ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for HMGA1

Query protein: HMGA1
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX22146975 | IMR-90
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
HMGA1's Target genes

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◢ SRX10476573: Hep G2

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◢ SRX22146998: NCI-H1299

◢ HMGA1: STRING
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BAGE3 ↻ ≫
BAGE ↻ ≫
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GAGE6 ↻ ≫
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GAGE4 ↻ ≫
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TMEM273 ↻ ≫
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PRR36 ↻ ≫
OR11H12 ↻ ≫
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OR11H1 ↻ ≫
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MRAP ↻ ≫
GOLGA6B ↻ ≫
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STK38L ↻ ≫
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SGCE ↻ ≫
PEG10 ↻ ≫
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HLTF ↻ ≫
USP51 ↻ ≫
C12orf42 ↻ ≫
C5orf46 ↻ ≫
PCDHGB5 ↻ ≫
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CCZ1 ↻ ≫
GOLGA6D ↻ ≫
GOLGA6A ↻ ≫
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LOC102724219 ↻ ≫
HTR4 ↻ ≫
MINDY3 ↻ ≫
POM121C ↻ ≫
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CSNKA2IP ↻ ≫
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MEF2A ↻ ≫
OR51M1 ↻ ≫
MFSD4B ↻ ≫
MBNL1 ↻ ≫
OR4C5 ↻ ≫
TMPRSS5 ↻ ≫
CDRT15 ↻ ≫
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ATXN1 ↻ ≫
IFNAR1 ↻ ≫
HMHB1 ↻ ≫
GUCY1B1 ↻ ≫
ADAMTS20 ↻ ≫
DIRAS3 ↻ ≫
HTR3B ↻ ≫
CD34 ↻ ≫
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NR1H4 ↻ ≫
TNFSF18 ↻ ≫
SAMD4A ↻ ≫
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HIKESHI ↻ ≫
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CNKSR2 ↻ ≫
CXCL3 ↻ ≫
LRRC18 ↻ ≫
RAD54B ↻ ≫
PLEKHG1 ↻ ≫
SPECC1 ↻ ≫
MYL12A ↻ ≫
FGF9 ↻ ≫
WFDC11 ↻ ≫
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PCSK1N ↻ ≫
VPS8 ↻ ≫
MPP3 ↻ ≫
C2orf88 ↻ ≫
PGM5 ↻ ≫
APOOL ↻ ≫
NFIB ↻ ≫
MBD3L2 ↻ ≫
MBD3L3 ↻ ≫
OR2H1 ↻ ≫
KCNMB2 ↻ ≫
VIP ↻ ≫
OR4F4 ↻ ≫
KLB ↻ ≫
DNAJC5B ↻ ≫
FABP7 ↻ ≫
BICD1 ↻ ≫
CCDC125 ↻ ≫
FRMPD2 ↻ ≫
FYN ↻ ≫
TAPT1 ↻ ≫
PRSS54 ↻ ≫
C16orf78 ↻ ≫
ZNF549 ↻ ≫
OR4D1 ↻ ≫
LYZL6 ↻ ≫
DBNL ↻ ≫
ADGRL3 ↻ ≫
SOX6 ↻ ≫
RELN ↻ ≫
GPM6B ↻ ≫
UPP2 ↻ ≫
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LYZ ↻ ≫
LCE1F ↻ ≫
STK32A ↻ ≫
LY6L ↻ ≫
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TRANK1 ↻ ≫
ZFAND6 ↻ ≫
SIDT2 ↻ ≫
PLSCR2 ↻ ≫
EBNA1BP2 ↻ ≫
CFAP57 ↻ ≫
FOXR1 ↻ ≫
CCDC158 ↻ ≫
TEX30 ↻ ≫
VOPP1 ↻ ≫
ABCA13 ↻ ≫
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OR10T2 ↻ ≫
SPINK14 ↻ ≫
VCX ↻ ≫
OR10Q1 ↻ ≫
LOC100132202 ↻ ≫
OR2AG2 ↻ ≫
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CD160 ↻ ≫
ADTRP ↻ ≫
GFOD1 ↻ ≫
XPC ↻ ≫
LSM3 ↻ ≫
MINDY4B ↻ ≫
GUCY2D ↻ ≫
OR11H7 ↻ ≫
OR11H6 ↻ ≫
LIPH ↻ ≫
SGIP1 ↻ ≫
FMO5 ↻ ≫
RHOXF1 ↻ ≫
GAGE1 ↻ ≫
REEP1 ↻ ≫
KRTAP6-1 ↻ ≫
POTEH ↻ ≫
RAB6D ↻ ≫
JAKMIP2 ↻ ≫
SLC13A3 ↻ ≫
VCX3B ↻ ≫
OR13G1 ↻ ≫
ZNF732 ↻ ≫
OR3A1 ↻ ≫
PGBD4 ↻ ≫
CSTF2 ↻ ≫
FER1L6 ↻ ≫
CCND3 ↻ ≫
ACSL1 ↻ ≫
SHISA3 ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
ACTA2 ↻ ≫
OR1E3 ↻ ≫
ANKRD30BL ↻ ≫
L3MBTL4 ↻ ≫
OR6N1 ↻ ≫
OR10G6 ↻ ≫
REG1B ↻ ≫
SLC2A2 ↻ ≫
SORBS2 ↻ ≫
ANGPT1 ↻ ≫
TRIM33 ↻ ≫
DNAJC25-GNG10 ↻ ≫
DNAJC25 ↻ ≫
OR6N2 ↻ ≫
OR51B6 ↻ ≫
VN1R1 ↻ ≫
NAT1 ↻ ≫
OR1S2 ↻ ≫
SEMA6D ↻ ≫
TLR2 ↻ ≫
AIG1 ↻ ≫
SLAIN1 ↻ ≫
RIMBP2 ↻ ≫
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ELAPOR2 ↻ ≫
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THOC3 ↻ ≫
OR6C3 ↻ ≫
GPR174 ↻ ≫
ANKRD28 ↻ ≫
ZNF705E ↻ ≫
DHRS9 ↻ ≫
ZNF225 ↻ ≫
SVBP ↻ ≫
ERMAP ↻ ≫
FERMT1 ↻ ≫
FAM106C ↻ ≫
SYBU ↻ ≫
CD5 ↻ ≫
PCSK1 ↻ ≫
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GULP1 ↻ ≫
TBX4 ↻ ≫
GLCCI1 ↻ ≫
C11orf65 ↻ ≫
ELAC1 ↻ ≫
RGPD1 ↻ ≫
ADAM21 ↻ ≫
ITGA8 ↻ ≫
ZCRB1 ↻ ≫
PPHLN1 ↻ ≫
TRIM58 ↻ ≫
H2BC4 ↻ ≫
H2AC6 ↻ ≫
COL19A1 ↻ ≫
HLA-DPB1 ↻ ≫
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ZNF397 ↻ ≫
TET2 ↻ ≫
ACVR1C ↻ ≫
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OR4K3 ↻ ≫
OR4K2 ↻ ≫
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FRG2B ↻ ≫
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TLK1 ↻ ≫
ESM1 ↻ ≫
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KRT33A ↻ ≫
OR5H2 ↻ ≫
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MTRNR2L1 ↻ ≫
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RUNX1T1 ↻ ≫
CDRT15L2 ↻ ≫
EPHX4 ↻ ≫
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CITED1 ↻ ≫
DBT ↻ ≫
FAM106B ↻ ≫
PRKRA ↻ ≫
PJVK ↻ ≫
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GOLGA6C ↻ ≫
HNF4G ↻ ≫
JRKL ↻ ≫
CCDC82 ↻ ≫
TLR6 ↻ ≫
KRTAP21-3 ↻ ≫
IMMP2L ↻ ≫
RGS7BP ↻ ≫
TMEM267 ↻ ≫
NCOR1 ↻ ≫
IFNA13 ↻ ≫
FOXD4L4 ↻ ≫
VN1R4 ↻ ≫
TREML4 ↻ ≫
MDGA2 ↻ ≫
OR2T8 ↻ ≫
PRB3 ↻ ≫
INPP4B ↻ ≫
CFAP58 ↻ ≫
LCE1C ↻ ≫
LCE1B ↻ ≫
EXOC1L ↻ ≫
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OR4Q3 ↻ ≫
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BBS10 ↻ ≫
SSBP2 ↻ ≫
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MS4A6E ↻ ≫
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PCDHB11 ↻ ≫
ZNF337 ↻ ≫
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PSMA2 ↻ ≫
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LILRA5 ↻ ≫
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HMGN1 ↻ ≫
GZMB ↻ ≫
IL17D ↻ ≫
PCDHA7 ↻ ≫
PCDHA6 ↻ ≫
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IFTAP ↻ ≫
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CLVS1 ↻ ≫
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HMGB1 ↻ ≫
CA1 ↻ ≫
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GRIA2 ↻ ≫
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POTEI ↻ ≫
OR6M1 ↻ ≫
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CARD8 ↻ ≫
NET1 ↻ ≫
MYT1L ↻ ≫
DNAJC13 ↻ ≫
RELCH ↻ ≫
PIGN ↻ ≫
OR2M4 ↻ ≫
ADGRB3 ↻ ≫
NPY5R ↻ ≫
TIAM2 ↻ ≫
IKZF2 ↻ ≫
CDKN2C ↻ ≫
ZNF148 ↻ ≫
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ZMYM6 ↻ ≫
UBTFL1 ↻ ≫
SRD5A2 ↻ ≫
DTX4 ↻ ≫
TMEM237 ↻ ≫
OR52E4 ↻ ≫
NPIPA3 ↻ ≫
NPIPA2 ↻ ≫
WDR49 ↻ ≫
SYNJ2BP-COX16 ↻ ≫
SYNJ2BP ↻ ≫
IFIT2 ↻ ≫
OR8B2 ↻ ≫
HRNR ↻ ≫
GSTA1 ↻ ≫
TBC1D22A ↻ ≫
C10orf99 ↻ ≫
STS ↻ ≫
SYCP2 ↻ ≫
FAM217B ↻ ≫
POTEJ ↻ ≫
RGS13 ↻ ≫
TMED5 ↻ ≫
CCDC18 ↻ ≫
GBA3 ↻ ≫
MIA2 ↻ ≫
CXCL5 ↻ ≫
PMP2 ↻ ≫
BEX3 ↻ ≫
CYP2C8 ↻ ≫
MSTN ↻ ≫
TCEAL7 ↻ ≫
OR2A14 ↻ ≫
RNF148 ↻ ≫
MUCL1 ↻ ≫
OR6C74 ↻ ≫
OR4C6 ↻ ≫
OR4K13 ↻ ≫
CATSPERB ↻ ≫
KDF1 ↻ ≫
RFPL3 ↻ ≫
HOXD8 ↻ ≫
ITPRIP ↻ ≫
LACTB ↻ ≫
ARSF ↻ ≫
GPR25 ↻ ≫
SNX6 ↻ ≫
REG4 ↻ ≫
LRRC69 ↻ ≫
ARHGEF9 ↻ ≫
BOD1L1 ↻ ≫
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PARD3B ↻ ≫
PPP2CB ↻ ≫
EMC7 ↻ ≫
LYPD6 ↻ ≫
CPVL ↻ ≫
CHN2 ↻ ≫
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UMAD1 ↻ ≫
CDH12 ↻ ≫
ITLN1 ↻ ≫
TEKT5 ↻ ≫
OPN5 ↻ ≫
OTOGL ↻ ≫
BBS12 ↻ ≫
FOXD4L5 ↻ ≫
DCUN1D5 ↻ ≫
GPR15 ↻ ≫
MAS1L ↻ ≫
RBP2 ↻ ≫
CHEK1 ↻ ≫
HIF1A ↻ ≫
HEATR5A ↻ ≫
CRYGS ↻ ≫
TRIM51 ↻ ≫
HAPLN1 ↻ ≫
SLFN11 ↻ ≫
SUCNR1 ↻ ≫
LIG4 ↻ ≫
ABHD13 ↻ ≫
NBDY ↻ ≫
AHI1 ↻ ≫
OR2F1 ↻ ≫
PCDH20 ↻ ≫
ERMN ↻ ≫
OR2J2 ↻ ≫
TRIM36 ↻ ≫
OVCH1 ↻ ≫
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DEFB115 ↻ ≫
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KCNB2 ↻ ≫
DCDC2 ↻ ≫
PHACTR1 ↻ ≫
NDUFA5 ↻ ≫
STARD13 ↻ ≫
KCNV1 ↻ ≫
PCBP3 ↻ ≫
RUFY2 ↻ ≫
KRTAP17-1 ↻ ≫
TACR1 ↻ ≫
ETV6 ↻ ≫
CLEC4A ↻ ≫
STX2 ↻ ≫
NPIPB8 ↻ ≫
CCDC90B ↻ ≫
POTEM ↻ ≫
SLC17A8 ↻ ≫
SLC22A2 ↻ ≫
ZNF543 ↻ ≫
SPAG11B ↻ ≫
DMD ↻ ≫
DYDC2 ↻ ≫
RAB33A ↻ ≫
AIFM1 ↻ ≫
CPNE8 ↻ ≫
OXSR1 ↻ ≫
SLC41A3 ↻ ≫
PARP8 ↻ ≫
PROX1 ↻ ≫
SLC15A5 ↻ ≫
OR10R2 ↻ ≫
IL22 ↻ ≫
LOC102723623 ↻ ≫
GOLGA6L1 ↻ ≫
LMO3 ↻ ≫
FGL1 ↻ ≫
PRMT2 ↻ ≫
COX5B ↻ ≫
OR4N2 ↻ ≫
KLHL32 ↻ ≫
CNTNAP2 ↻ ≫
MEI4 ↻ ≫
KRTAP12-2 ↻ ≫
KRTAP12-3 ↻ ≫
SKAP2 ↻ ≫
IL33 ↻ ≫
OR8K1 ↻ ≫
MAGEE2 ↻ ≫
CTAGE8 ↻ ≫
CTAGE4 ↻ ≫
TRPM3 ↻ ≫
GOLIM4 ↻ ≫
FOXD4L3 ↻ ≫
SOGA3 ↻ ≫
SCN1A ↻ ≫
COL28A1 ↻ ≫
FCGR2A ↻ ≫
PIK3CA ↻ ≫
PLPPR1 ↻ ≫
TAAR5 ↻ ≫
B3GNT6 ↻ ≫
HOXB2 ↻ ≫
TBC1D31 ↻ ≫
MEIKIN ↻ ≫
PREX2 ↻ ≫
ZNF717 ↻ ≫
SMYD1 ↻ ≫
C11orf54 ↻ ≫
NPIPB6 ↻ ≫
P2RY10 ↻ ≫
CCSER2 ↻ ≫
MROH2B ↻ ≫
SLC35G2 ↻ ≫
CTSD ↻ ≫
LYZL2 ↻ ≫
COLCA2 ↻ ≫
RNFT1 ↻ ≫
PNCK ↻ ≫
TRPM2 ↻ ≫
SLC7A3 ↻ ≫
RUFY3 ↻ ≫
NPIPA5 ↻ ≫
MAML3 ↻ ≫
IGF1R ↻ ≫
GPAT3 ↻ ≫
CSTF2T ↻ ≫
TAF1D ↻ ≫
HCRTR2 ↻ ≫
ALDH8A1 ↻ ≫
SERF1B ↻ ≫
SERF1A ↻ ≫
RORB ↻ ≫
LUZP4 ↻ ≫
OR4C11 ↻ ≫
SDCCAG8 ↻ ≫
CEP170 ↻ ≫
OMD ↻ ≫
FOXD4 ↻ ≫
COL9A1 ↻ ≫
OR2G2 ↻ ≫
TAS2R16 ↻ ≫
ME1 ↻ ≫
ZNF557 ↻ ≫
CALHM4 ↻ ≫
MYBPC1 ↻ ≫
CLEC2B ↻ ≫
SOX30 ↻ ≫
KLKB1 ↻ ≫
TC2N ↻ ≫
RBM20 ↻ ≫
H4C11 ↻ ≫
TFEC ↻ ≫
IFNA8 ↻ ≫
IL22RA2 ↻ ≫
CCL23 ↻ ≫
PRRG4 ↻ ≫
UBE2K ↻ ≫
CDHR3 ↻ ≫
FAM25G ↻ ≫
FAM25C ↻ ≫
CLDN18 ↻ ≫
ACP3 ↻ ≫
REG3A ↻ ≫
PRDM10 ↻ ≫
ZFYVE26 ↻ ≫
LEPR ↻ ≫
OIP5 ↻ ≫
NUSAP1 ↻ ≫
OR7C1 ↻ ≫
OR7A5 ↻ ≫
IRX5 ↻ ≫
GPR176 ↻ ≫
DNAAF4 ↻ ≫
CD1A ↻ ≫
CD84 ↻ ≫
KCNJ1 ↻ ≫
SYNE1 ↻ ≫
FGF19 ↻ ≫
VDAC3 ↻ ≫
ANKRD18B ↻ ≫
BDH2 ↻ ≫
SYT9 ↻ ≫
SELENOP ↻ ≫
CENPP ↻ ≫
AGBL2 ↻ ≫
PMAIP1 ↻ ≫
LRIF1 ↻ ≫
LILRA2 ↻ ≫
NPIPB12 ↻ ≫
PF4 ↻ ≫
CD96 ↻ ≫
GOLGA6L22 ↻ ≫
FAM13A ↻ ≫
POTED ↻ ≫
FRMD7 ↻ ≫
FAM168A ↻ ≫
SYN1 ↻ ≫
OR51G2 ↻ ≫
OR51G1 ↻ ≫
UGT8 ↻ ≫
SNTG1 ↻ ≫
CNTN1 ↻ ≫
MMRN1 ↻ ≫
TEKT3 ↻ ≫
ZBTB20 ↻ ≫
CBY2 ↻ ≫
ZNF365 ↻ ≫
ANP32C ↻ ≫
NDST4 ↻ ≫
SPRR1A ↻ ≫
SPATA31C2 ↻ ≫
LCE6A ↻ ≫
CCNG1 ↻ ≫
ESRP1 ↻ ≫
ETDB ↻ ≫
IMPG1 ↻ ≫
OR4L1 ↻ ≫
SLC22A14 ↻ ≫
SPRR2D ↻ ≫
HDAC9 ↻ ≫
IDO2 ↻ ≫
SERPINA6 ↻ ≫
SERPINB7 ↻ ≫
EDNRB ↻ ≫
BBS9 ↻ ≫
ING1 ↻ ≫
DPY19L2 ↻ ≫
FOXI3 ↻ ≫
MYH1 ↻ ≫
FCER1A ↻ ≫
NHLH2 ↻ ≫
SPANXD ↻ ≫
GABRA2 ↻ ≫
ELOVL4 ↻ ≫
HEATR1 ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
ACTRT1 ↻ ≫
USP40 ↻ ≫
TAF7L ↻ ≫
PPP1R2C ↻ ≫
PPP1R11 ↻ ≫
POLR1H ↻ ≫
ATP1A4 ↻ ≫
HEBP2 ↻ ≫
IFT80 ↻ ≫
SMC4 ↻ ≫
ARRDC3 ↻ ≫
LECT2 ↻ ≫
IL36RN ↻ ≫
IL36B ↻ ≫
SHOC1 ↻ ≫
LAMA3 ↻ ≫
ZNF300 ↻ ≫
RNASEL ↻ ≫
MAGEB3 ↻ ≫
STN1 ↻ ≫
HCK ↻ ≫
DEFB106B ↻ ≫
DEFB106A ↻ ≫
DEFB105B ↻ ≫
DEFB105A ↻ ≫
B3GALNT2 ↻ ≫
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CCL20 ↻ ≫
KCNAB1 ↻ ≫
TBX19 ↻ ≫
BTBD10 ↻ ≫
C1orf53 ↻ ≫
KAT2B ↻ ≫
KIZ ↻ ≫
C9orf24 ↻ ≫
CKAP2L ↻ ≫
FGF1 ↻ ≫
HNF1B ↻ ≫
ATP5F1E ↻ ≫
FAM106A ↻ ≫
PRMT6 ↻ ≫
ETFRF1 ↻ ≫
CFAP94 ↻ ≫
PCM1 ↻ ≫
NCR1 ↻ ≫
SCGB1C1 ↻ ≫
OPCML ↻ ≫
MAGEA9B ↻ ≫
MAGEA9 ↻ ≫
TP53TG3F ↻ ≫
LOC102723655 ↻ ≫
TP53TG3B ↻ ≫
MEP1A ↻ ≫
MSANTD4 ↻ ≫
CRYM ↻ ≫
FOXD4L6 ↻ ≫
OR3A3 ↻ ≫
OR2A2 ↻ ≫
TCEAL4 ↻ ≫
GCSAML ↻ ≫
BEX2 ↻ ≫
GPR89B ↻ ≫
TMC3 ↻ ≫
ACTR6 ↻ ≫
PTPN2 ↻ ≫
NUAK1 ↻ ≫
WNT16 ↻ ≫
IQUB ↻ ≫
BRAF ↻ ≫
ZMYND11 ↻ ≫
RNF128 ↻ ≫
AQP9 ↻ ≫
NAALADL2 ↻ ≫
OR51S1 ↻ ≫
SVEP1 ↻ ≫
JMJD1C ↻ ≫
OR5B3 ↻ ≫
NPS ↻ ≫
REEP3 ↻ ≫
RNASE9 ↻ ≫
MBD3L2B ↻ ≫
NPFFR2 ↻ ≫
SLK ↻ ≫
LRRK2 ↻ ≫
LPXN ↻ ≫
FKBP5 ↻ ≫
BANK1 ↻ ≫
CBLN2 ↻ ≫
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TWIST2 ↻ ≫
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RHOXF2 ↻ ≫
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AGA ↻ ≫
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DPP10 ↻ ≫
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FTMT ↻ ≫
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IL7 ↻ ≫
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XK ↻ ≫
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MCTP2 ↻ ≫
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PRKX ↻ ≫
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C5 ↻ ≫
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FCGR1A ↻ ≫
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PIGH ↻ ≫
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