SECISBP2 ↻ ≫
ACTN4 ↻ ≫
TSHZ2 ↻ ≫
NUDCD1 ↻ ≫
COX20 ↻ ≫
ZNF253 ↻ ≫
CIRBP ↻ ≫
CDCA7 ↻ ≫
ZFP30 ↻ ≫
SPRING1 ↻ ≫
RNFT2 ↻ ≫
IMPA2 ↻ ≫
UBE3C ↻ ≫
EXOC3L4 ↻ ≫
AFF1 ↻ ≫
H4C3 ↻ ≫
H1-6 ↻ ≫
GMPPB ↻ ≫
CXorf38 ↻ ≫
CHRFAM7A ↻ ≫
AMIGO3 ↻ ≫
RND1 ↻ ≫
OBSL1 ↻ ≫
INHA ↻ ≫
ZNF653 ↻ ≫
TSPAN31 ↻ ≫
H4C2 ↻ ≫
H3C2 ↻ ≫
H2AC4 ↻ ≫
CYP19A1 ↻ ≫
AGAP2 ↻ ≫
ZNF345 ↻ ≫
PPP6R3 ↻ ≫
MDC1 ↻ ≫
TTI2 ↻ ≫
PFKFB3 ↻ ≫
RPLP2 ↻ ≫
ANO10 ↻ ≫
ABHD5 ↻ ≫
RPL36A-HNRNPH2 ↻ ≫
RPL36A ↻ ≫
BTK ↻ ≫
MYLIP ↻ ≫
HES6 ↻ ≫
SMURF2 ↻ ≫
PSMA4 ↻ ≫
POR ↻ ≫
ERCC6L2 ↻ ≫
FUT11 ↻ ≫
CIC ↻ ≫
ZNF260 ↻ ≫
EBI3 ↻ ≫
CATSPERG ↻ ≫
C7orf26 ↻ ≫
ACTRT3 ↻ ≫
KLF7 ↻ ≫
CT45A9 ↻ ≫
CT45A8 ↻ ≫
CT45A2 ↻ ≫
ZNF382 ↻ ≫
KIF27 ↻ ≫
ASNS ↻ ≫
GPR89A ↻ ≫
GAGE1 ↻ ≫
EIF4A2 ↻ ≫
ZBTB9 ↻ ≫
TRAF3IP2 ↻ ≫
GFRA1 ↻ ≫
ERI1 ↻ ≫
RNF225 ↻ ≫
RASD2 ↻ ≫
H2AX ↻ ≫
MAK16 ↻ ≫
LRFN3 ↻ ≫
ITPKC ↻ ≫
IPCEF1 ↻ ≫
FAM168B ↻ ≫
COQ8B ↻ ≫
ZNF420 ↻ ≫
BCAR1 ↻ ≫
XKR7 ↻ ≫
TTC16 ↻ ≫
SMIM8 ↻ ≫
PTRH1 ↻ ≫
NUP62 ↻ ≫
IL4I1 ↻ ≫
H4C9 ↻ ≫
GCN1 ↻ ≫
E4F1 ↻ ≫
ATF5 ↻ ≫
USP17L5 ↻ ≫
USP17L30 ↻ ≫
USP17L29 ↻ ≫
USP17L28 ↻ ≫
USP17L27 ↻ ≫
USP17L26 ↻ ≫
USP17L25 ↻ ≫
USP17L24 ↻ ≫
PWWP2B ↻ ≫
LENG9 ↻ ≫
NPM1 ↻ ≫
SHBG ↻ ≫
SAT2 ↻ ≫
POLR2C ↻ ≫
GPR85 ↻ ≫
TTC17 ↻ ≫
LYPD5 ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
CCDC138 ↻ ≫
SLC16A10 ↻ ≫
PPFIA4 ↻ ≫
H3C6 ↻ ≫
CHST8 ↻ ≫
RPL5 ↻ ≫
FSCN2 ↻ ≫
CDKN3 ↻ ≫
DDAH1 ↻ ≫
CCN1 ↻ ≫
UBQLN1 ↻ ≫
PAXBP1 ↻ ≫
ZFP36 ↻ ≫
SPDYE18 ↻ ≫
PLEKHG2 ↻ ≫
ZNF793 ↻ ≫
USP42 ↻ ≫
THBS1 ↻ ≫
HCN2 ↻ ≫
LRCH4 ↻ ≫
FBXO24 ↻ ≫
RPS28 ↻ ≫
NDUFA7 ↻ ≫
MAT2B ↻ ≫
GLCCI1 ↻ ≫
ECI1 ↻ ≫
CSE1L ↻ ≫
USE1 ↻ ≫
SMAP2 ↻ ≫
SLC22A7 ↻ ≫
BCL9 ↻ ≫
TMEM223 ↻ ≫
TMEM179B ↻ ≫
ID4 ↻ ≫
FSCN1 ↻ ≫
TNS3 ↻ ≫
GLUL ↻ ≫
FOXS1 ↻ ≫
VPS16 ↻ ≫
RBMX ↻ ≫
PCED1A ↻ ≫
MYL6 ↻ ≫
H2BC15 ↻ ≫
H2AC15 ↻ ≫
CD79A ↻ ≫
SESN1 ↻ ≫
PAPOLA ↻ ≫
CEP57L1 ↻ ≫
ZNF573 ↻ ≫
IFNAR1 ↻ ≫
ECE1 ↻ ≫
DNAJB5 ↻ ≫
DENND6A ↻ ≫
ARL6IP1 ↻ ≫
AP2A2 ↻ ≫
ZBTB37 ↻ ≫
PTPRU ↻ ≫
ABCD4 ↻ ≫
ZNHIT3 ↻ ≫
SERPINA12 ↻ ≫
JCAD ↻ ≫
BCLAF1 ↻ ≫
ATXN7L2 ↻ ≫
ZNF292 ↻ ≫
VARS2 ↻ ≫
DNAH10 ↻ ≫
RNF220 ↻ ≫
GBX1 ↻ ≫
ZNF302 ↻ ≫
PHF20 ↻ ≫
TTLL3 ↻ ≫
NTSR2 ↻ ≫
KLHL12 ↻ ≫
GTF2IRD2B ↻ ≫
C10orf99 ↻ ≫
SMCO1 ↻ ≫
RSPH10B2 ↻ ≫
RSPH10B ↻ ≫
YPEL4 ↻ ≫
SUMF1 ↻ ≫
SPAG9 ↻ ≫
SEC24B ↻ ≫
JPT1 ↻ ≫
CDC14A ↻ ≫
WDR90 ↻ ≫
RRS1 ↻ ≫
NECTIN2 ↻ ≫
LRRC37A3 ↻ ≫
JUP ↻ ≫
ELAC1 ↻ ≫
ADHFE1 ↻ ≫
PLXNA4 ↻ ≫
MDP1 ↻ ≫
MCOLN1 ↻ ≫
LRP2BP ↻ ≫
EPN1 ↻ ≫
CHMP4A ↻ ≫
ANKRD37 ↻ ≫
FBF1 ↻ ≫
SCN1B ↻ ≫
TCFL5 ↻ ≫
RBBP5 ↻ ≫
POLR3D ↻ ≫
PIP5KL1 ↻ ≫
ACTB ↻ ≫
SRSF7 ↻ ≫
HMGA1 ↻ ≫
ZNF566 ↻ ≫
RPL6 ↻ ≫
DAPK3 ↻ ≫
TTYH1 ↻ ≫
CEBPA ↻ ≫
CCDC39 ↻ ≫
AGRN ↻ ≫
TRAF4 ↻ ≫
TCTE3 ↻ ≫
RPS24 ↻ ≫
RGMB ↻ ≫
POLR3A ↻ ≫
HBQ1 ↻ ≫
HBA1 ↻ ≫
ERMARD ↻ ≫
COL6A1 ↻ ≫
CHAMP1 ↻ ≫
ADGRE1 ↻ ≫
GTPBP8 ↻ ≫
EIF4EBP3 ↻ ≫
ASGR2 ↻ ≫
PSTK ↻ ≫
NOD2 ↻ ≫
CDK5R1 ↻ ≫
LOC100287896 ↻ ≫
LIPT2 ↻ ≫
TRMO ↻ ≫
PRMT1 ↻ ≫
TPD52L1 ↻ ≫
MC5R ↻ ≫
ZNF850 ↻ ≫
SELL ↻ ≫
RMI1 ↻ ≫
ING5 ↻ ≫
HNRNPK ↻ ≫
HMGA2 ↻ ≫
GOLGA6D ↻ ≫
NUCKS1 ↻ ≫
MCM7 ↻ ≫
AP4M1 ↻ ≫
KMT2B ↻ ≫
CACNA1B ↻ ≫
SLC6A6 ↻ ≫
NFYC ↻ ≫
GPANK1 ↻ ≫
CSKMT ↻ ≫
C6orf47 ↻ ≫
C11orf98 ↻ ≫
APOM ↻ ≫
TPM4 ↻ ≫
IDS ↻ ≫
CREG1 ↻ ≫
CADM4 ↻ ≫
RFC4 ↻ ≫
HEXIM2 ↻ ≫
CDKN2C ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
SNX18 ↻ ≫
LUC7L2 ↻ ≫
FMC1-LUC7L2 ↻ ≫
FMC1 ↻ ≫
SRSF6 ↻ ≫
FAM131A ↻ ≫
BIRC6 ↻ ≫
ACHE ↻ ≫
ZNF24 ↻ ≫
RAB7B ↻ ≫
PLK5 ↻ ≫
MATR3 ↻ ≫
GOLGA6L4 ↻ ≫
OIP5 ↻ ≫
NUSAP1 ↻ ≫
KDM2A ↻ ≫
EPC1 ↻ ≫
CTNNB1 ↻ ≫
IGF2BP3 ↻ ≫
WIZ ↻ ≫
UBE2QL1 ↻ ≫
H4C1 ↻ ≫
DLG4 ↻ ≫
ACADVL ↻ ≫
ADGRG1 ↻ ≫
SMN2 ↻ ≫
SMN1 ↻ ≫
FBXL5 ↻ ≫
RAB5C ↻ ≫
CCNC ↻ ≫
PTPN4 ↻ ≫
CYTH2 ↻ ≫
TRIM44 ↻ ≫
CD300A ↻ ≫
ASGR1 ↻ ≫
PIGW ↻ ≫
MYO19 ↻ ≫
LMLN ↻ ≫
IQCG ↻ ≫
IER2 ↻ ≫
TSFM ↻ ≫
SAMD4B ↻ ≫
KMT5C ↻ ≫
SLC4A8 ↻ ≫
MZF1 ↻ ≫
CLASRP ↻ ≫
TPGS2 ↻ ≫
PCBD2 ↻ ≫
ADAMTS10 ↻ ≫
NOP14 ↻ ≫
GRK4 ↻ ≫
CASP7 ↻ ≫
PLPPR2 ↻ ≫
GABARAP ↻ ≫
LRFN1 ↻ ≫
VTI1B ↻ ≫
NUDT15 ↻ ≫
RASGRF2 ↻ ≫