ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc1a

Query protein: Smc1a
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX5358275 | mESCs, differentiated
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc1a's Target genes

◢ Smc1a: Average

◢ SRX2599821: 3T3-L1

◢ SRX2599822: 3T3-L1

◢ SRX2599823: 3T3-L1

◢ SRX2599824: 3T3-L1

◢ SRX2599825: 3T3-L1

◢ SRX2599826: 3T3-L1

◢ SRX2599827: 3T3-L1

◢ SRX2599828: 3T3-L1

◢ SRX2599829: 3T3-L1

◢ SRX2599830: 3T3-L1

◢ SRX2957352: AtT-20

◢ SRX218284: B cells

◢ SRX218288: B cells

◢ SRX700951: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX700952: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348143: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348144: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348145: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348146: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX6988645: Cerebellum

◢ SRX6988646: Cerebellum

◢ SRX6988647: Cerebellum

◢ SRX6988648: Cerebellum

◢ SRX20793618: Cortical neuron

◢ SRX20793619: Cortical neuron

◢ SRX20793622: Cortical neuron

◢ SRX20793623: Cortical neuron

◢ SRX12601724: Dendritic Cells

◢ SRX12601725: Dendritic Cells

◢ SRX12601726: Dendritic Cells

◢ SRX12601727: Dendritic Cells

◢ SRX204343: Embryonic brains

◢ SRX4395347: Embryonic brains

◢ SRX4395356: Embryonic brains

◢ DRX021197: Embryonic head

◢ DRX021198: Embryonic limb

◢ SRX204337: Embryonic limb

◢ SRX204338: Embryonic limb

◢ SRX2440040: EpiSC

◢ SRX2440041: EpiSC

◢ SRX2440050: EpiSC

◢ SRX2440051: EpiSC

◢ SRX2440060: EpiSC

◢ SRX2440061: EpiSC

◢ SRX022688: ES cells

◢ SRX022689: ES cells

◢ SRX085109: ES cells

◢ SRX085110: ES cells

◢ SRX10560008: ES cells

◢ SRX10560009: ES cells

◢ SRX10560010: ES cells

◢ SRX10560011: ES cells

◢ SRX11237495: ES cells

◢ SRX11237501: ES cells

◢ SRX11237507: ES cells

◢ SRX11237513: ES cells

◢ SRX11237519: ES cells

◢ SRX11237525: ES cells

◢ SRX11237531: ES cells

◢ SRX11237537: ES cells

◢ SRX12204127: ES cells

◢ SRX12204128: ES cells

◢ SRX12204129: ES cells

◢ SRX12204130: ES cells

◢ SRX12204137: ES cells

◢ SRX12204138: ES cells

◢ SRX12204139: ES cells

◢ SRX12204140: ES cells

◢ SRX12204141: ES cells

◢ SRX12204142: ES cells

◢ SRX12204149: ES cells

◢ SRX12204150: ES cells

◢ SRX12204151: ES cells

◢ SRX12204152: ES cells

◢ SRX12204153: ES cells

◢ SRX12204154: ES cells

◢ SRX12963303: ES cells

◢ SRX13439102: ES cells

◢ SRX13439103: ES cells

◢ SRX13439104: ES cells

◢ SRX13439130: ES cells

◢ SRX17024519: ES cells

◢ SRX17024520: ES cells

◢ SRX17024521: ES cells

◢ SRX17024522: ES cells

◢ SRX2440036: ES cells

◢ SRX2440037: ES cells

◢ SRX2440070: ES cells

◢ SRX2440071: ES cells

◢ SRX2440080: ES cells

◢ SRX2440081: ES cells

◢ SRX3197475: ES cells

◢ SRX3197480: ES cells

◢ SRX4167137: ES cells

◢ SRX5088234: ES cells

◢ SRX5088236: ES cells

◢ SRX5125620: ES cells

◢ SRX5125624: ES cells

◢ SRX5401524: ES cells

◢ SRX5401525: ES cells

◢ SRX5401526: ES cells

◢ SRX5401527: ES cells

◢ SRX5401528: ES cells

◢ SRX5401529: ES cells

◢ SRX5436004: ES cells

◢ SRX5858855: ES cells

◢ SRX5858856: ES cells

◢ SRX5858857: ES cells

◢ SRX5858858: ES cells

◢ SRX6831866: ES cells

◢ SRX6831867: ES cells

◢ SRX7786279: ES cells

◢ SRX7786280: ES cells

◢ SRX7786281: ES cells

◢ SRX7786282: ES cells

◢ SRX3024490: Forelimb

◢ SRX8820366: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820367: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903169: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903170: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903174: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903175: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX2436121: Mammary glands

◢ SRX2564298: Mammary glands

◢ SRX2564307: Mammary glands

◢ SRX2564312: Mammary glands

◢ SRX2564313: Mammary glands

◢ SRX022702: MEF

◢ SRX022703: MEF

◢ SRX120168: MEF

◢ SRX120169: MEF

◢ SRX120170: MEF

◢ SRX17241102: MEF

◢ SRX17241103: MEF

◢ SRX17241104: MEF

◢ SRX17241105: MEF

◢ SRX17241107: MEF

◢ SRX17241108: MEF

◢ SRX17241109: MEF

◢ SRX17241110: MEF

◢ SRX17241113: MEF

◢ SRX17241114: MEF

◢ SRX17241115: MEF

◢ SRX17241116: MEF

◢ SRX17241117: MEF

◢ SRX17241118: MEF

◢ SRX17241119: MEF

◢ SRX17241120: MEF

◢ SRX17241123: MEF

◢ SRX17241125: MEF

◢ SRX976733: MEF

◢ SRX976734: MEF

◣ SRX5358275: mESCs, differentiated

◢ SRX5358276: mESCs, differentiated

◢ SRX5358277: mESCs, differentiated

◢ SRX5358278: mESCs, differentiated

◢ SRX5358279: mESCs, differentiated

◢ SRX5358280: mESCs, differentiated

◢ SRX125273: mESC derived neural cells

◢ SRX8693946: Neutrophils

◢ SRX8693947: Neutrophils

◢ SRX8693948: Neutrophils

◢ SRX8693949: Neutrophils

◢ SRX8693950: Neutrophils

◢ SRX8693951: Neutrophils

◢ SRX8694033: Neutrophils

◢ SRX8694034: Neutrophils

◢ SRX8694041: Neutrophils

◢ SRX8694042: Neutrophils

◢ SRX11169408: NIH/3T3

◢ SRX11169409: NIH/3T3

◢ SRX26175725: NIH/3T3

◢ SRX26175728: NIH/3T3

◢ SRX20340931: Pre-B cells

◢ SRX20340932: Pre-B cells

◢ SRX20340933: Pre-B cells

◢ SRX20340934: Pre-B cells

◢ SRX11169415: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169416: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169417: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169418: Scid.adh.2c2

◢ SRX1631901: Sperm

◢ SRX2370885: Sperm

◢ SRX7348141: Thymocytes

◢ SRX7348142: Thymocytes

◢ SRX4546348: Trophoblast stem cells

◢ SRX4546349: Trophoblast stem cells

◢ SRX1306535: T cells

◢ SRX5318290: Uterus

◢ SRX5318291: Uterus

◢ SRX5318292: Uterus

◢ Smc1a: STRING
Pafah2 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Ascl5 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Marcksl1 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Lrfn2 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Wnt7a ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Plcb1 ↻ ≫
Nppc ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Spock1 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Slc30a1 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Lemd2 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Fhod3 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Tmem200a ↻ ≫
Ror2 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Aanat ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Gm3667 ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Stk11 ↻ ≫
Npdc1 ↻ ≫
Mafa ↻ ≫
Nr1h3 ↻ ≫
Rtca ↻ ≫
Carmil2 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Fbxo7 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Ephb1 ↻ ≫
Fam151b ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Slc24a3 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Dact3 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Stx3 ↻ ≫
Flvcr2 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
2610042L04Rik ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Slc6a19 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Pim1 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
Mettl24 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Exosc6 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Pfkfb3 ↻ ≫
Akt1 ↻ ≫
Ctxn1 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Tnfaip8l2 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Gm10406 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Dsel ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Fis1 ↻ ≫
Wdr37 ↻ ≫
Pcp4 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Ankle1 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Dpysl3 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Myod1 ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Cdk6 ↻ ≫
Creg2 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Garnl3 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Inka1 ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Atmin ↻ ≫
Gjc2 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Tmem211 ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Adra2b ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Sema5b ↻ ≫
Wnt11 ↻ ≫
Rnd3 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Hsd17b14 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Myrf ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
Fbl ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Cblc ↻ ≫
Col27a1 ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Flrt3 ↻ ≫
Tmem167b ↻ ≫
Pts ↻ ≫
Slc12a9 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Fam222a ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Sirt7 ↻ ≫
Ccdc42 ↻ ≫
Prss57 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Ntn5 ↻ ≫
Gm5544 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Setd2 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Dhx30 ↻ ≫
Erap1 ↻ ≫
Ddx24 ↻ ≫
Ints7 ↻ ≫
Dtl ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Tcf7l2 ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
Cdh23 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Casp2 ↻ ≫
Ntrk2 ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Ppm1f ↻ ≫
H6pd ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Xylb ↻ ≫
Nol7 ↻ ≫
Ppp2cb ↻ ≫
Gm3500 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Foxs1 ↻ ≫
Tonsl ↻ ≫
Tcerg1l ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Mettl21a ↻ ≫
Dennd6b ↻ ≫
Map2k1 ↻ ≫
Adora2a ↻ ≫
Gpr135 ↻ ≫
Nrg1 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
H13 ↻ ≫
Rdh10 ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Ttpal ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Fam83d ↻ ≫
Slc2a4 ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Gm7932 ↻ ≫
Gm11100 ↻ ≫
Ndufv1 ↻ ≫
Madcam1 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Pomk ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Parp11 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Mafb ↻ ≫
Kctd15 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Depdc1b ↻ ≫
Amigo3 ↻ ≫
Tiparp ↻ ≫
Dop1b ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
Sh3rf3 ↻ ≫
Slco3a1 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
Spink10 ↻ ≫
Fbxo38 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Atp1a1 ↻ ≫
Lrrc24 ↻ ≫
C030006K11Rik ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Carmil1 ↻ ≫
Plk2 ↻ ≫
Acaa1b ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Apba1 ↻ ≫
Samd9l ↻ ≫
2410004P03Rik ↻ ≫
Rab5if ↻ ≫
A830018L16Rik ↻ ≫
Scap ↻ ≫
Coil ↻ ≫
Ndufaf4 ↻ ≫
Map7 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Parl ↻ ≫
Gtf3c6 ↻ ≫
Dctn1 ↻ ≫
Pvalb ↻ ≫
Noc3l ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Ap1ar ↻ ≫
Tfap2c ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Dctpp1 ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Hnrnph3 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Mien1 ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Rrp1 ↻ ≫
Mrpl38 ↻ ≫
Fam83h ↻ ≫
Pstk ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
Tmtc2 ↻ ≫
Setd5 ↻ ≫
Tpd52l1 ↻ ≫
Edar ↻ ≫
Slitrk5 ↻ ≫
Cbl ↻ ≫
Gh ↻ ≫
Saa3 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Ccdc126 ↻ ≫
Eif3g ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Ccdc85a ↻ ≫
C87436 ↻ ≫
Gatb ↻ ≫
Nectin1 ↻ ≫
Lrrc41 ↻ ≫
Uqcrh ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Becn1 ↻ ≫
Cav1 ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Cpne4 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Man2b2 ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Aldh1a2 ↻ ≫
Serpinb9 ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
Spry1 ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Cryba2 ↻ ≫
Rnd2 ↻ ≫
Ndufa13 ↻ ≫
Tssk6 ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Pkn3 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Nfx1 ↻ ≫
Kcnj6 ↻ ≫
Elmo1 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Slc5a5 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Glipr1l1 ↻ ≫
Hs3st2 ↻ ≫
Tox4 ↻ ≫
Rab2b ↻ ≫
Mtus2 ↻ ≫
Jag1 ↻ ≫
Fam136a ↻ ≫
Ndufc1 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Glipr1l3 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Cpne8 ↻ ≫
Znrf1 ↻ ≫
Dmtn ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Snapin ↻ ≫
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Gng8 ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Farsa ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
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Flt3l ↻ ≫
Nck1 ↻ ≫
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Prss32 ↻ ≫
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Rhog ↻ ≫
Astl ↻ ≫
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C1rl ↻ ≫
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Lmo1 ↻ ≫
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F3 ↻ ≫
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Golgb1 ↻ ≫
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Mertk ↻ ≫
Apc2 ↻ ≫
Amh ↻ ≫
Taf10 ↻ ≫
Calr ↻ ≫
Trmu ↻ ≫
Nt5c1a ↻ ≫
Cfap97d1 ↻ ≫
Tagln ↻ ≫
S100a6 ↻ ≫
Cep350 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Rpl7l1 ↻ ≫
Yif1a ↻ ≫
Prag1 ↻ ≫
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Tmem191c ↻ ≫
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T2 ↻ ≫
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Mtres1 ↻ ≫
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Mro ↻ ≫
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Deptor ↻ ≫
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Kctd11 ↻ ≫
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Ccdc153 ↻ ≫
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Pnma1 ↻ ≫
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Plec ↻ ≫
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Senp3 ↻ ≫
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Tesmin ↻ ≫
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Lix1 ↻ ≫