ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc1a

Query protein: Smc1a
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX4395347 | Embryonic brains
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc1a's Target genes

◢ Smc1a: Average

◢ SRX2599821: 3T3-L1

◢ SRX2599822: 3T3-L1

◢ SRX2599823: 3T3-L1

◢ SRX2599824: 3T3-L1

◢ SRX2599825: 3T3-L1

◢ SRX2599826: 3T3-L1

◢ SRX2599827: 3T3-L1

◢ SRX2599828: 3T3-L1

◢ SRX2599829: 3T3-L1

◢ SRX2599830: 3T3-L1

◢ SRX2957352: AtT-20

◢ SRX218284: B cells

◢ SRX218288: B cells

◢ SRX700951: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX700952: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348143: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348144: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348145: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348146: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX6988645: Cerebellum

◢ SRX6988646: Cerebellum

◢ SRX6988647: Cerebellum

◢ SRX6988648: Cerebellum

◢ SRX20793618: Cortical neuron

◢ SRX20793619: Cortical neuron

◢ SRX20793622: Cortical neuron

◢ SRX20793623: Cortical neuron

◢ SRX12601724: Dendritic Cells

◢ SRX12601725: Dendritic Cells

◢ SRX12601726: Dendritic Cells

◢ SRX12601727: Dendritic Cells

◢ SRX204343: Embryonic brains

◣ SRX4395347: Embryonic brains

◢ SRX4395356: Embryonic brains

◢ DRX021197: Embryonic head

◢ DRX021198: Embryonic limb

◢ SRX204337: Embryonic limb

◢ SRX204338: Embryonic limb

◢ SRX2440040: EpiSC

◢ SRX2440041: EpiSC

◢ SRX2440050: EpiSC

◢ SRX2440051: EpiSC

◢ SRX2440060: EpiSC

◢ SRX2440061: EpiSC

◢ SRX022688: ES cells

◢ SRX022689: ES cells

◢ SRX085109: ES cells

◢ SRX085110: ES cells

◢ SRX10560008: ES cells

◢ SRX10560009: ES cells

◢ SRX10560010: ES cells

◢ SRX10560011: ES cells

◢ SRX11237495: ES cells

◢ SRX11237501: ES cells

◢ SRX11237507: ES cells

◢ SRX11237513: ES cells

◢ SRX11237519: ES cells

◢ SRX11237525: ES cells

◢ SRX11237531: ES cells

◢ SRX11237537: ES cells

◢ SRX12204127: ES cells

◢ SRX12204128: ES cells

◢ SRX12204129: ES cells

◢ SRX12204130: ES cells

◢ SRX12204137: ES cells

◢ SRX12204138: ES cells

◢ SRX12204139: ES cells

◢ SRX12204140: ES cells

◢ SRX12204141: ES cells

◢ SRX12204142: ES cells

◢ SRX12204149: ES cells

◢ SRX12204150: ES cells

◢ SRX12204151: ES cells

◢ SRX12204152: ES cells

◢ SRX12204153: ES cells

◢ SRX12204154: ES cells

◢ SRX12963303: ES cells

◢ SRX13439102: ES cells

◢ SRX13439103: ES cells

◢ SRX13439104: ES cells

◢ SRX13439130: ES cells

◢ SRX17024519: ES cells

◢ SRX17024520: ES cells

◢ SRX17024521: ES cells

◢ SRX17024522: ES cells

◢ SRX2440036: ES cells

◢ SRX2440037: ES cells

◢ SRX2440070: ES cells

◢ SRX2440071: ES cells

◢ SRX2440080: ES cells

◢ SRX2440081: ES cells

◢ SRX3197475: ES cells

◢ SRX3197480: ES cells

◢ SRX4167137: ES cells

◢ SRX5088234: ES cells

◢ SRX5088236: ES cells

◢ SRX5125620: ES cells

◢ SRX5125624: ES cells

◢ SRX5401524: ES cells

◢ SRX5401525: ES cells

◢ SRX5401526: ES cells

◢ SRX5401527: ES cells

◢ SRX5401528: ES cells

◢ SRX5401529: ES cells

◢ SRX5436004: ES cells

◢ SRX5858855: ES cells

◢ SRX5858856: ES cells

◢ SRX5858857: ES cells

◢ SRX5858858: ES cells

◢ SRX6831866: ES cells

◢ SRX6831867: ES cells

◢ SRX7786279: ES cells

◢ SRX7786280: ES cells

◢ SRX7786281: ES cells

◢ SRX7786282: ES cells

◢ SRX3024490: Forelimb

◢ SRX8820366: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820367: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903169: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903170: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903174: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903175: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX2436121: Mammary glands

◢ SRX2564298: Mammary glands

◢ SRX2564307: Mammary glands

◢ SRX2564312: Mammary glands

◢ SRX2564313: Mammary glands

◢ SRX022702: MEF

◢ SRX022703: MEF

◢ SRX120168: MEF

◢ SRX120169: MEF

◢ SRX120170: MEF

◢ SRX17241102: MEF

◢ SRX17241103: MEF

◢ SRX17241104: MEF

◢ SRX17241105: MEF

◢ SRX17241107: MEF

◢ SRX17241108: MEF

◢ SRX17241109: MEF

◢ SRX17241110: MEF

◢ SRX17241113: MEF

◢ SRX17241114: MEF

◢ SRX17241115: MEF

◢ SRX17241116: MEF

◢ SRX17241117: MEF

◢ SRX17241118: MEF

◢ SRX17241119: MEF

◢ SRX17241120: MEF

◢ SRX17241123: MEF

◢ SRX17241125: MEF

◢ SRX976733: MEF

◢ SRX976734: MEF

◢ SRX5358275: mESCs, differentiated

◢ SRX5358276: mESCs, differentiated

◢ SRX5358277: mESCs, differentiated

◢ SRX5358278: mESCs, differentiated

◢ SRX5358279: mESCs, differentiated

◢ SRX5358280: mESCs, differentiated

◢ SRX125273: mESC derived neural cells

◢ SRX8693946: Neutrophils

◢ SRX8693947: Neutrophils

◢ SRX8693948: Neutrophils

◢ SRX8693949: Neutrophils

◢ SRX8693950: Neutrophils

◢ SRX8693951: Neutrophils

◢ SRX8694033: Neutrophils

◢ SRX8694034: Neutrophils

◢ SRX8694041: Neutrophils

◢ SRX8694042: Neutrophils

◢ SRX11169408: NIH/3T3

◢ SRX11169409: NIH/3T3

◢ SRX26175725: NIH/3T3

◢ SRX26175728: NIH/3T3

◢ SRX20340931: Pre-B cells

◢ SRX20340932: Pre-B cells

◢ SRX20340933: Pre-B cells

◢ SRX20340934: Pre-B cells

◢ SRX11169415: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169416: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169417: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169418: Scid.adh.2c2

◢ SRX1631901: Sperm

◢ SRX2370885: Sperm

◢ SRX7348141: Thymocytes

◢ SRX7348142: Thymocytes

◢ SRX4546348: Trophoblast stem cells

◢ SRX4546349: Trophoblast stem cells

◢ SRX1306535: T cells

◢ SRX5318290: Uterus

◢ SRX5318291: Uterus

◢ SRX5318292: Uterus

◢ Smc1a: STRING
Cldn34d ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Abca3 ↻ ≫
Abca17 ↻ ≫
Cacng4 ↻ ≫
Gm525 ↻ ≫
E030030I06Rik ↻ ≫
Dcdc2a ↻ ≫
Lactbl1 ↻ ≫
Gnai2 ↻ ≫
Hsd11b1 ↻ ≫
Wdr63 ↻ ≫
Txndc11 ↻ ≫
Zfp473 ↻ ≫
Vrk3 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Nicn1 ↻ ≫
Amt ↻ ≫
Epop ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Rbms2 ↻ ≫
Gls2 ↻ ≫
Cldn11 ↻ ≫
Gm51573 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
9230019H11Rik ↻ ≫
Scn5a ↻ ≫
Atp2c1 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Trmt12 ↻ ≫
Dux ↻ ≫
Gm4981 ↻ ≫
Epha7 ↻ ≫
Dand5 ↻ ≫
Ice1 ↻ ≫
Wdr25 ↻ ≫
Wars ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Ip6k3 ↻ ≫
Fbxw4 ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Sema5a ↻ ≫
Tarbp1 ↻ ≫
Pdgfra ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Rer1 ↻ ≫
Morn1 ↻ ≫
Lyl1 ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Secisbp2l ↻ ≫
Sdhaf3 ↻ ≫
Prkce ↻ ≫
Ffar3 ↻ ≫
Ffar1 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
1700001O22Rik ↻ ≫
Adamtsl5 ↻ ≫
Kcnc1 ↻ ≫
Rttn ↻ ≫
Mepe ↻ ≫
Ercc1 ↻ ≫
Rpl12 ↻ ≫
Lrsam1 ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Kcnq3 ↻ ≫
Msi1 ↻ ≫
Tmem115 ↻ ≫
Ufl1 ↻ ≫
Nxph3 ↻ ≫
Sst ↻ ≫
Tmem250-ps ↻ ≫
Cd79a ↻ ≫
Tle6 ↻ ≫
Arhgef1 ↻ ≫
4931408C20Rik ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Ptprf ↻ ≫
Pdcd4 ↻ ≫
Aqp6 ↻ ≫
Aqp5 ↻ ≫
5730409E04Rik ↻ ≫
Gm10354 ↻ ≫
Nkx6-1 ↻ ≫
Ankar ↻ ≫
Sema4a ↻ ≫
Pnmal2 ↻ ≫
Pnmal1 ↻ ≫
Ttf1 ↻ ≫
Cfap77 ↻ ≫
Bloc1s5 ↻ ≫
Pxdn ↻ ≫
Prkrip1 ↻ ≫
Tfap4 ↻ ≫
Srp9 ↻ ≫
Mrtfa ↻ ≫
Erp27 ↻ ≫
Nkx2-2 ↻ ≫
Heatr1 ↻ ≫
Sox6 ↻ ≫
Hoxc6 ↻ ≫
Hoxc5 ↻ ≫
ccdc198 ↻ ≫
Nxph4 ↻ ≫
Lmna ↻ ≫
Grk1 ↻ ≫
Il17rd ↻ ≫
Cntfr ↻ ≫
Srgap3 ↻ ≫
Cebpe ↻ ≫
Snrpf ↻ ≫
Spr ↻ ≫
Ap2s1 ↻ ≫
Ceacam9 ↻ ≫
Dnajb5 ↻ ≫
Aspg ↻ ≫
Dpys ↻ ≫
Adra2a ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
Prmt3 ↻ ≫
Il17b ↻ ≫
Ramp3 ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
Fam53b ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
Tfap2b ↻ ≫
Olfr957 ↻ ≫
Crb2 ↻ ≫
Wscd1 ↻ ≫
Btnl9 ↻ ≫
Kcna10 ↻ ≫
Pitx2 ↻ ≫
Tmem18 ↻ ≫
Ncapg ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Osbpl1a ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Adgrb1 ↻ ≫
Adamts1 ↻ ≫
Melk ↻ ≫
Artn ↻ ≫
Dlgap1 ↻ ≫
Cyb5r4 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Tekt4 ↻ ≫
Zfp36l2 ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Pin1 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Bace1 ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Fes ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Cpne8 ↻ ≫
Hipk2 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Trim2 ↻ ≫
Pex26 ↻ ≫
Cpsf4l ↻ ≫
Ggt7 ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Psd2 ↻ ≫
Nepro ↻ ≫
Mtnr1b ↻ ≫
Bcl2l14 ↻ ≫
Pcsk9 ↻ ≫
Fut7 ↻ ≫
Abca2 ↻ ≫
Elfn2 ↻ ≫
Wnt3 ↻ ≫
Glcci1 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Trim61 ↻ ≫
Trim60 ↻ ≫
Htr6 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Wfdc21 ↻ ≫
Ptp4a3 ↻ ≫
Mtap ↻ ≫
Mllt3 ↻ ≫
Ntm ↻ ≫
Ccn4 ↻ ≫
Tmem198 ↻ ≫
Chpf ↻ ≫
Cd247 ↻ ≫
Wnt11 ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Slit3 ↻ ≫
Sipa1l2 ↻ ≫
Adamts6 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Lrrc10b ↻ ≫
Tjp3 ↻ ≫
Pip5k1c ↻ ≫
Tlcd3b ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Ldhd ↻ ≫
Plk2 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Runx1 ↻ ≫
Topbp1 ↻ ≫
Tma16 ↻ ≫
Stk32b ↻ ≫
Chrna3 ↻ ≫
Pfdn4 ↻ ≫
Vpreb3 ↻ ≫
Gm5134 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Camk2n1 ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Elobl ↻ ≫
Coil ↻ ≫
Sgk1 ↻ ≫
Pax2 ↻ ≫
Cryaa ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Dnajc7 ↻ ≫
Nkiras2 ↻ ≫
Lsg1 ↻ ≫
Fam43a ↻ ≫
Opcml ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Calm3 ↻ ≫
Tfeb ↻ ≫
Cux2 ↻ ≫
Pdhb ↻ ≫
Rasgrp4 ↻ ≫
Ryr1 ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Creb3l2 ↻ ≫
Acss1 ↻ ≫
Mmp2 ↻ ≫
Ephb2 ↻ ≫
Ppil1 ↻ ≫
BC004004 ↻ ≫
Cdh2 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Ovca2 ↻ ≫
Iqsec1 ↻ ≫
Tcerg1l ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Traf4 ↻ ≫
Pnkd ↻ ≫
Gpbar1 ↻ ≫
Aamp ↻ ≫
Iyd ↻ ≫
Ubac1 ↻ ≫
Actr5 ↻ ≫
Axin2 ↻ ≫
Wnt1 ↻ ≫
Csnk1a1 ↻ ≫
Ddn ↻ ≫
L1td1 ↻ ≫
Klf7 ↻ ≫
R3hdm4 ↻ ≫
Kiss1r ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Nudt2 ↻ ≫
Kif24 ↻ ≫
Hdac4 ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Adamts16 ↻ ≫
Aox1 ↻ ≫
Zgrf1 ↻ ≫
Larp7 ↻ ≫
Gpr180 ↻ ≫
Dguok ↻ ≫
Phactr3 ↻ ≫
Fbxl13 ↻ ≫
Armc10 ↻ ≫
Guca2b ↻ ≫
Nags ↻ ≫
Fjx1 ↻ ≫
Foxc1 ↻ ≫
Grin2a ↻ ≫
Napg ↻ ≫
Celsr1 ↻ ≫
Ybx2 ↻ ≫
Neurl1a ↻ ≫
Fam240a ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Fdxr ↻ ≫
Lamtor5 ↻ ≫
Sppl2c ↻ ≫
Fxyd2 ↻ ≫
Pofut2 ↻ ≫
Rgma ↻ ≫
Spaca7 ↻ ≫
Jarid2 ↻ ≫
Prss2 ↻ ≫
Ccer1 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
E2f6 ↻ ≫
Tesk2 ↻ ≫
Zbtb45 ↻ ≫
Slc22a18 ↻ ≫
Cdkn1c ↻ ≫
Arl4d ↻ ≫
Pfkfb3 ↻ ≫
Cfap45 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Tnk2 ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Tagap1 ↻ ≫
Fcmr ↻ ≫
Clcn3 ↻ ≫
Nek1 ↻ ≫
Pkhd1 ↻ ≫
Cttnbp2 ↻ ≫
Itgb7 ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Gm11837 ↻ ≫
Adm ↻ ≫
Bod1 ↻ ≫
Wif1 ↻ ≫
Kcnip2 ↻ ≫
Dazl ↻ ≫
Clybl ↻ ≫
Uncx ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Nuak2 ↻ ≫
Inhba ↻ ≫
Ccnd1 ↻ ≫
Mdga1 ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Plk5 ↻ ≫
Zfp385b ↻ ≫
1600014C23Rik ↻ ≫
Eif4b ↻ ≫
Rfng ↻ ≫
Gps1 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Ptges2 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
H2-DMb2 ↻ ≫
H2-DMa ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Cldn13 ↻ ≫
Ccdc177 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Scgb1a1 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Olfr95 ↻ ≫
Ubd ↻ ≫
Olfr94 ↻ ≫
Fgfbp1 ↻ ≫
Nkx2-6 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Znfx1 ↻ ≫
Ethe1 ↻ ≫
Ggcx ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Niban1 ↻ ≫
Igsf9 ↻ ≫
Tagln2 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Mcts2 ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Qrich2 ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Sapcd1 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Fam174c ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Slc44a2 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Tac4 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Trpv4 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Gpr142 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Spon1 ↻ ≫
Cd2 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Gm38499 ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Zfpm1 ↻ ≫
Fgf20 ↻ ≫
Cox8b ↻ ≫
Shc4 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Zfp219 ↻ ≫
Tmem253 ↻ ≫
Lst1 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
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Cited2 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
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