ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for KDM5A

Query protein: KDM5A
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX116459 | hESC H1
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
KDM5A's Target genes

◢ KDM5A: Average

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◢ SRX3010239: A549

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◢ SRX3010254: GM12878

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◢ SRX116460: hESC H1

◢ SRX186642: hESC H1

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◢ SRX6783964: hESC H1

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◢ SRX23740431: SUM 149PT

◢ SRX23740438: SUM 149PT

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◢ SRX23740461: SUM 149PT

◢ SRX1721564: T-47D

◢ SRX1721565: T-47D

◢ KDM5A: STRING
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MTRNR2L1 ↻ ≫
RGPD2 ↻ ≫
RGPD1 ↻ ≫
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MRM3 ↻ ≫
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MRPS18C ↻ ≫
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ISY1 ↻ ≫
MRPL39 ↻ ≫
GATB ↻ ≫
RBM48 ↻ ≫
PEX1 ↻ ≫
COMMD9 ↻ ≫
CDC23 ↻ ≫
GPATCH3 ↻ ≫
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MRPL1 ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
COPS7B ↻ ≫
TSR3 ↻ ≫
GNPTG ↻ ≫
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RAD51B ↻ ≫
LMAN2 ↻ ≫
PHF5A ↻ ≫
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MED6 ↻ ≫
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NOC2L ↻ ≫
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TMEM41A ↻ ≫
WASHC2A ↻ ≫
POLR3F ↻ ≫
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TIMM22 ↻ ≫
BSDC1 ↻ ≫
PEPD ↻ ≫
POLR1F ↻ ≫
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TFPT ↻ ≫
PRPF31 ↻ ≫
SUPT7L ↻ ≫
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TOMM6 ↻ ≫
TRAPPC2L ↻ ≫
GALNS ↻ ≫
MRPL44 ↻ ≫
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CWC27 ↻ ≫
INTU ↻ ≫
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FAM89B ↻ ≫
FBXL12 ↻ ≫
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POLDIP2 ↻ ≫
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TRIP4 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
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PEX13 ↻ ≫
MRPS15 ↻ ≫
LIN52 ↻ ≫
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FEM1A ↻ ≫
MRPL45 ↻ ≫
NCAPH2 ↻ ≫
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NUP214 ↻ ≫
ALG1 ↻ ≫
BRIX1 ↻ ≫
CSPP1 ↻ ≫
COPS5 ↻ ≫
WASHC2C ↻ ≫
DNTTIP2 ↻ ≫
VIRMA ↻ ≫
UQCC1 ↻ ≫
RNF26 ↻ ≫
MRPS14 ↻ ≫
RPTOR ↻ ≫
URM1 ↻ ≫
EIF3H ↻ ≫
MAIP1 ↻ ≫
CWF19L1 ↻ ≫
TAF3 ↻ ≫
TEKT2 ↻ ≫
ADPRS ↻ ≫
PDCD6IP ↻ ≫
NOL8 ↻ ≫
CENPP ↻ ≫
PELP1 ↻ ≫
SAP30BP ↻ ≫
RECQL5 ↻ ≫
MRPL55 ↻ ≫
RRP15 ↻ ≫
COX10 ↻ ≫
TMEM126B ↻ ≫
DLG2 ↻ ≫
TIMM17A ↻ ≫
YIPF2 ↻ ≫
TIMM29 ↻ ≫
DBT ↻ ≫
LRRC29 ↻ ≫
BBS1 ↻ ≫
IPO11 ↻ ≫
RBM42 ↻ ≫
TMEM101 ↻ ≫
PFDN1 ↻ ≫
LARS2 ↻ ≫
MDH1B ↻ ≫
FASTKD2 ↻ ≫
MTERF4 ↻ ≫
VPS11 ↻ ≫
EIF1AD ↻ ≫
BANF1 ↻ ≫
NPM3 ↻ ≫
FGF8 ↻ ≫
FAM162A ↻ ≫
CCDC58 ↻ ≫
UBIAD1 ↻ ≫
C17orf75 ↻ ≫
TXN2 ↻ ≫
CRBN ↻ ≫
MUC3A ↻ ≫
ZMAT2 ↻ ≫
METAP1D ↻ ≫
TSR1 ↻ ≫
SGSM2 ↻ ≫
TRIAP1 ↻ ≫
PMPCA ↻ ≫
ENTR1 ↻ ≫
ATP5IF1 ↻ ≫
SETD3 ↻ ≫
CCNK ↻ ≫
MTBP ↻ ≫
MRPL13 ↻ ≫
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DNAJC30 ↻ ≫
BUD23 ↻ ≫
TRIM48 ↻ ≫
MRPS22 ↻ ≫
MFN2 ↻ ≫
NSFL1C ↻ ≫
TPRN ↻ ≫
TMEM203 ↻ ≫
NDOR1 ↻ ≫
APBB2 ↻ ≫
LONP1 ↻ ≫
CATSPERD ↻ ≫
RPUSD4 ↻ ≫
FAM118B ↻ ≫
METTL16 ↻ ≫
COMMD4 ↻ ≫
EIF3F ↻ ≫
BRF2 ↻ ≫
SLC39A4 ↻ ≫
CPSF1 ↻ ≫
RTN4IP1 ↻ ≫
QRSL1 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
DNAJC11 ↻ ≫
TOP3A ↻ ≫
SMCR8 ↻ ≫
BABAM1 ↻ ≫
PSMC3 ↻ ≫
GPATCH4 ↻ ≫
VCPKMT ↻ ≫
MRPL58 ↻ ≫
NUP54 ↻ ≫
PIGL ↻ ≫
NCOR1 ↻ ≫
MRTO4 ↻ ≫
EMC1 ↻ ≫
CEP20 ↻ ≫
HEXA ↻ ≫
MRPL21 ↻ ≫
IGHMBP2 ↻ ≫
RCE1 ↻ ≫
MKS1 ↻ ≫
SPATA25 ↻ ≫
NEURL2 ↻ ≫
CTSA ↻ ≫
DDX23 ↻ ≫
SF3B2 ↻ ≫
GAL3ST3 ↻ ≫
MYL5 ↻ ≫
ATP5ME ↻ ≫
KAT8 ↻ ≫
C5orf51 ↻ ≫
QRICH1 ↻ ≫
PEX19 ↻ ≫
C12orf43 ↻ ≫
SLC25A26 ↻ ≫
CSTF2 ↻ ≫
MRPL2 ↻ ≫
KLC4 ↻ ≫
RDH5 ↻ ≫
ITGA7 ↻ ≫
BLOC1S1 ↻ ≫
NMT1 ↻ ≫
DCAKD ↻ ≫
NOL11 ↻ ≫
ATP5MF-PTCD1 ↻ ≫
ATP5MF ↻ ≫
NMNAT1 ↻ ≫
LZIC ↻ ≫
SF3B3 ↻ ≫
COG4 ↻ ≫
NUP160 ↻ ≫
COX16 ↻ ≫
TACO1 ↻ ≫
HNRNPA1L2 ↻ ≫
TAS1R1 ↻ ≫
NOL9 ↻ ≫
VPS33A ↻ ≫
OAZ3 ↻ ≫
ZBTB45 ↻ ≫
UHMK1 ↻ ≫
TRMO ↻ ≫
UTP20 ↻ ≫
TRMT61B ↻ ≫
DPP9 ↻ ≫
PISD ↻ ≫
SENP1 ↻ ≫
PFKM ↻ ≫
ZFAND2A ↻ ≫
MNAT1 ↻ ≫
SUPV3L1 ↻ ≫
MOCS3 ↻ ≫
DPM1 ↻ ≫
OXNAD1 ↻ ≫
DPH3 ↻ ≫
USP30 ↻ ≫
ZNF213 ↻ ≫
MRPS11 ↻ ≫
MRPL46 ↻ ≫
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MRPL48 ↻ ≫
SPRYD4 ↻ ≫
ALKBH3 ↻ ≫
ZNF17 ↻ ≫
RPS28 ↻ ≫
NDUFA7 ↻ ≫
KCTD5 ↻ ≫
MRPS31 ↻ ≫
ZSCAN22 ↻ ≫
COL23A1 ↻ ≫
ATP7B ↻ ≫
ALG11 ↻ ≫
SPATA20 ↻ ≫
VAC14 ↻ ≫
HMGCL ↻ ≫
THUMPD1 ↻ ≫
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OS9 ↻ ≫
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USP54 ↻ ≫
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MZT2A ↻ ≫
SLC25A53 ↻ ≫
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DIABLO ↻ ≫
SUGCT ↻ ≫
MPLKIP ↻ ≫
PPP1R7 ↻ ≫
PASK ↻ ≫
TMEM216 ↻ ≫
ABT1 ↻ ≫
SLC35A3 ↻ ≫
TM9SF4 ↻ ≫
ERICH4 ↻ ≫
DMAC2 ↻ ≫
TPP1 ↻ ≫
TEFM ↻ ≫
TJAP1 ↻ ≫
TIMM21 ↻ ≫
FBXO15 ↻ ≫
TAF2 ↻ ≫
DNAJB12 ↻ ≫
HSPBP1 ↻ ≫
BRSK1 ↻ ≫
LYRM4 ↻ ≫
FARS2 ↻ ≫
CDK5RAP1 ↻ ≫
KDM4D ↻ ≫
CWC15 ↻ ≫
XPO4 ↻ ≫
RANBP3 ↻ ≫
USP8 ↻ ≫
POLR1H ↻ ≫
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SMPD4 ↻ ≫
MZT2B ↻ ≫
NCAPD2 ↻ ≫
MRPL51 ↻ ≫
TARS2 ↻ ≫
LIN7C ↻ ≫
OSCAR ↻ ≫
NDUFA3 ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
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OPA1 ↻ ≫
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GRWD1 ↻ ≫
SEC16A ↻ ≫
C9orf163 ↻ ≫
ANKRD13C ↻ ≫
AURKAIP1 ↻ ≫
MTO1 ↻ ≫
UBN1 ↻ ≫
GLYR1 ↻ ≫
PIGK ↻ ≫
ZDHHC6 ↻ ≫
VTI1A ↻ ≫
DOHH ↻ ≫
STX18 ↻ ≫
MRPS10 ↻ ≫
WDR48 ↻ ≫
SCN11A ↻ ≫
WDR53 ↻ ≫
FBXO45 ↻ ≫
VPS25 ↻ ≫
EEF1AKMT4-ECE2 ↻ ≫
EEF1AKMT4 ↻ ≫
ALG3 ↻ ≫
PPP1R15B ↻ ≫
METTL2B ↻ ≫
PCID2 ↻ ≫
CUL4A ↻ ≫
TAF11 ↻ ≫
ANKS1A ↻ ≫
SLC35B1 ↻ ≫
ZZZ3 ↻ ≫
TRMT44 ↻ ≫
ACOX3 ↻ ≫
WDR24 ↻ ≫
ZNF770 ↻ ≫
ATXN2L ↻ ≫
MPHOSPH10 ↻ ≫
MCEE ↻ ≫
SLC7A6OS ↻ ≫
PRMT7 ↻ ≫
NDUFB5 ↻ ≫
MRPL47 ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
DHX35 ↻ ≫
AP5Z1 ↻ ≫
DUS2 ↻ ≫
DDX28 ↻ ≫
EIF3E ↻ ≫
SYF2 ↻ ≫
ZNF2 ↻ ≫
MFSD5 ↻ ≫
TMX2 ↻ ≫
MED19 ↻ ≫
PHB2 ↻ ≫
CCAR2 ↻ ≫
C8orf58 ↻ ≫
TMEM217 ↻ ≫
TBC1D22B ↻ ≫
APTX ↻ ≫
EMC4 ↻ ≫
TSN ↻ ≫
SART3 ↻ ≫
ISCU ↻ ≫
NOC4L ↻ ≫
DDX51 ↻ ≫
IQCH ↻ ≫
AAGAB ↻ ≫
HAX1 ↻ ≫
CCDC43 ↻ ≫
NUP155 ↻ ≫
TAX1BP3 ↻ ≫
EMC6 ↻ ≫
KLF1 ↻ ≫
GCDH ↻ ≫
CDKAL1 ↻ ≫
RFXANK ↻ ≫
BORCS8-MEF2B ↻ ≫
BORCS8 ↻ ≫
NDUFA10 ↻ ≫
EEF1E1 ↻ ≫
XPC ↻ ≫
LSM3 ↻ ≫
TBRG4 ↻ ≫
WDR36 ↻ ≫
LAMP1 ↻ ≫
ZC3H18 ↻ ≫
ARFGEF2 ↻ ≫
RPUSD2 ↻ ≫
CCDC32 ↻ ≫
DHX40 ↻ ≫
GOLGA3 ↻ ≫
YIPF3 ↻ ≫
POLR1C ↻ ≫
KLHDC4 ↻ ≫
ZMPSTE24 ↻ ≫
CACTIN ↻ ≫
FDX2 ↻ ≫
UMPS ↻ ≫
POLR2K ↻ ≫
FBXO43 ↻ ≫
LRRC8A ↻ ≫
KYAT1 ↻ ≫
LSM5 ↻ ≫
AVL9 ↻ ≫
GTF3C3 ↻ ≫
SNRPC ↻ ≫
RPS7 ↻ ≫
DUS4L-BCAP29 ↻ ≫
DUS4L ↻ ≫
COG5 ↻ ≫
ACIN1 ↻ ≫
ARMC8 ↻ ≫
FAM187A ↻ ≫
EFTUD2 ↻ ≫
CCDC103 ↻ ≫
RNASEK ↻ ≫
C17orf49 ↻ ≫
TSR2 ↻ ≫
WDR83OS ↻ ≫
WDR83 ↻ ≫
MAN2B1 ↻ ≫
MAGOH ↻ ≫
DDX46 ↻ ≫
ZCCHC4 ↻ ≫
ZKSCAN4 ↻ ≫
UQCRC1 ↻ ≫
EXOSC3 ↻ ≫
TIMM44 ↻ ≫
UBXN11 ↻ ≫
TBC1D22A ↻ ≫
SRPRA ↻ ≫
NDUFA9 ↻ ≫
AKAP3 ↻ ≫
FANCD2 ↻ ≫
TRDMT1 ↻ ≫
TMEM126A ↻ ≫
NDUFV1 ↻ ≫
STOML2 ↻ ≫
SKIDA1 ↻ ≫
GOSR1 ↻ ≫
TBC1D23 ↻ ≫
NSUN4 ↻ ≫
PUM3 ↻ ≫
WDR11 ↻ ≫
ZDHHC16 ↻ ≫
EXOSC1 ↻ ≫
MTMR4 ↻ ≫
NUF2 ↻ ≫
NDUFAB1 ↻ ≫
TUFM ↻ ≫
SH2B1 ↻ ≫
MIA3 ↻ ≫
MCOLN1 ↻ ≫
TRUB1 ↻ ≫
UBN2 ↻ ≫
HIRIP3 ↻ ≫
PTPN21 ↻ ≫
TM2D1 ↻ ≫
PTCD2 ↻ ≫
MRPS27 ↻ ≫
NOP16 ↻ ≫
HIGD2A ↻ ≫
MED4 ↻ ≫
CCDC97 ↻ ≫
YBEY ↻ ≫
MCM3AP ↻ ≫
PHAX ↻ ≫
ZNF561 ↻ ≫
TOP3B ↻ ≫
SF3A3 ↻ ≫
ALKBH8 ↻ ≫
ZNF383 ↻ ≫
MYSM1 ↻ ≫
MRPL11 ↻ ≫
WASHC5 ↻ ≫
NSMCE2 ↻ ≫
TEPSIN ↻ ≫
NDUFAF8 ↻ ≫
EXOSC9 ↻ ≫
FAM149B1 ↻ ≫
ECD ↻ ≫
DLST ↻ ≫
MAGOHB ↻ ≫
ANAPC11 ↻ ≫
ALYREF ↻ ≫
NCSTN ↻ ≫
COPA ↻ ≫
SSBP1 ↻ ≫
GTPBP10 ↻ ≫
GPX8 ↻ ≫
COMMD2 ↻ ≫
ANKFY1 ↻ ≫
VAMP3 ↻ ≫
UBL5 ↻ ≫
SYNGAP1 ↻ ≫
CUTA ↻ ≫
MRPS7 ↻ ≫
GGA3 ↻ ≫
METTL1 ↻ ≫
EEF1AKMT3 ↻ ≫
CYP27B1 ↻ ≫
PTCD3 ↻ ≫
POLR1A ↻ ≫
TERF2IP ↻ ≫
KARS1 ↻ ≫
CXorf56 ↻ ≫
SDE2 ↻ ≫
DNAJA3 ↻ ≫
SDHC ↻ ≫
MPZ ↻ ≫
FAM32A ↻ ≫
NME3 ↻ ≫
MRPS34 ↻ ≫
EME2 ↻ ≫
IPPK ↻ ≫
STMN3 ↻ ≫
RTEL1 ↻ ≫
SH3YL1 ↻ ≫
ACP1 ↻ ≫
MRPL35 ↻ ≫
IMMT ↻ ≫
TBC1D19 ↻ ≫
AP3S1 ↻ ≫
SPTLC1 ↻ ≫
MRPL4 ↻ ≫
MRPS18A ↻ ≫
ABRAXAS2 ↻ ≫
NOB1 ↻ ≫
L3MBTL2 ↻ ≫
ZBTB8OS ↻ ≫
RBBP4 ↻ ≫
ZNF497 ↻ ≫
CWC25 ↻ ≫
CMTR1 ↻ ≫
MED9 ↻ ≫
ZSCAN30 ↻ ≫
MRPL20 ↻ ≫
TMEM11 ↻ ≫
TYW1B ↻ ≫
FOLR3 ↻ ≫
ELP5 ↻ ≫
CTDNEP1 ↻ ≫
NXT2 ↻ ≫
PIGS ↻ ≫
TTC31 ↻ ≫
CCDC142 ↻ ≫
PEX3 ↻ ≫
ADAT2 ↻ ≫
TBC1D17 ↻ ≫
AKT1S1 ↻ ≫
ASH2L ↻ ≫
B4GALT7 ↻ ≫
SNRPD3 ↻ ≫
GUCD1 ↻ ≫
SMU1 ↻ ≫
GTF2H3 ↻ ≫
EIF2B1 ↻ ≫
GPN1 ↻ ≫
CCDC121 ↻ ≫
TMEM230 ↻ ≫
VPS52 ↻ ≫
RPS18 ↻ ≫
PSMB2 ↻ ≫
MDP1 ↻ ≫
CHMP4A ↻ ≫
FRA10AC1 ↻ ≫
ZNF461 ↻ ≫
NUP107 ↻ ≫
ZNF408 ↻ ≫
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NUFIP1 ↻ ≫
GPALPP1 ↻ ≫
OTUB1 ↻ ≫
PEX14 ↻ ≫
DFFA ↻ ≫
SLIRP ↻ ≫
ALKBH1 ↻ ≫
MRPS23 ↻ ≫
SDHAF2 ↻ ≫
CPSF7 ↻ ≫
ZWINT ↻ ≫
RUVBL2 ↻ ≫
GYS1 ↻ ≫
RNF166 ↻ ≫
CTU2 ↻ ≫
SMG7 ↻ ≫
MTOR ↻ ≫
NFKBIL1 ↻ ≫
ATP6V1G2 ↻ ≫
DDX39B ↻ ≫
TBL3 ↻ ≫
EIF4G2 ↻ ≫
OSBPL9 ↻ ≫
TMEM128 ↻ ≫
PRPF38A ↻ ≫
ORC1 ↻ ≫
REXO4 ↻ ≫
ADAMTS13 ↻ ≫
ATAD3B ↻ ≫
MSX1 ↻ ≫
THBS3 ↻ ≫
MTX1 ↻ ≫
GTF2H4 ↻ ≫
MAP3K7 ↻ ≫
MRPL53 ↻ ≫
NBAS ↻ ≫
AP1G1 ↻ ≫
ZNF614 ↻ ≫
PNPT1 ↻ ≫
RMDN3 ↻ ≫
DDT ↻ ≫
DDTL ↻ ≫
ITGB3BP ↻ ≫
EFCAB7 ↻ ≫
ITGB1BP1 ↻ ≫
CPSF3 ↻ ≫
SPDL1 ↻ ≫
ZNF205 ↻ ≫
WDR4 ↻ ≫
SELENOH ↻ ≫
GFM2 ↻ ≫
C12orf73 ↻ ≫
RUVBL1 ↻ ≫
EEFSEC ↻ ≫
MAPKAPK5 ↻ ≫
ANAPC5 ↻ ≫
ZNF721 ↻ ≫
PIGG ↻ ≫
FAM104B ↻ ≫
MTRNR2L3 ↻ ≫
MAGEB10 ↻ ≫
SUPT4H1 ↻ ≫
ATP6V1C1 ↻ ≫
FKBPL ↻ ≫
ATF6B ↻ ≫
STK36 ↻ ≫
RNF25 ↻ ≫
NR1H3 ↻ ≫
ACP2 ↻ ≫
ZNHIT2 ↻ ≫
MRPL49 ↻ ≫
FAU ↻ ≫
IMMP1L ↻ ≫
ELP4 ↻ ≫
GBA ↻ ≫
VPS41 ↻ ≫
YY1 ↻ ≫
MRPS35 ↻ ≫
CEP162 ↻ ≫
PPP1R10 ↻ ≫
MRPS18B ↻ ≫
GPM6A ↻ ≫
MRPS17 ↻ ≫
SSU72 ↻ ≫
GRPEL2 ↻ ≫
MED18 ↻ ≫
MED21 ↻ ≫
SEC13 ↻ ≫
DGUOK ↻ ≫
NHP2 ↻ ≫
TBC1D15 ↻ ≫
ZBTB11 ↻ ≫
SEC11A ↻ ≫
SF3B5 ↻ ≫
MRPL52 ↻ ≫
SRRD ↻ ≫
HPS4 ↻ ≫
ZCCHC10 ↻ ≫
DCP1A ↻ ≫
BHLHB9 ↻ ≫
ZNF195 ↻ ≫
ANAPC1 ↻ ≫
NDUFC2-KCTD14 ↻ ≫
NDUFC2 ↻ ≫
MTRF1 ↻ ≫
NDUFA5 ↻ ≫
THAP10 ↻ ≫
LRRC49 ↻ ≫
THBS4 ↻ ≫
MTX3 ↻ ≫
AQR ↻ ≫
CHM ↻ ≫
UQCRB ↻ ≫
RAB3GAP1 ↻ ≫
HIF1AN ↻ ≫
SPC25 ↻ ≫
ZKSCAN8 ↻ ≫
DDX19A ↻ ≫
PWP1 ↻ ≫
KANSL2 ↻ ≫
GCN1 ↻ ≫
MFSD1 ↻ ≫
KLHL7 ↻ ≫
UBE2L6 ↻ ≫
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GADD45GIP1 ↻ ≫
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JRK ↻ ≫
NOL10 ↻ ≫
ATRIP ↻ ≫
PGGT1B ↻ ≫
MRPL3 ↻ ≫
NDUFAF5 ↻ ≫
ESF1 ↻ ≫
MRPL27 ↻ ≫
EME1 ↻ ≫
NME1 ↻ ≫
CSTF2T ↻ ≫
ZNF622 ↻ ≫
ZNF426 ↻ ≫
GPATCH1 ↻ ≫
RPP30 ↻ ≫
RPAIN ↻ ≫
NUP88 ↻ ≫
PAF1 ↻ ≫
MED29 ↻ ≫
TTC26 ↻ ≫
OTUD6B ↻ ≫
SCAF11 ↻ ≫
PSME3 ↻ ≫
BNIP1 ↻ ≫
ZNF79 ↻ ≫
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GRN ↻ ≫
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TBCK ↻ ≫
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CDC123 ↻ ≫
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GNL1 ↻ ≫
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PURB ↻ ≫
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BMS1 ↻ ≫
TFIP11 ↻ ≫
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MED1 ↻ ≫
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MAZ ↻ ≫
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DNAJC25 ↻ ≫
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NCBP2 ↻ ≫
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PPAN ↻ ≫
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