ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Atrx

Query protein: Atrx
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX2955819 | Neuroepithelial progenitor cell
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Atrx's Target genes

◢ Atrx: Average

◢ SRX804259: Cortical neuron

◢ SRX804260: Cortical neuron

◢ SRX804261: Cortical neuron

◢ SRX804262: Cortical neuron

◢ SRX804263: Cortical neuron

◢ SRX804264: Cortical neuron

◢ SRX2649460: Embryonic liver

◢ SRX021985: ES cells

◢ SRX1092370: ES cells

◢ SRX1092373: ES cells

◢ SRX15322661: ES cells

◢ SRX15322662: ES cells

◢ SRX15322665: ES cells

◢ SRX15322666: ES cells

◢ SRX15322669: ES cells

◢ SRX15322670: ES cells

◢ SRX523447: ES cells

◢ SRX523449: ES cells

◢ SRX8381405: ES cells

◢ SRX8381406: ES cells

◢ SRX2649458: MEF

◢ SRX2649461: MEF

◢ SRX2649463: MEF

◢ SRX523445: MEF

◢ SRX523455: MEF

◢ SRX523457: MEF

◢ SRX523451: mESCs, differentiated

◢ SRX523453: mESCs, differentiated

◢ SRX2955818: Neuroepithelial progenitor cell

◣ SRX2955819: Neuroepithelial progenitor cell

◢ SRX2955820: Neuroepithelial progenitor cell

◢ SRX2955824: Neuroepithelial progenitor cell

◢ SRX2955825: Neuroepithelial progenitor cell

◢ SRX2955826: Neuroepithelial progenitor cell

◢ SRX2955830: Neuroepithelial progenitor cell

◢ SRX22172939: Neurons

◢ SRX22172940: Neurons

◢ SRX22172941: Neurons

◢ SRX22172942: Neurons

◢ SRX24129399: Neurons

◢ SRX24129400: Neurons

◢ Atrx: STRING
Tcstv3 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
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A730008H23Rik ↻ ≫
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Mkx ↻ ≫
Msh2 ↻ ≫
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Nck1 ↻ ≫
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Trim24 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
4932438H23Rik ↻ ≫
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Olig1 ↻ ≫
Slc17a5 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Drg2 ↻ ≫
Nwd1 ↻ ≫
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Cnn2 ↻ ≫
Dctd ↻ ≫
Slc35c2 ↻ ≫
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Zcchc4 ↻ ≫
Pnpo ↻ ≫
Cpt2 ↻ ≫
Tle2 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Tas2r134 ↻ ≫
Atp9b ↻ ≫
Dcaf10 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Peli1 ↻ ≫
Zfp143 ↻ ≫
Gstm7 ↻ ≫
Cspg4 ↻ ≫
Tpk1 ↻ ≫
Trib2 ↻ ≫
Cacng2 ↻ ≫
Myh14 ↻ ≫
Kcnn2 ↻ ≫
Gm5165 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Chgb ↻ ≫
Zmpste24 ↻ ≫
Gatad2a ↻ ≫
Pex3 ↻ ≫
Adat2 ↻ ≫
Tmc3 ↻ ≫
Dhrs2 ↻ ≫
Rptor ↻ ≫
Cacna2d4 ↻ ≫
Lrtm2 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Ccdc88a ↻ ≫
Bod1l ↻ ≫
Rad54l2 ↻ ≫
Man2b2 ↻ ≫
Gorasp2 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Epas1 ↻ ≫
Tcf12 ↻ ≫
Metap2 ↻ ≫
Aacs ↻ ≫
Dnajc11 ↻ ≫
Crem ↻ ≫
Phf14 ↻ ≫
Ndufa4 ↻ ≫
Dthd1 ↻ ≫
Kctd14 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Dynlt1b ↻ ≫
Puf60 ↻ ≫
Mrgprd ↻ ≫
Degs1 ↻ ≫
Atxn7l3 ↻ ≫
Setdb1 ↻ ≫
Aanat ↻ ≫
Smim12 ↻ ≫
Vps13d ↻ ≫
Ghrh ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Terf2 ↻ ≫
Fam172a ↻ ≫
Arl14ep ↻ ≫
Irf1 ↻ ≫
Ecrg4 ↻ ≫
1110051M20Rik ↻ ≫
Ifi44l ↻ ≫
Rpl38 ↻ ≫
Map2k6 ↻ ≫
Arhgef37 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Pcnx4 ↻ ≫
Scpep1 ↻ ≫
Wdr7 ↻ ≫
Dipk1c ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Pou2af1 ↻ ≫
Atp5g3 ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Supv3l1 ↻ ≫
Ap1ar ↻ ≫
Cyp21a1 ↻ ≫
Usp12 ↻ ≫
Slc44a5 ↻ ≫
Ttyh1 ↻ ≫
Slc33a1 ↻ ≫
Mpp7 ↻ ≫
Frg1 ↻ ≫
Xpc ↻ ≫
Lsm3 ↻ ≫
Klhl20 ↻ ≫
Zfp341 ↻ ≫
Maneal ↻ ≫
Fut10 ↻ ≫
Mrpl22 ↻ ≫
Gemin5 ↻ ≫
Celf1 ↻ ≫
Nckap5 ↻ ≫
2210016F16Rik ↻ ≫
Prkar1a ↻ ≫
Utp25 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Kctd3 ↻ ≫
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Kiz ↻ ≫
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Zfp786 ↻ ≫
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Aadacl2fm1 ↻ ≫
Ap3s2 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Dglucy ↻ ≫
Nlrp10 ↻ ≫
Eif3f ↻ ≫
Cerk ↻ ≫
Dmap1 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Trappc2l ↻ ≫
Galns ↻ ≫
Msi1 ↻ ≫
Tars ↻ ≫
Birc5 ↻ ≫
Pmepa1 ↻ ≫
Kctd18 ↻ ≫
Pcca ↻ ≫
Smim5 ↻ ≫
Atp6v1h ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Nicn1 ↻ ≫
Amt ↻ ≫
Zfp598 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Cdc73 ↻ ≫
Abcd4 ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Apc ↻ ≫
Gm13290 ↻ ≫
Gm13289 ↻ ≫
Mrpl3 ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
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Zfp608 ↻ ≫
Gm13288 ↻ ≫
Zfp606 ↻ ≫
Fubp3 ↻ ≫
Tsn ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Sparcl1 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Tmod2 ↻ ≫
Gas7 ↻ ≫
2010315B03Rik ↻ ≫
Pcdh9 ↻ ≫
Sox5 ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Ppp2r3a ↻ ≫
Ncam1 ↻ ≫
Tmem260 ↻ ≫
Bmpr1b ↻ ≫
Mfsd1 ↻ ≫
Ndufa10 ↻ ≫
Arhgap18 ↻ ≫
Gpatch1 ↻ ≫
Pbx4 ↻ ≫
Ccdc107 ↻ ≫
Mnat1 ↻ ≫
Ufl1 ↻ ≫
Acsf3 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Cfap45 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Aebp2 ↻ ≫
Tma16 ↻ ≫
Ints4 ↻ ≫
Nsun7 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Elovl2 ↻ ≫
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Hes1 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Aco1 ↻ ≫
9230019H11Rik ↻ ≫
Tbcd ↻ ≫
Gpd1l ↻ ≫
Acoxl ↻ ≫
Gns ↻ ≫
Slc25a18 ↻ ≫
Rhot1 ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Chaf1b ↻ ≫
Kifap3 ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Rfc3 ↻ ≫
Stx1a ↻ ≫
Atg16l1 ↻ ≫
Btbd11 ↻ ≫
Nrep ↻ ≫
Usp33 ↻ ≫
Pipox ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Rgr ↻ ≫
Taar7f ↻ ≫
Spsb1 ↻ ≫
Vrk2 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Setd5 ↻ ≫
Rrp1 ↻ ≫
Psmd12 ↻ ≫
Kidins220 ↻ ≫
Arhgef1 ↻ ≫
Wdr36 ↻ ≫
Arl8b ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Pold3 ↻ ≫
Pdzrn4 ↻ ≫
Dbi ↻ ≫
4930505A04Rik ↻ ≫
Zfp960 ↻ ≫
Frg2f1 ↻ ≫
Foxj3 ↻ ≫
Wdr43 ↻ ≫
Zbtb14 ↻ ≫
Fabp7 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Stag3 ↻ ≫
Gpc2 ↻ ≫
Zfp933 ↻ ≫
Hspb3 ↻ ≫
Nudt5 ↻ ≫
Cdc123 ↻ ≫
Acer3 ↻ ≫
Tmem255b ↻ ≫
Znhit6 ↻ ≫
Hif1an ↻ ≫
Scg2 ↻ ≫
Rfx2 ↻ ≫
Sdhaf3 ↻ ≫
Mecr ↻ ≫
Gpr179 ↻ ≫
Foxp2 ↻ ≫
Tbpl1 ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Dusp18 ↻ ≫
4921536K21Rik ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Mapk10 ↻ ≫
Ncam2 ↻ ≫
Pld1 ↻ ≫
Tyw3 ↻ ≫
Cryz ↻ ≫
Micu1 ↻ ≫
Ghr ↻ ≫
Amer3 ↻ ≫
Ndufs4 ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Tspan11 ↻ ≫
Api5 ↻ ≫
Svop ↻ ≫
Atl2 ↻ ≫
Cpa4 ↻ ≫
Mmut ↻ ≫
Cenpq ↻ ≫
Unc5b ↻ ≫
Bend3 ↻ ≫
Clip1 ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Rubcnl ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Tmem267 ↻ ≫
Tmem229a ↻ ≫
Ccdc126 ↻ ≫
Rgs20 ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Ap3m2 ↻ ≫
Commd2 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Mfsd14b ↻ ≫
Shcbp1 ↻ ≫
Fam136a ↻ ≫
Slc35b1 ↻ ≫
Ccz1 ↻ ≫
7530416G11Rik ↻ ≫
Plpp3 ↻ ≫
Pex7 ↻ ≫
Insr ↻ ≫
Fez1 ↻ ≫
Sez6l ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Fra10ac1 ↻ ≫
Slc1a3 ↻ ≫
Rpp14 ↻ ≫
Htd2 ↻ ≫
Scyl1 ↻ ≫
Slc25a32 ↻ ≫
Dcaf13 ↻ ≫
Wdr41 ↻ ≫
Cdk5r1 ↻ ≫
Nap1l1 ↻ ≫
Mms22l ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Mrps31 ↻ ≫
Tph2 ↻ ≫
Rps24 ↻ ≫
Polr3a ↻ ≫
Nfix ↻ ≫
Tcf4 ↻ ≫
Agmo ↻ ≫
Olfr902 ↻ ≫
Lmbr1 ↻ ≫
Faap100 ↻ ≫
Pars2 ↻ ≫
Fhod3 ↻ ≫
Taf9 ↻ ≫
Rad17 ↻ ≫
Ak6 ↻ ≫
Mis18bp1 ↻ ≫
Riok1 ↻ ≫
Cage1 ↻ ≫
Slit1 ↻ ≫
Nsmce4a ↻ ≫
Riok2 ↻ ≫
Pla2g12a ↻ ≫
Pkd1 ↻ ≫
Mfsd8 ↻ ≫
Tprkb ↻ ≫
Tmbim4 ↻ ≫
Nus1 ↻ ≫
Myo10 ↻ ≫
Pole3 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Ankrd6 ↻ ≫
Dgat1 ↻ ≫
4933430I17Rik ↻ ≫
Tmem247 ↻ ≫
Alad ↻ ≫
Pyroxd1 ↻ ≫
Golga4 ↻ ≫
Rcan2 ↻ ≫
Slc27a1 ↻ ≫
Zfat ↻ ≫
Apba1 ↻ ≫
Ier3ip1 ↻ ≫
Tafa5 ↻ ≫
Ccdc14 ↻ ≫
Zeb2 ↻ ≫
Il33 ↻ ≫
Axin1 ↻ ≫
Arhgap42 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Ptpn9 ↻ ≫
Tab1 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Slc9a1 ↻ ≫
Rufy3 ↻ ≫
Ifnar1 ↻ ≫
Lpin1 ↻ ≫
Atox1 ↻ ≫
Alyref2 ↻ ≫
Rnf216 ↻ ≫
Ndufab1 ↻ ≫
Rab12 ↻ ≫
Apbb2 ↻ ≫
Mindy4 ↻ ≫
Trerf1 ↻ ≫
Zscan12 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Bard1 ↻ ≫
Zfp660 ↻ ≫
Ndufaf5 ↻ ≫
Esf1 ↻ ≫
Polr2m ↻ ≫
Mib1 ↻ ≫
Raf1 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Ctnnb1 ↻ ≫
Zfp280d ↻ ≫
Atrn ↻ ≫
Mtrex ↻ ≫
Dhx29 ↻ ≫
Cdkal1 ↻ ≫
Cog7 ↻ ≫
Tomm5 ↻ ≫
Sil1 ↻ ≫
Bmp2k ↻ ≫
Fzd2 ↻ ≫
Ndufs8 ↻ ≫
Pim3 ↻ ≫
Gpm6b ↻ ≫
Smc2 ↻ ≫
Caprin2 ↻ ≫
Zfp995 ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Fam227b ↻ ≫
Dtwd1 ↻ ≫
Cpxm2 ↻ ≫
Tmc5 ↻ ≫
Rps19 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Ppp1ccb ↻ ≫
Ppp1cc ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Smim17 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Efhd2 ↻ ≫
Kmt2d ↻ ≫
Klf15 ↻ ≫
Cdiptos ↻ ≫
Cdipt ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Stxbp4 ↻ ≫
Cox11 ↻ ≫
Psap ↻ ≫
Bcar1 ↻ ≫
Cacng3 ↻ ≫
Arhgef19 ↻ ≫
Psmc1 ↻ ≫
Pmpcb ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Bud13 ↻ ≫
Sec24b ↻ ≫
Pla2g3 ↻ ≫
Emc7 ↻ ≫
Ppp1r18 ↻ ≫
Itprid2 ↻ ≫
Slc15a4 ↻ ≫
Tbck ↻ ≫
Aimp1 ↻ ≫
D030056L22Rik ↻ ≫
Chd8 ↻ ≫
Gfap ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Fnip2 ↻ ≫
Pde1a ↻ ≫
Rpl5 ↻ ≫
Slc1a4 ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Dnttip2 ↻ ≫
Cdca7 ↻ ≫
Zar1l ↻ ≫
Brca2 ↻ ≫
Bche ↻ ≫
Cfap97d2 ↻ ≫
Bpnt2 ↻ ≫
App ↻ ≫
Nek3 ↻ ≫
Arsi ↻ ≫
Cybrd1 ↻ ≫
Mvk ↻ ≫
Mmab ↻ ≫
Gpcpd1 ↻ ≫
Slc25a15 ↻ ≫
Rbm25 ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Mymk ↻ ≫
Klhl18 ↻ ≫
Kif9 ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Kbtbd3 ↻ ≫
Aasdhppt ↻ ≫
Chmp5 ↻ ≫
Bag1 ↻ ≫
Cyb5r3 ↻ ≫
Ccdc57 ↻ ≫
Snap25 ↻ ≫
Zfp105 ↻ ≫
Cr1l ↻ ≫
Klhdc10 ↻ ≫
Adamtsl2 ↻ ≫
Gucy1b2 ↻ ≫
Igdcc4 ↻ ≫
Nudt9 ↻ ≫
Ddx18 ↻ ≫
Mro ↻ ≫
Zfp788 ↻ ≫
Aqp4 ↻ ≫
Pigz ↻ ≫
Sox6 ↻ ≫
Cdh10 ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Ehbp1 ↻ ≫
Gm7244 ↻ ≫
Ptpn13 ↻ ≫
Arhgap32 ↻ ≫
Mpzl3 ↻ ≫
N4bp2l2 ↻ ≫
Jakmip2 ↻ ≫
Erlec1 ↻ ≫
Asb3 ↻ ≫
Vps33b ↻ ≫
Ints2 ↻ ≫
Nfatc2 ↻ ≫
Ppp2r5c ↻ ≫
Tmem248 ↻ ≫
Vmn1r2 ↻ ≫
Mios ↻ ≫
Syt7 ↻ ≫
Sirt6 ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Pelp1 ↻ ≫
Ptprg ↻ ≫
Tmprss5 ↻ ≫
Pdzd2 ↻ ≫
Tmem87b ↻ ≫
Dner ↻ ≫
Slc25a40 ↻ ≫
Dbf4 ↻ ≫
Zbtb39 ↻ ≫
Clasp2 ↻ ≫
Wtap ↻ ≫
Wdr11 ↻ ≫
Slc10a6 ↻ ≫
C1qtnf5 ↻ ≫
Trmu ↻ ≫
Virma ↻ ≫
Gatb ↻ ≫
Pex5l ↻ ≫
Elavl2 ↻ ≫
Dr1 ↻ ≫
Tmtc2 ↻ ≫
Ttc7 ↻ ≫
Zbtb7a ↻ ≫
Opa1 ↻ ≫
Snx12 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Gm5111 ↻ ≫
Tac4 ↻ ≫
Twistnb ↻ ≫
Tti1 ↻ ≫
Rprd1b ↻ ≫
Nrg1 ↻ ≫
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Prss22 ↻ ≫
Psmf1 ↻ ≫
Dtwd2 ↻ ≫
Gjc3 ↻ ≫
Chrna7 ↻ ≫
Cyp2j9 ↻ ≫
Prpf18 ↻ ≫
Mtmr6 ↻ ≫
Txnip ↻ ≫
Hip1 ↻ ≫
Otud6b ↻ ≫
D5Ertd579e ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Slc2a13 ↻ ≫
Crocc ↻ ≫
Guf1 ↻ ≫
Camk2a ↻ ≫
Slc35a1 ↻ ≫
Tox2 ↻ ≫
Cox6c ↻ ≫
Klhl5 ↻ ≫
Tex33 ↻ ≫
Gnai3 ↻ ≫
Cox5a ↻ ≫
Pcsk5 ↻ ≫
Oxr1 ↻ ≫
Gxylt1 ↻ ≫
Nabp1 ↻ ≫
Rrp7a ↻ ≫
Mast2 ↻ ≫
Phyhipl ↻ ≫
Sf3b5 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Rps7 ↻ ≫
Sh3bgrl2 ↻ ≫
Vpreb1 ↻ ≫
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Dmac1 ↻ ≫
Hes5 ↻ ≫
Slc29a4 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Cdc42bpb ↻ ≫
Tmpo ↻ ≫
Kdm3b ↻ ≫
Gm13277 ↻ ≫
Ifnz ↻ ≫
Gm13276 ↻ ≫
Rffl ↻ ≫
Chmp6 ↻ ≫
Gpc6 ↻ ≫
Trim36 ↻ ≫
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Gins3 ↻ ≫
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Commd1 ↻ ≫
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Gtf2b ↻ ≫
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Gng7 ↻ ≫
Cops7a ↻ ≫
Oxct1 ↻ ≫
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St3gal5 ↻ ≫
Fam20b ↻ ≫
Raph1 ↻ ≫
Rad1 ↻ ≫
Brix1 ↻ ≫
Ece1 ↻ ≫
Adarb1 ↻ ≫
Vasn ↻ ≫
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Ro60 ↻ ≫
Vamp4 ↻ ≫
Meig1 ↻ ≫
Dclre1c ↻ ≫
Actr10 ↻ ≫
Wdr70 ↻ ≫
Spa17 ↻ ≫
Siae ↻ ≫
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Zfp949 ↻ ≫
Slc39a3 ↻ ≫
Fam3c ↻ ≫
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Spty2d1 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Pdcd7 ↻ ≫
Gm5148 ↻ ≫
Rabgap1l ↻ ≫
Fgr ↻ ≫
Denn2b ↻ ≫
Por ↻ ≫
Map3k19 ↻ ≫
Anks1b ↻ ≫
Magi1 ↻ ≫
Ppa2 ↻ ≫
Adam22 ↻ ≫
Tsku ↻ ≫
Rnf141 ↻ ≫
Marcks ↻ ≫
Ctsd ↻ ≫
Zfp759 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Cd24a ↻ ≫
Ier5 ↻ ≫
Ncald ↻ ≫
Heca ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Gm13283 ↻ ≫
Ahi1 ↻ ≫
Tmcc3 ↻ ≫
Blmh ↻ ≫
Herc4 ↻ ≫
Cobl ↻ ≫
Cdh6 ↻ ≫
Bambi ↻ ≫
Dock7 ↻ ≫
Dennd2a ↻ ≫
Ascc3 ↻ ≫
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