ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Cry1

Query protein: Cry1
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3411140 | Liver
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Cry1's Target genes

◢ Cry1: Average

◢ SRX20053915: ES cells

◢ SRX20053913: iPS cells

◢ SRX20053914: iPS cells

◢ SRX3411136: Liver

◢ SRX3411137: Liver

◢ SRX3411138: Liver

◢ SRX3411139: Liver

◣ SRX3411140: Liver

◢ SRX3411141: Liver

◢ SRX415003: Liver

◢ SRX20053912: MEF

◢ Cry1: STRING
Oasl1 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Per2 ↻ ≫
Cry1 ↻ ≫
Tbcel ↻ ≫
Ccne2 ↻ ≫
Cry2 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Rorc ↻ ≫
Bod1 ↻ ≫
Marchf8 ↻ ≫
Wdr38 ↻ ≫
Jade1 ↻ ≫
Pcbp1 ↻ ≫
Wee1 ↻ ≫
Lamtor4 ↻ ≫
Eif1ad ↻ ≫
Banf1 ↻ ≫
Mfsd1 ↻ ≫
Mthfd1l ↻ ≫
Tef ↻ ≫
Adh5 ↻ ≫
Hlf ↻ ≫
Ciart ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Crebrf ↻ ≫
Igsf23 ↻ ≫
Naaa ↻ ≫
Gm51573 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Ncl ↻ ≫
Ankrd12 ↻ ≫
Coq8a ↻ ≫
Ldha ↻ ≫
Mknk1 ↻ ≫
Rab3gap2 ↻ ≫
4931408C20Rik ↻ ≫
Krtap8-1 ↻ ≫
Ddx50 ↻ ≫
Dux ↻ ≫
Mllt1 ↻ ≫
Mex3d ↻ ≫
Aebp2 ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
Egln2 ↻ ≫
Sertad1 ↻ ≫
Gnpnat1 ↻ ≫
Rpia ↻ ≫
Usp28 ↻ ≫
Pus7 ↻ ≫
Kmt2c ↻ ≫
Lrp1 ↻ ≫
Tomm20 ↻ ≫
Abcf1 ↻ ≫
Phospho1 ↻ ≫
Slc27a2 ↻ ≫
Abhd11 ↻ ≫
Per3 ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Dhps ↻ ≫
Ankrd28 ↻ ≫
Senp5 ↻ ≫
Txnip ↻ ≫
A430005L14Rik ↻ ≫
Pdk1 ↻ ≫
Ntsr2 ↻ ≫
Snx8 ↻ ≫
Phf20 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Taf1c ↻ ≫
Cyth1 ↻ ≫
Trim37 ↻ ≫
Mgll ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Vmn2r4 ↻ ≫
Usp36 ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Hnrnpf ↻ ≫
Arrdc1 ↻ ≫
Pip4p1 ↻ ≫
Cndp2 ↻ ≫
Aph1b ↻ ≫
Bhmg1 ↻ ≫
Mtrr ↻ ≫
Fastkd3 ↻ ≫
Nfe2l2 ↻ ≫
Krtap7-1 ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
Cited2 ↻ ≫
Acsl1 ↻ ≫
Cc2d1b ↻ ≫
Frmd6 ↻ ≫
Rnaseh2b ↻ ≫
Nrtn ↻ ≫
Spata5 ↻ ≫
Nudt6 ↻ ≫
Trappc10 ↻ ≫
Pgm2l1 ↻ ≫
Phf1 ↻ ≫
Insig1 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Crisp2 ↻ ≫
Mapk8 ↻ ≫
Pfkl ↻ ≫
Slc20a1 ↻ ≫
Glrx3 ↻ ≫
Pfkfb3 ↻ ≫
Rragc ↻ ≫
Gm21190 ↻ ≫
Fkbp4 ↻ ≫
Xpo7 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Mob3c ↻ ≫
Erdr1 ↻ ≫
Txnl4a ↻ ≫
Gm16286 ↻ ≫
Rrp12 ↻ ≫
E030018B13Rik ↻ ≫
Ilvbl ↻ ≫
Dbi ↻ ≫
3110009E18Rik ↻ ≫
Shmt1 ↻ ≫
Srm ↻ ≫
Ddhd2 ↻ ≫
Hebp1 ↻ ≫
Lrrc58 ↻ ≫
Maco1 ↻ ≫
Mydgf ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Lima1 ↻ ≫
Inmt ↻ ≫
Ruvbl2 ↻ ≫
Gys1 ↻ ≫
Aph1c ↻ ≫
Klf9 ↻ ≫
Dnajc16 ↻ ≫
Gpr155 ↻ ≫
2610042L04Rik ↻ ≫
Cetn3 ↻ ≫
Sumo3 ↻ ≫
Rps6ka4 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Tet3 ↻ ≫
Pcsk9 ↻ ≫
Npm1 ↻ ≫
Tmem267 ↻ ≫
Bnip3 ↻ ≫
Ccno ↻ ≫
Usp4 ↻ ≫
Top1 ↻ ≫
Hoga1 ↻ ≫
Hsf4 ↻ ≫
Gm10229 ↻ ≫
Eif5a2 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Rmnd5a ↻ ≫
Qk ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Eef2k ↻ ≫
Xpot ↻ ≫
Atf7 ↻ ≫
Vps33a ↻ ≫
Ccnh ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Polr3b ↻ ≫
Cep85 ↻ ≫
Esrra ↻ ≫
Cct8 ↻ ≫
Pard6b ↻ ≫
3110082I17Rik ↻ ≫
Pigw ↻ ≫
Myo19 ↻ ≫
Trpm7 ↻ ≫
Vps13a ↻ ≫
Fnip1 ↻ ≫
Sox12 ↻ ≫
Mfap3l ↻ ≫
Plec ↻ ≫
Gm2237 ↻ ≫
Gfod1 ↻ ≫
Slc7a5 ↻ ≫
Atf6b ↻ ≫
Rab18 ↻ ≫
Mfap2 ↻ ≫
Ifnz ↻ ≫
Foxo3 ↻ ≫
Hes1 ↻ ≫
Mars2 ↻ ≫
Zkscan6 ↻ ≫
Serf2 ↻ ≫
Rps6ka5 ↻ ≫
Pxmp2 ↻ ≫
Pole ↻ ≫
Bsg ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Rbfox2 ↻ ≫
Usp20 ↻ ≫
Dctpp1 ↻ ≫
BC005624 ↻ ≫
Spring1 ↻ ≫
Rnft2 ↻ ≫
Fam20b ↻ ≫
Mapk6 ↻ ≫
Ruvbl1 ↻ ≫
Ddx39a ↻ ≫
Pcgf5 ↻ ≫
Wdr43 ↻ ≫
St6galnac1 ↻ ≫
Klc3 ↻ ≫
Eef1aknmt ↻ ≫
Utp11 ↻ ≫
Hsf1 ↻ ≫
Bop1 ↻ ≫
Tmem175 ↻ ≫
Gak ↻ ≫
Mbd3 ↻ ≫
Krt71 ↻ ≫
Gm3667 ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Xndc1 ↻ ≫
Rnf121 ↻ ≫
Bhlhe41 ↻ ≫
Mrpl36 ↻ ≫
Krtap15 ↻ ≫
Aldoc ↻ ≫
Eif4a1 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Sertad2 ↻ ≫
Gtf3c4 ↻ ≫
Ddx31 ↻ ≫
Uox ↻ ≫
Ccdc85b ↻ ≫
Ttc25 ↻ ≫
Rps9 ↻ ≫
Tbl2 ↻ ≫
Nfix ↻ ≫
Zc3h8 ↻ ≫
Urad ↻ ≫
E2f5 ↻ ≫
Prkaca ↻ ≫
Slc16a1 ↻ ≫
Lcorl ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Mat2b ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Kdm4b ↻ ≫
Akap8 ↻ ≫
Actr3 ↻ ≫
Mtrex ↻ ≫
Dhx29 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Phf7 ↻ ≫
Bap1 ↻ ≫
Zcwpw1 ↻ ≫
Wdr4 ↻ ≫
Slc10a3 ↻ ≫
Mepce ↻ ≫
Gm7347 ↻ ≫
Gm44504 ↻ ≫
Ino80 ↻ ≫
Dffb ↻ ≫
Derl3 ↻ ≫
Spout1 ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Gas1 ↻ ≫
Dvl2 ↻ ≫
Atf4 ↻ ≫
Slc38a9 ↻ ≫
Fam241a ↻ ≫
Mrps9 ↻ ≫
Ipo7 ↻ ≫
Ntpcr ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Rpp38 ↻ ≫
Gm9758 ↻ ≫
Ehd1 ↻ ≫
Ttc7 ↻ ≫
Tle1 ↻ ≫
Mfsd4b4 ↻ ≫
Krtap16-3 ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Ap3d1 ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Ngef ↻ ≫
Neu2 ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Gm13275 ↻ ≫
Gga2 ↻ ≫
1110008P14Rik ↻ ≫
Alkbh5 ↻ ≫
Akt2 ↻ ≫
Zfp526 ↻ ≫
Ppp1r3e ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Casc3 ↻ ≫
Sesn1 ↻ ≫
Gamt ↻ ≫
Ercc6 ↻ ≫
Cep57l1 ↻ ≫
Rrs1 ↻ ≫
Laptm4a ↻ ≫
Ppib ↻ ≫
Lims1 ↻ ≫
Slc17a3 ↻ ≫
Ppp1r15b ↻ ≫
Ppia ↻ ≫
Bcl2l11 ↻ ≫
Ube2f ↻ ≫
Slc29a2 ↻ ≫
Dnpep ↻ ≫
Edf1 ↻ ≫
1810013L24Rik ↻ ≫
Lipe ↻ ≫
Pdxk ↻ ≫
Pabpc4 ↻ ≫
Mob3a ↻ ≫
Izumo4 ↻ ≫
Eif6 ↻ ≫
Krtap3-1 ↻ ≫
Rassf6 ↻ ≫
F3 ↻ ≫
Zfp600 ↻ ≫
Abhd14a ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Polr2h ↻ ≫
Gas2 ↻ ≫
Fancf ↻ ≫
Atl3 ↻ ≫
Snai3 ↻ ≫
Clptm1l ↻ ≫
Rev1 ↻ ≫
Ccdc134 ↻ ≫
Slc7a2 ↻ ≫
Bahcc1 ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Rbbp6 ↻ ≫
Aacs ↻ ≫
Zfp281 ↻ ≫
Zbtb7b ↻ ≫
Hdgf ↻ ≫
Olfr279 ↻ ≫
Tatdn2 ↻ ≫
Supv3l1 ↻ ≫
Opa3 ↻ ≫
Nkain1 ↻ ≫