ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for PAF1

Query protein: PAF1
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3151495 | HCT 116
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
PAF1's Target genes

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◢ SRX7213083: U2OS

◢ PAF1: STRING
CCDC200 ↻ ≫
CHAC1 ↻ ≫
SUMF2 ↻ ≫
POLG2 ↻ ≫
UNK ↻ ≫
PANK4 ↻ ≫
CDCA3 ↻ ≫
SCRIB ↻ ≫
SLC7A11 ↻ ≫
INO80D ↻ ≫
GGA2 ↻ ≫
KBTBD6 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
FLOT1 ↻ ≫
IER3 ↻ ≫
SLC25A17 ↻ ≫
MFN2 ↻ ≫
SECISBP2 ↻ ≫
ZFX ↻ ≫
UBE2L3 ↻ ≫
KBTBD7 ↻ ≫
SLC7A5 ↻ ≫
EXOSC6 ↻ ≫
CCDC85B ↻ ≫
COX20 ↻ ≫
KDF1 ↻ ≫
MIB1 ↻ ≫
ROMO1 ↻ ≫
IFRD2 ↻ ≫
EEF1A1 ↻ ≫
RWDD2A ↻ ≫
PGM3 ↻ ≫
NUDCD1 ↻ ≫
MIS18A ↻ ≫
FEM1A ↻ ≫
DHDH ↻ ≫
CHMP4B ↻ ≫
ZNF34 ↻ ≫
CSKMT ↻ ≫
C11orf98 ↻ ≫
TRAPPC4 ↻ ≫
RPS25 ↻ ≫
MTHFD2 ↻ ≫
AKAP8 ↻ ≫
PIP4K2B ↻ ≫
HSPA4 ↻ ≫
TMSB10 ↻ ≫
TRPT1 ↻ ≫
NUDT22 ↻ ≫
H3-3B ↻ ≫
SDC4 ↻ ≫
ZSCAN31 ↻ ≫
UFSP2 ↻ ≫
PCBP2 ↻ ≫
C1orf159 ↻ ≫
RPTOR ↻ ≫
NR4A1 ↻ ≫
ZBTB4 ↻ ≫
POLR2A ↻ ≫
TCEA2 ↻ ≫
UBB ↻ ≫
RPS9 ↻ ≫
OVCA2 ↻ ≫
H4C3 ↻ ≫
C18orf32 ↻ ≫
NXT2 ↻ ≫
ACTB ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
EGLN2 ↻ ≫
TES ↻ ≫
KRBA2 ↻ ≫
EIF1 ↻ ≫
HSPA1L ↻ ≫
HSPA1A ↻ ≫
AREG ↻ ≫
TSNAXIP1 ↻ ≫
RANBP10 ↻ ≫
KMT2A ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
MICOS13 ↻ ≫
HSD11B1L ↻ ≫
MXRA7 ↻ ≫
HMGB1 ↻ ≫
USPL1 ↻ ≫
MRPL12 ↻ ≫
SFT2D3 ↻ ≫
PPRC1 ↻ ≫
ADNP ↻ ≫
PSAT1 ↻ ≫
SLC5A3 ↻ ≫
MRPS6 ↻ ≫
AP2S1 ↻ ≫
IQCG ↻ ≫
LMLN ↻ ≫
PAIP2 ↻ ≫
CS ↻ ≫
HSD17B7 ↻ ≫
H4C11 ↻ ≫
PHLDB1 ↻ ≫
KLHL9 ↻ ≫
TIMM21 ↻ ≫
FBXO15 ↻ ≫
C1QBP ↻ ≫
HSPB1 ↻ ≫
CRK ↻ ≫
EPN1 ↻ ≫
PSMA1 ↻ ≫
GADD45B ↻ ≫
LENG1 ↻ ≫
CNPY2 ↻ ≫
TMEM9 ↻ ≫
MRPS28 ↻ ≫
SOD1 ↻ ≫
TMC4 ↻ ≫
TPT1 ↻ ≫
KLF6 ↻ ≫
DAPK3 ↻ ≫
DDIT4 ↻ ≫
STK40 ↻ ≫
RABIF ↻ ≫
GPS2 ↻ ≫
ATXN7L3B ↻ ≫
RCC1 ↻ ≫
CSRNP1 ↻ ≫
EPHA2 ↻ ≫
CALR3 ↻ ≫
C19orf44 ↻ ≫
PLEKHA1 ↻ ≫
PIGF ↻ ≫
CRIPT ↻ ≫
NUDC ↻ ≫
ANKRD40 ↻ ≫
MT1E ↻ ≫
PPID ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
CLDN4 ↻ ≫
OSTC ↻ ≫
BAIAP2 ↻ ≫
MT2A ↻ ≫
MFSD3 ↻ ≫
DUSP1 ↻ ≫
TUBA1C ↻ ≫
HSPA6 ↻ ≫
TAF10 ↻ ≫
SLC26A6 ↻ ≫
GEM ↻ ≫
AZIN1 ↻ ≫
SARAF ↻ ≫
SFN ↻ ≫
TTYH2 ↻ ≫
HNRNPH1 ↻ ≫
KRT8 ↻ ≫
POMZP3 ↻ ≫
SNAPC5 ↻ ≫
BTRC ↻ ≫
ASNS ↻ ≫
CLK1 ↻ ≫
TUSC2 ↻ ≫
SNX19 ↻ ≫
P4HA1 ↻ ≫
CCN1 ↻ ≫
MAFF ↻ ≫
H2AX ↻ ≫
THAP3 ↻ ≫
SEC31A ↻ ≫
MAT2A ↻ ≫
DNLZ ↻ ≫
NUDT15 ↻ ≫
CTDP1 ↻ ≫
VPS4A ↻ ≫
CCT2 ↻ ≫
BOD1 ↻ ≫
EGR1 ↻ ≫
FOS ↻ ≫
RRP7A ↻ ≫
ZC3H10 ↻ ≫
SRSF4 ↻ ≫
NCKIPSD ↻ ≫
PRMT5 ↻ ≫
MCMBP ↻ ≫
PEMT ↻ ≫
TEX14 ↻ ≫
RAD51C ↻ ≫
PNMA1 ↻ ≫
DDIT3 ↻ ≫
SPAG4 ↻ ≫
STMP1 ↻ ≫
COX18 ↻ ≫
DERA ↻ ≫
IER5 ↻ ≫
BUD13 ↻ ≫
ST3GAL2 ↻ ≫
IAH1 ↻ ≫
EIF4A2 ↻ ≫
SETD5 ↻ ≫
TMEM115 ↻ ≫
ANXA3 ↻ ≫
RAB4B ↻ ≫
UPF1 ↻ ≫
PAN2 ↻ ≫
CHD8 ↻ ≫
ZNF444 ↻ ≫
SRSF5 ↻ ≫
SEC14L1 ↻ ≫
SH3D19 ↻ ≫
NPRL2 ↻ ≫
CYB561D2 ↻ ≫
SRP68 ↻ ≫
LRP2BP ↻ ≫
ANKRD37 ↻ ≫
HSPA5 ↻ ≫
BRD2 ↻ ≫
JPT1 ↻ ≫
BIRC5 ↻ ≫
MCL1 ↻ ≫
PISD ↻ ≫
HNRNPA2B1 ↻ ≫
TFPT ↻ ≫
PRPF31 ↻ ≫
CBX3 ↻ ≫
TARBP2 ↻ ≫
TIMM13 ↻ ≫
SRSF2 ↻ ≫
MFSD11 ↻ ≫
YWHAG ↻ ≫
H4C2 ↻ ≫
GMPPB ↻ ≫
FTL ↻ ≫
RBAK-RBAKDN ↻ ≫
RBAK ↻ ≫
PPP1R12C ↻ ≫
S100A2 ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
PUSL1 ↻ ≫
ACAP3 ↻ ≫
CSRNP2 ↻ ≫
TRA2B ↻ ≫
KMT2E ↻ ≫
DARS1 ↻ ≫
TMEM11 ↻ ≫
ID2 ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
C22orf39 ↻ ≫
RANGAP1 ↻ ≫
NDUFA11 ↻ ≫
VMAC ↻ ≫
SEPHS2 ↻ ≫
RNF19A ↻ ≫
CYTH2 ↻ ≫
NOB1 ↻ ≫
SCAMP3 ↻ ≫
H4C4 ↻ ≫
ZBTB11 ↻ ≫
UNC13D ↻ ≫
WDR1 ↻ ≫
STAU1 ↻ ≫
CLU ↻ ≫
SRSF6 ↻ ≫
ING1 ↻ ≫
PNPLA2 ↻ ≫
CCDC90B ↻ ≫
TAF9B ↻ ≫
TRIM25 ↻ ≫
LRCH3 ↻ ≫
LONP2 ↻ ≫
ABCC11 ↻ ≫
NEURL4 ↻ ≫
UBE2O ↻ ≫
AANAT ↻ ≫
TNFRSF10D ↻ ≫
INPP5E ↻ ≫
HSPA9 ↻ ≫
SLC38A2 ↻ ≫
DDX19B ↻ ≫
AARS1 ↻ ≫
SOCS1 ↻ ≫
SRSF3 ↻ ≫
ISY1-RAB43 ↻ ≫
ISY1 ↻ ≫
PHLDA2 ↻ ≫
L3MBTL2 ↻ ≫
SNX16 ↻ ≫
DYNLRB1 ↻ ≫
HMGA1 ↻ ≫
SLC7A1 ↻ ≫
SLC30A9 ↻ ≫
ACTG1 ↻ ≫
TTLL3 ↻ ≫
C12orf66 ↻ ≫
PRMT3 ↻ ≫
TPD52L2 ↻ ≫
JOSD2 ↻ ≫
PTDSS2 ↻ ≫
SOX6 ↻ ≫
C11orf58 ↻ ≫
MATR3 ↻ ≫
SCO2 ↻ ≫
SLC31A1 ↻ ≫
FKBP15 ↻ ≫
ODC1 ↻ ≫
ACYP2 ↻ ≫
COTL1 ↻ ≫
SCAF1 ↻ ≫
PA2G4 ↻ ≫
RRAS ↻ ≫
RPGRIP1L ↻ ≫
FTO ↻ ≫
MBP ↻ ≫
ALOXE3 ↻ ≫
SLC35E2B ↻ ≫
LRRC47 ↻ ≫
EDC4 ↻ ≫
NANS ↻ ≫
SNRPE ↻ ≫
RNF166 ↻ ≫
CTU2 ↻ ≫
BTF3 ↻ ≫
C4orf3 ↻ ≫
H4C5 ↻ ≫
PMAIP1 ↻ ≫
CLN8 ↻ ≫
SELENOI ↻ ≫
ADGRF3 ↻ ≫
TRIB1 ↻ ≫
CCDC117 ↻ ≫
ZNF460 ↻ ≫
MTCH1 ↻ ≫
HP1BP3 ↻ ≫
TOB1 ↻ ≫
MAPKBP1 ↻ ≫
VCPIP1 ↻ ≫
C8orf44-SGK3 ↻ ≫
STRAP ↻ ≫
RHBDD2 ↻ ≫
SETD6 ↻ ≫
ZNF251 ↻ ≫
NOLC1 ↻ ≫
TMEM101 ↻ ≫
CRLS1 ↻ ≫
ASB6 ↻ ≫
SYCE2 ↻ ≫
RNF220 ↻ ≫
AURKAIP1 ↻ ≫
ATF3 ↻ ≫
USF3 ↻ ≫
JUN ↻ ≫
C7orf50 ↻ ≫
RHOB ↻ ≫
USP45 ↻ ≫
USP47 ↻ ≫
ATP5F1B ↻ ≫
EIF3A ↻ ≫
RBKS ↻ ≫
BABAM2 ↻ ≫
APTX ↻ ≫
PRKAA1 ↻ ≫
NDEL1 ↻ ≫
TUBB6 ↻ ≫
CHRNA5 ↻ ≫
CCDC97 ↻ ≫
CREBZF ↻ ≫
TLL2 ↻ ≫
TFAP4 ↻ ≫
SMURF2 ↻ ≫
HDHD5 ↻ ≫
DDX59 ↻ ≫
SREBF1 ↻ ≫
ERCC1 ↻ ≫
DNM2 ↻ ≫
EIF4A1 ↻ ≫
DHPS ↻ ≫
JMJD8 ↻ ≫
SLC9A1 ↻ ≫
CDKN1A ↻ ≫
ISCA1 ↻ ≫
LRWD1 ↻ ≫
ALKBH4 ↻ ≫
PRCC ↻ ≫
VCP ↻ ≫
CLASRP ↻ ≫
MCRIP1 ↻ ≫
ASXL1 ↻ ≫
GPT2 ↻ ≫
PPP1R27 ↻ ≫
DDX23 ↻ ≫
ZDHHC7 ↻ ≫
SLC3A2 ↻ ≫
DUS3L ↻ ≫
ERRFI1 ↻ ≫
BCL2L12 ↻ ≫
IRF3 ↻ ≫
ARL14 ↻ ≫
MAF1 ↻ ≫
TXNDC17 ↻ ≫
KIAA0753 ↻ ≫
ABCA7 ↻ ≫
FOSL1 ↻ ≫
MALL ↻ ≫
ZNHIT2 ↻ ≫
ZNF24 ↻ ≫
CFAP92 ↻ ≫
NPM3 ↻ ≫
LZTR1 ↻ ≫
ZCCHC8 ↻ ≫
JMJD1C ↻ ≫
GFUS ↻ ≫
REEP3 ↻ ≫
UPF3A ↻ ≫
TRIP11 ↻ ≫
PTS ↻ ≫
CYP4F11 ↻ ≫
TOMM22 ↻ ≫
THTPA ↻ ≫
CTU1 ↻ ≫
CKB ↻ ≫
RSRC1 ↻ ≫
BMERB1 ↻ ≫
PPIA ↻ ≫
TPM4 ↻ ≫
JUNB ↻ ≫
FIS1 ↻ ≫
EIF5 ↻ ≫
ZNF546 ↻ ≫
CAVIN1 ↻ ≫
MMP25 ↻ ≫
POLD1 ↻ ≫
IFRD1 ↻ ≫
TRABD ↻ ≫
CAPN2 ↻ ≫
TUBB3 ↻ ≫
HTRA2 ↻ ≫
FUS ↻ ≫
MAML1 ↻ ≫
RPP38 ↻ ≫
NEK11 ↻ ≫
ASTE1 ↻ ≫
HNRNPU ↻ ≫
NAT10 ↻ ≫
NT5C ↻ ≫
CDKN2AIPNL ↻ ≫
ZC3H12A ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
ZNF143 ↻ ≫
ELOA ↻ ≫
VPS36 ↻ ≫
SCFD1 ↻ ≫
POP5 ↻ ≫
UBR2 ↻ ≫
SPAG9 ↻ ≫
C2orf88 ↻ ≫
HSPA4L ↻ ≫
GTF2IRD2 ↻ ≫
HMGN2 ↻ ≫
POR ↻ ≫
ATP6V0B ↻ ≫
FAM131A ↻ ≫
TSSC4 ↻ ≫
MKNK2 ↻ ≫
CEBPB ↻ ≫
VIPAS39 ↻ ≫
AHSA1 ↻ ≫
NOP53 ↻ ≫
CKS1B ↻ ≫
SHC1 ↻ ≫
GABARAP ↻ ≫
GET4 ↻ ≫
RSAD1 ↻ ≫
KITLG ↻ ≫
SESN2 ↻ ≫
WDR38 ↻ ≫
CCDC88A ↻ ≫
NSFL1C ↻ ≫
SF3B2 ↻ ≫
LENG9 ↻ ≫
COA3 ↻ ≫
CNTD1 ↻ ≫
EREG ↻ ≫
CNN3 ↻ ≫
CALM2 ↻ ≫
GADD45A ↻ ≫
ANXA2 ↻ ≫
INVS ↻ ≫
ERP44 ↻ ≫
KDM3B ↻ ≫
TCF25 ↻ ≫
ANXA7 ↻ ≫
TNIP2 ↻ ≫
CENPN ↻ ≫
FAM189B ↻ ≫
DNAJB4 ↻ ≫
KANSL1L ↻ ≫
CZIB ↻ ≫
PITPNB ↻ ≫
SELENOH ↻ ≫
THOC6 ↻ ≫
HCFC1R1 ↻ ≫
HEXIM1 ↻ ≫
SLC12A6 ↻ ≫
GBA ↻ ≫
HNRNPAB ↻ ≫
SQSTM1 ↻ ≫
PPP5D1 ↻ ≫
CALM3 ↻ ≫
ABRAXAS1 ↻ ≫
FKBP4 ↻ ≫
CIRBP ↻ ≫
DIDO1 ↻ ≫
HNRNPF ↻ ≫
BTG1 ↻ ≫
MBNL2 ↻ ≫
TMTC3 ↻ ≫
CEP290 ↻ ≫
ATAD3A ↻ ≫
DYRK1A ↻ ≫
ATP5MPL ↻ ≫
PTP4A1 ↻ ≫
CCNL2 ↻ ≫
TCTN1 ↻ ≫
KIAA0895 ↻ ≫
ANLN ↻ ≫
COG7 ↻ ≫
ALDH2 ↻ ≫
HSP90AB1 ↻ ≫
SLC35A2 ↻ ≫
WDPCP ↻ ≫
MDH1 ↻ ≫
FBXL19 ↻ ≫
ECI1 ↻ ≫
C7orf26 ↻ ≫
GANAB ↻ ≫
TMEM120A ↻ ≫
ZC3H4 ↻ ≫
PRNP ↻ ≫
THYN1 ↻ ≫
ACAD8 ↻ ≫
EDEM1 ↻ ≫
MTF2 ↻ ≫
INTS2 ↻ ≫
EIF4G2 ↻ ≫
FAM200A ↻ ≫
DUSP5 ↻ ≫
RASL11A ↻ ≫
HSPA1B ↻ ≫
SLC1A5 ↻ ≫
SDCBP2 ↻ ≫
CENPBD1 ↻ ≫
IMPDH2 ↻ ≫
HSPA8 ↻ ≫
PCBP1 ↻ ≫
MAPK1IP1L ↻ ≫
TSPAN10 ↻ ≫
NPLOC4 ↻ ≫
PYGO2 ↻ ≫
LOC101928120 ↻ ≫
RBM3 ↻ ≫
ZCCHC3 ↻ ≫
HECTD1 ↻ ≫
PET117 ↻ ≫
KAT14 ↻ ≫
C17orf58 ↻ ≫
SDF4 ↻ ≫
B3GALT6 ↻ ≫
VDAC1 ↻ ≫
NAXE ↻ ≫
TOMM40 ↻ ≫
ZNF507 ↻ ≫
METTL21A ↻ ≫
PDCD2 ↻ ≫
ISL2 ↻ ≫
RBM4 ↻ ≫
HNRNPA3 ↻ ≫
MYL12B ↻ ≫
MDM2 ↻ ≫
STIP1 ↻ ≫
BAG3 ↻ ≫
PKP3 ↻ ≫
TBC1D22A ↻ ≫
NOCT ↻ ≫
B3GLCT ↻ ≫
ZC3H6 ↻ ≫
EEF1AKMT1 ↻ ≫
RPL41 ↻ ≫
LEMD2 ↻ ≫
RANBP2 ↻ ≫
ARHGAP29 ↻ ≫
SERPINH1 ↻ ≫
DHX30 ↻ ≫
UQCRQ ↻ ≫
GDF9 ↻ ≫
SYNRG ↻ ≫
VWA7 ↻ ≫
UFL1 ↻ ≫
H2BC21 ↻ ≫
H2AC20 ↻ ≫
H2AC21 ↻ ≫
XBP1 ↻ ≫
DCBLD2 ↻ ≫
ANXA1 ↻ ≫
MSX1 ↻ ≫
C6orf226 ↻ ≫
MYG1 ↻ ≫
SENP6 ↻ ≫
MAPT ↻ ≫
NAA25 ↻ ≫
APP ↻ ≫
HEXIM2 ↻ ≫
PTBP1 ↻ ≫
SLC35B2 ↻ ≫
HNRNPM ↻ ≫
UFSP1 ↻ ≫
DERL1 ↻ ≫
RNASEH2C ↻ ≫
ENDOV ↻ ≫
NUDT3 ↻ ≫
REPIN1 ↻ ≫
CLK3 ↻ ≫
PNKD ↻ ≫
AAMP ↻ ≫
PPP1R10 ↻ ≫
MRPS18B ↻ ≫
CRTC2 ↻ ≫
NXF1 ↻ ≫
KATNBL1 ↻ ≫
HGS ↻ ≫
ARL16 ↻ ≫
ACY1 ↻ ≫
RPL12 ↻ ≫
LRSAM1 ↻ ≫
SLTM ↻ ≫
SUN1 ↻ ≫
RRP8 ↻ ≫
ILK ↻ ≫
GAPVD1 ↻ ≫
SP1 ↻ ≫
EIF2S2 ↻ ≫
DNAJC21 ↻ ≫
ATMIN ↻ ≫
IER3IP1 ↻ ≫
RAD23A ↻ ≫
IFTAP ↻ ≫
CCT8 ↻ ≫
PRKD2 ↻ ≫
ANXA5 ↻ ≫
FBXW9 ↻ ≫
SLC24A1 ↻ ≫
RPL6 ↻ ≫
MOB4 ↻ ≫
BNIP1 ↻ ≫
CDC6 ↻ ≫
PTPN11 ↻ ≫
PTGES3 ↻ ≫
ZNF789 ↻ ≫
MFGE8 ↻ ≫
C8orf37 ↻ ≫
GPN3 ↻ ≫
FAM216A ↻ ≫
HNRNPR ↻ ≫
USP8 ↻ ≫
CLCF1 ↻ ≫
RNF227 ↻ ≫
SAT1 ↻ ≫
PYCR1 ↻ ≫
CAAP1 ↻ ≫
SULT6B1 ↻ ≫
RNFT1 ↻ ≫
TMBIM4 ↻ ≫
CKS2 ↻ ≫
PEX19 ↻ ≫
DGCR8 ↻ ≫
ZNF766 ↻ ≫
AMOTL2 ↻ ≫
ZFP36 ↻ ≫
ABCB8 ↻ ≫
ZNF37A ↻ ≫
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