ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Dnmt1

Query protein: Dnmt1
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX23732077 | PN24
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Dnmt1's Target genes

◢ Dnmt1: Average

◢ ERX631804: ES cells

◢ ERX631805: ES cells

◢ ERX631809: ES cells

◢ ERX631810: ES cells

◢ ERX631816: ES cells

◢ ERX631817: ES cells

◢ ERX631821: ES cells

◢ ERX631822: ES cells

◢ SRX14786113: Liver

◢ SRX23732072: PH2

◢ SRX23732073: PH2

◢ SRX23732074: PH2

◢ SRX23732075: PN24

◢ SRX23732076: PN24

◣ SRX23732077: PN24

◢ Dnmt1: STRING
Oasl1 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Vmn2r4 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Ddx6 ↻ ≫
Taf15 ↻ ≫
Lrpprc ↻ ≫
Fus ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
Ccdc9 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
Dffb ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Npm2 ↻ ≫
Tardbp ↻ ≫
Map7d1 ↻ ≫
Syncrip ↻ ≫
Otud6b ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Ppm1l ↻ ≫
Stpg2 ↻ ≫
Ccdc126 ↻ ≫
Slc25a3 ↻ ≫
Dnajb1 ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Dgat2 ↻ ≫
Nsmce1 ↻ ≫
Dux ↻ ≫
Wdr36 ↻ ≫
Nfat5 ↻ ≫
Cd47 ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
Mrps35 ↻ ≫
Nemp2 ↻ ≫
Tmem29 ↻ ≫
Phrf1 ↻ ≫
Gbe1 ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Zfp619 ↻ ≫
Trrap ↻ ≫
Ints9 ↻ ≫
Hmbox1 ↻ ≫
Cnot6 ↻ ≫
Vps4a ↻ ≫
Rpl9 ↻ ≫
Lias ↻ ≫
Sltm ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Rbm27 ↻ ≫
Opn3 ↻ ≫
Brms1l ↻ ≫
Nr1d2 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Ctnnbl1 ↻ ≫
Elp1 ↻ ≫
Atxn2l ↻ ≫
Atp1b3 ↻ ≫
Abitram ↻ ≫
Selenos ↻ ≫
BC005537 ↻ ≫
Nhej1 ↻ ≫
Esyt2 ↻ ≫
Dguok ↻ ≫
Sod2 ↻ ≫
Oxsm ↻ ≫
Ngly1 ↻ ≫
Zfp433 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Pygo2 ↻ ≫
Pemt ↻ ≫
Mafa ↻ ≫
Gm32687 ↻ ≫
Ctdp1 ↻ ≫
Tmx4 ↻ ≫
Ss18 ↻ ≫
Rab11a ↻ ≫
Trp53inp2 ↻ ≫
Ruvbl2 ↻ ≫
Mrpl55 ↻ ≫
Impdh2 ↻ ≫
Gys1 ↻ ≫
Ccdc85c ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Flcn ↻ ≫
Ube2b ↻ ≫
Nbn ↻ ≫
Slc25a38 ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Tia1 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Med28 ↻ ≫
Anapc4 ↻ ≫
Trmt10a ↻ ≫
Srd5a3 ↻ ≫
Mttp ↻ ≫
Pdk1 ↻ ≫
Zfp119b ↻ ≫
Rxylt1 ↻ ≫
Polg ↻ ≫
Cenpp ↻ ≫
Washc4 ↻ ≫
Sec61g ↻ ≫
H3c7 ↻ ≫
Zfp560 ↻ ≫
H4c11 ↻ ≫
Taf4 ↻ ≫
Rbm39 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Rpl23 ↻ ≫
Rbm33 ↻ ≫
Nsmce3 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Capn7 ↻ ≫
Mfn1 ↻ ≫
Papss1 ↻ ≫
Wdr34 ↻ ≫
R3hcc1 ↻ ≫
Prkdc ↻ ≫
Mcm4 ↻ ≫
Chrac1 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Zbtb49 ↻ ≫
Tpgs1 ↻ ≫
Tmem260 ↻ ≫
Sec61a2 ↻ ≫
Rrn3 ↻ ≫
Rcbtb1 ↻ ≫
Lyar ↻ ≫
Tmem254c ↻ ≫
Tmem254b ↻ ≫
Tmem254a ↻ ≫
Phospho2 ↻ ≫
Ccdc173 ↻ ≫
Alg14 ↻ ≫
Xrn2 ↻ ≫
Rab10 ↻ ≫
Ywhag ↻ ≫
Sp3 ↻ ≫
Pole3 ↻ ≫
Pik3r3 ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Ltv1 ↻ ≫
Dpysl2 ↻ ≫
Avl9 ↻ ≫
4933430I17Rik ↻ ≫
Tm9sf2 ↻ ≫
Rps8 ↻ ≫
Rpl39 ↻ ≫
Hint3 ↻ ≫
Tmco1 ↻ ≫
Rfk ↻ ≫
Btf3 ↻ ≫
Rfc4 ↻ ≫
Rcn2 ↻ ≫
Prelid3b ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Hdac2 ↻ ≫
Ate1 ↻ ≫
Anapc10 ↻ ≫
Abce1 ↻ ≫
Ppil4 ↻ ≫
Ndufa10 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Zc3h6 ↻ ≫
Wdsub1 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Sf3b3 ↻ ≫
Fam227b ↻ ≫
Dtwd1 ↻ ≫
Cpsf6 ↻ ≫
Cog4 ↻ ≫
Wbp11 ↻ ≫
Ubxn2b ↻ ≫
Ptdss1 ↻ ≫
Nipa2 ↻ ≫
Mterf3 ↻ ≫
Mpc2 ↻ ≫
Lancl2 ↻ ≫
Gan ↻ ≫
Dcaf6 ↻ ≫
Cln8 ↻ ≫
BC049715 ↻ ≫
Usp16 ↻ ≫
Ubn1 ↻ ≫
Tchp ↻ ≫
Sgo1 ↻ ≫
Glyr1 ↻ ≫
Ddost ↻ ≫
C1d ↻ ≫
Atf4 ↻ ≫
Aco1 ↻ ≫
Vwa8 ↻ ≫
Trub2 ↻ ≫
Impact ↻ ≫
H3c2 ↻ ≫
H2ac4 ↻ ≫
Zranb2 ↻ ≫
Top1 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Smyd3 ↻ ≫
Rraga ↻ ≫
Pts ↻ ≫
Ppig ↻ ≫
Polr3g ↻ ≫
Mblac2 ↻ ≫
Imp3 ↻ ≫
Hibadh ↻ ≫
Frg2f1 ↻ ≫
Foxj3 ↻ ≫
Dnajc9 ↻ ≫
Cacng2 ↻ ≫
Slc35b2 ↻ ≫
Raly ↻ ≫
Nfkb2 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Lta4h ↻ ≫
Ints13 ↻ ≫
Fgfr1op2 ↻ ≫
Dcaf10 ↻ ≫
Tox4 ↻ ≫
Tmem87a ↻ ≫
Suclg1 ↻ ≫
Rab2b ↻ ≫
Pcif1 ↻ ≫
Ganc ↻ ≫
Drosha ↻ ≫
Atp6v0c ↻ ≫
6030458C11Rik ↻ ≫
Ttc32 ↻ ≫
Rita1 ↻ ≫
Prkar2b ↻ ≫
Polr3b ↻ ≫
Ddx54 ↻ ≫
Vcpkmt ↻ ≫
Utp18 ↻ ≫
Tmem123 ↻ ≫
Psmd7 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Nabp1 ↻ ≫
Mbtd1 ↻ ≫
Ikzf5 ↻ ≫
Fibin ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Cct8 ↻ ≫
Acadsb ↻ ≫
Zbtb46 ↻ ≫
Usp35 ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Smim10l1 ↻ ≫
Sdr39u1 ↻ ≫
Mars2 ↻ ≫
Kctd21 ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Thrap3 ↻ ≫
Slain2 ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Parp2 ↻ ≫
Mib2 ↻ ≫
Cst3 ↻ ≫
Atxn7l3b ↻ ≫
Snapc1 ↻ ≫
Pttg1ip ↻ ≫
Pigx ↻ ≫
Osbpl9 ↻ ≫
Mcm7 ↻ ≫
Cmtr1 ↻ ≫
Cep19 ↻ ≫
Ap4m1 ↻ ≫
A430005L14Rik ↻ ≫
Rbm22 ↻ ≫
Klhl24 ↻ ≫
Fkbp3 ↻ ≫
Atf7ip ↻ ≫
Tctex1d2 ↻ ≫
Slc25a32 ↻ ≫
Naxd ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Gm13290 ↻ ≫
Gm13289 ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Dcaf13 ↻ ≫
Cutc ↻ ≫
Cstf2t ↻ ≫
Cox15 ↻ ≫
Chd1l ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Hps3 ↻ ≫
Commd8 ↻ ≫
1190007I07Rik ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Tmem168 ↻ ≫
Stx12 ↻ ≫
Saysd1 ↻ ≫
Rps14 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Ccdc17 ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
AW209491 ↻ ≫
Rbm25 ↻ ≫
Glg1 ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Dnal4 ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Myl12a ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
H2bc7 ↻ ≫
H2ac7 ↻ ≫
Bbc3 ↻ ≫
Zfp738 ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Rps17 ↻ ≫
Pole4 ↻ ≫
P2rx4 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Lpcat4 ↻ ≫
Atp6v0e ↻ ≫
Tmem179b ↻ ≫
Stn1 ↻ ≫
Snx21 ↻ ≫
Mtif2 ↻ ≫
Llph ↻ ≫
Diablo ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Taok2 ↻ ≫
Rpn2 ↻ ≫
Rala ↻ ≫
Pigg ↻ ≫
Mroh8 ↻ ≫
Lonp1 ↻ ≫
Cbwd1 ↻ ≫
Catsperd ↻ ≫
Sfswap ↻ ≫
Kif5b ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Elovl5 ↻ ≫
Afg3l1 ↻ ≫
Adsl ↻ ≫
Poc5 ↻ ≫
Ncln ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Zfp963 ↻ ≫
Tcta ↻ ≫
Rhoa ↻ ≫
C87436 ↻ ≫
Nphp4 ↻ ≫
Mtmr10 ↻ ≫
Mob1a ↻ ≫
Kcnab2 ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Adam17 ↻ ≫
Sf3b5 ↻ ≫
Setdb2 ↻ ≫
Gm45935 ↻ ≫
Dnajc1 ↻ ≫
Cmc1 ↻ ≫
Cab39l ↻ ≫
Nudcd3 ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Morc3 ↻ ≫
Smarca5 ↻ ≫
Paip1 ↻ ≫
Eed ↻ ≫
Mrpl23 ↻ ≫
Mrpl4 ↻ ≫
H2bc12 ↻ ≫
H2ac12 ↻ ≫
Plpp1 ↻ ≫
Cmc2 ↻ ≫
Cenpn ↻ ≫
Arih2 ↻ ≫
Kit ↻ ≫
Rasal1 ↻ ≫
Pparg ↻ ≫
Tcf21 ↻ ≫
Rgs10 ↻ ≫
Reln ↻ ≫
Socs1 ↻ ≫
Nr4a1 ↻ ≫
Hgf ↻ ≫
Cdh1 ↻ ≫
Spry2 ↻ ≫