ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc1a

Query protein: Smc1a
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX17241123 | MEF
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc1a's Target genes

◢ Smc1a: Average

◢ SRX2599821: 3T3-L1

◢ SRX2599822: 3T3-L1

◢ SRX2599823: 3T3-L1

◢ SRX2599824: 3T3-L1

◢ SRX2599825: 3T3-L1

◢ SRX2599826: 3T3-L1

◢ SRX2599827: 3T3-L1

◢ SRX2599828: 3T3-L1

◢ SRX2599829: 3T3-L1

◢ SRX2599830: 3T3-L1

◢ SRX2957352: AtT-20

◢ SRX218284: B cells

◢ SRX218288: B cells

◢ SRX700951: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX700952: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348143: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348144: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348145: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348146: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX6988645: Cerebellum

◢ SRX6988646: Cerebellum

◢ SRX6988647: Cerebellum

◢ SRX6988648: Cerebellum

◢ SRX20793618: Cortical neuron

◢ SRX20793619: Cortical neuron

◢ SRX20793622: Cortical neuron

◢ SRX20793623: Cortical neuron

◢ SRX12601724: Dendritic Cells

◢ SRX12601725: Dendritic Cells

◢ SRX12601726: Dendritic Cells

◢ SRX12601727: Dendritic Cells

◢ SRX204343: Embryonic brains

◢ SRX4395347: Embryonic brains

◢ SRX4395356: Embryonic brains

◢ DRX021197: Embryonic head

◢ DRX021198: Embryonic limb

◢ SRX204337: Embryonic limb

◢ SRX204338: Embryonic limb

◢ SRX2440040: EpiSC

◢ SRX2440041: EpiSC

◢ SRX2440050: EpiSC

◢ SRX2440051: EpiSC

◢ SRX2440060: EpiSC

◢ SRX2440061: EpiSC

◢ SRX022688: ES cells

◢ SRX022689: ES cells

◢ SRX085109: ES cells

◢ SRX085110: ES cells

◢ SRX10560008: ES cells

◢ SRX10560009: ES cells

◢ SRX10560010: ES cells

◢ SRX10560011: ES cells

◢ SRX11237495: ES cells

◢ SRX11237501: ES cells

◢ SRX11237507: ES cells

◢ SRX11237513: ES cells

◢ SRX11237519: ES cells

◢ SRX11237525: ES cells

◢ SRX11237531: ES cells

◢ SRX11237537: ES cells

◢ SRX12204127: ES cells

◢ SRX12204128: ES cells

◢ SRX12204129: ES cells

◢ SRX12204130: ES cells

◢ SRX12204137: ES cells

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◢ SRX12204139: ES cells

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◢ SRX12204142: ES cells

◢ SRX12204149: ES cells

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◢ SRX12204151: ES cells

◢ SRX12204152: ES cells

◢ SRX12204153: ES cells

◢ SRX12204154: ES cells

◢ SRX12963303: ES cells

◢ SRX13439102: ES cells

◢ SRX13439103: ES cells

◢ SRX13439104: ES cells

◢ SRX13439130: ES cells

◢ SRX17024519: ES cells

◢ SRX17024520: ES cells

◢ SRX17024521: ES cells

◢ SRX17024522: ES cells

◢ SRX2440036: ES cells

◢ SRX2440037: ES cells

◢ SRX2440070: ES cells

◢ SRX2440071: ES cells

◢ SRX2440080: ES cells

◢ SRX2440081: ES cells

◢ SRX3197475: ES cells

◢ SRX3197480: ES cells

◢ SRX4167137: ES cells

◢ SRX5088234: ES cells

◢ SRX5088236: ES cells

◢ SRX5125620: ES cells

◢ SRX5125624: ES cells

◢ SRX5401524: ES cells

◢ SRX5401525: ES cells

◢ SRX5401526: ES cells

◢ SRX5401527: ES cells

◢ SRX5401528: ES cells

◢ SRX5401529: ES cells

◢ SRX5436004: ES cells

◢ SRX5858855: ES cells

◢ SRX5858856: ES cells

◢ SRX5858857: ES cells

◢ SRX5858858: ES cells

◢ SRX6831866: ES cells

◢ SRX6831867: ES cells

◢ SRX7786279: ES cells

◢ SRX7786280: ES cells

◢ SRX7786281: ES cells

◢ SRX7786282: ES cells

◢ SRX3024490: Forelimb

◢ SRX8820366: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820367: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903169: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903170: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903174: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903175: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX2436121: Mammary glands

◢ SRX2564298: Mammary glands

◢ SRX2564307: Mammary glands

◢ SRX2564312: Mammary glands

◢ SRX2564313: Mammary glands

◢ SRX022702: MEF

◢ SRX022703: MEF

◢ SRX120168: MEF

◢ SRX120169: MEF

◢ SRX120170: MEF

◢ SRX17241102: MEF

◢ SRX17241103: MEF

◢ SRX17241104: MEF

◢ SRX17241105: MEF

◢ SRX17241107: MEF

◢ SRX17241108: MEF

◢ SRX17241109: MEF

◢ SRX17241110: MEF

◢ SRX17241113: MEF

◢ SRX17241114: MEF

◢ SRX17241115: MEF

◢ SRX17241116: MEF

◢ SRX17241117: MEF

◢ SRX17241118: MEF

◢ SRX17241119: MEF

◢ SRX17241120: MEF

◣ SRX17241123: MEF

◢ SRX17241125: MEF

◢ SRX976733: MEF

◢ SRX976734: MEF

◢ SRX5358275: mESCs, differentiated

◢ SRX5358276: mESCs, differentiated

◢ SRX5358277: mESCs, differentiated

◢ SRX5358278: mESCs, differentiated

◢ SRX5358279: mESCs, differentiated

◢ SRX5358280: mESCs, differentiated

◢ SRX125273: mESC derived neural cells

◢ SRX8693946: Neutrophils

◢ SRX8693947: Neutrophils

◢ SRX8693948: Neutrophils

◢ SRX8693949: Neutrophils

◢ SRX8693950: Neutrophils

◢ SRX8693951: Neutrophils

◢ SRX8694033: Neutrophils

◢ SRX8694034: Neutrophils

◢ SRX8694041: Neutrophils

◢ SRX8694042: Neutrophils

◢ SRX11169408: NIH/3T3

◢ SRX11169409: NIH/3T3

◢ SRX26175725: NIH/3T3

◢ SRX26175728: NIH/3T3

◢ SRX20340931: Pre-B cells

◢ SRX20340932: Pre-B cells

◢ SRX20340933: Pre-B cells

◢ SRX20340934: Pre-B cells

◢ SRX11169415: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169416: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169417: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169418: Scid.adh.2c2

◢ SRX1631901: Sperm

◢ SRX2370885: Sperm

◢ SRX7348141: Thymocytes

◢ SRX7348142: Thymocytes

◢ SRX4546348: Trophoblast stem cells

◢ SRX4546349: Trophoblast stem cells

◢ SRX1306535: T cells

◢ SRX5318290: Uterus

◢ SRX5318291: Uterus

◢ SRX5318292: Uterus

◢ Smc1a: STRING
Cldn34d ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Fes ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Plcl1 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Cdc42ep2 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Uqcrc1 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Snrnp200 ↻ ≫
1810024B03Rik ↻ ≫
Dpys ↻ ≫
Casq2 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Htra3 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Phf12 ↻ ≫
Nek3 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Ctnnbip1 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Slc39a10 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Ccn5 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
Spz1 ↻ ≫
A530032D15Rik ↻ ≫
Pfkfb3 ↻ ≫
Crym ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
Ifitm3 ↻ ≫
Prok1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
Faf2 ↻ ≫
Cd200r1 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Sema5b ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Muc3 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Faiml ↻ ≫
Crb2 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Afap1l2 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Dsel ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Agfg1 ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Phyhd1 ↻ ≫
Sh3rf3 ↻ ≫
Apeh ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Atp6v0c ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Carmil1 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Pappa2 ↻ ≫
Nol12 ↻ ≫
Lgals1 ↻ ≫
Gucy2f ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Pigv ↻ ≫
Erp27 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Aadat ↻ ≫
Nav2 ↻ ≫
Tlk1 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Mtf1 ↻ ≫
Cep55 ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Upk3bl ↻ ≫
Ap3m2 ↻ ≫
Fam219b ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Uevld ↻ ≫
4930590J08Rik ↻ ≫
Igf1r ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Foxs1 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Aoc2 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Ghrh ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Plcb1 ↻ ≫
Rtca ↻ ≫
Dbt ↻ ≫
Plrg1 ↻ ≫
Fgb ↻ ≫
Bin3 ↻ ≫
Dst ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Ppil1 ↻ ≫
BC004004 ↻ ≫
Chd1l ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Syngr1 ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Wnt5b ↻ ≫
Cyp26b1 ↻ ≫
Kcnh4 ↻ ≫
Hcrt ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Elovl3 ↻ ≫
Trappc5 ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Ggnbp1 ↻ ≫
Bak1 ↻ ≫
Igsf23 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Lmtk2 ↻ ≫
Dipk1a ↻ ≫
Rnf17 ↻ ≫
Dennd2a ↻ ≫
Fh1 ↻ ≫
Cebpa ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Art4 ↻ ≫
Ccdc85a ↻ ≫
Myof ↻ ≫
Pdcd4 ↻ ≫
Cthrc1 ↻ ≫
Dpysl3 ↻ ≫
Sema5a ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Gucy1b2 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Epg5 ↻ ≫
9330182O14Rik ↻ ≫
Lamtor5 ↻ ≫
Ajuba ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Fmnl1 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Nudcd1 ↻ ≫
Eny2 ↻ ≫
Irak3 ↻ ≫
Foxa1 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Ssh2 ↻ ≫
Elob ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
T2 ↻ ≫
Gata3 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Aqp8 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Spa17 ↻ ≫
Siae ↻ ≫
Cndp2 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Ptk2b ↻ ≫
Mpv17l ↻ ≫
Pdxdc1 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Fxyd1 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Smim24 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Odf3 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
Optc ↻ ≫
Col26a1 ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Neil2 ↻ ≫
Ppy ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Cebpe ↻ ≫
Ctrl ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Gm15517 ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Cox8b ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Fbxo9 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Prkrip1 ↻ ≫
Plbd2 ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Gm3336 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
S1pr4 ↻ ≫
Pyy ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Cables2 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Tmem221 ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Nxnl1 ↻ ≫
Hipk4 ↻ ≫
Slc17a7 ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Ifi30 ↻ ≫
Slc52a3 ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Id2 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Cnih2 ↻ ≫
Pde4c ↻ ≫
Msra ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Zfp385c ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Tmprss9 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Pnkd ↻ ≫
Aamp ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Dusp8 ↻ ≫
Csk ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Ache ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Endou ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
P2rx1 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Gatd1 ↻ ≫
Trpc4ap ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Ceacam1 ↻ ≫
Tmem250-ps ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Ralgds ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Tekt4 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Synm ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Gsn ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Zfp653 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
4930558K02Rik ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Crip1 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Cox6a2 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
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Notum ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
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Aen ↻ ≫
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Prss35 ↻ ≫
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Ramp3 ↻ ≫
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1110032A03Rik ↻ ≫
Vgf ↻ ≫
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Lsr ↻ ≫
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Tap2 ↻ ≫
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Sipa1l2 ↻ ≫
Glul ↻ ≫
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Ago2 ↻ ≫
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Mien1 ↻ ≫
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Adm ↻ ≫
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Cldn11 ↻ ≫
Pml ↻ ≫
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Wnt3a ↻ ≫
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Crh ↻ ≫
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Haao ↻ ≫
Crocc ↻ ≫
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H2-L ↻ ≫
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Parl ↻ ≫
Scrn2 ↻ ≫
Scai ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
Becn1 ↻ ≫
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Th ↻ ≫
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