ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for ARID1A

Query protein: ARID1A
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX14999345 | 786-O
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
ARID1A's Target genes

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◢ SRX10445306: Neural crest cells

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◢ SRX11857211: Neural crest cells

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◢ SRX3241380: RMG-I

◢ SRX4704621: RMG-I

◢ ARID1A: STRING
DUX4 ↻ ≫
ITPRIP ↻ ≫
CDYL ↻ ≫
PLEKHG4 ↻ ≫
CA11 ↻ ≫
SATB2 ↻ ≫
SLC35A5 ↻ ≫
ATG3 ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
CFDP1 ↻ ≫
SNAP29 ↻ ≫
PI4KA ↻ ≫
QRICH1 ↻ ≫
LSP1 ↻ ≫
FRMD5 ↻ ≫
PLEC ↻ ≫
HECTD2 ↻ ≫
MTRNR2L1 ↻ ≫
FGFR4 ↻ ≫
HILPDA ↻ ≫
COG1 ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
ZNF862 ↻ ≫
GOLM2 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
TAGLN2 ↻ ≫
MAFG ↻ ≫
VIM ↻ ≫
TMEM168 ↻ ≫
FOXJ2 ↻ ≫
GBA ↻ ≫
PDE8A ↻ ≫
XRRA1 ↻ ≫
SPCS2 ↻ ≫
DAP ↻ ≫
RNF169 ↻ ≫
PSMD14 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
RRBP1 ↻ ≫
LHPP ↻ ≫
RTN4RL2 ↻ ≫
AHCYL2 ↻ ≫
RCOR3 ↻ ≫
STXBP3 ↻ ≫
PPM1D ↻ ≫
S100A2 ↻ ≫
TTC30B ↻ ≫
RRAD ↻ ≫
ERF ↻ ≫
ADGRL1 ↻ ≫
FARSA ↻ ≫
CALR ↻ ≫
NIBAN2 ↻ ≫
CDKN1B ↻ ≫
OR2T1 ↻ ≫
MVB12A ↻ ≫
ALDOA ↻ ≫
SLC44A1 ↻ ≫
KCNMA1 ↻ ≫
RNF19A ↻ ≫
ECPAS ↻ ≫
C18orf63 ↻ ≫
RABGEF1 ↻ ≫
KMT2C ↻ ≫
USP17L5 ↻ ≫
USP17L30 ↻ ≫
USP17L29 ↻ ≫
USP17L28 ↻ ≫
USP17L27 ↻ ≫
USP17L26 ↻ ≫
USP17L25 ↻ ≫
USP17L24 ↻ ≫
PDP1 ↻ ≫
BAIAP2 ↻ ≫
NOL3 ↻ ≫
FZD6 ↻ ≫
KIAA1958 ↻ ≫
C9orf147 ↻ ≫
PLEKHA1 ↻ ≫
TUBB6 ↻ ≫
GIP ↻ ≫
GLCCI1 ↻ ≫
NOXA1 ↻ ≫
BCAR1 ↻ ≫
NDST1 ↻ ≫
RALGDS ↻ ≫
LOC644090 ↻ ≫
ITGA3 ↻ ≫
OASL ↻ ≫
PCP2 ↻ ≫
STXBP2 ↻ ≫
UBAC1 ↻ ≫
ANKRD2 ↻ ≫
ELFN2 ↻ ≫
TMEM249 ↻ ≫
SLC52A2 ↻ ≫
FBXL6 ↻ ≫
SNX16 ↻ ≫
TNFRSF6B ↻ ≫
MCC ↻ ≫
SLC35F3 ↻ ≫
KLF13 ↻ ≫
ST6GALNAC4 ↻ ≫
SLC7A5 ↻ ≫
DPY19L3 ↻ ≫
PLXNB2 ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
TRIM47 ↻ ≫
ANKRD1 ↻ ≫
NME4 ↻ ≫
DECR2 ↻ ≫
CAMTA1 ↻ ≫
SMARCD2 ↻ ≫
BASP1 ↻ ≫
TES ↻ ≫
OSMR ↻ ≫
ADM ↻ ≫
NR3C1 ↻ ≫
SPTBN4 ↻ ≫
SBNO2 ↻ ≫
THAP11 ↻ ≫
NUTF2 ↻ ≫
MEFV ↻ ≫
NOTCH2NLC ↻ ≫
NOTCH2NLB ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
TENT5B ↻ ≫
DUSP1 ↻ ≫
MAN1A2 ↻ ≫
DEPP1 ↻ ≫
ACSF3 ↻ ≫
GAS1 ↻ ≫
LOC102724265 ↻ ≫
GTF2IRD2 ↻ ≫
GTF2IRD2B ↻ ≫
RASEF ↻ ≫
TARBP1 ↻ ≫
RFFL ↻ ≫
ZNF341 ↻ ≫
AHDC1 ↻ ≫
CARD19 ↻ ≫
ZNRF2 ↻ ≫
DGAT1 ↻ ≫
ITGB2 ↻ ≫
CCN2 ↻ ≫
CYP2R1 ↻ ≫
FOXO1 ↻ ≫
TP53BP2 ↻ ≫
OPRL1 ↻ ≫
LKAAEAR1 ↻ ≫
C8orf88 ↻ ≫
RASA3 ↻ ≫
TRIB1 ↻ ≫
IGFBP7 ↻ ≫
TNFRSF12A ↻ ≫
THOC6 ↻ ≫
HCFC1R1 ↻ ≫
CLDN6 ↻ ≫
ZNF398 ↻ ≫
RXRA ↻ ≫
ENKUR ↻ ≫
SLC39A4 ↻ ≫
CPSF1 ↻ ≫
PKP4 ↻ ≫
CCDC148 ↻ ≫
DOCK9 ↻ ≫
TCFL5 ↻ ≫
USP3 ↻ ≫
SLC35E1 ↻ ≫
TPM4 ↻ ≫
GPR157 ↻ ≫
NOP53 ↻ ≫
SMARCA5 ↻ ≫
CAB39 ↻ ≫
INPP5E ↻ ≫
CEBPD ↻ ≫
TACC1 ↻ ≫
AXL ↻ ≫
SPAAR ↻ ≫
WDR97 ↻ ≫
MAF1 ↻ ≫
SH3BP4 ↻ ≫
DHRS9 ↻ ≫
RB1 ↻ ≫
ENO1 ↻ ≫
ATP2B4 ↻ ≫
STK32C ↻ ≫
LRRC27 ↻ ≫
PRDM11 ↻ ≫
PELI1 ↻ ≫
ZNF367 ↻ ≫
KPNA7 ↻ ≫
MTF2 ↻ ≫
PFKP ↻ ≫
DHRS13 ↻ ≫
GSDMD ↻ ≫
CCDC130 ↻ ≫
HPCAL1 ↻ ≫
ZFAND4 ↻ ≫
SAMD1 ↻ ≫
SHROOM1 ↻ ≫
PEAR1 ↻ ≫
CYP1B1 ↻ ≫
THOC1 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
RAP2B ↻ ≫
NDUFS8 ↻ ≫
NSFL1C ↻ ≫
LMNA ↻ ≫
C19orf33 ↻ ≫
LZTS3 ↻ ≫
GAL3ST1 ↻ ≫
FSCN1 ↻ ≫
CCDC88A ↻ ≫
POR ↻ ≫
SLC16A3 ↻ ≫
OTUD4 ↻ ≫
TRIM55 ↻ ≫
TP53INP1 ↻ ≫
EPB41 ↻ ≫
CLDN16 ↻ ≫
ECHDC2 ↻ ≫
ERCC1 ↻ ≫
GGNBP2 ↻ ≫
DCP1A ↻ ≫
CES3 ↻ ≫
CD151 ↻ ≫
MAMDC4 ↻ ≫
NEBL ↻ ≫
TBC1D22A ↻ ≫
MCIDAS ↻ ≫
GALNT10 ↻ ≫
LOXL4 ↻ ≫
INAVA ↻ ≫
COX19 ↻ ≫
PIK3CD ↻ ≫
RABGAP1 ↻ ≫
ZCCHC4 ↻ ≫
CACNA1I ↻ ≫
ACAP2 ↻ ≫
TTLL12 ↻ ≫
NFAT5 ↻ ≫
ZNF354A ↻ ≫
KRT80 ↻ ≫
DPY19L4 ↻ ≫
ADCY9 ↻ ≫
RGS3 ↻ ≫
FAM3C ↻ ≫
AP2A2 ↻ ≫
BCL9 ↻ ≫
SYT7 ↻ ≫
PUF60 ↻ ≫
TRIM65 ↻ ≫
TRAM1 ↻ ≫
DNAAF2 ↻ ≫
KMT2A ↻ ≫
STK31 ↻ ≫
ESRP2 ↻ ≫
KLF9 ↻ ≫
MTBP ↻ ≫
MRPL13 ↻ ≫
LGR4 ↻ ≫
TGM2 ↻ ≫
CXXC5 ↻ ≫
PRRC2B ↻ ≫
SHCBP1L ↻ ≫
CCDC57 ↻ ≫
FOXC1 ↻ ≫
SPACA9 ↻ ≫
AK8 ↻ ≫
ECE1 ↻ ≫
SBF2 ↻ ≫
FZD1 ↻ ≫
HDAC7 ↻ ≫
SERTAD1 ↻ ≫
TMEM222 ↻ ≫
KMT2E ↻ ≫
ZNF655 ↻ ≫
DGKD ↻ ≫
MTHFR ↻ ≫
CLCN6 ↻ ≫
TOE1 ↻ ≫
MUTYH ↻ ≫
CETP ↻ ≫
PAXBP1 ↻ ≫
MCHR1 ↻ ≫
UNKL ↻ ≫
DNMT3B ↻ ≫
ALDH3A1 ↻ ≫
SEMA5B ↻ ≫
CPPED1 ↻ ≫
RIMBP3C ↻ ≫
MRPL40 ↻ ≫
HIRA ↻ ≫
TMEM95 ↻ ≫
KCTD11 ↻ ≫
WFIKKN1 ↻ ≫
ZNF474 ↻ ≫
ARHGAP26 ↻ ≫
ZP3 ↻ ≫
KCNK9 ↻ ≫
ARHGDIG ↻ ≫
PDIA2 ↻ ≫
EEF1AKMT2 ↻ ≫
AIFM2 ↻ ≫
ZDHHC8 ↻ ≫
YIPF2 ↻ ≫
TIMM29 ↻ ≫
CCDC88B ↻ ≫
MUC5AC ↻ ≫
NDUFB2 ↻ ≫
PTMS ↻ ≫
MYEOV ↻ ≫
GPX4 ↻ ≫
KLRC3 ↻ ≫
RCAN1 ↻ ≫
COG7 ↻ ≫
MXRA8 ↻ ≫
RFX1 ↻ ≫
METTL26 ↻ ≫
GPCPD1 ↻ ≫
RUFY3 ↻ ≫
COL23A1 ↻ ≫
SEPSECS ↻ ≫
TNIP1 ↻ ≫
LINGO3 ↻ ≫
GUSB ↻ ≫
RBM28 ↻ ≫
UPP1 ↻ ≫
MARVELD1 ↻ ≫
PLOD2 ↻ ≫
TLE4 ↻ ≫
PPP1R3C ↻ ≫
SLC39A3 ↻ ≫
EIF2B3 ↻ ≫
CRYBG1 ↻ ≫
TXNDC16 ↻ ≫
SMAD7 ↻ ≫
MXI1 ↻ ≫
FHL2 ↻ ≫
HTR7 ↻ ≫
PPP1R9B ↻ ≫
AK4 ↻ ≫
RBM17 ↻ ≫
CREM ↻ ≫
AAR2 ↻ ≫
TOP3B ↻ ≫
LINC02210-CRHR1 ↻ ≫
NFE2L2 ↻ ≫
STK40 ↻ ≫
GOLGA1 ↻ ≫
LRRFIP1 ↻ ≫
MAGIX ↻ ≫
PLP2 ↻ ≫
ASB2 ↻ ≫
DRAP1 ↻ ≫
C11orf68 ↻ ≫
HSPA5 ↻ ≫
PIP4P2 ↻ ≫
TSEN54 ↻ ≫
CASKIN2 ↻ ≫
COL16A1 ↻ ≫
PAX2 ↻ ≫
PRKAG2 ↻ ≫
SLBP ↻ ≫
BCL9L ↻ ≫
WIZ ↻ ≫
TP53I13 ↻ ≫
ABHD15 ↻ ≫
EBAG9 ↻ ≫
CCDC9B ↻ ≫
SIRT1 ↻ ≫
GPR160 ↻ ≫
CRABP2 ↻ ≫
GNB2 ↻ ≫
SYNM ↻ ≫
TCTEX1D4 ↻ ≫
BTBD19 ↻ ≫
KSR1 ↻ ≫
XKR8 ↻ ≫
CCNF ↻ ≫
ENAH ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
ZFAND6 ↻ ≫
FZD5 ↻ ≫
HOXD1 ↻ ≫
SLC41A3 ↻ ≫
MOXD1 ↻ ≫
NUF2 ↻ ≫
LRATD2 ↻ ≫
SLC3A2 ↻ ≫
HBP1 ↻ ≫
TMEM144 ↻ ≫
SFMBT1 ↻ ≫
STAT6 ↻ ≫
SLC8A1 ↻ ≫
OGFOD3 ↻ ≫
HEXD ↻ ≫
FXYD2 ↻ ≫
KLF4 ↻ ≫
ABLIM1 ↻ ≫
RIN1 ↻ ≫
TLN2 ↻ ≫
THEM6 ↻ ≫
DPF2 ↻ ≫
KIF2C ↻ ≫
SNX30 ↻ ≫
PEMT ↻ ≫
STPG3 ↻ ≫
NELFB ↻ ≫
BICD2 ↻ ≫
RNF130 ↻ ≫
USP17L20 ↻ ≫
USP17L11 ↻ ≫
USP17L21 ↻ ≫
USP17L12 ↻ ≫
USP17L18 ↻ ≫
TTC26 ↻ ≫
SLC25A45 ↻ ≫
LY6K ↻ ≫
FRMD8 ↻ ≫
IBA57 ↻ ≫
THEM4 ↻ ≫
OR14K1 ↻ ≫
PLAU ↻ ≫
FKBP9 ↻ ≫
E2F6 ↻ ≫
TTC30A ↻ ≫
KLHDC10 ↻ ≫
KAT6A ↻ ≫
SCAND1 ↻ ≫
VPS28 ↻ ≫
F3 ↻ ≫
SSNA1 ↻ ≫
ANAPC2 ↻ ≫
NGLY1 ↻ ≫
OXSM ↻ ≫
ARID1A ↻ ≫
GPRC5C ↻ ≫
RAB33B ↻ ≫
NREP ↻ ≫
PDLIM7 ↻ ≫
KRTAP2-4 ↻ ≫
LDHD ↻ ≫
AKIRIN1 ↻ ≫
NF2 ↻ ≫
GSN ↻ ≫
SYNPO ↻ ≫
ODC1 ↻ ≫
INO80 ↻ ≫
GMEB2 ↻ ≫
MKRN2OS ↻ ≫
MKRN2 ↻ ≫
SDHAF1 ↻ ≫
CCDC117 ↻ ≫
BIN1 ↻ ≫
NFKBIA ↻ ≫
SOCS5 ↻ ≫
ARL8B ↻ ≫
TMEM41A ↻ ≫
TBC1D9B ↻ ≫
SECISBP2 ↻ ≫
VRK2 ↻ ≫
ARHGEF17 ↻ ≫
AMPD2 ↻ ≫
SERTAD2 ↻ ≫
STUB1 ↻ ≫
JMJD8 ↻ ≫
RHBDL1 ↻ ≫
NAT10 ↻ ≫
NBN ↻ ≫
MYLK4 ↻ ≫
GRHL1 ↻ ≫
UBE2V2 ↻ ≫
CYP20A1 ↻ ≫
WRNIP1 ↻ ≫
DCBLD1 ↻ ≫
ZCCHC14 ↻ ≫
C11orf95 ↻ ≫
ALDH3B1 ↻ ≫
CDK18 ↻ ≫
ANKAR ↻ ≫
RAD54B ↻ ≫
FSBP ↻ ≫
SPTBN5 ↻ ≫
SF3A3 ↻ ≫
BIRC7 ↻ ≫
TEAD1 ↻ ≫
POLDIP3 ↻ ≫
PRR7 ↻ ≫
RBBP5 ↻ ≫
USP46 ↻ ≫
ZNF3 ↻ ≫
JMJD1C ↻ ≫
ZBTB45 ↻ ≫
CDC25C ↻ ≫
FAM53C ↻ ≫
SCD ↻ ≫
WDR47 ↻ ≫
TCTN3 ↻ ≫
SHISA2 ↻ ≫
PRDX1 ↻ ≫
ESCO1 ↻ ≫
ARL4A ↻ ≫
FGFR2 ↻ ≫
DCDC2 ↻ ≫
KAAG1 ↻ ≫
NBEAL1 ↻ ≫
PLEKHM3 ↻ ≫
IFIT5 ↻ ≫
NBL1 ↻ ≫
RBM7 ↻ ≫
C11orf71 ↻ ≫
SOX12 ↻ ≫
MCM7 ↻ ≫
AP4M1 ↻ ≫
SETX ↻ ≫
C21orf91 ↻ ≫
P4HA1 ↻ ≫
COL5A1 ↻ ≫
AHNAK2 ↻ ≫
CD2BP2 ↻ ≫
C8G ↻ ≫
VWA7 ↻ ≫
TMEM242 ↻ ≫
FBXW5 ↻ ≫
LPIN1 ↻ ≫
MRPL38 ↻ ≫
PLIN3 ↻ ≫
PABPC4 ↻ ≫
EPHA4 ↻ ≫
MEPE ↻ ≫
AMOTL2 ↻ ≫
ASB5 ↻ ≫
CDC73 ↻ ≫
SLC35E2B ↻ ≫
TMEM250 ↻ ≫
KLF2 ↻ ≫
HGS ↻ ≫
ARL16 ↻ ≫
SELENOH ↻ ≫
FLG ↻ ≫
SYTL1 ↻ ≫
FOSL1 ↻ ≫
DDX1 ↻ ≫
IST1 ↻ ≫
LRRC6 ↻ ≫
FCHSD2 ↻ ≫
KCNJ18 ↻ ≫
KANSL3 ↻ ≫
FER1L5 ↻ ≫
BRIX1 ↻ ≫
ZNF282 ↻ ≫
C11orf86 ↻ ≫
GFUS ↻ ≫
CGB5 ↻ ≫
CGB1 ↻ ≫
NSD2 ↻ ≫
FOXK1 ↻ ≫
SPAG4 ↻ ≫
SYDE2 ↻ ≫
LDLR ↻ ≫
JUND ↻ ≫
GCLM ↻ ≫
SKIDA1 ↻ ≫
DPP9 ↻ ≫
MET ↻ ≫
SERTAD3 ↻ ≫
POLG2 ↻ ≫
RPS20 ↻ ≫
B4GALT7 ↻ ≫
GPT2 ↻ ≫
LFNG ↻ ≫
GSE1 ↻ ≫
TBL1XR1 ↻ ≫
PFN1 ↻ ≫
ENO3 ↻ ≫
PDE11A ↻ ≫
NECAP2 ↻ ≫
RBM45 ↻ ≫
KCTD5 ↻ ≫
TRAPPC3 ↻ ≫
GCK ↻ ≫
DTNB ↻ ≫
VPS16 ↻ ≫
PCED1A ↻ ≫
CCDC71L ↻ ≫
CTSZ ↻ ≫
KRT79 ↻ ≫
TLE1 ↻ ≫
OXR1 ↻ ≫
PLS1 ↻ ≫
NOM1 ↻ ≫
ISG20 ↻ ≫
SUPT20H ↻ ≫
CREBL2 ↻ ≫
MYDGF ↻ ≫
AGFG2 ↻ ≫
LIF ↻ ≫
WIPF1 ↻ ≫
SMYD3 ↻ ≫
EFR3A ↻ ≫
RBM39 ↻ ≫
NUDT4B ↻ ≫
NUDT4 ↻ ≫
STX18 ↻ ≫
CARNMT1 ↻ ≫
MRPS23 ↻ ≫
NMNAT1 ↻ ≫
LZIC ↻ ≫
BORCS6 ↻ ≫
BAHD1 ↻ ≫
C16orf86 ↻ ≫
KLF10 ↻ ≫
RPS3A ↻ ≫
SLK ↻ ≫
KIF12 ↻ ≫
ZNF425 ↻ ≫
ANKS6 ↻ ≫
TMEM273 ↻ ≫
MARCHF7 ↻ ≫
DENR ↻ ≫
GORASP2 ↻ ≫
TCF12 ↻ ≫
ENOSF1 ↻ ≫
NUDT3 ↻ ≫
ZNF746 ↻ ≫
XYLB ↻ ≫
NMI ↻ ≫
PFKL ↻ ≫
ITGB1 ↻ ≫
DSTYK ↻ ≫
ORAI1 ↻ ≫
PRKAR2A ↻ ≫
KDM7A ↻ ≫
ZNF337 ↻ ≫
NDUFA6 ↻ ≫
MEX3D ↻ ≫
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DLX2 ↻ ≫
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GTF2H2C ↻ ≫
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NCOA4 ↻ ≫
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HNRNPK ↻ ≫
FAM228B ↻ ≫
ZNF318 ↻ ≫
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TOR1AIP1 ↻ ≫
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WASL ↻ ≫
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CMIP ↻ ≫
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CALM2 ↻ ≫
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RPL5 ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
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PTEN ↻ ≫
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SLC35B4 ↻ ≫
ZFP36L2 ↻ ≫
LRRC37A3 ↻ ≫
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OCIAD2 ↻ ≫
METTL5 ↻ ≫
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PLAAT2 ↻ ≫
GET4 ↻ ≫
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DNM1 ↻ ≫
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MYO10 ↻ ≫
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DYNC2I1 ↻ ≫
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TRUB2 ↻ ≫
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KDM4B ↻ ≫
DYNC2I2 ↻ ≫
PUM1 ↻ ≫
DSE ↻ ≫
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CNOT6 ↻ ≫
PHLDA2 ↻ ≫
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MSC ↻ ≫
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GLIS2 ↻ ≫
ATP2A2 ↻ ≫
SKP2 ↻ ≫
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PPIB ↻ ≫
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AGRN ↻ ≫
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HAGH ↻ ≫
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