ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for ARID1A

Query protein: ARID1A
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX10445306 | Neural crest cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
ARID1A's Target genes

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◢ SRX3241380: RMG-I

◢ SRX4704621: RMG-I

◢ ARID1A: STRING
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LOC102724770 ↻ ≫
DGCR6 ↻ ≫
SRCAP ↻ ≫
LOC730183 ↻ ≫
ART1 ↻ ≫
HEXIM2 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
GTF2IRD2B ↻ ≫
H3C6 ↻ ≫
H2BC8 ↻ ≫
H2AC8 ↻ ≫
MRPS18B ↻ ≫
PRRC2A ↻ ≫
AIF1 ↻ ≫
YWHAE ↻ ≫
KMT2E ↻ ≫
HNRNPUL1 ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
NFYC ↻ ≫
LRRC37A3 ↻ ≫
NCOA5 ↻ ≫
EPC1 ↻ ≫
TRMT12 ↻ ≫
DRAP1 ↻ ≫
C11orf68 ↻ ≫
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DYNC2I2 ↻ ≫
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NDUFB5 ↻ ≫
MRPL47 ↻ ≫
TSTD1 ↻ ≫
USF1 ↻ ≫
PRCC ↻ ≫
CNOT3 ↻ ≫
TRA2B ↻ ≫
CYB561D1 ↻ ≫
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NACA ↻ ≫
USE1 ↻ ≫
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ATP6V1G2 ↻ ≫
SRSF3 ↻ ≫
RNF220 ↻ ≫
RPS14 ↻ ≫
KCNN2 ↻ ≫
PPP4R3B ↻ ≫
SPRYD4 ↻ ≫
DEDD ↻ ≫
KNTC1 ↻ ≫
ZFR2 ↻ ≫
PRSS33 ↻ ≫
ELOB ↻ ≫
RPS3 ↻ ≫
SUGT1 ↻ ≫
NAV2 ↻ ≫
MTF2 ↻ ≫
SERBP1 ↻ ≫
INTS7 ↻ ≫
DTL ↻ ≫
C1orf174 ↻ ≫
ZBTB8OS ↻ ≫
RBBP4 ↻ ≫
ADNP ↻ ≫
TMEM138 ↻ ≫
CYB561A3 ↻ ≫
BRWD1 ↻ ≫
WDR82 ↻ ≫
GLYCTK ↻ ≫
NASP ↻ ≫
CCDC59 ↻ ≫
RPL11 ↻ ≫
ZNF101 ↻ ≫
ATP13A1 ↻ ≫
ZNF484 ↻ ≫
ZBTB11 ↻ ≫
RPL24 ↻ ≫
LOC100996842 ↻ ≫
MPDU1 ↻ ≫
CD68 ↻ ≫
SOX15 ↻ ≫
GTPBP8 ↻ ≫
TASOR ↻ ≫
CROCC ↻ ≫
LRP6 ↻ ≫
MRPL3 ↻ ≫
DYNC1LI2 ↻ ≫
HNRNPA3 ↻ ≫
PRORP ↻ ≫
PPP2R3C ↻ ≫
ERCC6L2 ↻ ≫
RPS15A ↻ ≫
GTF2H2C ↻ ≫
GTF2H2 ↻ ≫
CHGB ↻ ≫
TNRC6B ↻ ≫
SEPTIN7 ↻ ≫
MRPL1 ↻ ≫
ATAD2B ↻ ≫
RPL5 ↻ ≫
ZNF614 ↻ ≫
XRCC5 ↻ ≫
MAGOHB ↻ ≫
RHBDD3 ↻ ≫
EWSR1 ↻ ≫
EPC2 ↻ ≫
IMP4 ↻ ≫
CCDC115 ↻ ≫
MCM5 ↻ ≫
MORF4L1 ↻ ≫
DDX17 ↻ ≫
AP1G1 ↻ ≫
RPL35A ↻ ≫
IQCG ↻ ≫
SF3B3 ↻ ≫
COG4 ↻ ≫
LMLN ↻ ≫
CDK5RAP2 ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
EXD2 ↻ ≫
CCNI ↻ ≫
PCBP1 ↻ ≫
MRPL44 ↻ ≫
ZNF793 ↻ ≫
HACD2 ↻ ≫
RAB7A ↻ ≫
UBAP1 ↻ ≫
ZCCHC4 ↻ ≫
KDM3A ↻ ≫
PAFAH2 ↻ ≫
PNISR ↻ ≫
SEC24C ↻ ≫
CCNT2 ↻ ≫
UBAP2L ↻ ≫
C1orf43 ↻ ≫
ANKRD13C ↻ ≫
CRADD ↻ ≫
HNRNPD ↻ ≫
ZNF865 ↻ ≫
ZNF524 ↻ ≫
FIZ1 ↻ ≫
RIF1 ↻ ≫
CACYBP ↻ ≫
TRIP11 ↻ ≫
PSMC5 ↻ ≫
FTSJ3 ↻ ≫
CHD2 ↻ ≫
PRKCSH ↻ ≫
CCDC151 ↻ ≫
SPTLC1 ↻ ≫
PPP2R3B ↻ ≫
NSFL1C ↻ ≫
GTF3C5 ↻ ≫
MAT2A ↻ ≫
MTREX ↻ ≫
DHX29 ↻ ≫
PWP1 ↻ ≫
FOSL1 ↻ ≫
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BAZ2B ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
KBTBD4 ↻ ≫
FAM180B ↻ ≫
SLC39A9 ↻ ≫
ERH ↻ ≫
SART3 ↻ ≫
ISCU ↻ ≫
NUDCD3 ↻ ≫
CCAR2 ↻ ≫
C8orf58 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
STX5 ↻ ≫
RAVER1 ↻ ≫
PLK4 ↻ ≫
ICAM3 ↻ ≫
POLR2M ↻ ≫
TBC1D17 ↻ ≫
AKT1S1 ↻ ≫
PNKP ↻ ≫
PCDHGA1 ↻ ≫
TAF7 ↻ ≫
LATS1 ↻ ≫
MFN2 ↻ ≫
PIP4K2B ↻ ≫
RNF10 ↻ ≫
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CCDC157 ↻ ≫
ILF3 ↻ ≫
PPIL4 ↻ ≫
MTRNR2L8 ↻ ≫
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SCFD1 ↻ ≫
URM1 ↻ ≫
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POLR2A ↻ ≫
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BCLAF1 ↻ ≫
NUP35 ↻ ≫
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ATG4B ↻ ≫
EAPP ↻ ≫
COIL ↻ ≫
DMTF1 ↻ ≫
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ALG8 ↻ ≫
TBL1X ↻ ≫
LUC7L3 ↻ ≫
CTH ↻ ≫
BORCS7 ↻ ≫
KIF15 ↻ ≫
KIAA1143 ↻ ≫
SNX5 ↻ ≫
MGME1 ↻ ≫
EFCAB2 ↻ ≫
OTUB1 ↻ ≫
RAB30 ↻ ≫
ZNF335 ↻ ≫
MRPL21 ↻ ≫
IGHMBP2 ↻ ≫
RNPS1 ↻ ≫
PPP4R3A ↻ ≫
NR2C2 ↻ ≫
IMPACT ↻ ≫
MRPL42 ↻ ≫
ZFC3H1 ↻ ≫
THAP2 ↻ ≫
RNF139 ↻ ≫
GTF3C6 ↻ ≫
NDUFS2 ↻ ≫
ADAMTS4 ↻ ≫
ATG16L2 ↻ ≫
KANSL1 ↻ ≫
SCAF8 ↻ ≫
WDR33 ↻ ≫
ZNF41 ↻ ≫
TTC21B ↻ ≫
ZC3H10 ↻ ≫
RPL41 ↻ ≫
MRPS15 ↻ ≫
PBLD ↻ ≫
HNRNPH3 ↻ ≫
KPNA5 ↻ ≫
PPWD1 ↻ ≫
CENPK ↻ ≫
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ATE1 ↻ ≫
DGCR2 ↻ ≫
TSSK2 ↻ ≫
GSK3B ↻ ≫
ARID2 ↻ ≫
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PHC3 ↻ ≫
ZNF292 ↻ ≫
BPTF ↻ ≫
TMEM187 ↻ ≫
HCFC1 ↻ ≫
ZNF43 ↻ ≫
CLTC ↻ ≫
FAM174C ↻ ≫
CIRBP ↻ ≫
ZCCHC3 ↻ ≫
C20orf96 ↻ ≫
VPS35L ↻ ≫
ZNF207 ↻ ≫
C17orf75 ↻ ≫
DCP1A ↻ ≫
SLX4IP ↻ ≫
MKKS ↻ ≫
RBM5 ↻ ≫
SNRPE ↻ ≫
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PPP2R5C ↻ ≫
HSPA8 ↻ ≫
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FBXO41 ↻ ≫
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ATL2 ↻ ≫
ZNF518A ↻ ≫
CDC14A ↻ ≫
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SSB ↻ ≫
RRN3 ↻ ≫
GMCL2 ↻ ≫
ZFY ↻ ≫
TOR1AIP2 ↻ ≫
ZC3H4 ↻ ≫
TOR1AIP1 ↻ ≫
CLK1 ↻ ≫
PTBP1 ↻ ≫
RAB21 ↻ ≫
RAB13 ↻ ≫
RPS27 ↻ ≫
TOMM22 ↻ ≫
ARHGEF38 ↻ ≫
TPRA1 ↻ ≫
RANBP6 ↻ ≫
PSMC3 ↻ ≫
MCM2 ↻ ≫
KIAA2026 ↻ ≫
CCDC90B ↻ ≫
RPUSD4 ↻ ≫
FAM118B ↻ ≫
BRIX1 ↻ ≫
ATP5F1A ↻ ≫
SPHK2 ↻ ≫
CNTRL ↻ ≫
RPL18 ↻ ≫
FAM83E ↻ ≫
C5 ↻ ≫
PCYOX1 ↻ ≫
TIA1 ↻ ≫
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POLDIP3 ↻ ≫
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TAF12 ↻ ≫
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TNKS2 ↻ ≫
CNIH1 ↻ ≫
PTMA ↻ ≫
EIF4G3 ↻ ≫
TMEM101 ↻ ≫
CNOT4 ↻ ≫
BUB1B ↻ ≫
RPGRIP1 ↻ ≫
TMEM79 ↻ ≫
SMG5 ↻ ≫
COX20 ↻ ≫
AKAP9 ↻ ≫
TCP11L1 ↻ ≫
HMGA1 ↻ ≫
MAN2C1 ↻ ≫
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KCNN1 ↻ ≫
TEAD1 ↻ ≫
GABPB1 ↻ ≫
ATG14 ↻ ≫
RRP1 ↻ ≫
CBX5 ↻ ≫
ENOSF1 ↻ ≫
PHAX ↻ ≫
ALDH7A1 ↻ ≫
SF3B1 ↻ ≫
NUP188 ↻ ≫
DOLK ↻ ≫
RPTOR ↻ ≫
MEST ↻ ≫
RAD23A ↻ ≫
CALR ↻ ≫
PSMA1 ↻ ≫
NAPEPLD ↻ ≫
STAG1 ↻ ≫
SSU72 ↻ ≫
RAF1 ↻ ≫
SRSF10 ↻ ≫
INTS9 ↻ ≫
HMBOX1 ↻ ≫
DUSP12 ↻ ≫
FANCD2 ↻ ≫
RCE1 ↻ ≫
STOML2 ↻ ≫
PIGO ↻ ≫
HNRNPA2B1 ↻ ≫
CBX3 ↻ ≫
RPS8 ↻ ≫
COQ9 ↻ ≫
CIAPIN1 ↻ ≫
CD99L2 ↻ ≫
PRR5L ↻ ≫
COMMD9 ↻ ≫
CCND3 ↻ ≫
TAF8 ↻ ≫
ZNF274 ↻ ≫
RACK1 ↻ ≫
NCBP3 ↻ ≫
RCOR3 ↻ ≫
ACYP2 ↻ ≫
MRPS16 ↻ ≫
PCIF1 ↻ ≫
MEMO1 ↻ ≫
PDF ↻ ≫
MTHFD2 ↻ ≫
NIP7 ↻ ≫
COG8 ↻ ≫
LEO1 ↻ ≫
RBM22 ↻ ≫
DNAJC9 ↻ ≫
RBM4 ↻ ≫
AMOTL2 ↻ ≫
CSNK1A1 ↻ ≫
MRPL48 ↻ ≫
TRPC4AP ↻ ≫
ZXDC ↻ ≫
TRIM59 ↻ ≫
UTP20 ↻ ≫
LEKR1 ↻ ≫
MDM4 ↻ ≫
UBE2T ↻ ≫
NKIRAS2 ↻ ≫
DNAJC7 ↻ ≫
PPP1R12B ↻ ≫
NEMF ↻ ≫
DCAF10 ↻ ≫
ZNF154 ↻ ≫
UBE2L3 ↻ ≫
PLK3 ↻ ≫
TCTEX1D4 ↻ ≫
BTBD19 ↻ ≫
RC3H1 ↻ ≫
CCDC86 ↻ ≫
SSBP1 ↻ ≫
ZBTB47 ↻ ≫
EPHX3 ↻ ≫
DPPA4 ↻ ≫
SRSF5 ↻ ≫
NSRP1 ↻ ≫
FOSB ↻ ≫
RAD21 ↻ ≫
MRPS18C ↻ ≫
HELQ ↻ ≫
GINS1 ↻ ≫
WTIP ↻ ≫
STAT1 ↻ ≫
RPL13 ↻ ≫
RTTN ↻ ≫
ITFG2 ↻ ≫
FOCAD ↻ ≫
CSTF3 ↻ ≫
SFPQ ↻ ≫
KCTD5 ↻ ≫
L3MBTL2 ↻ ≫
DOT1L ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
ENPP3 ↻ ≫
SDHAF2 ↻ ≫
CPSF7 ↻ ≫
KMT2A ↻ ≫
GFI1B ↻ ≫
MAPK6 ↻ ≫
TSC1 ↻ ≫
BAZ2A ↻ ≫
NAA60 ↻ ≫
GCFC2 ↻ ≫
CWC22 ↻ ≫
CSDE1 ↻ ≫
RPS16 ↻ ≫
TMEM242 ↻ ≫
EIF4G2 ↻ ≫
ZWILCH ↻ ≫
SNAPC5 ↻ ≫
RPL4 ↻ ≫
PCM1 ↻ ≫
SUPT5H ↻ ≫
CEP68 ↻ ≫
MEN1 ↻ ≫
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CEMIP2 ↻ ≫
MICU2 ↻ ≫
PPP1CC ↻ ≫
NLRX1 ↻ ≫
GART ↻ ≫
SKAP2 ↻ ≫
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GNG3 ↻ ≫
BSCL2 ↻ ≫
ST3GAL3 ↻ ≫
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NME1 ↻ ≫
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CSNK2A1 ↻ ≫
NECAP2 ↻ ≫
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CNTLN ↻ ≫
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PAM ↻ ≫
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CLPB ↻ ≫
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COX6A1 ↻ ≫
TRIAP1 ↻ ≫
SH2B1 ↻ ≫
CTNND1 ↻ ≫
BTBD18 ↻ ≫
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CHD9 ↻ ≫
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MAPK1IP1L ↻ ≫
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SVBP ↻ ≫
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PHB2 ↻ ≫
MFF ↻ ≫
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MRPL45 ↻ ≫
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ING3 ↻ ≫
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KMT2D ↻ ≫
PSMD5 ↻ ≫
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SNRPG ↻ ≫
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H4C14 ↻ ≫
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FBXO45 ↻ ≫
C12orf73 ↻ ≫
KRBA2 ↻ ≫
CEP350 ↻ ≫
SFSWAP ↻ ≫
KANSL2 ↻ ≫
NUP160 ↻ ≫
FBXO22 ↻ ≫
WARS2 ↻ ≫
NELFA ↻ ≫
NPIPA3 ↻ ≫
NPIPA2 ↻ ≫
SFT2D3 ↻ ≫
TOPORS ↻ ≫
SMIM27 ↻ ≫
C3orf33 ↻ ≫
GSTA4 ↻ ≫
CASP2 ↻ ≫
TMEM139 ↻ ≫
TSSK6 ↻ ≫
NDUFA13 ↻ ≫
TMEM183A ↻ ≫
PPP1R12A ↻ ≫
MCEE ↻ ≫
TP53BP2 ↻ ≫
MPHOSPH10 ↻ ≫
LPCAT4 ↻ ≫
RBM15B ↻ ≫
MANF ↻ ≫
CCNG2 ↻ ≫
EEF2 ↻ ≫
TTC17 ↻ ≫
TM9SF4 ↻ ≫
KDM5C ↻ ≫
PGGT1B ↻ ≫
C17orf50 ↻ ≫
CHD1L ↻ ≫
PRKAB2 ↻ ≫
SRSF1 ↻ ≫
EBPL ↻ ≫
TMEM217 ↻ ≫
TBC1D22B ↻ ≫
PEX14 ↻ ≫
SUMO2 ↻ ≫
POLE4 ↻ ≫
SOX6 ↻ ≫
SMDT1 ↻ ≫
PHETA2 ↻ ≫
NAGA ↻ ≫
C11orf58 ↻ ≫
DFFA ↻ ≫
KNL1 ↻ ≫
ZNF354C ↻ ≫
SULT4A1 ↻ ≫
SMARCD2 ↻ ≫
LMNB2 ↻ ≫
PRRT2 ↻ ≫
MAZ ↻ ≫
EPB41L5 ↻ ≫
YWHAQ ↻ ≫
TP53RK ↻ ≫
SLC13A3 ↻ ≫
YARS1 ↻ ≫
S100PBP ↻ ≫
SMN2 ↻ ≫
SMN1 ↻ ≫
YJU2 ↻ ≫
MMADHC ↻ ≫
POMK ↻ ≫
ATOH7 ↻ ≫
PDZD2 ↻ ≫
UCKL1 ↻ ≫
GABPB2 ↻ ≫
PPP3CB ↻ ≫
TRA2A ↻ ≫
CPNE1 ↻ ≫
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RBM12 ↻ ≫
REXO1 ↻ ≫
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IRS1 ↻ ≫
STRIP1 ↻ ≫
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KIFBP ↻ ≫
TAB1 ↻ ≫
JUNB ↻ ≫
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RBM3 ↻ ≫
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PHIP ↻ ≫
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LYRM4 ↻ ≫
FARS2 ↻ ≫
UBTF ↻ ≫
GGCX ↻ ≫
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SLBP ↻ ≫
TMEM129 ↻ ≫
TACC3 ↻ ≫
CAMTA1 ↻ ≫
NR1H3 ↻ ≫
ACP2 ↻ ≫
FAM228B ↻ ≫
RBM33 ↻ ≫
RNF114 ↻ ≫
TP53I3 ↻ ≫
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CENPL ↻ ≫
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ZZEF1 ↻ ≫
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RMI1 ↻ ≫
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TMEM222 ↻ ≫
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INTS14 ↻ ≫
TCERG1 ↻ ≫
SNRPB2 ↻ ≫
FAM98B ↻ ≫
HPD ↻ ≫
PSMD9 ↻ ≫
PCNP ↻ ≫
ZC3HC1 ↻ ≫
DDX49 ↻ ≫
COPE ↻ ≫
FIGN ↻ ≫
TATDN3 ↻ ≫
NSL1 ↻ ≫
NAT2 ↻ ≫
UBE2J2 ↻ ≫
NUDT9 ↻ ≫
ANAPC10 ↻ ≫
ABCE1 ↻ ≫
ZNF846 ↻ ≫
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MRPL50 ↻ ≫
RLIM ↻ ≫
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CAMLG ↻ ≫
CHERP ↻ ≫
CLVS1 ↻ ≫
ZNF732 ↻ ≫
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FRS3 ↻ ≫
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GBA ↻ ≫
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ETFA ↻ ≫
SKA2 ↻ ≫
PRR11 ↻ ≫
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CYREN ↻ ≫
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HNRNPH1 ↻ ≫
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MRPL27 ↻ ≫
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TRMO ↻ ≫
ZNF574 ↻ ≫
TEFM ↻ ≫
GRIK5 ↻ ≫
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DLG2 ↻ ≫
SYTL3 ↻ ≫
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RANBP3 ↻ ≫
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NRF1 ↻ ≫
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NAA15 ↻ ≫
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RING1 ↻ ≫
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RXRB ↻ ≫
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CCIN ↻ ≫
ZEB2 ↻ ≫
UMPS ↻ ≫
COL11A2 ↻ ≫
TAF9B ↻ ≫
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BICD2 ↻ ≫
STX10 ↻ ≫
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THAP1 ↻ ≫
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GOLPH3 ↻ ≫
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WDR43 ↻ ≫
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