ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX8737122 | CD4 CD8 double positive cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◣ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Tcstv3 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Sorbs1 ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Txndc11 ↻ ≫
Lst1 ↻ ≫
Tnf ↻ ≫
Lta ↻ ≫
Ltb ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Traf4 ↻ ≫
Sec22c ↻ ≫
E030030I06Rik ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
H2-DMb2 ↻ ≫
H2-DMa ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
9230019H11Rik ↻ ≫
Rfng ↻ ≫
Gps1 ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Lag3 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
R3hdm4 ↻ ≫
Kiss1r ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Ptges2 ↻ ≫
Fam174c ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Ing4 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Utp25 ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Mcts2 ↻ ≫
Lrrc32 ↻ ≫
Ethe1 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Qrich2 ↻ ≫
Rbp7 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Zbtb46 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Lat ↻ ≫
Ms4a6d ↻ ≫
Zfp36 ↻ ≫
Paf1 ↻ ≫
Med29 ↻ ≫
Ggcx ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Ccdc177 ↻ ≫
Ddx39a ↻ ≫
Tmem88 ↻ ≫
Naa38 ↻ ≫
Cyb5d1 ↻ ≫
Ccnd3 ↻ ≫
Taf8 ↻ ≫
Mien1 ↻ ≫
Grb7 ↻ ≫
Fgfbp1 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Slc44a2 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Ppp1r1b ↻ ≫
Cpsf4l ↻ ≫
Smdt1 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Acads ↻ ≫
Unc119b ↻ ≫
Mex3a ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Srp14 ↻ ≫
Ccr7 ↻ ≫
4930415O20Rik ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Ramp3 ↻ ≫
Scgb1a1 ↻ ≫
Runx1 ↻ ≫
Ankrd6 ↻ ≫
Spon1 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Hdhd5 ↻ ≫
H2bc4 ↻ ≫
H2ac6 ↻ ≫
Ndufa4l2 ↻ ≫
Shmt2 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Endou ↻ ≫
Trpv4 ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Camk2g ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Carmil2 ↻ ≫
Zfp219 ↻ ≫
Tmem253 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Rgcc ↻ ≫
Cdk2ap2 ↻ ≫
Pitpnm1 ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
Zfpm1 ↻ ≫
Spsb1 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Mknk2 ↻ ≫
Setd1b ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Nol12 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Lgals1 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Tmem161a ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
Tespa1 ↻ ≫
Brf1 ↻ ≫
Pacs2 ↻ ≫
Pdpk1 ↻ ≫
H3c2 ↻ ≫
H4c2 ↻ ≫
H4c1 ↻ ≫
H3c1 ↻ ≫
H1f1 ↻ ≫
Ptpn6 ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Gnai2 ↻ ≫
Gipr ↻ ≫
Spats1 ↻ ≫
Snrpd2 ↻ ≫
Qpctl ↻ ≫
Rinl ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Cbfa2t3 ↻ ≫
Sord ↻ ≫
Cd2 ↻ ≫
1700001O22Rik ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Map7d1 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Cnr2 ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
Gsk3a ↻ ≫
H3c3 ↻ ≫
H2bc3 ↻ ≫
H2ac4 ↻ ≫
Plag1 ↻ ≫
Ppt2 ↻ ≫
Egfl8 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Tsen2 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Gm21149 ↻ ≫
Lman1l ↻ ≫
Iyd ↻ ≫
Zfp786 ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Vps13d ↻ ≫
Tgfbr1 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Gcat ↻ ≫
Galr3 ↻ ≫
Psma1 ↻ ≫
Msl1 ↻ ≫
Klf16 ↻ ≫
Ahdc1 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Mpv17l2 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Pik3r2 ↻ ≫
Ifi30 ↻ ≫
Gpr61 ↻ ≫
Gnai3 ↻ ≫
Med7 ↻ ≫
Pfn3 ↻ ≫
F12 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Zfp131 ↻ ≫
Mdga1 ↻ ≫
Id2 ↻ ≫
Carns1 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Timp2 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Eif1b ↻ ≫
H3c13 ↻ ≫
H2bc18 ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Brf2 ↻ ≫
Hmgb2 ↻ ≫
Ppp1r3b ↻ ≫
Ccn4 ↻ ≫
0610009B22Rik ↻ ≫
Arrdc5 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Smim41 ↻ ≫
Tnk2 ↻ ≫
Gsg1 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Ehd1 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Phb2 ↻ ≫
Emg1 ↻ ≫
Elavl3 ↻ ≫
Fam135b ↻ ≫
Gpt2 ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Rrp1 ↻ ≫
Col26a1 ↻ ≫
Trmt61a ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Dapk3 ↻ ≫
Eef2 ↻ ≫
Pias4 ↻ ≫
Polg2 ↻ ≫
Ddx5 ↻ ≫
Cep95 ↻ ≫
Padi6 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Pgf ↻ ≫
Smtnl1 ↻ ≫
Timm10 ↻ ≫
Slc43a1 ↻ ≫
Map3k14 ↻ ≫
Sytl3 ↻ ≫
Gm38499 ↻ ≫
Stk32c ↻ ≫
Lrrc27 ↻ ≫
Tomm6 ↻ ≫
Prickle4 ↻ ≫
Frs3 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
H2-Ob ↻ ≫
Crbn ↻ ≫
Dctpp1 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Tff3 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Cldn13 ↻ ≫
Prkce ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Llgl2 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Tbc1d22a ↻ ≫
Bub1b ↻ ≫
Capn3 ↻ ≫
H3c10 ↻ ≫
H2bc13 ↻ ≫
H2ac13 ↻ ≫
H2bc14 ↻ ≫
Nfatc2ip ↻ ≫
Scn2b ↻ ≫
Cd79a ↻ ≫
Rps19 ↻ ≫
Cd82 ↻ ≫
Mrpl23 ↻ ≫
Ifngr1 ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Fstl3 ↻ ≫
Gatd3a ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Psmb10 ↻ ≫
Ctrl ↻ ≫
Nab2 ↻ ≫
Pml ↻ ≫
Crocc ↻ ≫
Cd52 ↻ ≫
Ubxn11 ↻ ≫
H4c11 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Gnat1 ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H3c4 ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Mrpl38 ↻ ≫
Scrn2 ↻ ≫
Sp6 ↻ ≫
Sh3bgrl3 ↻ ≫
Runx3 ↻ ≫
Tmem134 ↻ ≫
Aip ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
H2bc12 ↻ ≫
H2ac12 ↻ ≫
H3c6 ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
H2bc8 ↻ ≫
H2ac8 ↻ ≫
H2bc11 ↻ ≫
H2ac11 ↻ ≫
H2bc7 ↻ ≫
H2ac7 ↻ ≫
Gpr3 ↻ ≫
Ccr4 ↻ ≫
Cd164l2 ↻ ≫
Pkn3 ↻ ≫
H4c6 ↻ ≫
H3c8 ↻ ≫
H3c7 ↻ ≫
H2bc9 ↻ ≫
Atad2b ↻ ≫
Ubxn2a ↻ ≫
Ypel3 ↻ ≫
Tbx6 ↻ ≫
Actb ↻ ≫
Sh3bp2 ↻ ≫
Tnip2 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Poc1a ↻ ≫
Vgf ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Asb2 ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
H4c17 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Odf3 ↻ ≫
Urah ↻ ≫
Stmn1 ↻ ≫
Sema4a ↻ ≫
P2rx1 ↻ ≫
Pde4c ↻ ≫
Gm3336 ↻ ≫
Slc39a5 ↻ ≫
Nabp2 ↻ ≫
Cacnb3 ↻ ≫
Bcl2l14 ↻ ≫
Vps29 ↻ ≫
Rad9b ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
Dhx30 ↻ ≫
Sema4d ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Pnkd ↻ ≫
Gpbar1 ↻ ≫
Aamp ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Rita1 ↻ ≫
Ddx54 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Ppp2r5c ↻ ≫
C3 ↻ ≫
Rffl ↻ ≫
Tmem234 ↻ ≫
Eif3i ↻ ≫
Dcdc2b ↻ ≫
Ppm1f ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Clpp ↻ ≫
Sf3a3 ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
H3c11 ↻ ≫
H2bc22 ↻ ≫
H2ac22 ↻ ≫
H1f5 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Mrgbp ↻ ≫
Ogfr ↻ ≫
Ephb2 ↻ ≫
Padi2 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Ankrd46 ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Kctd11 ↻ ≫
Slc5a5 ↻ ≫
Rpl18a ↻ ≫
Ap4e1 ↻ ≫
Nsun6 ↻ ≫
Prrg2 ↻ ≫
Nosip ↻ ≫
1700003F12Rik ↻ ≫
Gemin4 ↻ ≫
Dbil5 ↻ ≫
Actl10 ↻ ≫
Necab3 ↻ ≫
H4c12 ↻ ≫
H2bc15 ↻ ≫
H2ac15 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Reg4 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Kcnh2 ↻ ≫
Nos3 ↻ ≫
Clec2m ↻ ≫
Nfkbie ↻ ≫
Tmem151b ↻ ≫
Ndufaf6 ↻ ≫
Icam2 ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Slc16a13 ↻ ≫
Rnasek ↻ ≫
0610010K14Rik ↻ ≫
Bcl6b ↻ ≫
Macrod1 ↻ ≫
Bckdhb ↻ ≫
Lrig2 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
H2ac10 ↻ ≫
H4c8 ↻ ≫
Tlcd3b ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Dazap2 ↻ ≫
Arhgef2 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Igdcc3 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Chaf1a ↻ ≫
Acbd3 ↻ ≫
Rusf1 ↻ ≫
Sephs2 ↻ ≫
Psrc1 ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Ifnk ↻ ≫
Vps45 ↻ ≫
Ap1ar ↻ ≫
Ubtf ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Amdhd1 ↻ ≫
Ccdc38 ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Gnb3 ↻ ≫
Car14 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Grhpr ↻ ≫
Nxph3 ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Itgb7 ↻ ≫
Ptk2b ↻ ≫
Celsr1 ↻ ≫
Cisd3 ↻ ≫
Pcgf2 ↻ ≫
H1f3 ↻ ≫
Anxa6 ↻ ≫
Mrps11 ↻ ≫
Mrpl46 ↻ ≫
Zfp91 ↻ ≫
Lpxn ↻ ≫
Msh6 ↻ ≫
Gm17455 ↻ ≫
Ccn6 ↻ ≫
Lpcat4 ↻ ≫
Nadsyn1 ↻ ≫
Dhcr7 ↻ ≫
Ndufc1 ↻ ≫
Naa15 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Npw ↻ ≫
Slc9a3r2 ↻ ≫
Capn11 ↻ ≫
Slc27a1 ↻ ≫
Tmem221 ↻ ≫
Lmna ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Nxnl1 ↻ ≫
Bcl11b ↻ ≫
Twf2 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Ccnd1 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Erfe ↻ ≫
Tsc22d4 ↻ ≫
Nyap1 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
S1pr4 ↻ ≫
Ncln ↻ ≫
Prss8 ↻ ≫
Ambp ↻ ≫
Cd8a ↻ ≫
Ipo4 ↻ ≫
Bphl ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Naglu ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Prr7 ↻ ≫
Lsmem1 ↻ ≫
Cstf1 ↻ ≫
Aurka ↻ ≫
Trim8 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
U2af1 ↻ ≫
Taf1c ↻ ≫
Adad2 ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Ost4 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Eps8l3 ↻ ≫
Kctd17 ↻ ≫
Hdac7 ↻ ≫
Tnfrsf18 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
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Pagr1a ↻ ≫
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