ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for KDM5A

Query protein: KDM5A
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3010254 | GM12878
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
KDM5A's Target genes

◢ KDM5A: Average

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◢ SRX3010239: A549

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◢ SRX116460: hESC H1

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◢ SRX6783964: hESC H1

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◢ SRX1721564: T-47D

◢ SRX1721565: T-47D

◢ KDM5A: STRING
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POLDIP2 ↻ ≫
TSR1 ↻ ≫
SGSM2 ↻ ≫
C8orf33 ↻ ≫
MZT2A ↻ ≫
MTO1 ↻ ≫
JUND ↻ ≫
IQCN ↻ ≫
MAZ ↻ ≫
SNX16 ↻ ≫
OSBPL9 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
SYP ↻ ≫
SUPT7L ↻ ≫
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SFSWAP ↻ ≫
NPM3 ↻ ≫
FGF8 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
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SUMF1 ↻ ≫
BABAM1 ↻ ≫
METTL25 ↻ ≫
CCDC59 ↻ ≫
MRPL11 ↻ ≫
RBM19 ↻ ≫
PISD ↻ ≫
SPRYD4 ↻ ≫
PPT1 ↻ ≫
TCTN2 ↻ ≫
LYRM4 ↻ ≫
FARS2 ↻ ≫
SPAAR ↻ ≫
TRAPPC2L ↻ ≫
GALNS ↻ ≫
LIN52 ↻ ≫
ALDH6A1 ↻ ≫
DNTTIP2 ↻ ≫
PELP1 ↻ ≫
IPO11 ↻ ≫
WDR18 ↻ ≫
RTN4IP1 ↻ ≫
QRSL1 ↻ ≫
HAX1 ↻ ≫
CDC25C ↻ ≫
ALG1 ↻ ≫
MRPL39 ↻ ≫
STIL ↻ ≫
CRBN ↻ ≫
OAZ3 ↻ ≫
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SREK1IP1 ↻ ≫
CWC27 ↻ ≫
ZC3HC1 ↻ ≫
ATP5IF1 ↻ ≫
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FEM1A ↻ ≫
ZFPL1 ↻ ≫
CDCA5 ↻ ≫
TROAP ↻ ≫
NDUFB5 ↻ ≫
MRPL47 ↻ ≫
PEX19 ↻ ≫
PSMB7 ↻ ≫
SLC7A6OS ↻ ≫
PRMT7 ↻ ≫
ZNF341 ↻ ≫
TPRN ↻ ≫
TMEM203 ↻ ≫
NDOR1 ↻ ≫
ZGRF1 ↻ ≫
LARP7 ↻ ≫
QRICH1 ↻ ≫
TIMM22 ↻ ≫
TTC31 ↻ ≫
CCDC142 ↻ ≫
MRPL1 ↻ ≫
VPS50 ↻ ≫
HEPACAM2 ↻ ≫
NFAM1 ↻ ≫
ELP5 ↻ ≫
CTDNEP1 ↻ ≫
PMPCA ↻ ≫
ENTR1 ↻ ≫
COMMD9 ↻ ≫
MTMR4 ↻ ≫
MND1 ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
KBTBD4 ↻ ≫
TOP3A ↻ ≫
SMCR8 ↻ ≫
SETD3 ↻ ≫
CCNK ↻ ≫
VCPKMT ↻ ≫
TMEM101 ↻ ≫
TFPT ↻ ≫
PRPF31 ↻ ≫
MFN2 ↻ ≫
TRMT61B ↻ ≫
DDX23 ↻ ≫
TRAIP ↻ ≫
HAGH ↻ ≫
FAHD1 ↻ ≫
FDX2 ↻ ≫
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COPS5 ↻ ≫
WDR48 ↻ ≫
SCN11A ↻ ≫
NOC2L ↻ ≫
KLHL17 ↻ ≫
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OSCAR ↻ ≫
NDUFA3 ↻ ≫
EIF2S1 ↻ ≫
ATP6V1D ↻ ≫
DHRS4 ↻ ≫
DNAJC11 ↻ ≫
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ATP5MF ↻ ≫
WDR53 ↻ ≫
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ING4 ↻ ≫
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MRPS14 ↻ ≫
WDR83OS ↻ ≫
WDR83 ↻ ≫
MAN2B1 ↻ ≫
TMEM126B ↻ ≫
DLG2 ↻ ≫
PEPD ↻ ≫
METTL15 ↻ ≫
KIF18A ↻ ≫
NDUFAF2 ↻ ≫
ERCC8 ↻ ≫
MRPS11 ↻ ≫
MRPL46 ↻ ≫
RANBP6 ↻ ≫
MDH1B ↻ ≫
FASTKD2 ↻ ≫
TOMM6 ↻ ≫
MAGOHB ↻ ≫
NOM1 ↻ ≫
RPL9 ↻ ≫
LIAS ↻ ≫
VIRMA ↻ ≫
NR6A1 ↻ ≫
OLFML2A ↻ ≫
SPATA25 ↻ ≫
NEURL2 ↻ ≫
CTSA ↻ ≫
CDKAL1 ↻ ≫
UBE4B ↻ ≫
ABCC5 ↻ ≫
RTTN ↻ ≫
XPO4 ↻ ≫
PTCD2 ↻ ≫
MRPS27 ↻ ≫
ERICH4 ↻ ≫
DMAC2 ↻ ≫
MRTO4 ↻ ≫
EMC1 ↻ ≫
ZFAND2A ↻ ≫
MRPL48 ↻ ≫
DPP9 ↻ ≫
SPC25 ↻ ≫
CCNA2 ↻ ≫
PUS10 ↻ ≫
PEX13 ↻ ≫
ERGIC2 ↻ ≫
TRIP11 ↻ ≫
CDCA8 ↻ ≫
C1orf109 ↻ ≫
RBM42 ↻ ≫
RANBP3 ↻ ≫
PPIL4 ↻ ≫
CDK1 ↻ ≫
CCDC43 ↻ ≫
PFDN1 ↻ ≫
TAS1R1 ↻ ≫
NOL9 ↻ ≫
WDR38 ↻ ≫
RPTOR ↻ ≫
EMC4 ↻ ≫
ZDHHC6 ↻ ≫
VTI1A ↻ ≫
SPOUT1 ↻ ≫
PLK4 ↻ ≫
COX10 ↻ ≫
MRPL45 ↻ ≫
EIF3F ↻ ≫
UTP20 ↻ ≫
SF3B3 ↻ ≫
COG4 ↻ ≫
MRPS35 ↻ ≫
LAMP1 ↻ ≫
DUS2 ↻ ≫
DDX28 ↻ ≫
MED21 ↻ ≫
TRIAP1 ↻ ≫
TRUB1 ↻ ≫
MTBP ↻ ≫
MRPL13 ↻ ≫
LATS1 ↻ ≫
C16orf91 ↻ ≫
ESCO2 ↻ ≫
CCDC25 ↻ ≫
TRMT44 ↻ ≫
ACOX3 ↻ ≫
DDX46 ↻ ≫
NUP160 ↻ ≫
ANKFY1 ↻ ≫
SF3B2 ↻ ≫
GAL3ST3 ↻ ≫
TMEM126A ↻ ≫
NOL11 ↻ ≫
SGO2 ↻ ≫
LRRC29 ↻ ≫
PDE6D ↻ ≫
POLR3F ↻ ≫
DZANK1 ↻ ≫
HEXA ↻ ≫
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CDC23 ↻ ≫
EIF3H ↻ ≫
WASHC2C ↻ ≫
COMMD4 ↻ ≫
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POLR2J3 ↻ ≫
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UQCC1 ↻ ≫
CWF19L1 ↻ ≫
TRIP4 ↻ ≫
TSR2 ↻ ≫
ALKBH3 ↻ ≫
DNAJB12 ↻ ≫
KRR1 ↻ ≫
MRPL44 ↻ ≫
MRPS22 ↻ ≫
TBC1D23 ↻ ≫
NUP214 ↻ ≫
SLC25A26 ↻ ≫
TMEM41A ↻ ≫
VPS33A ↻ ≫
WASHC2A ↻ ≫
SUPV3L1 ↻ ≫
TMEM39A ↻ ≫
SPTLC1 ↻ ≫
SLC35B1 ↻ ≫
KAT8 ↻ ≫
BBS1 ↻ ≫
MRPL55 ↻ ≫
WASHC5 ↻ ≫
NSMCE2 ↻ ≫
RBX1 ↻ ≫
NUP107 ↻ ≫
SDE2 ↻ ≫
ZC3H18 ↻ ≫
ZNF383 ↻ ≫
TIMM17A ↻ ≫
ABT1 ↻ ≫
MAGOH ↻ ≫
NMT1 ↻ ≫
DCAKD ↻ ≫
NSFL1C ↻ ≫
HDAC6 ↻ ≫
UHMK1 ↻ ≫
ZNRD2 ↻ ≫
FAM89B ↻ ≫
ISY1-RAB43 ↻ ≫
ISY1 ↻ ≫
THBS3 ↻ ≫
MTX1 ↻ ≫
TACO1 ↻ ≫
RCE1 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
TXN2 ↻ ≫
ZNF17 ↻ ≫
ZZZ3 ↻ ≫
C5orf51 ↻ ≫
MOCS3 ↻ ≫
DPM1 ↻ ≫
UBIAD1 ↻ ≫
TSN ↻ ≫
HMGCL ↻ ≫
MRPL21 ↻ ≫
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OS9 ↻ ≫
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ARFGEF2 ↻ ≫
NOL8 ↻ ≫
CENPP ↻ ≫
POLR2J2 ↻ ≫
SLIRP ↻ ≫
ALKBH1 ↻ ≫
NUP133 ↻ ≫
PHAX ↻ ≫
PSMC3 ↻ ≫
NUP54 ↻ ≫
MED4 ↻ ≫
SDHB ↻ ≫
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TMX2 ↻ ≫
MED19 ↻ ≫
LRRC46 ↻ ≫
NDUFAB1 ↻ ≫
RNASEH1 ↻ ≫
HSPBP1 ↻ ≫
BRSK1 ↻ ≫
HTRA2 ↻ ≫
DQX1 ↻ ≫
MAPKAPK5 ↻ ≫
ZMAT2 ↻ ≫
ZNF165 ↻ ≫
YIPF2 ↻ ≫
TIMM29 ↻ ≫
STMN3 ↻ ≫
RTEL1 ↻ ≫
NCBP2AS2 ↻ ≫
NCBP2 ↻ ≫
SENP1 ↻ ≫
PFKM ↻ ≫
YJU2 ↻ ≫
FBXO28 ↻ ≫
RTF2 ↻ ≫
DDX41 ↻ ≫
ZNF2 ↻ ≫
POLR1H ↻ ≫
SNRPC ↻ ≫
FBXL12 ↻ ≫
GOSR1 ↻ ≫
GPX8 ↻ ≫
ZNF408 ↻ ≫
ARHGAP1 ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
BRF2 ↻ ≫
VPS25 ↻ ≫
CDK5RAP1 ↻ ≫
OXNAD1 ↻ ≫
DPH3 ↻ ≫
MED1 ↻ ≫
CACTIN ↻ ≫
THUMPD1 ↻ ≫
UBXN1 ↻ ≫
SUPT4H1 ↻ ≫
TEKT2 ↻ ≫
ADPRS ↻ ≫
UBQLN1 ↻ ≫
ATG9B ↻ ≫
ABCB8 ↻ ≫
KLHDC4 ↻ ≫
CWC25 ↻ ≫
RPS6KB2 ↻ ≫
FAM204A ↻ ≫
KDM4D ↻ ≫
CWC15 ↻ ≫
CMTR1 ↻ ≫
NDUFA9 ↻ ≫
AKAP3 ↻ ≫
DOLPP1 ↻ ≫
LANCL2 ↻ ≫
TMEM262 ↻ ≫
MIS12 ↻ ≫
DERL2 ↻ ≫
EXOSC10 ↻ ≫
ATP6V0D1 ↻ ≫
AGRP ↻ ≫
C1D ↻ ≫
FAAP20 ↻ ≫
REXO1 ↻ ≫
LSM5 ↻ ≫
TAF2 ↻ ≫
COMMD2 ↻ ≫
PSME3 ↻ ≫
MRPL2 ↻ ≫
KLC4 ↻ ≫
MRPL37 ↻ ≫
CYB5RL ↻ ≫
POLR2J ↻ ≫
ASH2L ↻ ≫
NMNAT1 ↻ ≫
LZIC ↻ ≫
CDK11B ↻ ≫
CDK11A ↻ ≫
PLEKHM3 ↻ ≫
EIF3E ↻ ≫
MTMR2 ↻ ≫
RFXANK ↻ ≫
BORCS8-MEF2B ↻ ≫
BORCS8 ↻ ≫
MRPS7 ↻ ≫
GGA3 ↻ ≫
LONP1 ↻ ≫
CATSPERD ↻ ≫
HBS1L ↻ ≫
SLC39A4 ↻ ≫
CPSF1 ↻ ≫
AVL9 ↻ ≫
CTCF ↻ ≫
PNPT1 ↻ ≫
TATDN3 ↻ ≫
NSL1 ↻ ≫
DHX35 ↻ ≫
NUP155 ↻ ≫
SEC13 ↻ ≫
ZCCHC4 ↻ ≫
ECSIT ↻ ≫
TEFM ↻ ≫
JRK ↻ ≫
GRWD1 ↻ ≫
DNAJC30 ↻ ≫
BUD23 ↻ ≫
GCN1 ↻ ≫
FAM98B ↻ ≫
GTF2H4 ↻ ≫
TBL3 ↻ ≫
ATP6V1C1 ↻ ≫
METTL17 ↻ ≫
MUL1 ↻ ≫
NUFIP1 ↻ ≫
GPALPP1 ↻ ≫
RRP7A ↻ ≫
DOHH ↻ ≫
ZNF507 ↻ ≫
TEPSIN ↻ ≫
NDUFAF8 ↻ ≫
OPA1 ↻ ≫
MED27 ↻ ≫
CEP20 ↻ ≫
ZNF212 ↻ ≫
WDR61 ↻ ≫
TBCCD1 ↻ ≫
DNAJB11 ↻ ≫
MRPL58 ↻ ≫
HIF1AN ↻ ≫
DIABLO ↻ ≫
XPC ↻ ≫
LSM3 ↻ ≫
RAD51AP1 ↻ ≫
C12orf4 ↻ ≫
MNAT1 ↻ ≫
PSMD4 ↻ ≫
VPS52 ↻ ≫
RPS18 ↻ ≫
PIGL ↻ ≫
NCOR1 ↻ ≫
STPG3 ↻ ≫
NELFB ↻ ≫
PDCD6IP ↻ ≫
COG2 ↻ ≫
DBT ↻ ≫
GPATCH1 ↻ ≫
RNF40 ↻ ≫
CCDC189 ↻ ≫
OTUB1 ↻ ≫
AURKAIP1 ↻ ≫
EIF1AD ↻ ≫
BANF1 ↻ ≫
SERP1 ↻ ≫
EIF2A ↻ ≫
SMN2 ↻ ≫
SMN1 ↻ ≫
SART3 ↻ ≫
ISCU ↻ ≫
STK36 ↻ ≫
RNF25 ↻ ≫
MRPS30 ↻ ≫
NDUFB3 ↻ ≫
FAM126B ↻ ≫
FANCD2 ↻ ≫
NXT2 ↻ ≫
RPS28 ↻ ≫
NDUFA7 ↻ ≫
GINS1 ↻ ≫
NCAPD2 ↻ ≫
MRPL51 ↻ ≫
CLCN7 ↻ ≫
RDH5 ↻ ≫
ITGA7 ↻ ≫
BLOC1S1 ↻ ≫
ATP6V1G1 ↻ ≫
SEC16A ↻ ≫
MCOLN1 ↻ ≫
C9orf163 ↻ ≫
MFSD1 ↻ ≫
SRPRA ↻ ≫
RNF166 ↻ ≫
CTU2 ↻ ≫
NEK2 ↻ ≫
ZDHHC16 ↻ ≫
EXOSC1 ↻ ≫
GFM1 ↻ ≫
PGBD4 ↻ ≫
EMC7 ↻ ≫
THBS4 ↻ ≫
MTX3 ↻ ≫
MED9 ↻ ≫
SFTPC ↻ ≫
DNAJA3 ↻ ≫
LMTK2 ↻ ≫
USP30 ↻ ≫
COA6 ↻ ≫
SNIP1 ↻ ≫
DNALI1 ↻ ≫
VTA1 ↻ ≫
NMBR ↻ ≫
SURF2 ↻ ≫
SURF1 ↻ ≫
KCTD5 ↻ ≫
PSMB6 ↻ ≫
TMEM128 ↻ ≫
EIF2B5 ↻ ≫
POLR1F ↻ ≫
MRPS31 ↻ ≫
TIMM50 ↻ ≫
TAF3 ↻ ≫
TXNL4B ↻ ≫
DHX38 ↻ ≫
COPS8 ↻ ≫
TSFM ↻ ≫
MAP3K7 ↻ ≫
WDR24 ↻ ≫
SRP68 ↻ ≫
GALR2 ↻ ≫
TARS2 ↻ ≫
MESD ↻ ≫
NDUFAF5 ↻ ≫
ESF1 ↻ ≫
EPG5 ↻ ≫
COMMD1 ↻ ≫
AAR2 ↻ ≫
MTIF2 ↻ ≫
THOC1 ↻ ≫
ZKSCAN4 ↻ ≫
PMPCB ↻ ≫
TUFM ↻ ≫
SH2B1 ↻ ≫
NDUFA12 ↻ ≫
MRPL4 ↻ ≫
VAMP3 ↻ ≫
CHMP1B ↻ ≫
CCDC97 ↻ ≫
COQ7 ↻ ≫
PEX14 ↻ ≫
DFFA ↻ ≫
TMEM217 ↻ ≫
TBC1D22B ↻ ≫
BNIP1 ↻ ≫
TJAP1 ↻ ≫
UBOX5 ↻ ≫
FASTKD5 ↻ ≫
MYNN ↻ ≫
ACTRT3 ↻ ≫
MRPS23 ↻ ≫
SMG7 ↻ ≫
AP5Z1 ↻ ≫
NOC4L ↻ ≫
DDX51 ↻ ≫
BORCS7 ↻ ≫
MRPS18C ↻ ≫
HELQ ↻ ≫
RAD18 ↻ ≫
MYDGF ↻ ≫
SDHC ↻ ≫
MPZ ↻ ≫
RFNG ↻ ≫
GPS1 ↻ ≫
EXOC3L1 ↻ ≫
E2F4 ↻ ≫
DDX49 ↻ ≫
COPE ↻ ≫
COPZ1 ↻ ≫
WDR81 ↻ ≫
DYNC1LI2 ↻ ≫
CLPTM1 ↻ ≫
MRPS18A ↻ ≫
LIN7C ↻ ≫
UTP15 ↻ ≫
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PALB2 ↻ ≫
DCTN5 ↻ ≫
UBXN7 ↻ ≫
TAF11 ↻ ≫
ANKS1A ↻ ≫
TAX1BP3 ↻ ≫
EMC6 ↻ ≫
BBS10 ↻ ≫
UQCRC1 ↻ ≫
NVL ↻ ≫
PSMC6 ↻ ≫
METTL1 ↻ ≫
EEF1AKMT3 ↻ ≫
CYP27B1 ↻ ≫
ASB6 ↻ ≫
ATXN1L ↻ ≫
DHDDS ↻ ≫
MIS18A ↻ ≫
AARSD1 ↻ ≫
ZNF292 ↻ ≫
RICTOR ↻ ≫
TRAPPC8 ↻ ≫
UBXN11 ↻ ≫
MKS1 ↻ ≫
SAMD10 ↻ ≫
PRPF6 ↻ ≫
ATRIP ↻ ≫
NOL10 ↻ ≫
LTO1 ↻ ≫
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FBXO15 ↻ ≫
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RPUSD2 ↻ ≫
CCDC32 ↻ ≫
TSPAN10 ↻ ≫
NPLOC4 ↻ ≫
ANAPC11 ↻ ≫
ALYREF ↻ ≫
KAT5 ↻ ≫
SUGCT ↻ ≫
MPLKIP ↻ ≫
B4GALT7 ↻ ≫
ABRAXAS2 ↻ ≫
GOSR2 ↻ ≫
UBFD1 ↻ ≫
EARS2 ↻ ≫
YIPF4 ↻ ≫
DHX40 ↻ ≫
SART1 ↻ ≫
SMG5 ↻ ≫
UBN1 ↻ ≫
GLYR1 ↻ ≫
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PTCD3 ↻ ≫
POLR1A ↻ ≫
NUDT5 ↻ ≫
CDC123 ↻ ≫
CSTF2 ↻ ≫
GRN ↻ ≫
VPS37A ↻ ≫
CNOT7 ↻ ≫
PPIE ↻ ≫
SH3YL1 ↻ ≫
ACP1 ↻ ≫
ARMC8 ↻ ≫
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ORC1 ↻ ≫
TERF2IP ↻ ≫
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PSMB2 ↻ ≫
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PARL ↻ ≫
TYW3 ↻ ≫
CRYZ ↻ ≫
PIH1D2 ↻ ≫
NKAPD1 ↻ ≫
TPRKB ↻ ≫
COX6A1 ↻ ≫
NOP9 ↻ ≫
DHRS1 ↻ ≫
DDX52 ↻ ≫
PHB2 ↻ ≫
AARS2 ↻ ≫
FXR1 ↻ ≫
TUBGCP6 ↻ ≫
PHKA2 ↻ ≫
PEX3 ↻ ≫
ADAT2 ↻ ≫
TOX4 ↻ ≫
RAB2B ↻ ≫
NDUFV1 ↻ ≫
PPP1R7 ↻ ≫
PASK ↻ ≫
KLF1 ↻ ≫
GCDH ↻ ≫
REXO4 ↻ ≫
ADAMTS13 ↻ ≫
ZSCAN22 ↻ ≫
EXOSC3 ↻ ≫
GFM2 ↻ ≫
PCCB ↻ ≫
MFSD5 ↻ ≫
RFC1 ↻ ≫
NAT10 ↻ ≫
NOXO1 ↻ ≫
GFER ↻ ≫
UBE2V2 ↻ ≫
TYW1 ↻ ≫
SBDS ↻ ≫
CIAO2B ↻ ≫
CES2 ↻ ≫
RECQL ↻ ≫
GOLT1B ↻ ≫
TRIM23 ↻ ≫
TRAPPC13 ↻ ≫
SHLD3 ↻ ≫
CENPBD1 ↻ ≫
ARL8B ↻ ≫
ZSCAN30 ↻ ≫
MIA3 ↻ ≫
SLC38A7 ↻ ≫
MYL5 ↻ ≫
ATP5ME ↻ ≫
STARD10 ↻ ≫
ATXN7L2 ↻ ≫
EXOSC9 ↻ ≫
TBC1D30 ↻ ≫
GNS ↻ ≫
ATP6V1H ↻ ≫
SKIV2L ↻ ≫
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