ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for YBX3

Query protein: YBX3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX2424152 | K-562
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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YBX3's Target genes

◢ YBX3: Average

◢ SRX2424151: K-562

◣ SRX2424152: K-562

◢ YBX3: STRING
SPATC1L ↻ ≫
RBM48 ↻ ≫
PEX1 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
SP2 ↻ ≫
SFSWAP ↻ ≫
DNM2 ↻ ≫
ART1 ↻ ≫
ZNF830 ↻ ≫
CCT6B ↻ ≫
SUPT7L ↻ ≫
SLC4A1AP ↻ ≫
GET3 ↻ ≫
PPWD1 ↻ ≫
CENPK ↻ ≫
GPN2 ↻ ≫
GPATCH3 ↻ ≫
TRMO ↻ ≫
NAGPA ↻ ≫
UBE3B ↻ ≫
MTRNR2L1 ↻ ≫
NUP214 ↻ ≫
SMG8 ↻ ≫
RAB5B ↻ ≫
PMEL ↻ ≫
CDK2 ↻ ≫
VAMP2 ↻ ≫
PER1 ↻ ≫
SP1 ↻ ≫
EVI5L ↻ ≫
RBM42 ↻ ≫
GATB ↻ ≫
OSBP ↻ ≫
ERAL1 ↻ ≫
SUMF1 ↻ ≫
PER2 ↻ ≫
LRCH4 ↻ ≫
FBXO24 ↻ ≫
VPS50 ↻ ≫
HEPACAM2 ↻ ≫
IDH3B ↻ ≫
RRP15 ↻ ≫
WASHC2C ↻ ≫
THRA ↻ ≫
MED24 ↻ ≫
GTF3C5 ↻ ≫
GTPBP6 ↻ ≫
SYP ↻ ≫
PRICKLE3 ↻ ≫
ZNF408 ↻ ≫
ARHGAP1 ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
TMEM199 ↻ ≫
SEBOX ↻ ≫
POLDIP2 ↻ ≫
CIC ↻ ≫
TMEM242 ↻ ≫
MTBP ↻ ≫
MRPL13 ↻ ≫
SLC25A25 ↻ ≫
NAIF1 ↻ ≫
ZC3HC1 ↻ ≫
ZNF687 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
STX5 ↻ ≫
TAF12 ↻ ≫
RBM19 ↻ ≫
NLK ↻ ≫
SLC25A53 ↻ ≫
FAM199X ↻ ≫
PSMB7 ↻ ≫
DNAJB12 ↻ ≫
RFX1 ↻ ≫
NOL8 ↻ ≫
CENPP ↻ ≫
NGDN ↻ ≫
ZBTB45 ↻ ≫
SLC27A5 ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
KBTBD4 ↻ ≫
FAM180B ↻ ≫
CRY1 ↻ ≫
ZNF165 ↻ ≫
OR1F12 ↻ ≫
KHSRP ↻ ≫
CCDC59 ↻ ≫
CACTIN ↻ ≫
KIF2C ↻ ≫
PDE6D ↻ ≫
COPS7B ↻ ≫
POLR3F ↻ ≫
DZANK1 ↻ ≫
PHRF1 ↻ ≫
WDR83OS ↻ ≫
WDR83 ↻ ≫
MAN2B1 ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
SHC1 ↻ ≫
FLAD1 ↻ ≫
CKS1B ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
XAB2 ↻ ≫
STXBP2 ↻ ≫
PCP2 ↻ ≫
ISY1-RAB43 ↻ ≫
ISY1 ↻ ≫
TOM1L2 ↻ ≫
DRC3 ↻ ≫
RNASEH2C ↻ ≫
KAT5 ↻ ≫
SLC35B1 ↻ ≫
SPNS1 ↻ ≫
LAT ↻ ≫
VPS33A ↻ ≫
CWF19L1 ↻ ≫
MRPS15 ↻ ≫
ZFYVE26 ↻ ≫
RAD51B ↻ ≫
COMMD4 ↻ ≫
ANKHD1-EIF4EBP3 ↻ ≫
ANKHD1 ↻ ≫
MED6 ↻ ≫
TFPT ↻ ≫
PRPF31 ↻ ≫
HEXA ↻ ≫
EIF3F ↻ ≫
SAP30BP ↻ ≫
RECQL5 ↻ ≫
SSNA1 ↻ ≫
ANAPC2 ↻ ≫
HAGH ↻ ≫
FAHD1 ↻ ≫
MRPL39 ↻ ≫
POLDIP3 ↻ ≫
ABHD2 ↻ ≫
TNPO3 ↻ ≫
BTNL9 ↻ ≫
HBP1 ↻ ≫
BAZ2A ↻ ≫
ATP5F1B ↻ ≫
SUPV3L1 ↻ ≫
ZSWIM1 ↻ ≫
SPATA25 ↻ ≫
NEURL2 ↻ ≫
CTSA ↻ ≫
TOP3A ↻ ≫
SMCR8 ↻ ≫
IPO11 ↻ ≫
DIMT1 ↻ ≫
ATG14 ↻ ≫
PLEKHN1 ↻ ≫
NOC2L ↻ ≫
KLHL17 ↻ ≫
OAZ3 ↻ ≫
MRPL9 ↻ ≫
CRYAA2 ↻ ≫
CRYAA ↻ ≫
DBNDD2 ↻ ≫
CDC23 ↻ ≫
PARP16 ↻ ≫
MRPL45 ↻ ≫
PUS10 ↻ ≫
PEX13 ↻ ≫
SPSB3 ↻ ≫
MRPS34 ↻ ≫
EME2 ↻ ≫
LAMP1 ↻ ≫
C5orf51 ↻ ≫
RAB11B ↻ ≫
TEPSIN ↻ ≫
NDUFAF8 ↻ ≫
PIH1D2 ↻ ≫
NKAPD1 ↻ ≫
YIPF2 ↻ ≫
TIMM29 ↻ ≫
EAPP ↻ ≫
C8orf33 ↻ ≫
PSPN ↻ ≫
ALKBH7 ↻ ≫
STT3A ↻ ≫
TRIAP1 ↻ ≫
COX6A1 ↻ ≫
AK2 ↻ ≫
TRMT61B ↻ ≫
TMEM107 ↻ ≫
ZNF561 ↻ ≫
PPT1 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
RPTOR ↻ ≫
PPIL4 ↻ ≫
PSMC3 ↻ ≫
ABT1 ↻ ≫
MAP3K7 ↻ ≫
RGS14 ↻ ≫
LMAN2 ↻ ≫
SSBP1 ↻ ≫
DUS2 ↻ ≫
DPEP2NB ↻ ≫
DDX28 ↻ ≫
ZDHHC6 ↻ ≫
VTI1A ↻ ≫
HNRNPL ↻ ≫
CRBN ↻ ≫
TBCK ↻ ≫
AIMP1 ↻ ≫
TCERG1 ↻ ≫
LIN52 ↻ ≫
ALDH6A1 ↻ ≫
DCAF7 ↻ ≫
GSC2 ↻ ≫
VARS2 ↻ ≫
GTF2H4 ↻ ≫
WASHC5 ↻ ≫
NSMCE2 ↻ ≫
TRIP10 ↻ ≫
GPR108 ↻ ≫
EIF1AD ↻ ≫
CST6 ↻ ≫
BANF1 ↻ ≫
METTL15 ↻ ≫
KIF18A ↻ ≫
VIRMA ↻ ≫
TGFBRAP1 ↻ ≫
C2orf49 ↻ ≫
MRPL1 ↻ ≫
MTOR ↻ ≫
DNAJC11 ↻ ≫
NDUFB3 ↻ ≫
FAM126B ↻ ≫
TIMM22 ↻ ≫
SENP1 ↻ ≫
PFKM ↻ ≫
RAD51AP1 ↻ ≫
C12orf4 ↻ ≫
UQCC1 ↻ ≫
PRR5L ↻ ≫
COMMD9 ↻ ≫
TSR2 ↻ ≫
RDH5 ↻ ≫
ITGA7 ↻ ≫
BLOC1S1 ↻ ≫
FAM149B1 ↻ ≫
ECD ↻ ≫
NXT2 ↻ ≫
WDR97 ↻ ≫
MAF1 ↻ ≫
CYC1 ↻ ≫
TRMT1 ↻ ≫
NACC1 ↻ ≫
STIP1 ↻ ≫
TPRN ↻ ≫
TMEM203 ↻ ≫
NDOR1 ↻ ≫
PHF5A ↻ ≫
ACO2 ↻ ≫
FAM162A ↻ ≫
CCDC58 ↻ ≫
ZSWIM3 ↻ ≫
ACOT8 ↻ ≫
LARS2 ↻ ≫
KAT6B ↻ ≫
STX18 ↻ ≫
CDKAL1 ↻ ≫
YJU2 ↻ ≫
ZNF143 ↻ ≫
NMNAT1 ↻ ≫
LZIC ↻ ≫
KRR1 ↻ ≫
TRAPPC6A ↻ ≫
BLOC1S3 ↻ ≫
RANBP6 ↻ ≫
KIAA2026 ↻ ≫
MRPS18C ↻ ≫
HELQ ↻ ≫
FZR1 ↻ ≫
DOHH ↻ ≫
USP17L22 ↻ ≫
USP17L21 ↻ ≫
USP17L20 ↻ ≫
USP17L12 ↻ ≫
TMEM208 ↻ ≫
LRRC29 ↻ ≫
ATP5IF1 ↻ ≫
CDK11B ↻ ≫
TOMM22 ↻ ≫
TRUB2 ↻ ≫
COQ4 ↻ ≫
UBIAD1 ↻ ≫
NUP160 ↻ ≫
TMX2 ↻ ≫
MED19 ↻ ≫
SPAG7 ↻ ≫
DOLPP1 ↻ ≫
SMG7 ↻ ≫
VPS52 ↻ ≫
RPS18 ↻ ≫
LSM5 ↻ ≫
B3GALT4 ↻ ≫
AVL9 ↻ ≫
FAM204A ↻ ≫
TMEM41A ↻ ≫
PSME3 ↻ ≫
BECN1 ↻ ≫
WDR24 ↻ ≫
STUB1 ↻ ≫
JMJD8 ↻ ≫
EMC4 ↻ ≫
C16orf89 ↻ ≫
ALG1 ↻ ≫
UBL5 ↻ ≫
FBXL12 ↻ ≫
TRIP4 ↻ ≫
PCLAF ↻ ≫
VPS11 ↻ ≫
C12orf43 ↻ ≫
DIABLO ↻ ≫
TOMM40 ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
WDR70 ↻ ≫
NUP155 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
H2AZ2 ↻ ≫
OXNAD1 ↻ ≫
DPH3 ↻ ≫
CSTF2 ↻ ≫
PWWP2A ↻ ≫
USP17L5 ↻ ≫
USP17L30 ↻ ≫
USP17L29 ↻ ≫
USP17L28 ↻ ≫
USP17L27 ↻ ≫
USP17L26 ↻ ≫
USP17L25 ↻ ≫
USP17L24 ↻ ≫
NFATC2IP ↻ ≫
NUF2 ↻ ≫
SPAAR ↻ ≫
HRCT1 ↻ ≫
PPP1R11 ↻ ≫
POLR1H ↻ ≫
EIF2AK3 ↻ ≫
USHBP1 ↻ ≫
BABAM1 ↻ ≫
DNTTIP2 ↻ ≫
TTI2 ↻ ≫
CCAR2 ↻ ≫
C8orf58 ↻ ≫
HDGFL2 ↻ ≫
CWC25 ↻ ≫
NOP16 ↻ ≫
HIGD2A ↻ ≫
FEM1A ↻ ≫
RBM28 ↻ ≫
MRPL53 ↻ ≫
MOGS ↻ ≫
AP1G1 ↻ ≫
SREK1IP1 ↻ ≫
CWC27 ↻ ≫
URM1 ↻ ≫
RNF5 ↻ ≫
AGPAT1 ↻ ≫
AGER ↻ ≫
KCTD5 ↻ ≫
AURKAIP1 ↻ ≫
NPM3 ↻ ≫
FGF8 ↻ ≫
ZCCHC4 ↻ ≫
TMEM101 ↻ ≫
RBM8A ↻ ≫
PEX11B ↻ ≫
ALKBH3 ↻ ≫
BRIX1 ↻ ≫
ATG9B ↻ ≫
ABCB8 ↻ ≫
PRMT1 ↻ ≫
NDUFAF2 ↻ ≫
ERCC8 ↻ ≫
ZBTB32 ↻ ≫
FCMR ↻ ≫
ERICH4 ↻ ≫
DMAC2 ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
ENPP3 ↻ ≫
MRM3 ↻ ≫
GLOD4 ↻ ≫
UNKL ↻ ≫
C16orf91 ↻ ≫
HAX1 ↻ ≫
SNRPC ↻ ≫
TEF ↻ ≫
FASTKD2 ↻ ≫
AARSD1 ↻ ≫
NDUFB5 ↻ ≫
MRPL47 ↻ ≫
KMT5C ↻ ≫
ZNF595 ↻ ≫
TOM1 ↻ ≫
TMEM126B ↻ ≫
DLG2 ↻ ≫
MOCS3 ↻ ≫
DPM1 ↻ ≫
TMEM128 ↻ ≫
PAK1IP1 ↻ ≫
C6orf52 ↻ ≫
DDX49 ↻ ≫
COPE ↻ ≫
ECE1 ↻ ≫
ZNF576 ↻ ≫
IRGQ ↻ ≫
PEF1 ↻ ≫
TACO1 ↻ ≫
NUP107 ↻ ≫
TIMM21 ↻ ≫
LYRM4 ↻ ≫
FBXO15 ↻ ≫
FARS2 ↻ ≫
PPIL2 ↻ ≫
DBP ↻ ≫
CA11 ↻ ≫
UBE2L3 ↻ ≫
TOP3B ↻ ≫
RIMBP3C ↻ ≫
RIMBP3B ↻ ≫
TBL3 ↻ ≫
RPS2 ↻ ≫
RNF151 ↻ ≫
NOXO1 ↻ ≫
NDUFAF1 ↻ ≫
GTF2H3 ↻ ≫
EIF2B1 ↻ ≫
EEF1AKNMT ↻ ≫
RTTN ↻ ≫
OLFML2A ↻ ≫
NR6A1 ↻ ≫
FAM187A ↻ ≫
EFTUD2 ↻ ≫
CCDC103 ↻ ≫
MRTO4 ↻ ≫
EMC1 ↻ ≫
TSN ↻ ≫
DOK3 ↻ ≫
DDX41 ↻ ≫
TM9SF4 ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
PHF19 ↻ ≫
COX16 ↻ ≫
U2SURP ↻ ≫
MRPS11 ↻ ≫
MRPL46 ↻ ≫
DDX23 ↻ ≫
ST3GAL4 ↻ ≫
MED20 ↻ ≫
BYSL ↻ ≫
SLC6A19 ↻ ≫
FANCD2 ↻ ≫
RFXANK ↻ ≫
BORCS8 ↻ ≫
PRCD ↻ ≫
CYGB ↻ ≫
COL6A1 ↻ ≫
EBF1 ↻ ≫
SEC13 ↻ ≫
NUP42 ↻ ≫
ZSCAN22 ↻ ≫
BMT2 ↻ ≫
ANP32E ↻ ≫
DCTN4 ↻ ≫
ZNF181 ↻ ≫
NOC4L ↻ ≫
DDX51 ↻ ≫
FBH1 ↻ ≫
ANKRD16 ↻ ≫
C3 ↻ ≫
ZBTB3 ↻ ≫
POLR2G ↻ ≫
ZMAT2 ↻ ≫
HARS2 ↻ ≫
HARS1 ↻ ≫
CNOT3 ↻ ≫
ZFAND2A ↻ ≫
AFAP1 ↻ ≫
ZCCHC24 ↻ ≫
MRPL55 ↻ ≫
TRAF2 ↻ ≫
CRY2 ↻ ≫
TMEM160 ↻ ≫
LGR6 ↻ ≫
WASHC2A ↻ ≫
RPEL1 ↻ ≫
PIRT ↻ ≫
TMEM98 ↻ ≫
ZNF48 ↻ ≫
TBC1D10B ↻ ≫
MYLPF ↻ ≫
CENPA ↻ ≫
MRPL21 ↻ ≫
IGHMBP2 ↻ ≫
WNT7B ↻ ≫
GATAD2A ↻ ≫
LZTR1 ↻ ≫
TSR3 ↻ ≫
GNPTG ↻ ≫
MZT2A ↻ ≫
RALGDS ↻ ≫
PODNL1 ↻ ≫
DCAF15 ↻ ≫
ZASP ↻ ≫
SEPTIN5 ↻ ≫
SAP25 ↻ ≫
GP1BB ↻ ≫
PEPD ↻ ≫
PACSIN3 ↻ ≫
ARFGAP2 ↻ ≫
HNRNPC ↻ ≫
CYTH2 ↻ ≫
HPS5 ↻ ≫
GTF2H1 ↻ ≫
ODF3L2 ↻ ≫
EIF4A1 ↻ ≫
CD68 ↻ ≫
BRD7 ↻ ≫
BPGM ↻ ≫
FOXK1 ↻ ≫
C22orf39 ↻ ≫
TLCD5 ↻ ≫
KDM4B ↻ ≫
ARHGEF12 ↻ ≫
SMU1 ↻ ≫
ZNRD2 ↻ ≫
FAM89B ↻ ≫
EHBP1L1 ↻ ≫
ST7 ↻ ≫
DNAJC30 ↻ ≫
BUD23 ↻ ≫
TOR4A ↻ ≫
RPS28 ↻ ≫
PLK5 ↻ ≫
NDUFA7 ↻ ≫
BRF2 ↻ ≫
CEP192 ↻ ≫
MRPL27 ↻ ≫
EME1 ↻ ≫
NRSN2 ↻ ≫
ENSA ↻ ≫
EDC3 ↻ ≫
DHX40 ↻ ≫
RPS8 ↻ ≫
MYBL2 ↻ ≫
TSFM ↻ ≫
SLC25A42 ↻ ≫
SMPD4 ↻ ≫
MZT2B ↻ ≫
DHDDS ↻ ≫
CASC3 ↻ ≫
GPR137 ↻ ≫
CDK11A ↻ ≫
TRPM5 ↻ ≫
SF3B5 ↻ ≫
PUM3 ↻ ≫
CCDC187 ↻ ≫
PPP1R3F ↻ ≫
OCA2 ↻ ≫
FOXP3 ↻ ≫
ZC3HAV1 ↻ ≫
LINGO1 ↻ ≫
EXOC3L4 ↻ ≫
MFN2 ↻ ≫
GGTLC2 ↻ ≫
PDCD7 ↻ ≫
KAT7 ↻ ≫
SEPTIN4 ↻ ≫
MTMR4 ↻ ≫
ADGRG1 ↻ ≫
TPP1 ↻ ≫
TEKT2 ↻ ≫
TAF10 ↻ ≫
SIKE1 ↻ ≫
ADPRS ↻ ≫
G3BP1 ↻ ≫
FAM89A ↻ ≫
NHP2 ↻ ≫
APBA2 ↻ ≫
PCGF3 ↻ ≫
SETD3 ↻ ≫
RPUSD1 ↻ ≫
MKS1 ↻ ≫
CHTF18 ↻ ≫
CCNK ↻ ≫
ADARB1 ↻ ≫
MEGF6 ↻ ≫
FSCN2 ↻ ≫
SRPRA ↻ ≫
P2RX6 ↻ ≫
GPR84 ↻ ≫
BTN2A2 ↻ ≫
POLA1 ↻ ≫
PINX1 ↻ ≫
TBXA2R ↻ ≫
ZNHIT6 ↻ ≫
VANGL1 ↻ ≫
TBX1 ↻ ≫
MUC5AC ↻ ≫
NFIC ↻ ≫
SPACA6 ↻ ≫
TTC26 ↻ ≫
THEG ↻ ≫
TCTEX1D2 ↻ ≫
KLF1 ↻ ≫
GCDH ↻ ≫
DNASE2 ↻ ≫
ZNF17 ↻ ≫
UBE2I ↻ ≫
TNNI2 ↻ ≫
TNFSF9 ↻ ≫
LSP1 ↻ ≫
SPRING1 ↻ ≫
RNFT2 ↻ ≫
MAG ↻ ≫
ESPNL ↻ ≫
ITGB3BP ↻ ≫
EIF4B ↻ ≫
EFCAB7 ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
MSS51 ↻ ≫
CWF19L2 ↻ ≫
PCOLCE ↻ ≫
MTIF2 ↻ ≫
MOSPD3 ↻ ≫
SIN3A ↻ ≫
BBC3 ↻ ≫
PAPLN ↻ ≫
STX2 ↻ ≫
DLGAP4 ↻ ≫
CYB561D1 ↻ ≫
ATXN7L2 ↻ ≫
ATP6V1C1 ↻ ≫
OSBPL5 ↻ ≫
KCTD14 ↻ ≫
ADI1 ↻ ≫
CBLL1 ↻ ≫
COL6A2 ↻ ≫
ZNF529 ↻ ≫
NTN5 ↻ ≫
CRKL ↻ ≫
CDHR1 ↻ ≫
C14orf119 ↻ ≫
ACIN1 ↻ ≫
LENG1 ↻ ≫
ERVH48-1 ↻ ≫
SPSB1 ↻ ≫
GAGE12J ↻ ≫
GAGE12G ↻ ≫
GAGE12D ↻ ≫
NFX1 ↻ ≫
HPCAL1 ↻ ≫
CCDC174 ↻ ≫
CALML5 ↻ ≫
UCN3 ↻ ≫
OSCAR ↻ ≫
NDUFA3 ↻ ≫
HACL1 ↻ ≫
BTD ↻ ≫
SP8 ↻ ≫
GCNT2 ↻ ≫
NKX1-1 ↻ ≫
RAB7B ↻ ≫
FAF1 ↻ ≫
CHRNE ↻ ≫
CDKN2C ↻ ≫
C17orf107 ↻ ≫
MRI1 ↻ ≫
C19orf53 ↻ ≫
PRR36 ↻ ≫
CASQ1 ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
TBC1D22A ↻ ≫