ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX11237514 | ES cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◣ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Greb1 ↻ ≫
Nkx2-6 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
E030030I06Rik ↻ ≫
Fbxw4 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Osbpl1a ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
Pknox1 ↻ ≫
Gm525 ↻ ≫
Cdh12 ↻ ≫
Hexb ↻ ≫
Vmn2r4 ↻ ≫
H1f3 ↻ ≫
H3c6 ↻ ≫
H4c6 ↻ ≫
H2bc8 ↻ ≫
H2ac8 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
H1f6 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Txndc11 ↻ ≫
Vmn1r2 ↻ ≫
Cox8c ↻ ≫
Tmem267 ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
H3c3 ↻ ≫
H2bc3 ↻ ≫
Rpl30 ↻ ≫
Erich5 ↻ ≫
Pald1 ↻ ≫
Plekhn1 ↻ ≫
Klhl17 ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H3c4 ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
H2bc7 ↻ ≫
H2ac7 ↻ ≫
H4c11 ↻ ≫
Cd209a ↻ ≫
Muc3 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Copz1 ↻ ≫
H3c8 ↻ ≫
H3c7 ↻ ≫
H2bc9 ↻ ≫
H2bc1 ↻ ≫
H2ac1 ↻ ≫
H1f4 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
H3c13 ↻ ≫
H2bc18 ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Csf2ra ↻ ≫
Trim50 ↻ ≫
Fkbp6 ↻ ≫
Lypd11 ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
Pramel32 ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
H3c2 ↻ ≫
H2ac4 ↻ ≫
Aadacl2fm1 ↻ ≫
Pcdh20 ↻ ≫
H2bc21 ↻ ≫
H2ac21 ↻ ≫
H2ac20 ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
H4c17 ↻ ≫
Mylip ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
H3c11 ↻ ≫
H2bc22 ↻ ≫
H2ac22 ↻ ≫
H1f5 ↻ ≫
Cbr1 ↻ ≫
Setd4 ↻ ≫
Rpl3 ↻ ≫
Rack1 ↻ ≫
Trim41 ↻ ≫
Zc3h10 ↻ ≫
Rpl41 ↻ ≫
Gm5458 ↻ ≫
Zbtb37 ↻ ≫
Gsdma2 ↻ ≫
H4c2 ↻ ≫
H4c1 ↻ ≫
H3c1 ↻ ≫
Dux ↻ ≫
Gm4981 ↻ ≫
Gapdh ↻ ≫
Dapk3 ↻ ≫
Eef2 ↻ ≫
H2bc12 ↻ ≫
H2ac12 ↻ ≫
H4c18 ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
H2bc11 ↻ ≫
H2ac11 ↻ ≫
Hsp90ab1 ↻ ≫
Slc35b2 ↻ ≫
H2ac10 ↻ ≫
H4c8 ↻ ≫
Cd79a ↻ ≫
Rps19 ↻ ≫
Vps52 ↻ ≫
Rps18 ↻ ≫
B3galt4 ↻ ≫
9230019H11Rik ↻ ≫
Pisd ↻ ≫
H4f16 ↻ ≫
H2aj ↻ ≫
Eef1a1 ↻ ≫
Vmn1r3 ↻ ≫
H4c12 ↻ ≫
H2bc15 ↻ ≫
H2ac15 ↻ ≫
Cacnb1 ↻ ≫
Rpl19 ↻ ≫
Speer4e ↻ ≫
Dnajb14 ↻ ≫
H2az1 ↻ ≫
H2bc4 ↻ ≫
H2ac6 ↻ ≫
Rps5 ↻ ≫
Rnf225 ↻ ≫
H1f1 ↻ ≫
Atat1 ↻ ≫
Ppp1r10 ↻ ≫
Mrps18b ↻ ≫
Rcc1 ↻ ≫
H3c10 ↻ ≫
H2bc13 ↻ ≫
H2ac13 ↻ ≫
H2bc14 ↻ ≫
Rps9 ↻ ≫
Hspa1b ↻ ≫
Speer4f1 ↻ ≫
Atp6v0c ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Rpl13 ↻ ≫
Hspa8 ↻ ≫
Slc3a2 ↻ ≫
Wdr74 ↻ ≫
Tubb5 ↻ ≫
Mdc1 ↻ ≫
Smim12 ↻ ≫
Dcdc2a ↻ ≫
Eif4a2 ↻ ≫
Snapc5 ↻ ≫
Rpl4 ↻ ≫
Zwilch ↻ ≫
Cyb5r1 ↻ ≫
Gm51598 ↻ ≫
Adipor1 ↻ ≫
Actg1 ↻ ≫
Dpagt1 ↻ ≫
Hmbs ↻ ≫
H2ax ↻ ≫
Galk1 ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Unk ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Ptma ↻ ≫
Polg2 ↻ ≫
Ddx5 ↻ ≫
Cep95 ↻ ≫
Rps12 ↻ ≫
Idh3b ↻ ≫
Gramd2 ↻ ≫
1810009A15Rik ↻ ≫
Ints5 ↻ ≫
Uqcc3 ↻ ≫
Lbhd1 ↻ ≫
Trim17 ↻ ≫
H3f4 ↻ ≫
H2bu2 ↻ ≫
H2aw ↻ ≫
Nat10 ↻ ≫
Mat2a ↻ ≫
Rps6kc1 ↻ ≫
Rps19bp1 ↻ ≫
Atf4 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
AI413582 ↻ ≫
Rpl10a ↻ ≫
Znfx1 ↻ ≫
Cd68 ↻ ≫
Eif4a1 ↻ ≫
Npm1 ↻ ≫
Rplp0 ↻ ≫
Gcn1 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Bax ↻ ≫
Fcgr3 ↻ ≫
Slc5a5 ↻ ≫
Rpl18a ↻ ≫
Rnf151 ↻ ≫
Rps2 ↻ ≫
Rpl3l ↻ ≫
Ndufb10 ↻ ≫
Eif3g ↻ ≫
Ppan ↻ ≫
Rab42 ↻ ≫
Sumf2 ↻ ≫
Ppia ↻ ≫
Rpl38 ↻ ≫
Ttyh2 ↻ ≫
Tmsb10 ↻ ≫
Fam166a ↻ ≫
Tubb4b ↻ ≫
Stpg3 ↻ ≫
Rpsa ↻ ≫
Rpl23 ↻ ≫
1700001P01Rik ↻ ≫
Cwc25 ↻ ≫
Eif4b ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Rfng ↻ ≫
Gps1 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
H2-DMb2 ↻ ≫
H2-DMa ↻ ≫
Ptges2 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Mmp2 ↻ ≫
R3hdm4 ↻ ≫
Kiss1r ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Cldn13 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Rer1 ↻ ≫
Morn1 ↻ ≫
Scgb1a1 ↻ ≫
Ccdc177 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Fam174c ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Ubd ↻ ≫
Olfr95 ↻ ≫
Olfr94 ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Sec22c ↻ ≫
Ethe1 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Zfp219 ↻ ≫
Tmem253 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Fgfbp1 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Cfap45 ↻ ≫
Qrich2 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Cpsf4l ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Ggcx ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban1 ↻ ≫
Slc26a11 ↻ ≫
Sgsh ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Bphl ↻ ≫
Slc44a2 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Trpv4 ↻ ≫
Cd2 ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Mcts2 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Slc7a15 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Gm38499 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Sema4a ↻ ≫
Clrn3 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Lrrc45 ↻ ≫
Cenpx ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Lst1 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Dcxr ↻ ≫
Tagln2 ↻ ≫
Igsf9 ↻ ≫
Cox8b ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Olfr71 ↻ ≫
Htra4 ↻ ≫
Dapp1 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Rttn ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Gnai2 ↻ ≫
Echdc3 ↻ ≫
Azin2 ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Gpr142 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Inpp5j ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Sapcd1 ↻ ≫
Ppp1r1b ↻ ≫
Tac4 ↻ ≫
Fbxo9 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Tekt1 ↻ ≫
Tbc1d2 ↻ ≫
Traf4 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Wfdc21 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Fxyd7 ↻ ≫
Fxyd1 ↻ ≫
S100a10 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Map7d1 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Trpc4ap ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Zfpm1 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Susd2 ↻ ≫
Mrm3 ↻ ≫
Glod4 ↻ ≫
Map3k9 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Arl5c ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Cryaa ↻ ≫
Mex3a ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Ncf4 ↻ ≫
Crym ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Gatd3a ↻ ≫
Twf2 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Prkce ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Ahdc1 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Fgf20 ↻ ≫
Pfdn4 ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Adcy6 ↻ ≫
Filip1 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Psrc1 ↻ ≫
Ephb2 ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Zfp691 ↻ ≫
Smdt1 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
1700001O22Rik ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
Cep20 ↻ ≫
Man2b2 ↻ ≫
Sema4c ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Cln6 ↻ ≫
0610009B22Rik ↻ ≫
4930415O20Rik ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
Tprkb ↻ ≫
Tubb4a ↻ ≫
Tnfsf9 ↻ ≫
Eaf2 ↻ ≫
Ccn4 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Bace1 ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Plag1 ↻ ≫
Chchd7 ↻ ≫
Igdcc3 ↻ ≫
Gm19345 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Pde4dip ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Alg8 ↻ ≫
Pofut2 ↻ ≫
Rnasel ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Gm15517 ↻ ≫
Acp4 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Camk2n1 ↻ ≫
Bub1b ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Camk2g ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Dcaf7 ↻ ≫
Shc4 ↻ ≫
Capg ↻ ≫
Tmem198 ↻ ≫
Chpf ↻ ≫
Sytl3 ↻ ≫
E330021D16Rik ↻ ≫
Carmil3 ↻ ≫
Cables2 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Cited2 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Nxph3 ↻ ≫
Gsn ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Btbd17 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Srp9 ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Clcf1 ↻ ≫
Recql4 ↻ ≫
Lrrc14 ↻ ≫
Ccnd3 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Gpt ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Taf8 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Bcl2l14 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Rbp7 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Odf3 ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Rab3b ↻ ≫
Zfp385c ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Lyl1 ↻ ≫
Ing4 ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Mosmo ↻ ≫
Urah ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Pfn3 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Rph3al ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
C1qtnf9 ↻ ≫
Srp14 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Capn11 ↻ ≫
Spon1 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Ehd1 ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Ramp3 ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Tbxas1 ↻ ≫
Ttc24 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Cyp26a1 ↻ ≫
Ccdc65 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Tmem161a ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Iqgap3 ↻ ≫
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