ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX7248105 | CD4 CD8 double positive cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◣ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Vps13d ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Rgcc ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Astl ↻ ≫
Gtf3c6 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Cbfa2t3 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Gimap8 ↻ ≫
Carmil2 ↻ ≫
Actb ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Actl10 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Nfkbil1 ↻ ≫
Atp6v1g2 ↻ ≫
Ppp1r3b ↻ ≫
Socs1 ↻ ≫
Ddah2 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Tmem134 ↻ ≫
Aip ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Pkn3 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Ap4e1 ↻ ≫
Eif3g ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Fh1 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Slc35b1 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
B3gnt9 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Timeless ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Tlk1 ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Mapk14 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Ago2 ↻ ≫
Kctd18 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Ankrd6 ↻ ≫
Trim29 ↻ ≫
Mien1 ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Hsd17b14 ↻ ≫
Ap1ar ↻ ≫
Mrpl23 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Dhcr7 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Rrp1 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
Zfp341 ↻ ≫
Lrig2 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Timp2 ↻ ≫
Camta2 ↻ ≫
Trp53i11 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Cacnb3 ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Lsmem1 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Nyap1 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Sh3pxd2a ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
H13 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Dhx30 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Pdlim7 ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Atp1a1 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Rtca ↻ ≫
Itga4 ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Erap1 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
St8sia1 ↻ ≫
Endov ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Vsir ↻ ≫
Extl3 ↻ ≫
Utp25 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Crbn ↻ ≫
Tap2 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Gorasp2 ↻ ≫
B3gnt2 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Lpcat4 ↻ ≫
Cutc ↻ ≫
Cox15 ↻ ≫
Lyrm9 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Dlg4 ↻ ≫
Prpf38b ↻ ≫
Cxcr4 ↻ ≫
Cbl ↻ ≫
Zfp786 ↻ ≫
Fam222a ↻ ≫
Ppm1f ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
Uchl5 ↻ ≫
Ro60 ↻ ≫
Mars1 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Mafb ↻ ≫
Fam3c ↻ ≫
Ddx46 ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Tex22 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Zpbp ↻ ≫
Mfhas1 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Ints7 ↻ ≫
Dtl ↻ ≫
Gabpb2 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Epc1 ↻ ≫
Tex14 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Tctex1d1 ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Fads6 ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Hbq1b ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
2200002D01Rik ↻ ≫
Atl2 ↻ ≫
Ankrd46 ↻ ≫
Stk4 ↻ ≫
Gh ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Nabp2 ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Grap2 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Gm3336 ↻ ≫
Tlcd1 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Amigo3 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Mrps14 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
N4bp2l2 ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Scai ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Lrrc3c ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Wdr37 ↻ ≫
Itpa ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Fntb ↻ ≫
Cenps ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Tesmin ↻ ≫
Fam151b ↻ ≫
Dtwd2 ↻ ≫
2810021J22Rik ↻ ≫
Sf3a3 ↻ ≫
Prag1 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Stk11 ↻ ≫
Dctpp1 ↻ ≫
H2aw ↻ ≫
Ppp1ccb ↻ ≫
Ppp1cc ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Rab27a ↻ ≫
Sec31b ↻ ≫
Hsdl1 ↻ ≫
Dnaaf1 ↻ ≫
Prickle4 ↻ ≫
Frs3 ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Rpl7l1 ↻ ≫
Dipk1a ↻ ≫
Kifc5b ↻ ≫
Rcc1 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Taf1c ↻ ≫
Mei1 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Mei4 ↻ ≫
Mro ↻ ≫
Afmid ↻ ≫
Aars2 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Slc2a4 ↻ ≫
Flt3l ↻ ≫
Frmd6 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Dennd6b ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Ermp1 ↻ ≫
Bcl6b ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Ovca2 ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Tubb2a ↻ ≫
Kdm3b ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Tagln ↻ ≫
Dph7 ↻ ≫
Sirt7 ↻ ≫
Abcc5 ↻ ≫
Eif3f ↻ ≫
Cdk17 ↻ ≫
Pds5b ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Ndufb7 ↻ ≫
Inpp5e ↻ ≫
Cercam ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
Mrps12 ↻ ≫
Sars2 ↻ ≫
Gcc1 ↻ ≫
Polr2j ↻ ≫
Gosr1 ↻ ≫
Pprc1 ↻ ≫
Arid1a ↻ ≫
Trpv2 ↻ ≫
Cblc ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
H6pd ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Cdh24 ↻ ≫
Arl8b ↻ ≫
Ddit4 ↻ ≫
Tchp ↻ ≫
Lat ↻ ≫
Fam131b ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Them6 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Nlrx1 ↻ ≫
Setd5 ↻ ≫
Inhbe ↻ ≫
Slc9a1 ↻ ≫
Nob1 ↻ ≫
LOC114841036 ↻ ≫
Fkbp2 ↻ ≫
Irf9 ↻ ≫
Trib3 ↻ ≫
Rpl10a ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
Tspoap1 ↻ ≫
Nle1 ↻ ≫
Dpp8 ↻ ≫
Pomk ↻ ≫
Hsd17b6 ↻ ≫
Cdk6 ↻ ≫
Hmgcs2 ↻ ≫
Fam83d ↻ ≫
Cracr2a ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Ddx24 ↻ ≫
Rplp0 ↻ ≫
Mrpl3 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Gle1 ↻ ≫
A130010J15Rik ↻ ≫
Ndufb10 ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Cabyr ↻ ≫
Prnd ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Fem1a ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Med13 ↻ ≫
Spry1 ↻ ≫
Rpl37rt ↻ ≫
Ephb6 ↻ ≫
Bambi ↻ ≫
Wdr38 ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Ppp1r14a ↻ ≫
H1f4 ↻ ≫
Smyd3 ↻ ≫
Ccr9 ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
Limk2 ↻ ≫
Ccdc63 ↻ ≫
Dcaf10 ↻ ≫
Trim69 ↻ ≫
Mrpl38 ↻ ≫
Esyt2 ↻ ≫
Chd8 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Mmgt2 ↻ ≫
Lrrc75a ↻ ≫
Nol7 ↻ ≫
Patz1 ↻ ≫
Adnp ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Epb41l4b ↻ ≫
Exosc6 ↻ ≫
Mrps23 ↻ ≫
Mbnl3 ↻ ≫
Ripor1 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Ilf2 ↻ ≫
Cfap54 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Cenpx ↻ ≫
Lrrc45 ↻ ≫
Synj2 ↻ ≫
Pip5k1c ↻ ≫
C2cd5 ↻ ≫
Tmem11 ↻ ≫
9530077C05Rik ↻ ≫
Col27a1 ↻ ≫
Mynn ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Psmd11 ↻ ≫
Ogfod2 ↻ ≫
Cbr3 ↻ ≫
Frg1 ↻ ≫
Zbtb45 ↻ ≫
Slc35b2 ↻ ≫
Samd4b ↻ ≫
Gmfg ↻ ≫
H3c6 ↻ ≫
Rasgrp2 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Mlst8 ↻ ≫
Rpl11 ↻ ≫
Elf4 ↻ ≫
Sdad1 ↻ ≫
Btnl10 ↻ ≫
Gm572 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
T2 ↻ ≫
Trappc3l ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Agfg1 ↻ ≫
Atad2b ↻ ≫
Psap ↻ ≫
Mcidas ↻ ≫
Tjp3 ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Lrrc59 ↻ ≫
Dnlz ↻ ≫
Phospho2 ↻ ≫
Ccdc173 ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Abhd8 ↻ ≫
Pip4k2a ↻ ≫
Iqgap2 ↻ ≫
Psip1 ↻ ≫
Scrn2 ↻ ≫
Cntnap1 ↻ ≫
Cdh23 ↻ ≫
Tmem220 ↻ ≫
4930402F06Rik ↻ ≫
Npc1 ↻ ≫
Uckl1 ↻ ≫
Abca2 ↻ ≫
Tatdn3 ↻ ≫
Nsl1 ↻ ≫
Lrrc1 ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Hddc3 ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Car13 ↻ ≫
Ago1 ↻ ≫
Ep400 ↻ ≫
Fndc1 ↻ ≫
Tmem259 ↻ ≫
Mdp1 ↻ ≫
Drg2 ↻ ≫
Slc6a19 ↻ ≫
Dand5 ↻ ≫
Ccdc142 ↻ ≫
Hrob ↻ ≫
Mtres1 ↻ ≫
Ift46 ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Det1 ↻ ≫
Pccb ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Secisbp2 ↻ ≫
Zdhhc18 ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Cplane2 ↻ ≫
Arpc3 ↻ ≫
Stim1 ↻ ≫
Spg7 ↻ ≫
Pafah1b3 ↻ ≫
Ggnbp1 ↻ ≫
Bak1 ↻ ≫
Ndrg3 ↻ ≫
Npff ↻ ≫
Nrn1l ↻ ≫
Rab5if ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Scrib ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Sirt6 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Tnfaip8l2 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Hmg20b ↻ ≫
Tram1 ↻ ≫
Cul5 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Stxbp3 ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Ajuba ↻ ≫
Spag1 ↻ ≫
Ube2i ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Clpb ↻ ≫
H1f3 ↻ ≫
H3c7 ↻ ≫
Ddx18 ↻ ≫
H2bc9 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Alox12e ↻ ≫
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