ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CBX3

Query protein: CBX3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX6712572 | MCF-7
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
CBX3's Target genes

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◢ SRX3010076: GM12878

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◢ SRX822010: T-47D

◢ CBX3: STRING
PSMD6 ↻ ≫
APPBP2 ↻ ≫
EAPP ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
H3C15 ↻ ≫
H3C14 ↻ ≫
H2AC19 ↻ ≫
H2AC18 ↻ ≫
NCOA3 ↻ ≫
NRAS ↻ ≫
TEX14 ↻ ≫
RAD51C ↻ ≫
FAM227B ↻ ≫
DTWD1 ↻ ≫
ZNF217 ↻ ≫
TUBD1 ↻ ≫
RPS6KB1 ↻ ≫
BCAS4 ↻ ≫
RINT1 ↻ ≫
PUS7 ↻ ≫
XBP1 ↻ ≫
ARFGEF2 ↻ ≫
PFDN4 ↻ ≫
TRIM37 ↻ ≫
USP32 ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
H4C11 ↻ ≫
H2BC15 ↻ ≫
H2AC15 ↻ ≫
HEATR6 ↻ ≫
SPPL2A ↻ ≫
PPM1D ↻ ≫
MUC20 ↻ ≫
H2BC21 ↻ ≫
H2AC21 ↻ ≫
H2AC20 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
STX5 ↻ ≫
ARAP1 ↻ ≫
TRIM33 ↻ ≫
ZBTB45 ↻ ≫
TRIM28 ↻ ≫
RABIF ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
C7orf26 ↻ ≫
JUND ↻ ≫
IQCN ↻ ≫
PARD6B ↻ ≫
ATXN7 ↻ ≫
SLC7A5 ↻ ≫
MTHFS ↻ ≫
H2BC14 ↻ ≫
H2AC14 ↻ ≫
KRT18 ↻ ≫
IGFBP4 ↻ ≫
MYO5C ↻ ≫
PMPCB ↻ ≫
UNK ↻ ≫
H3-3B ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
SGF29 ↻ ≫
BMP7 ↻ ≫
CYRIB ↻ ≫
HNRNPH1 ↻ ≫
SCRIB ↻ ≫
DPAGT1 ↻ ≫
H2AX ↻ ≫
HMBS ↻ ≫
HIPK1 ↻ ≫
MAPK6 ↻ ≫
RPLP1 ↻ ≫
TRPM7 ↻ ≫
MAT2A ↻ ≫
H3C13 ↻ ≫
H2BC18 ↻ ≫
HEXD ↻ ≫
IER3 ↻ ≫
FLOT1 ↻ ≫
TMEM104 ↻ ≫
NAT9 ↻ ≫
TMEM167B ↻ ≫
ZBTB4 ↻ ≫
SLC35G6 ↻ ≫
POLR2A ↻ ≫
GABPB1 ↻ ≫
GRHL2 ↻ ≫
H3C4 ↻ ≫
H4C5 ↻ ≫
H2BC7 ↻ ≫
H2AC7 ↻ ≫
SQSTM1 ↻ ≫
RNF32 ↻ ≫
CKS2 ↻ ≫
SECISBP2 ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
ORC5 ↻ ≫
RPS3 ↻ ≫
KRT8 ↻ ≫
TFRC ↻ ≫
MCL1 ↻ ≫
KMT2E ↻ ≫
MICU2 ↻ ≫
TOB1 ↻ ≫
KRT19 ↻ ≫
UBC ↻ ≫
KRT15 ↻ ≫
PARP10 ↻ ≫
PCIF1 ↻ ≫
GRINA ↻ ≫
FAM133B ↻ ≫
ASNS ↻ ≫
THEM4 ↻ ≫
ZBTB38 ↻ ≫
GET3 ↻ ≫
THOC7 ↻ ≫
TMOD3 ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
FUS ↻ ≫
SIKE1 ↻ ≫
H2BC5 ↻ ≫
H1-4 ↻ ≫
DHX9 ↻ ≫
CALM1 ↻ ≫
C8orf76 ↻ ≫
SEMA3C ↻ ≫
USP8 ↻ ≫
LRRC37A3 ↻ ≫
TFF1 ↻ ≫
IMPACT ↻ ≫
FAM91A1 ↻ ≫
RNF139 ↻ ≫
ATP5F1A ↻ ≫
RMND5B ↻ ≫
ZMYND8 ↻ ≫
MAN1A2 ↻ ≫
SEC62 ↻ ≫
BCAS2 ↻ ≫
EXOSC6 ↻ ≫
MYL12A ↻ ≫
ACTB ↻ ≫
MRPS18B ↻ ≫
ATAT1 ↻ ≫
IER5L ↻ ≫
RNFT1 ↻ ≫
BRIP1 ↻ ≫
ZKSCAN2 ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
CCDC71L ↻ ≫
UTP4 ↻ ≫
DERPC ↻ ≫
CHTF8 ↻ ≫
SYCE2 ↻ ≫
ZNF316 ↻ ≫
ARPP19 ↻ ≫
CDYL ↻ ≫
NAPEPLD ↻ ≫
CLN6 ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
EDC4 ↻ ≫
FIS1 ↻ ≫
CLDN15 ↻ ≫
TIPARP ↻ ≫
OAZ1 ↻ ≫
ZNF398 ↻ ≫
SRSF2 ↻ ≫
MFSD11 ↻ ≫
METTL23 ↻ ≫
JMJD6 ↻ ≫
VARS2 ↻ ≫
GTF2H4 ↻ ≫
SRSF7 ↻ ≫
SYPL1 ↻ ≫
TMEM185B ↻ ≫
UQCC3 ↻ ≫
LBHD1 ↻ ≫
CSKMT ↻ ≫
C11orf98 ↻ ≫
FAM131A ↻ ≫
YWHAG ↻ ≫
KLHL12 ↻ ≫
ADCK2 ↻ ≫
AKAP8 ↻ ≫
RBM14-RBM4 ↻ ≫
RBM14 ↻ ≫
ZNF425 ↻ ≫
LSMEM1 ↻ ≫
ACAP2 ↻ ≫
CCZ1B ↻ ≫
PRMT6 ↻ ≫
AP4E1 ↻ ≫
ZNF23 ↻ ≫
TMEM183A ↻ ≫
MYL12B ↻ ≫
TMEM168 ↻ ≫
PNMA1 ↻ ≫
RPLP0 ↻ ≫
GCN1 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
GNPNAT1 ↻ ≫
TMBIM4 ↻ ≫
C6orf226 ↻ ≫
KCTD18 ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
VPS9D1 ↻ ≫
PRELID3A ↻ ≫
THOC3 ↻ ≫
MRPL2 ↻ ≫
KLC4 ↻ ≫
CUL7 ↻ ≫
LYPLAL1 ↻ ≫
DYNLL2 ↻ ≫
RRP36 ↻ ≫
MEA1 ↻ ≫
KLHDC3 ↻ ≫
OTUD7B ↻ ≫
PLCG1 ↻ ≫
H4C8 ↻ ≫
S100A13 ↻ ≫
S100A1 ↻ ≫
CHTOP ↻ ≫
TRIM25 ↻ ≫
RHOB ↻ ≫
JUP ↻ ≫
NTMT1 ↻ ≫
C9orf50 ↻ ≫
CFAP410 ↻ ≫
IBA57 ↻ ≫
FRS2 ↻ ≫
LYSMD2 ↻ ≫
ANGEL1 ↻ ≫
HSP90AB1 ↻ ≫
SLC35B2 ↻ ≫
SLC39A13 ↻ ≫
HOOK2 ↻ ≫
RMDN1 ↻ ≫
CPNE3 ↻ ≫
PPDPF ↻ ≫
DRD4 ↻ ≫
UBE3C ↻ ≫
PREX1 ↻ ≫
USP31 ↻ ≫
POLG2 ↻ ≫
DDX5 ↻ ≫
B4GALNT3 ↻ ≫
EIF1 ↻ ≫
LOC100287896 ↻ ≫
LIPT2 ↻ ≫
C15orf39 ↻ ≫
THAP5 ↻ ≫
DNAJB9 ↻ ≫
PARPBP ↻ ≫
NUP37 ↻ ≫
MAN2C1 ↻ ≫
ZNF706 ↻ ≫
GPR89B ↻ ≫
FAM3C ↻ ≫
GAPDH ↻ ≫
C12orf66 ↻ ≫
GET4 ↻ ≫
NOM1 ↻ ≫
MRPS21 ↻ ≫
TBX2 ↻ ≫
RRNAD1 ↻ ≫
ISG20L2 ↻ ≫
ENOSF1 ↻ ≫
SPATA17 ↻ ≫
GPATCH2 ↻ ≫
STPG3 ↻ ≫
FAM166A ↻ ≫
RBM4 ↻ ≫
BRD2 ↻ ≫
TUBB4B ↻ ≫
NAA60 ↻ ≫
MOAP1 ↻ ≫
TMEM251 ↻ ≫
DUS4L-BCAP29 ↻ ≫
DUS4L ↻ ≫
COG5 ↻ ≫
KANSL2 ↻ ≫
CHD2 ↻ ≫
TCTE3 ↻ ≫
ERMARD ↻ ≫
CCT2 ↻ ≫
NOTCH2NLC ↻ ≫
VPS28 ↻ ≫
RPL17-C18orf32 ↻ ≫
RPL17 ↻ ≫
C18orf32 ↻ ≫
RNF115 ↻ ≫
POLR3C ↻ ≫
RAP1B ↻ ≫
MXD1 ↻ ≫
GTF2IRD2B ↻ ≫
NKIRAS1 ↻ ≫
RPL15 ↻ ≫
FAM168B ↻ ≫
RAN ↻ ≫
CLTC ↻ ≫
ZMYM5 ↻ ≫
CIRBP ↻ ≫
FAM174C ↻ ≫
EIF5 ↻ ≫
EFNA2 ↻ ≫
HES1 ↻ ≫
EBAG9 ↻ ≫
ATXN7L3B ↻ ≫
SIAH2 ↻ ≫
NARF ↻ ≫
FZD6 ↻ ≫
CYBC1 ↻ ≫
CALR ↻ ≫
FARSA ↻ ≫
C5orf24 ↻ ≫
INSIG1 ↻ ≫
H4C13 ↻ ≫
H3C11 ↻ ≫
H2AC16 ↻ ≫
H1-5 ↻ ≫
NBN ↻ ≫
CCNL1 ↻ ≫
RASEF ↻ ≫
SEH1L ↻ ≫
MMAA ↻ ≫
EEF2 ↻ ≫
EIF3A ↻ ≫
ERN1 ↻ ≫
SLC35F5 ↻ ≫
NELFCD ↻ ≫
GATAD1 ↻ ≫
SNX6 ↻ ≫
LUC7L2 ↻ ≫
RPS3A ↻ ≫
SSBP2 ↻ ≫
ZNF212 ↻ ≫
FTH1 ↻ ≫
DYNC2I1 ↻ ≫
ESYT2 ↻ ≫
POLE4 ↻ ≫
BAMBI ↻ ≫
ELK4 ↻ ≫
RPS19 ↻ ≫
LEO1 ↻ ≫
NPEPL1 ↻ ≫
RPL13 ↻ ≫
YEATS4 ↻ ≫
DTD1 ↻ ≫
CAND1 ↻ ≫
CTDSP1 ↻ ≫
TNIP2 ↻ ≫
BDKRB1 ↻ ≫
BCAS3 ↻ ≫
GNAS ↻ ≫
FLYWCH1 ↻ ≫
CRBN ↻ ≫
AGK ↻ ≫
POLR3B ↻ ≫
NPM1 ↻ ≫
C10orf95 ↻ ≫
PAK2 ↻ ≫
RAB21 ↻ ≫
STARD7 ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
DDX59 ↻ ≫
BCAP29 ↻ ≫
AMZ2 ↻ ≫
RAD50 ↻ ≫
BCKDK ↻ ≫
KAT8 ↻ ≫
SLC9A3R1 ↻ ≫
CSRP1 ↻ ≫
PNPLA7 ↻ ≫
MRPL41 ↻ ≫
SH3BP5 ↻ ≫
DYNLL1 ↻ ≫
ZNF248 ↻ ≫
MTDH ↻ ≫
FKBP4 ↻ ≫
PAPOLA ↻ ≫
PRKRA ↻ ≫
PJVK ↻ ≫
ATR ↻ ≫
FAM214A ↻ ≫
CBX5 ↻ ≫
HNRNPA1 ↻ ≫
COMMD2 ↻ ≫
UPF1 ↻ ≫
MDM4 ↻ ≫
CREBZF ↻ ≫
RPL23 ↻ ≫
ACBD6 ↻ ≫
CYP2W1 ↻ ≫
COX19 ↻ ≫
OVCA2 ↻ ≫
TRIM27 ↻ ≫
BPTF ↻ ≫
RUFY1 ↻ ≫
TGFBRAP1 ↻ ≫
C2orf49 ↻ ≫
PPFIA4 ↻ ≫
ATP5MC2 ↻ ≫
SETD5 ↻ ≫
ZFP1 ↻ ≫
PSMG1 ↻ ≫
MKNK2 ↻ ≫
OSGIN2 ↻ ≫
TMEM256 ↻ ≫
PLSCR3 ↻ ≫
SREBF1 ↻ ≫
SHC1 ↻ ≫
PYGO2 ↻ ≫
PBXIP1 ↻ ≫
LOC101928120 ↻ ≫
AHCY ↻ ≫
CD68 ↻ ≫
EIF4A1 ↻ ≫
PTPN2 ↻ ≫
B4GALT7 ↻ ≫
TMED9 ↻ ≫
MARVELD2 ↻ ≫
B3GNTL1 ↻ ≫
SRSF6 ↻ ≫
TATDN1 ↻ ≫
NDUFB9 ↻ ≫
PCBP2 ↻ ≫
RPS24 ↻ ≫
POLR3A ↻ ≫
KANSL3 ↻ ≫
FER1L5 ↻ ≫
ZCCHC14 ↻ ≫
GPR89A ↻ ≫
CYB5R1 ↻ ≫
URI1 ↻ ≫
ADIPOR1 ↻ ≫
RNF166 ↻ ≫
CTU2 ↻ ≫
FBXL13 ↻ ≫
ARMC10 ↻ ≫
SPTAN1 ↻ ≫
SP3 ↻ ≫
NUDCD1 ↻ ≫
MTHFD2 ↻ ≫
ECI1 ↻ ≫
SET ↻ ≫
ZNF783 ↻ ≫
TXNIP ↻ ≫
CANX ↻ ≫
EZH2 ↻ ≫
LRRC58 ↻ ≫
CNNM3 ↻ ≫
NUCKS1 ↻ ≫
GMFB ↻ ≫
SUPT20H ↻ ≫
TXNRD3 ↻ ≫
BANP ↻ ≫
MYO5A ↻ ≫
TSEN34 ↻ ≫
ELOB ↻ ≫
CENPBD1 ↻ ≫
PRSS33 ↻ ≫
N4BP3 ↻ ≫
UQCC2 ↻ ≫
INTS2 ↻ ≫
TSPAN10 ↻ ≫
TMEM199 ↻ ≫
SEBOX ↻ ≫
POLDIP2 ↻ ≫
MUS81 ↻ ≫
CFL1 ↻ ≫
NPLOC4 ↻ ≫
LHX9 ↻ ≫
C1orf53 ↻ ≫
ABTB1 ↻ ≫
EEF1AKMT3 ↻ ≫
GTPBP10 ↻ ≫
AZIN1 ↻ ≫
ATP6V0C ↻ ≫
AMDHD2 ↻ ≫
METTL1 ↻ ≫
CYP27B1 ↻ ≫
TKFC ↻ ≫
DDB1 ↻ ≫
ZP3 ↻ ≫
EEF1AKMT1 ↻ ≫
PUF60 ↻ ≫
RELA ↻ ≫
LRCH3 ↻ ≫
HMGN1 ↻ ≫
PPP1R16A ↻ ≫
FOXH1 ↻ ≫
KIFC2 ↻ ≫
CYHR1 ↻ ≫
H4C3 ↻ ≫
H1-6 ↻ ≫
RBM4B ↻ ≫
RNF114 ↻ ≫
SEC11A ↻ ≫
SPG7 ↻ ≫
OLA1 ↻ ≫
CHPT1 ↻ ≫
RRP15 ↻ ≫
PDF ↻ ≫
NIP7 ↻ ≫
COG8 ↻ ≫
RPL22L1 ↻ ≫
ARIH1 ↻ ≫
ZFP36 ↻ ≫
PLEKHG2 ↻ ≫
ACTRT3 ↻ ≫
NFKBIA ↻ ≫
MYNN ↻ ≫
MYC ↻ ≫
H4C4 ↻ ≫
H2BC6 ↻ ≫
ATP5MF-PTCD1 ↻ ≫
ATP5MF ↻ ≫
ZNF789 ↻ ≫
UFSP1 ↻ ≫
ACHE ↻ ≫
PIEZO1 ↻ ≫
MRPL21 ↻ ≫
IGHMBP2 ↻ ≫
C8orf33 ↻ ≫
TMBIM6 ↻ ≫
ATP5F1E ↻ ≫
PRELID3B ↻ ≫
ATP2A2 ↻ ≫
SPOPL ↻ ≫
SRGAP1 ↻ ≫
ZNF592 ↻ ≫
TRIP6 ↻ ≫
SRRT ↻ ≫
SV2A ↻ ≫
BOLA1 ↻ ≫
ZDHHC4 ↻ ≫
TRAPPC10 ↻ ≫
ATXN2L ↻ ≫
RBM17 ↻ ≫
CNBP ↻ ≫
SLC3A2 ↻ ≫
INPP5E ↻ ≫
PRMT2 ↻ ≫
GPSM1 ↻ ≫
CARD9 ↻ ≫
ZNF746 ↻ ≫
NOXA1 ↻ ≫
DPY19L4 ↻ ≫
AFG3L2 ↻ ≫
FZD1 ↻ ≫
RPL5 ↻ ≫
EPN1 ↻ ≫
LSM5 ↻ ≫
AVL9 ↻ ≫
VPS52 ↻ ≫
RPS18 ↻ ≫
B3GALT4 ↻ ≫
CAMSAP2 ↻ ≫
AP1S1 ↻ ≫
SENP5 ↻ ≫
TMEM223 ↻ ≫
TMEM179B ↻ ≫
VGF ↻ ≫
XPOT ↻ ≫
SRI ↻ ≫
RBM8A ↻ ≫
PEX11B ↻ ≫
PDXDC1 ↻ ≫
TBC1D9B ↻ ≫
ZC3H10 ↻ ≫
RPL41 ↻ ≫
ESYT1 ↻ ≫
ZWILCH ↻ ≫
SNAPC5 ↻ ≫
RPL4 ↻ ≫
GPR160 ↻ ≫
DIDO1 ↻ ≫
C16orf95 ↻ ≫
TMSB10 ↻ ≫
SCAMP2 ↻ ≫
PTCD1 ↻ ≫
CPSF4 ↻ ≫
YWHAZ ↻ ≫
METRN ↻ ≫
ANTKMT ↻ ≫
RCE1 ↻ ≫
HAGHL ↻ ≫
CCDC78 ↻ ≫
MTRNR2L1 ↻ ≫
H1-2 ↻ ≫
ZBTB37 ↻ ≫
TATDN2 ↻ ≫
SH3BGR ↻ ≫
LCA5L ↻ ≫
XPO6 ↻ ≫
TDRD9 ↻ ≫
ATP5MPL ↻ ≫
POM121C ↻ ≫
RPP38 ↻ ≫
SPDYE5 ↻ ≫
ACBD7 ↻ ≫
RPL21 ↻ ≫
TONSL ↻ ≫
RPL30 ↻ ≫
CTNNB1 ↻ ≫
ACSF3 ↻ ≫
PSMC1 ↻ ≫
ZNF205 ↻ ≫
ZSCAN10 ↻ ≫
HNRNPAB ↻ ≫
TMEM243 ↻ ≫
FRA10AC1 ↻ ≫
ANKRD46 ↻ ≫
PCF11 ↻ ≫
NME2 ↻ ≫
PTPN6 ↻ ≫
C12orf57 ↻ ≫
ATN1 ↻ ≫
CSDE1 ↻ ≫
SLC25A10 ↻ ≫
MRPL12 ↻ ≫
RPL37A ↻ ≫
ARL8A ↻ ≫
POLR3E ↻ ≫
TNKS2 ↻ ≫
PIP5KL1 ↻ ≫
DPM2 ↻ ≫
RAD9A ↻ ≫
PPP1CA ↻ ≫
ZNF786 ↻ ≫
POLR2D ↻ ≫
TBC1D10C ↻ ≫
SMARCD2 ↻ ≫
CLK3 ↻ ≫
TAF9 ↻ ≫
RAD17 ↻ ≫
AK6 ↻ ≫
TSPYL5 ↻ ≫
RBBP8NL ↻ ≫
PPP3CB ↻ ≫
PPIA ↻ ≫
MKRN2OS ↻ ≫
MKRN2 ↻ ≫
IFRD1 ↻ ≫
ANKRD36C ↻ ≫
CSK ↻ ≫
IER5 ↻ ≫
UBE2S ↻ ≫
ECHS1 ↻ ≫
EEF1A1 ↻ ≫
PPP1R15B ↻ ≫
EIF3B ↻ ≫
ASCC1 ↻ ≫
ANAPC16 ↻ ≫
SNX18 ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
ATP13A3 ↻ ≫
PMVK ↻ ≫
RC3H1 ↻ ≫
PSMD12 ↻ ≫
TIMMDC1 ↻ ≫
TRNT1 ↻ ≫
MLYCD ↻ ≫
PRKAG1 ↻ ≫
PITPNA ↻ ≫
NT5DC3 ↻ ≫
PCNX4 ↻ ≫
TEX22 ↻ ≫
CD2AP ↻ ≫
COQ2 ↻ ≫
TPTE ↻ ≫
PPP4R3A ↻ ≫
URGCP ↻ ≫
UBE2D4 ↻ ≫
H2AZ2 ↻ ≫
H4-16 ↻ ≫
H2AJ ↻ ≫
PLEKHA7 ↻ ≫
NDUFB2 ↻ ≫
SPTSSA ↻ ≫
ADAMTSL4 ↻ ≫
GNG14 ↻ ≫
DHPS ↻ ≫
UBE2V2 ↻ ≫
CDT1 ↻ ≫
APRT ↻ ≫
TUBA1B ↻ ≫
CELF1 ↻ ≫
HSPB1 ↻ ≫
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RIPK2 ↻ ≫
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SMG1 ↻ ≫
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MFSD3 ↻ ≫
NDST2 ↻ ≫
VPS4A ↻ ≫
LMLN ↻ ≫
IQCG ↻ ≫
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RPL35A ↻ ≫
GPT ↻ ≫
CORO1C ↻ ≫
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FEM1B ↻ ≫
LEKR1 ↻ ≫
SRSF3 ↻ ≫
NAXE ↻ ≫
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C15orf61 ↻ ≫
ZBTB21 ↻ ≫
ATMIN ↻ ≫
STX6 ↻ ≫
CRYM ↻ ≫
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TRAP1 ↻ ≫
SLC27A3 ↻ ≫
AP2A2 ↻ ≫
ZSWIM7 ↻ ≫
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TRAPPC2L ↻ ≫
GALNS ↻ ≫
PPP6R3 ↻ ≫
ARL5A ↻ ≫
RPL37 ↻ ≫
CARD6 ↻ ≫
HDHD5 ↻ ≫
PMS2 ↻ ≫
AIMP2 ↻ ≫
ZNF595 ↻ ≫
SAP18 ↻ ≫
IMMP2L ↻ ≫
DCLRE1B ↻ ≫
AP4B1 ↻ ≫
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