ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc1a

Query protein: Smc1a
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX17241113 | MEF
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc1a's Target genes

◢ Smc1a: Average

◢ SRX2599821: 3T3-L1

◢ SRX2599822: 3T3-L1

◢ SRX2599823: 3T3-L1

◢ SRX2599824: 3T3-L1

◢ SRX2599825: 3T3-L1

◢ SRX2599826: 3T3-L1

◢ SRX2599827: 3T3-L1

◢ SRX2599828: 3T3-L1

◢ SRX2599829: 3T3-L1

◢ SRX2599830: 3T3-L1

◢ SRX2957352: AtT-20

◢ SRX218284: B cells

◢ SRX218288: B cells

◢ SRX700951: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX700952: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348143: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348144: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348145: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348146: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX6988645: Cerebellum

◢ SRX6988646: Cerebellum

◢ SRX6988647: Cerebellum

◢ SRX6988648: Cerebellum

◢ SRX20793618: Cortical neuron

◢ SRX20793619: Cortical neuron

◢ SRX20793622: Cortical neuron

◢ SRX20793623: Cortical neuron

◢ SRX12601724: Dendritic Cells

◢ SRX12601725: Dendritic Cells

◢ SRX12601726: Dendritic Cells

◢ SRX12601727: Dendritic Cells

◢ SRX204343: Embryonic brains

◢ SRX4395347: Embryonic brains

◢ SRX4395356: Embryonic brains

◢ DRX021197: Embryonic head

◢ DRX021198: Embryonic limb

◢ SRX204337: Embryonic limb

◢ SRX204338: Embryonic limb

◢ SRX2440040: EpiSC

◢ SRX2440041: EpiSC

◢ SRX2440050: EpiSC

◢ SRX2440051: EpiSC

◢ SRX2440060: EpiSC

◢ SRX2440061: EpiSC

◢ SRX022688: ES cells

◢ SRX022689: ES cells

◢ SRX085109: ES cells

◢ SRX085110: ES cells

◢ SRX10560008: ES cells

◢ SRX10560009: ES cells

◢ SRX10560010: ES cells

◢ SRX10560011: ES cells

◢ SRX11237495: ES cells

◢ SRX11237501: ES cells

◢ SRX11237507: ES cells

◢ SRX11237513: ES cells

◢ SRX11237519: ES cells

◢ SRX11237525: ES cells

◢ SRX11237531: ES cells

◢ SRX11237537: ES cells

◢ SRX12204127: ES cells

◢ SRX12204128: ES cells

◢ SRX12204129: ES cells

◢ SRX12204130: ES cells

◢ SRX12204137: ES cells

◢ SRX12204138: ES cells

◢ SRX12204139: ES cells

◢ SRX12204140: ES cells

◢ SRX12204141: ES cells

◢ SRX12204142: ES cells

◢ SRX12204149: ES cells

◢ SRX12204150: ES cells

◢ SRX12204151: ES cells

◢ SRX12204152: ES cells

◢ SRX12204153: ES cells

◢ SRX12204154: ES cells

◢ SRX12963303: ES cells

◢ SRX13439102: ES cells

◢ SRX13439103: ES cells

◢ SRX13439104: ES cells

◢ SRX13439130: ES cells

◢ SRX17024519: ES cells

◢ SRX17024520: ES cells

◢ SRX17024521: ES cells

◢ SRX17024522: ES cells

◢ SRX2440036: ES cells

◢ SRX2440037: ES cells

◢ SRX2440070: ES cells

◢ SRX2440071: ES cells

◢ SRX2440080: ES cells

◢ SRX2440081: ES cells

◢ SRX3197475: ES cells

◢ SRX3197480: ES cells

◢ SRX4167137: ES cells

◢ SRX5088234: ES cells

◢ SRX5088236: ES cells

◢ SRX5125620: ES cells

◢ SRX5125624: ES cells

◢ SRX5401524: ES cells

◢ SRX5401525: ES cells

◢ SRX5401526: ES cells

◢ SRX5401527: ES cells

◢ SRX5401528: ES cells

◢ SRX5401529: ES cells

◢ SRX5436004: ES cells

◢ SRX5858855: ES cells

◢ SRX5858856: ES cells

◢ SRX5858857: ES cells

◢ SRX5858858: ES cells

◢ SRX6831866: ES cells

◢ SRX6831867: ES cells

◢ SRX7786279: ES cells

◢ SRX7786280: ES cells

◢ SRX7786281: ES cells

◢ SRX7786282: ES cells

◢ SRX3024490: Forelimb

◢ SRX8820366: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820367: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903169: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903170: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903174: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903175: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX2436121: Mammary glands

◢ SRX2564298: Mammary glands

◢ SRX2564307: Mammary glands

◢ SRX2564312: Mammary glands

◢ SRX2564313: Mammary glands

◢ SRX022702: MEF

◢ SRX022703: MEF

◢ SRX120168: MEF

◢ SRX120169: MEF

◢ SRX120170: MEF

◢ SRX17241102: MEF

◢ SRX17241103: MEF

◢ SRX17241104: MEF

◢ SRX17241105: MEF

◢ SRX17241107: MEF

◢ SRX17241108: MEF

◢ SRX17241109: MEF

◢ SRX17241110: MEF

◣ SRX17241113: MEF

◢ SRX17241114: MEF

◢ SRX17241115: MEF

◢ SRX17241116: MEF

◢ SRX17241117: MEF

◢ SRX17241118: MEF

◢ SRX17241119: MEF

◢ SRX17241120: MEF

◢ SRX17241123: MEF

◢ SRX17241125: MEF

◢ SRX976733: MEF

◢ SRX976734: MEF

◢ SRX5358275: mESCs, differentiated

◢ SRX5358276: mESCs, differentiated

◢ SRX5358277: mESCs, differentiated

◢ SRX5358278: mESCs, differentiated

◢ SRX5358279: mESCs, differentiated

◢ SRX5358280: mESCs, differentiated

◢ SRX125273: mESC derived neural cells

◢ SRX8693946: Neutrophils

◢ SRX8693947: Neutrophils

◢ SRX8693948: Neutrophils

◢ SRX8693949: Neutrophils

◢ SRX8693950: Neutrophils

◢ SRX8693951: Neutrophils

◢ SRX8694033: Neutrophils

◢ SRX8694034: Neutrophils

◢ SRX8694041: Neutrophils

◢ SRX8694042: Neutrophils

◢ SRX11169408: NIH/3T3

◢ SRX11169409: NIH/3T3

◢ SRX26175725: NIH/3T3

◢ SRX26175728: NIH/3T3

◢ SRX20340931: Pre-B cells

◢ SRX20340932: Pre-B cells

◢ SRX20340933: Pre-B cells

◢ SRX20340934: Pre-B cells

◢ SRX11169415: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169416: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169417: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169418: Scid.adh.2c2

◢ SRX1631901: Sperm

◢ SRX2370885: Sperm

◢ SRX7348141: Thymocytes

◢ SRX7348142: Thymocytes

◢ SRX4546348: Trophoblast stem cells

◢ SRX4546349: Trophoblast stem cells

◢ SRX1306535: T cells

◢ SRX5318290: Uterus

◢ SRX5318291: Uterus

◢ SRX5318292: Uterus

◢ Smc1a: STRING
Asmt ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Col27a1 ↻ ≫
Ankrd44 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Apob ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Gnptab ↻ ≫
Zfp65 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Spry1 ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Ddx24 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Itga9 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Carmil1 ↻ ≫
Pcp4 ↻ ≫
F3 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Col6a2 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Ror2 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Rdh10 ↻ ≫
Hcn1 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Syt17 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Nppc ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Cpne8 ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Nck1 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Fhod3 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Cldn1 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Apbb2 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Tmem211 ↻ ≫
Alyref2 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Rnf215 ↻ ≫
Dpysl3 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Cdk6 ↻ ≫
Tgm2 ↻ ≫
Plcb1 ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Trappc3l ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Garem1 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Lrrc8c ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Neto2 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
Ppm1j ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Lrrc24 ↻ ≫
Barx2 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Elovl7 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Afap1l2 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Agfg1 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Mettl21a ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Jade1 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Atmin ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Lsm2 ↻ ≫
Edn1 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Eml1 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Epb41l4b ↻ ≫
Ccbe1 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
Wdr38 ↻ ≫
Pik3r5 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Oma1 ↻ ≫
Kctd18 ↻ ≫
Rasgef1c ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Foxs1 ↻ ≫
Ago1 ↻ ≫
Rps6ka5 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Uvssa ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
Wnt7a ↻ ≫
2410004P03Rik ↻ ≫
Spg20 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Phldb2 ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
Mei4 ↻ ≫
Cdk14 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Sulf2 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Mycn ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Med13 ↻ ≫
Cenpx ↻ ≫
Lrrc45 ↻ ≫
Tfeb ↻ ≫
Fbxo32 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Lmtk2 ↻ ≫
Prmt3 ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Sik1 ↻ ≫
Fzd8 ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Alcam ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Mertk ↻ ≫
Prickle4 ↻ ≫
Frs3 ↻ ≫
Pfkfb3 ↻ ≫
Rcc1 ↻ ≫
Icosl ↻ ≫
Ptprm ↻ ≫
Tnfrsf11a ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Pkn3 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tmem200a ↻ ≫
Tnnt3 ↻ ≫
Sema3d ↻ ≫
Hbq1b ↻ ≫
Synj2 ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Rgcc ↻ ≫
Wnt11 ↻ ≫
Mfhas1 ↻ ≫
Spg7 ↻ ≫
Cdkn2a ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Fam124a ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Fam136a ↻ ≫
Tesmin ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Wif1 ↻ ≫
Ints7 ↻ ≫
Dtl ↻ ≫
Rhou ↻ ≫
C1rb ↻ ≫
Fam83d ↻ ≫
Nxph3 ↻ ≫
Cpne4 ↻ ≫
Gatb ↻ ≫
Dazl ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Scap ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Igfbp7 ↻ ≫
Scaf8 ↻ ≫
Sorl1 ↻ ≫
Mettl24 ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
2900026A02Rik ↻ ≫
C1ql3 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Nrp1 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Cdc42ep2 ↻ ≫
Ovca2 ↻ ≫
Stim1 ↻ ≫
Patz1 ↻ ≫
Fabp12 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Diras2 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Inhba ↻ ≫
Npy1r ↻ ≫
Myo1b ↻ ≫
Ube2e3 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Sufu ↻ ≫
Actr1a ↻ ≫
Socs1 ↻ ≫
Usp42 ↻ ≫
Gdnf ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Dagla ↻ ≫
Cebpa ↻ ≫
Slc9a4 ↻ ≫
Glipr1l1 ↻ ≫
Bcl7c ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Pds5b ↻ ≫
Cpe ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Slc30a1 ↻ ≫
Taf15 ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Ints14 ↻ ≫
Plxna1 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Matn2 ↻ ≫
Kansl1 ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Cblc ↻ ≫
Astl ↻ ≫
Smco4 ↻ ≫
Ackr3 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
Tent5b ↻ ≫
Prcp ↻ ≫
Ddias ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Kcnk13 ↻ ≫
Frmd6 ↻ ≫
Rtn4rl1 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Abcb8 ↻ ≫
Htr1a ↻ ≫
Iqgap2 ↻ ≫
Pik3cd ↻ ≫
Cdh22 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Ccdc71l ↻ ≫
Morn3 ↻ ≫
Dnm1 ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Dennd6b ↻ ≫
App ↻ ≫
Timeless ↻ ≫
Irs1 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Ifnb1 ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Fndc1 ↻ ≫
Nop14 ↻ ≫
Grk4 ↻ ≫
Vps37d ↻ ≫
Dapk2 ↻ ≫
Hsd17b14 ↻ ≫
Scai ↻ ≫
Creg2 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Tbc1d4 ↻ ≫
Sema3c ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Fzd5 ↻ ≫
Bace2 ↻ ≫
Dact3 ↻ ≫
Dapk1 ↻ ≫
Upf3a ↻ ≫
Def8 ↻ ≫
Cnnm4 ↻ ≫
Met ↻ ≫
Abcc5 ↻ ≫
Fntb ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Creb3l1 ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Atxn7l1 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
Ep400 ↻ ≫
Farp1 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Rab37 ↻ ≫
Frg1 ↻ ≫
Xylb ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Dnlz ↻ ≫
Adora2a ↻ ≫
Tmtc2 ↻ ≫
Srd5a3 ↻ ≫
Gpr135 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
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Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
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Palm ↻ ≫
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