ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc1a

Query protein: Smc1a
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX5358275 | mESCs, differentiated
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc1a's Target genes

◢ Smc1a: Average

◢ SRX2599821: 3T3-L1

◢ SRX2599822: 3T3-L1

◢ SRX2599823: 3T3-L1

◢ SRX2599824: 3T3-L1

◢ SRX2599825: 3T3-L1

◢ SRX2599826: 3T3-L1

◢ SRX2599827: 3T3-L1

◢ SRX2599828: 3T3-L1

◢ SRX2599829: 3T3-L1

◢ SRX2599830: 3T3-L1

◢ SRX2957352: AtT-20

◢ SRX218284: B cells

◢ SRX218288: B cells

◢ SRX700951: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX700952: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348143: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348144: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348145: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348146: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX6988645: Cerebellum

◢ SRX6988646: Cerebellum

◢ SRX6988647: Cerebellum

◢ SRX6988648: Cerebellum

◢ SRX20793618: Cortical neuron

◢ SRX20793619: Cortical neuron

◢ SRX20793622: Cortical neuron

◢ SRX20793623: Cortical neuron

◢ SRX12601724: Dendritic Cells

◢ SRX12601725: Dendritic Cells

◢ SRX12601726: Dendritic Cells

◢ SRX12601727: Dendritic Cells

◢ SRX204343: Embryonic brains

◢ SRX4395347: Embryonic brains

◢ SRX4395356: Embryonic brains

◢ DRX021197: Embryonic head

◢ DRX021198: Embryonic limb

◢ SRX204337: Embryonic limb

◢ SRX204338: Embryonic limb

◢ SRX2440040: EpiSC

◢ SRX2440041: EpiSC

◢ SRX2440050: EpiSC

◢ SRX2440051: EpiSC

◢ SRX2440060: EpiSC

◢ SRX2440061: EpiSC

◢ SRX022688: ES cells

◢ SRX022689: ES cells

◢ SRX085109: ES cells

◢ SRX085110: ES cells

◢ SRX10560008: ES cells

◢ SRX10560009: ES cells

◢ SRX10560010: ES cells

◢ SRX10560011: ES cells

◢ SRX11237495: ES cells

◢ SRX11237501: ES cells

◢ SRX11237507: ES cells

◢ SRX11237513: ES cells

◢ SRX11237519: ES cells

◢ SRX11237525: ES cells

◢ SRX11237531: ES cells

◢ SRX11237537: ES cells

◢ SRX12204127: ES cells

◢ SRX12204128: ES cells

◢ SRX12204129: ES cells

◢ SRX12204130: ES cells

◢ SRX12204137: ES cells

◢ SRX12204138: ES cells

◢ SRX12204139: ES cells

◢ SRX12204140: ES cells

◢ SRX12204141: ES cells

◢ SRX12204142: ES cells

◢ SRX12204149: ES cells

◢ SRX12204150: ES cells

◢ SRX12204151: ES cells

◢ SRX12204152: ES cells

◢ SRX12204153: ES cells

◢ SRX12204154: ES cells

◢ SRX12963303: ES cells

◢ SRX13439102: ES cells

◢ SRX13439103: ES cells

◢ SRX13439104: ES cells

◢ SRX13439130: ES cells

◢ SRX17024519: ES cells

◢ SRX17024520: ES cells

◢ SRX17024521: ES cells

◢ SRX17024522: ES cells

◢ SRX2440036: ES cells

◢ SRX2440037: ES cells

◢ SRX2440070: ES cells

◢ SRX2440071: ES cells

◢ SRX2440080: ES cells

◢ SRX2440081: ES cells

◢ SRX3197475: ES cells

◢ SRX3197480: ES cells

◢ SRX4167137: ES cells

◢ SRX5088234: ES cells

◢ SRX5088236: ES cells

◢ SRX5125620: ES cells

◢ SRX5125624: ES cells

◢ SRX5401524: ES cells

◢ SRX5401525: ES cells

◢ SRX5401526: ES cells

◢ SRX5401527: ES cells

◢ SRX5401528: ES cells

◢ SRX5401529: ES cells

◢ SRX5436004: ES cells

◢ SRX5858855: ES cells

◢ SRX5858856: ES cells

◢ SRX5858857: ES cells

◢ SRX5858858: ES cells

◢ SRX6831866: ES cells

◢ SRX6831867: ES cells

◢ SRX7786279: ES cells

◢ SRX7786280: ES cells

◢ SRX7786281: ES cells

◢ SRX7786282: ES cells

◢ SRX3024490: Forelimb

◢ SRX8820366: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820367: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903169: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903170: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903174: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903175: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX2436121: Mammary glands

◢ SRX2564298: Mammary glands

◢ SRX2564307: Mammary glands

◢ SRX2564312: Mammary glands

◢ SRX2564313: Mammary glands

◢ SRX022702: MEF

◢ SRX022703: MEF

◢ SRX120168: MEF

◢ SRX120169: MEF

◢ SRX120170: MEF

◢ SRX17241102: MEF

◢ SRX17241103: MEF

◢ SRX17241104: MEF

◢ SRX17241105: MEF

◢ SRX17241107: MEF

◢ SRX17241108: MEF

◢ SRX17241109: MEF

◢ SRX17241110: MEF

◢ SRX17241113: MEF

◢ SRX17241114: MEF

◢ SRX17241115: MEF

◢ SRX17241116: MEF

◢ SRX17241117: MEF

◢ SRX17241118: MEF

◢ SRX17241119: MEF

◢ SRX17241120: MEF

◢ SRX17241123: MEF

◢ SRX17241125: MEF

◢ SRX976733: MEF

◢ SRX976734: MEF

◣ SRX5358275: mESCs, differentiated

◢ SRX5358276: mESCs, differentiated

◢ SRX5358277: mESCs, differentiated

◢ SRX5358278: mESCs, differentiated

◢ SRX5358279: mESCs, differentiated

◢ SRX5358280: mESCs, differentiated

◢ SRX125273: mESC derived neural cells

◢ SRX8693946: Neutrophils

◢ SRX8693947: Neutrophils

◢ SRX8693948: Neutrophils

◢ SRX8693949: Neutrophils

◢ SRX8693950: Neutrophils

◢ SRX8693951: Neutrophils

◢ SRX8694033: Neutrophils

◢ SRX8694034: Neutrophils

◢ SRX8694041: Neutrophils

◢ SRX8694042: Neutrophils

◢ SRX11169408: NIH/3T3

◢ SRX11169409: NIH/3T3

◢ SRX26175725: NIH/3T3

◢ SRX26175728: NIH/3T3

◢ SRX20340931: Pre-B cells

◢ SRX20340932: Pre-B cells

◢ SRX20340933: Pre-B cells

◢ SRX20340934: Pre-B cells

◢ SRX11169415: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169416: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169417: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169418: Scid.adh.2c2

◢ SRX1631901: Sperm

◢ SRX2370885: Sperm

◢ SRX7348141: Thymocytes

◢ SRX7348142: Thymocytes

◢ SRX4546348: Trophoblast stem cells

◢ SRX4546349: Trophoblast stem cells

◢ SRX1306535: T cells

◢ SRX5318290: Uterus

◢ SRX5318291: Uterus

◢ SRX5318292: Uterus

◢ Smc1a: STRING
Tcstv3 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Cacng4 ↻ ≫
Txndc11 ↻ ≫
Eif4b ↻ ≫
Rfng ↻ ≫
Gps1 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Ptges2 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Recql4 ↻ ≫
Lrrc14 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Gpt ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Ggcx ↻ ≫
Nkx2-6 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Man2b2 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Plekhh3 ↻ ≫
Cntnap1 ↻ ≫
Ccr10 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Mmp2 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Ethe1 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Crym ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Traf4 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Pofut2 ↻ ≫
Kcnma1 ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Gpr142 ↻ ≫
Btbd17 ↻ ≫
Pnliprp2 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Cldn13 ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Ccn4 ↻ ≫
Zfp219 ↻ ≫
Tmem253 ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Gnai2 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Lat ↻ ≫
Ccdc177 ↻ ≫
Rpl22 ↻ ≫
Chd5 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Fbxw4 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Hexb ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Mcts2 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Clrn3 ↻ ≫
Aoc2 ↻ ≫
Psme3 ↻ ≫
Aoc3 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Ptp4a3 ↻ ≫
E2f6 ↻ ≫
Gatd3a ↻ ≫
Rer1 ↻ ≫
Morn1 ↻ ≫
Rnasel ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Znfx1 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Rab3b ↻ ≫
R3hdm4 ↻ ≫
Kiss1r ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Igsf9 ↻ ≫
Tagln2 ↻ ≫
E030030I06Rik ↻ ≫
Bub1b ↻ ≫
Il17b ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Sytl3 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Pam16 ↻ ≫
Vasn ↻ ≫
H2-DMb2 ↻ ≫
H2-DMa ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Carmil3 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Nxph3 ↻ ≫
Slc7a15 ↻ ≫
Ing4 ↻ ≫
Cryl1 ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Adora1 ↻ ≫
E230025N22Rik ↻ ≫
Rhbdf1 ↻ ≫
Mpg ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Ms4a6d ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Igdcc3 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Fam174c ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Aspg ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Polr2h ↻ ≫
Clcn2 ↻ ≫
Thpo ↻ ≫
Chrd ↻ ≫
Fgfr2 ↻ ≫
Plag1 ↻ ≫
Macrod1 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Psmb10 ↻ ≫
Ctrl ↻ ≫
Ctdspl ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Fgfbp1 ↻ ≫
Gsn ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Grin2d ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Mrps17 ↻ ≫
Ddx56 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Comt ↻ ≫
Cacna1s ↻ ≫
Ascl5 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Poc1a ↻ ≫
Rbp7 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Htra4 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Gstt4 ↻ ≫
Ppp1r1b ↻ ≫
Eps8l3 ↻ ≫
Marcksl1 ↻ ≫
Mpv17l2 ↻ ≫
Ifi30 ↻ ≫
Pik3r2 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Pif1 ↻ ≫
Vps37c ↻ ≫
4930590J08Rik ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Napg ↻ ≫
Cpsf4l ↻ ≫
Smdt1 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Rbm28 ↻ ≫
Prrt4 ↻ ≫
Slc44a2 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Cebpe ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Lrfn2 ↻ ≫
Traf1 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Dapp1 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Inpp5j ↻ ≫
Kcnc4 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Tac4 ↻ ≫
Lst1 ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Wnt7a ↻ ≫
Elovl3 ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Ufsp1 ↻ ≫
Ache ↻ ≫
Igfbp5 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
Pld5 ↻ ≫
Pitx2 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Col20a1 ↻ ≫
Tbc1d2 ↻ ≫
Arhgef10l ↻ ≫
Mtarc2 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Ifitm6 ↻ ≫
Ifitm3 ↻ ≫
Igf1r ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Spon1 ↻ ≫
Serpinb1b ↻ ≫
Plcb1 ↻ ≫
Nppc ↻ ≫
Exoc3l4 ↻ ≫
Lbhd2 ↻ ≫
Mex3a ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Nol6 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Cadm3 ↻ ≫
Dhx58 ↻ ≫
Kat2a ↻ ≫
Chst1 ↻ ≫
Bcl2l11 ↻ ≫
Mycn ↻ ≫
1700001O22Rik ↻ ≫
Gipr ↻ ≫
Snrpd2 ↻ ≫
Qpctl ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Twf2 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Sema4c ↻ ≫
Kcnc1 ↻ ≫
Echdc3 ↻ ≫
Olfr71 ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Dok4 ↻ ≫
Nxph4 ↻ ≫
Unc5b ↻ ≫
Rrm2 ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Clcf1 ↻ ≫
Camk2g ↻ ≫
Ralgds ↻ ≫
Ahdc1 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Mtss2 ↻ ≫
Spock1 ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Gm38499 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Rpl3 ↻ ≫
Syngr1 ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Psmb7 ↻ ≫
Tekt1 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Lyl1 ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Slc30a1 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Ckap2 ↻ ≫
Ephb2 ↻ ≫
Susd2 ↻ ≫
Sympk ↻ ≫
Foxa3 ↻ ≫
Lemd2 ↻ ≫
Col26a1 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Fth1 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Smim12 ↻ ≫
Rfxap ↻ ≫
Dact2 ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Cfap45 ↻ ≫
Ripk3 ↻ ≫
Adcy4 ↻ ≫
Prkce ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Atp8b3 ↻ ≫
Fhod3 ↻ ≫
Niban1 ↻ ≫
Taar6 ↻ ≫
Taar5 ↻ ≫
Smug1 ↻ ≫
Wnt3a ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Rbsn ↻ ≫
Adnp ↻ ≫
Dnajc7 ↻ ≫
Nkiras2 ↻ ≫
Tmem200a ↻ ≫
Ror2 ↻ ≫
Gnat1 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Th ↻ ≫
Slc38a3 ↻ ≫
Cox8b ↻ ≫
Prelp ↻ ≫
Optc ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Rttn ↻ ≫
Alkbh3 ↻ ≫
Efna3 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Fmnl1 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Gpr61 ↻ ≫
Gnai3 ↻ ≫
Casq2 ↻ ≫
Prss35 ↻ ≫
Aqp12 ↻ ≫
Smim24 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Dohh ↻ ≫
Aanat ↻ ≫
Axin2 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Trp53rka ↻ ≫
Adgrb1 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Neil2 ↻ ≫
P2rx1 ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Gm3667 ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Scgb1a1 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Irf2bp1 ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Sema4a ↻ ≫
Slc17a7 ↻ ≫
Pih1d1 ↻ ≫
Aldh16a1 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Tecpr1 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Dhh ↻ ≫
Cln6 ↻ ≫
Crb2 ↻ ≫
1810046K07Rik ↻ ≫
Spsb1 ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Fdxr ↻ ≫
Eno1 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Tprkb ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Ccnd1 ↻ ≫
Cd2 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
P3h4 ↻ ≫
Fkbp10 ↻ ≫
Stk11 ↻ ≫
Rpl37a ↻ ≫
Smoc2 ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Pla2g5 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Gm13030 ↻ ≫
Zfp612 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Psrc1 ↻ ≫
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Vav2 ↻ ≫
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Trappc3l ↻ ≫
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Ttpal ↻ ≫
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Tsfm ↻ ≫
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Clu ↻ ≫
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Pnoc ↻ ≫
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Dcxr ↻ ≫
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Srrd ↻ ≫
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Gsk3a ↻ ≫
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Ttc16 ↻ ≫
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Erf ↻ ≫
Lif ↻ ≫
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Lta ↻ ≫
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Fxyd1 ↻ ≫
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Zp3 ↻ ≫
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Gpr20 ↻ ≫
Acss1 ↻ ≫
Capn5 ↻ ≫
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Znhit3 ↻ ≫
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Flot1 ↻ ≫
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Cited2 ↻ ≫
Ctsf ↻ ≫
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Ccs ↻ ≫
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Tfeb ↻ ≫
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Mrpl46 ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
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Nelfe ↻ ≫
Cfb ↻ ≫
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Nr1i3 ↻ ≫
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Faiml ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
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Cdk9 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
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1600014C10Rik ↻ ≫
Riox2 ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Dsel ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Dalrd3 ↻ ≫
Ndufaf3 ↻ ≫
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Aamp ↻ ≫
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Capn11 ↻ ≫
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Ndrg4 ↻ ≫
Babam1 ↻ ≫
Ankle1 ↻ ≫
Nynrin ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
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Msra ↻ ≫
Pirt ↻ ≫
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