ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for USF3

Query protein: USF3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX10478412 | Hep G2
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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USF3's Target genes

◢ USF3: Average

◢ SRX10478411: Hep G2

◣ SRX10478412: Hep G2

◢ USF3: STRING
LOC102724770 ↻ ≫
DGCR6 ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
MTRNR2L1 ↻ ≫
MTRNR2L8 ↻ ≫
MAMDC2 ↻ ≫
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STX5 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
IQSEC3 ↻ ≫
XKR7 ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
DBI ↻ ≫
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MUC3A ↻ ≫
TMEM242 ↻ ≫
NKX1-1 ↻ ≫
HTR5A ↻ ≫
FAM24A ↻ ≫
TLE3 ↻ ≫
LIN28A ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
KCNH7 ↻ ≫
ARL4D ↻ ≫
COL23A1 ↻ ≫
MTRNR2L9 ↻ ≫
SMIM17 ↻ ≫
TLE6 ↻ ≫
CHGB ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
EAPP ↻ ≫
CELSR3 ↻ ≫
RAB37 ↻ ≫
TLE4 ↻ ≫
GLRA1 ↻ ≫
LHFPL5 ↻ ≫
CLPS ↻ ≫
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OPRL1 ↻ ≫
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CPLX2 ↻ ≫
HERPUD1 ↻ ≫
ZNF23 ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
TLE1 ↻ ≫
NRL ↻ ≫
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IPO4 ↻ ≫
TSSK4 ↻ ≫
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GADD45B ↻ ≫
ZFP37 ↻ ≫
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PCNA ↻ ≫
DCP1A ↻ ≫
GOLGA5 ↻ ≫
SNRPB2 ↻ ≫
RPS6 ↻ ≫
RAB5IF ↻ ≫
LDHA ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
LRRC24 ↻ ≫
C8orf82 ↻ ≫
RANBP3 ↻ ≫
L1CAM ↻ ≫
ZNF285 ↻ ≫
AFAP1 ↻ ≫
KATNA1 ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
H4C11 ↻ ≫
H2BC15 ↻ ≫
H2AC15 ↻ ≫
NOMO3 ↻ ≫
ABCC6 ↻ ≫
SLC7A6OS ↻ ≫
PRMT7 ↻ ≫
CDIP1 ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
LEMD3 ↻ ≫
POLR3E ↻ ≫
HBQ1 ↻ ≫
HBA2 ↻ ≫
HBA1 ↻ ≫
BARHL1 ↻ ≫
ANKRD36 ↻ ≫
KDM3A ↻ ≫
ZPBP2 ↻ ≫
RNF130 ↻ ≫
IKZF3 ↻ ≫
OR2T1 ↻ ≫
TIGD1 ↻ ≫
PMS2 ↻ ≫
EIF4E2 ↻ ≫
AIMP2 ↻ ≫
PTMA ↻ ≫
BRMS1L ↻ ≫
UBE2Q1 ↻ ≫
CHRNB2 ↻ ≫
SNAP25 ↻ ≫
THOP1 ↻ ≫
SGTA ↻ ≫
VGF ↻ ≫
ANKRD36C ↻ ≫
EBAG9 ↻ ≫
USPL1 ↻ ≫
HMGB1 ↻ ≫
PAX5 ↻ ≫
DLGAP3 ↻ ≫
TINF2 ↻ ≫
RPL31 ↻ ≫
GMPR2 ↻ ≫
TMX3 ↻ ≫
TMEM106B ↻ ≫
CCDC102B ↻ ≫
SLC25A10 ↻ ≫
MRPL12 ↻ ≫
CENPA ↻ ≫
SLC25A21 ↻ ≫
ZFYVE27 ↻ ≫
HPCA ↻ ≫
STAT1 ↻ ≫
CDCA7 ↻ ≫
STK25 ↻ ≫
MAPK8IP2 ↻ ≫
CDS2 ↻ ≫
ABCA3 ↻ ≫
MRRF ↻ ≫
KCNK12 ↻ ≫
ZC3H6 ↻ ≫
SCFD1 ↻ ≫
NOL7 ↻ ≫
HECTD1 ↻ ≫
CMTR2 ↻ ≫
DHRS4L2 ↻ ≫
SCAMP4 ↻ ≫
RBSN ↻ ≫
DTD2 ↻ ≫
ADAT3 ↻ ≫
SPAAR ↻ ≫
PPFIA3 ↻ ≫
HRCT1 ↻ ≫
C19orf73 ↻ ≫
C14orf93 ↻ ≫
TASOR2 ↻ ≫
ZNF219 ↻ ≫
TMEM253 ↻ ≫
RNASEH1 ↻ ≫
PET117 ↻ ≫
KAT14 ↻ ≫
LRP2BP ↻ ≫
CTDSPL ↻ ≫
ANKRD37 ↻ ≫
USP14 ↻ ≫
SPOP ↻ ≫
BCKDK ↻ ≫
RBM28 ↻ ≫
NR1D1 ↻ ≫
FOXN2 ↻ ≫
RPL5 ↻ ≫
GCFC2 ↻ ≫
N6AMT1 ↻ ≫
MRPS23 ↻ ≫
IFNAR1 ↻ ≫
AATF ↻ ≫
DDX1 ↻ ≫
CPQ ↻ ≫
PIK3R3 ↻ ≫
ATIC ↻ ≫
MTIF2 ↻ ≫
GDAP1L1 ↻ ≫
RFC1 ↻ ≫
GTF2H2 ↻ ≫
PLA2G10 ↻ ≫
NPIPA3 ↻ ≫
NPIPA2 ↻ ≫
SPAG4 ↻ ≫
SLC22A4 ↻ ≫
RIOK1 ↻ ≫
MRPL3 ↻ ≫
KANSL3 ↻ ≫
FER1L5 ↻ ≫
CAGE1 ↻ ≫
SLC17A9 ↻ ≫
LYRM2 ↻ ≫
HDAC4 ↻ ≫
ZCCHC3 ↻ ≫
ENOSF1 ↻ ≫
C20orf96 ↻ ≫
PHOSPHO2-KLHL23 ↻ ≫
PHOSPHO2 ↻ ≫
PGRMC2 ↻ ≫
MYT1 ↻ ≫
GOLGA6D ↻ ≫
FAM151B ↻ ≫
CFAP20 ↻ ≫
CCDC173 ↻ ≫
SDHAF3 ↻ ≫
PUM2 ↻ ≫
PSMD7 ↻ ≫
H4C3 ↻ ≫
H1-6 ↻ ≫
C2orf73 ↻ ≫
MTERF4 ↻ ≫
FANCL ↻ ≫
RPS7 ↻ ≫
VRK2 ↻ ≫
TRIM65 ↻ ≫
NHLRC1 ↻ ≫
MRPL38 ↻ ≫
EVI5 ↻ ≫
RNF103-CHMP3 ↻ ≫
RMND5A ↻ ≫
IRF9 ↻ ≫
HID1 ↻ ≫
FAM187A ↻ ≫
EIF4A3 ↻ ≫
EFTUD2 ↻ ≫
E2F6 ↻ ≫
CDR2L ↻ ≫
CCDC103 ↻ ≫
THNSL1 ↻ ≫
OSBPL8 ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
KIF22 ↻ ≫
ZSWIM1 ↻ ≫
SPATA25 ↻ ≫
NEURL2 ↻ ≫
GOPC ↻ ≫
GMCL1 ↻ ≫
G2E3 ↻ ≫
CTSA ↻ ≫
SAYSD1 ↻ ≫
PABPN1 ↻ ≫
MOB4 ↻ ≫
AKAP10 ↻ ≫
WTAP ↻ ≫
SOD2 ↻ ≫
RAP1GAP ↻ ≫
LSM12 ↻ ≫
G6PC3 ↻ ≫
MAPK6 ↻ ≫
HNF4A ↻ ≫
CPNE4 ↻ ≫
STX18 ↻ ≫
PTPRS ↻ ≫
POLE4 ↻ ≫
GAS2L3 ↻ ≫
DSCC1 ↻ ≫
MSH2 ↻ ≫
IPMK ↻ ≫
CISD1 ↻ ≫
CEP295 ↻ ≫
FMNL3 ↻ ≫
FIGNL1 ↻ ≫
EFCAB13 ↻ ≫
DHDDS ↻ ≫
CBWD5 ↻ ≫
CBWD3 ↻ ≫
BLOC1S6 ↻ ≫
LMCD1 ↻ ≫
DHRS4L1 ↻ ≫
AGPS ↻ ≫
COPS8 ↻ ≫
CDPF1 ↻ ≫
ZNF451 ↻ ≫
RABL2B ↻ ≫
NME6 ↻ ≫
MTF2 ↻ ≫
MRM3 ↻ ≫
GLOD4 ↻ ≫
DPY19L4 ↻ ≫
MEIG1 ↻ ≫
ETNK1 ↻ ≫
DCLRE1C ↻ ≫
CASC3 ↻ ≫
PPP1R3C ↻ ≫
NANP ↻ ≫
NACA ↻ ≫
GINS1 ↻ ≫
CLK1 ↻ ≫
CCNC ↻ ≫
ADAM17 ↻ ≫
WASHC2A ↻ ≫
TK2 ↻ ≫
TGM1 ↻ ≫
RABGGTA ↻ ≫
CKLF-CMTM1 ↻ ≫
CKLF ↻ ≫
ARL6IP1 ↻ ≫
ZNF337 ↻ ≫
SPAG16 ↻ ≫
CHEK1 ↻ ≫
ACTR3 ↻ ≫
SYNGAP1 ↻ ≫
SURF6 ↻ ≫
PHF1 ↻ ≫
CUTA ↻ ≫
WWP2 ↻ ≫
UBFD1 ↻ ≫
TRIL ↻ ≫
SRSF1 ↻ ≫
RSPH3 ↻ ≫
PTGES3 ↻ ≫
PDCL3 ↻ ≫
NOB1 ↻ ≫
EARS2 ↻ ≫
CYP21A2 ↻ ≫
ADI1 ↻ ≫
ZNF292 ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
NAT10 ↻ ≫
MYBL2 ↻ ≫
DHRS4 ↻ ≫
PSMF1 ↻ ≫
HMGN3 ↻ ≫
CTNNB1 ↻ ≫
C1QBP ↻ ≫
C10orf88 ↻ ≫
AIP ↻ ≫
TMED4 ↻ ≫
PDF ↻ ≫
NIP7 ↻ ≫
FAM111B ↻ ≫
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VARS2 ↻ ≫
TSGA10 ↻ ≫
SNRPB ↻ ≫
PBLD ↻ ≫
HNRNPH3 ↻ ≫
GTF2H4 ↻ ≫
GEMIN2 ↻ ≫
EXD1 ↻ ≫
CHP1 ↻ ≫
VTA1 ↻ ≫
NMBR ↻ ≫
HEXA ↻ ≫
CRLS1 ↻ ≫
ABHD10 ↻ ≫
NOP56 ↻ ≫
LTV1 ↻ ≫
LATS1 ↻ ≫
TOMM6 ↻ ≫
TAF3 ↻ ≫
SPATC1L ↻ ≫
PRICKLE4 ↻ ≫
NCOA3 ↻ ≫
FRS3 ↻ ≫
ZNF184 ↻ ≫
PPP4R3B ↻ ≫
LOC112694756 ↻ ≫
TNS1 ↻ ≫
TBL3 ↻ ≫
SAXO1 ↻ ≫
RRAGA ↻ ≫
RPS2 ↻ ≫
RNF151 ↻ ≫
NOXO1 ↻ ≫
NOTCH2NLC ↻ ≫
NOTCH2NLB ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
NET1 ↻ ≫
BCAS3 ↻ ≫
ATP5MC2 ↻ ≫
UCKL1 ↻ ≫
CTR9 ↻ ≫
RAD50 ↻ ≫
PLEKHG6 ↻ ≫
TMEM129 ↻ ≫
TACC3 ↻ ≫
SLBP ↻ ≫
SHOX2 ↻ ≫
SEC23A ↻ ≫
RSRC1 ↻ ≫
EZH1 ↻ ≫
C16orf89 ↻ ≫
ALG1 ↻ ≫
SCGN ↻ ≫
OCEL1 ↻ ≫
IST1 ↻ ≫
ESYT3 ↻ ≫
USP37 ↻ ≫
CNOT9 ↻ ≫
ARHGAP18 ↻ ≫
TTPAL ↻ ≫
NSUN5 ↻ ≫
METTL25 ↻ ≫
CCDC59 ↻ ≫
ATR ↻ ≫
ZFHX2 ↻ ≫
THTPA ↻ ≫
TAF1B ↻ ≫
HM13 ↻ ≫
GORASP2 ↻ ≫
CTSL ↻ ≫
ZFR ↻ ≫
POLR3B ↻ ≫
MXD1 ↻ ≫
HEATR5A ↻ ≫
GCAT ↻ ≫
GALR3 ↻ ≫
MRPL35 ↻ ≫
IMMT ↻ ≫
DDX18 ↻ ≫
ASCC3 ↻ ≫
NDUFB5 ↻ ≫
MRPL47 ↻ ≫
MRPL40 ↻ ≫
HIRA ↻ ≫
DNAJC25-GNG10 ↻ ≫
DNAJC25 ↻ ≫
TMOD3 ↻ ≫
STAM2 ↻ ≫
SLC23A3 ↻ ≫
RIOK2 ↻ ≫
RETREG2 ↻ ≫
NUDT15 ↻ ≫
CNPPD1 ↻ ≫
TRAM1 ↻ ≫
MRPS28 ↻ ≫
CDC73 ↻ ≫
MRPL2 ↻ ≫
KLC4 ↻ ≫
CUL7 ↻ ≫
NFX1 ↻ ≫
MARCHF7 ↻ ≫
ID1 ↻ ≫
GTF3C6 ↻ ≫
TPM3 ↻ ≫
SCAND1 ↻ ≫
PSD4 ↻ ≫
COMMD2 ↻ ≫
TOMM22 ↻ ≫
ANKLE1 ↻ ≫
COA7 ↻ ≫
WDR33 ↻ ≫
METAP1D ↻ ≫
C18orf21 ↻ ≫
NOL11 ↻ ≫
GTF2A1 ↻ ≫
APMAP ↻ ≫
DYNC2I1 ↻ ≫
TMEM186 ↻ ≫
PMM2 ↻ ≫
ROMO1 ↻ ≫
TMEM181 ↻ ≫
BCLAF1 ↻ ≫
SULT1A4 ↻ ≫
SULT1A3 ↻ ≫
SLX1B ↻ ≫
SLX1A ↻ ≫
BOLA2B ↻ ≫
BOLA2-SMG1P6 ↻ ≫
BOLA2 ↻ ≫