ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CBX3

Query protein: CBX3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX13327965 | LNCAP
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
CBX3's Target genes

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◢ SRX3010076: GM12878

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◢ CBX3: STRING
LOC102724770 ↻ ≫
DGCR6 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
EAPP ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
STX5 ↻ ≫
MAMDC2 ↻ ≫
TAF12 ↻ ≫
SNX16 ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
KIF2C ↻ ≫
TMEM107 ↻ ≫
PARP16 ↻ ≫
TRIP4 ↻ ≫
PCLAF ↻ ≫
KDM3B ↻ ≫
POLDIP3 ↻ ≫
PTPN6 ↻ ≫
C12orf57 ↻ ≫
PSMB7 ↻ ≫
EXOSC6 ↻ ≫
SCRIB ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
RNF24 ↻ ≫
NFYC ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
SLC36A2 ↻ ≫
USP17L22 ↻ ≫
USP17L21 ↻ ≫
USP17L20 ↻ ≫
USP17L12 ↻ ≫
RPL5 ↻ ≫
UGT2B15 ↻ ≫
KMT2A ↻ ≫
TTI2 ↻ ≫
GTF2H2 ↻ ≫
NOTCH2NLC ↻ ≫
NOTCH2NLB ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
SRRM3 ↻ ≫
KAT6A ↻ ≫
CLEC2A ↻ ≫
PAXBP1 ↻ ≫
MAPK11 ↻ ≫
PEX3 ↻ ≫
ADAT2 ↻ ≫
PDE11A ↻ ≫
RBM45 ↻ ≫
MUC3A ↻ ≫
CDH18 ↻ ≫
MMP12 ↻ ≫
KIF27 ↻ ≫
RAD54L2 ↻ ≫
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R3HCC1 ↻ ≫
RBBP8NL ↻ ≫
DNAAF4 ↻ ≫
RBM4B ↻ ≫
CTNNB1 ↻ ≫
UBE4A ↻ ≫
SLC9A1 ↻ ≫
MAN2C1 ↻ ≫
RNF135 ↻ ≫
PRSS8 ↻ ≫
ZNF790 ↻ ≫
C7orf26 ↻ ≫
STX6 ↻ ≫
LRIF1 ↻ ≫
HEXIM1 ↻ ≫
NSFL1C ↻ ≫
BCL9 ↻ ≫
ROMO1 ↻ ≫
PLEKHS1 ↻ ≫
SPON1 ↻ ≫
TMEM134 ↻ ≫
PAIP1 ↻ ≫
TMEM42 ↻ ≫
TGM4 ↻ ≫
ZCCHC3 ↻ ≫
C20orf96 ↻ ≫
NR2E1 ↻ ≫
HMGB1 ↻ ≫
HECTD1 ↻ ≫
COMMD2 ↻ ≫
ANKRD40 ↻ ≫
PPP1R14C ↻ ≫
TDRD7 ↻ ≫
ELAVL2 ↻ ≫
RSPH14 ↻ ≫
RAB36 ↻ ≫
COPS4 ↻ ≫
SSBP2 ↻ ≫
SAMD3 ↻ ≫
BICC1 ↻ ≫
XKR9 ↻ ≫
LACTB2 ↻ ≫
SLC25A21 ↻ ≫
PEX26 ↻ ≫
ADRA1A ↻ ≫
XPC ↻ ≫
LSM3 ↻ ≫
NOL8 ↻ ≫
CENPP ↻ ≫
DCAF10 ↻ ≫
H4C3 ↻ ≫
H1-6 ↻ ≫
MTF2 ↻ ≫
EIF4G2 ↻ ≫
DSCC1 ↻ ≫
SLC39A13 ↻ ≫
SMN2 ↻ ≫
SMN1 ↻ ≫
MRPS28 ↻ ≫
MICU2 ↻ ≫
ACTB ↻ ≫
NCAM2 ↻ ≫
SLC45A4 ↻ ≫
CAB39L ↻ ≫
TBX3 ↻ ≫
AGK ↻ ≫
CHCHD1 ↻ ≫
FUT11 ↻ ≫
POLR3B ↻ ≫
MARCHF7 ↻ ≫
AARS2 ↻ ≫
INTS6 ↻ ≫
SLC39A4 ↻ ≫
CPSF1 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
FAM207A ↻ ≫
MMP16 ↻ ≫
TXNRD1 ↻ ≫
NOTCH2 ↻ ≫
ZCCHC4 ↻ ≫
ATN1 ↻ ≫
HUS1 ↻ ≫
COQ3 ↻ ≫
POLR3E ↻ ≫
CYP51A1 ↻ ≫
GTF2H2C_2 ↻ ≫
GTF2H2C ↻ ≫
NCKAP1 ↻ ≫
PABPN1 ↻ ≫
ZNF672 ↻ ≫
DNAJC11 ↻ ≫
MIS18A ↻ ≫
SCGB1D1 ↻ ≫
NRAS ↻ ≫
DVL2 ↻ ≫
GABARAP ↻ ≫
SDHAF3 ↻ ≫
PHF23 ↻ ≫
CYP3A43 ↻ ≫
LRRC37A3 ↻ ≫
BIRC3 ↻ ≫
TP53I11 ↻ ≫
GOLM2 ↻ ≫
C17orf49 ↻ ≫
BCL6B ↻ ≫
RNASEK ↻ ≫
RPF2 ↻ ≫
CTNNAL1 ↻ ≫
EBAG9 ↻ ≫
EIF1 ↻ ≫
CCNI ↻ ≫
DGLUCY ↻ ≫
RPS6KA5 ↻ ≫
C6orf226 ↻ ≫
TMEM242 ↻ ≫
RPS3A ↻ ≫
ELAPOR2 ↻ ≫
ACBD6 ↻ ≫
FOXP1 ↻ ≫
NSUN5 ↻ ≫
CYREN ↻ ≫
ECM1 ↻ ≫
BRSK2 ↻ ≫
TAF1B ↻ ≫
SLC38A2 ↻ ≫
DENND4A ↻ ≫
AADAT ↻ ≫
CCDC71L ↻ ≫
ZC3H6 ↻ ≫
PPP1CC ↻ ≫
TMEM201 ↻ ≫
SLIRP ↻ ≫
ALKBH1 ↻ ≫
ALG10 ↻ ≫
CCDC106 ↻ ≫
ZNF581 ↻ ≫
U2AF2 ↻ ≫
CCDC149 ↻ ≫
INPP5E ↻ ≫
ZNF398 ↻ ≫
ELAVL3 ↻ ≫
PARP2 ↻ ≫
CCNB1IP1 ↻ ≫
CXCL2 ↻ ≫
RPA2 ↻ ≫
ZNF787 ↻ ≫
ZNF93 ↻ ≫
ALKBH3 ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
KBTBD4 ↻ ≫
FAM180B ↻ ≫
RFX3 ↻ ≫
WDR70 ↻ ≫
NUP155 ↻ ≫
HDHD5 ↻ ≫
RBX1 ↻ ≫
ART1 ↻ ≫
SRI ↻ ≫
CALM1 ↻ ≫
ATR ↻ ≫
TRMT10C ↻ ≫
CCDC91 ↻ ≫
C1orf115 ↻ ≫
ZBTB6 ↻ ≫
RC3H2 ↻ ≫
TBK1 ↻ ≫
SNX15 ↻ ≫
SAC3D1 ↻ ≫
TNFSF15 ↻ ≫
GTF2IRD2 ↻ ≫
GTF2IRD2B ↻ ≫
PSMD6 ↻ ≫
DDIT4 ↻ ≫
TEKT2 ↻ ≫
ADPRS ↻ ≫
PSMG1 ↻ ≫
COX20 ↻ ≫
TRAF6 ↻ ≫
RAG1 ↻ ≫
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RUVBL1 ↻ ≫
EEFSEC ↻ ≫
ZNF653 ↻ ≫
MED4 ↻ ≫
SPATC1L ↻ ≫
SUCLG2 ↻ ≫
FAM133B ↻ ≫
ACTL10 ↻ ≫
NECAB3 ↻ ≫
EDC4 ↻ ≫
C20orf144 ↻ ≫
PLEKHM3 ↻ ≫
HNRNPU ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
H3C15 ↻ ≫
H3C14 ↻ ≫
H2AC19 ↻ ≫
H2AC18 ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
TMEM101 ↻ ≫
MACROD1 ↻ ≫
ARIH1 ↻ ≫
SVIP ↻ ≫
STK32A ↻ ≫
CALML5 ↻ ≫
ZC3H10 ↻ ≫
RPL41 ↻ ≫
ESYT1 ↻ ≫
CCZ1B ↻ ≫
MOB3A ↻ ≫
IZUMO4 ↻ ≫
SP3 ↻ ≫
ASNS ↻ ≫
C1orf74 ↻ ≫
MAML1 ↻ ≫
NDUFAF3 ↻ ≫
IMPDH2 ↻ ≫
DALRD3 ↻ ≫
RAG2 ↻ ≫
IFTAP ↻ ≫
HIBCH ↻ ≫
TEX10 ↻ ≫
UGT2B28 ↻ ≫
ACSF3 ↻ ≫
MRPL3 ↻ ≫
AKAP8 ↻ ≫
PURA ↻ ≫
BRD2 ↻ ≫
GALNT11 ↻ ≫
STXBP5L ↻ ≫
OR6V1 ↻ ≫
CLTC ↻ ≫
PPP3CB ↻ ≫
ZBED9 ↻ ≫
P4HB ↻ ≫
ARHGDIA ↻ ≫
ZZEF1 ↻ ≫
CYB5D2 ↻ ≫
YAP1 ↻ ≫
PRRG4 ↻ ≫
LAMA3 ↻ ≫
POLG2 ↻ ≫
DDX5 ↻ ≫
CEP95 ↻ ≫
SETDB2-PHF11 ↻ ≫
SETDB2 ↻ ≫
NAT10 ↻ ≫
GXYLT1 ↻ ≫
SIKE1 ↻ ≫
CIRBP ↻ ≫
FAM174C ↻ ≫
VPS13B ↻ ≫
FBXO4 ↻ ≫
HLCS ↻ ≫
HOOK1 ↻ ≫
RRP15 ↻ ≫
CAPN5 ↻ ≫
CEBPB ↻ ≫
USP45 ↻ ≫
TSTD3 ↻ ≫
MVB12A ↻ ≫
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KDM6B ↻ ≫
PDE4DIP ↻ ≫
NRBF2 ↻ ≫
NDUFAB1 ↻ ≫
HNRNPF ↻ ≫
ARHGEF12 ↻ ≫
SRPRA ↻ ≫
BMP2K ↻ ≫
STX18 ↻ ≫
GPAM ↻ ≫
FAM241B ↻ ≫
SELENOH ↻ ≫
TTC26 ↻ ≫
ATP6V0C ↻ ≫
AMDHD2 ↻ ≫
LAG3 ↻ ≫
USP42 ↻ ≫
ST3GAL3 ↻ ≫
SLCO4C1 ↻ ≫
DPY19L4 ↻ ≫
CHD2 ↻ ≫
FXYD3 ↻ ≫
MAFB ↻ ≫
MYEF2 ↻ ≫
CTXN2 ↻ ≫
ZFAT ↻ ≫
DDX59 ↻ ≫
NOC4L ↻ ≫
DDX51 ↻ ≫
NUP54 ↻ ≫
THNSL1 ↻ ≫
AK1 ↻ ≫
WDFY3 ↻ ≫
POLR2M ↻ ≫
FBXW4 ↻ ≫
POMT1 ↻ ≫
SLC25A4 ↻ ≫
TXNDC17 ↻ ≫
KIAA0753 ↻ ≫
RBM48 ↻ ≫
PEX1 ↻ ≫
STK38L ↻ ≫
ZMPSTE24 ↻ ≫
TMCO2 ↻ ≫
NCKIPSD ↻ ≫
C1QBP ↻ ≫
TUSC1 ↻ ≫
CBWD5 ↻ ≫
CBWD3 ↻ ≫
CBWD6 ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
ERMARD ↻ ≫
LPP ↻ ≫
PPIA ↻ ≫
L3HYPDH ↻ ≫
JKAMP ↻ ≫
ZNF621 ↻ ≫
TWF1 ↻ ≫
PDCD6 ↻ ≫
LIMA1 ↻ ≫
SNX14 ↻ ≫
GGNBP2 ↻ ≫
MYO19 ↻ ≫
PIGW ↻ ≫
FOXB2 ↻ ≫
SQSTM1 ↻ ≫
TDRD5 ↻ ≫
REPIN1 ↻ ≫
GULP1 ↻ ≫
SIRT1 ↻ ≫
SRCIN1 ↻ ≫
REV3L ↻ ≫
BTG1 ↻ ≫
FAM131A ↻ ≫
RPS9 ↻ ≫
TSEN34 ↻ ≫
CYP4V2 ↻ ≫
C7orf25 ↻ ≫
NFKB1 ↻ ≫
GPSM1 ↻ ≫
DNLZ ↻ ≫
CARD9 ↻ ≫
FOXN4 ↻ ≫
JARID2 ↻ ≫
KSR2 ↻ ≫
TADA1 ↻ ≫
PABPC4 ↻ ≫
FOLH1 ↻ ≫
SMG8 ↻ ≫
BCAS2 ↻ ≫
BMS1 ↻ ≫
MUS81 ↻ ≫
CFL1 ↻ ≫
C19orf48 ↻ ≫
ABTB1 ↻ ≫
RNF103 ↻ ≫
LOC105372440 ↻ ≫
ACP4 ↻ ≫
CTDSP1 ↻ ≫
WDR27 ↻ ≫
C6orf120 ↻ ≫
FBXO30 ↻ ≫
ABCB5 ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
CELSR2 ↻ ≫
RPL37 ↻ ≫
CARD6 ↻ ≫
NKIRAS1 ↻ ≫
NR1D2 ↻ ≫
ARHGEF5 ↻ ≫
EI24 ↻ ≫
SYNRG ↻ ≫
MBD3 ↻ ≫
IAH1 ↻ ≫
COG2 ↻ ≫
EXPH5 ↻ ≫
METTL25 ↻ ≫
CCDC59 ↻ ≫
ZBTB4 ↻ ≫
SLC35G6 ↻ ≫
POLR2A ↻ ≫
TAF9 ↻ ≫
RAD17 ↻ ≫
AK6 ↻ ≫
CASC3 ↻ ≫
UPF3A ↻ ≫
CRLS1 ↻ ≫
AEBP2 ↻ ≫
ZNF562 ↻ ≫
SLC39A10 ↻ ≫
WDR24 ↻ ≫
STUB1 ↻ ≫
JMJD8 ↻ ≫
GPS2 ↻ ≫
EIF5A ↻ ≫
ANKRD13C ↻ ≫
GPRC5A ↻ ≫
EXOSC8 ↻ ≫
ALG5 ↻ ≫
IDNK ↻ ≫
NDST2 ↻ ≫
TMEM65 ↻ ≫
ARID3A ↻ ≫
TMEM185B ↻ ≫
GLIPR1L2 ↻ ≫
NAPRT ↻ ≫
MROH6 ↻ ≫
ARHGEF10 ↻ ≫
USP17L13 ↻ ≫
USP17L17 ↻ ≫
USP17L15 ↻ ≫
ANGPTL6 ↻ ≫
P2RY11 ↻ ≫
PPAN-P2RY11 ↻ ≫
PPAN ↻ ≫
HPS3 ↻ ≫
CEP295 ↻ ≫
PLK2 ↻ ≫
TRIB3 ↻ ≫
KLHL20 ↻ ≫
TRMT112 ↻ ≫
PRDX5 ↻ ≫
TMX4 ↻ ≫
TUBGCP3 ↻ ≫
PCIF1 ↻ ≫
LSM8 ↻ ≫
TEX38 ↻ ≫
ATPAF1 ↻ ≫
KCTD15 ↻ ≫
MGAT1 ↻ ≫
EEF1A1 ↻ ≫
SHC1 ↻ ≫
SFSWAP ↻ ≫
PYGO2 ↻ ≫
PBXIP1 ↻ ≫
LOC101928120 ↻ ≫
ZFP64 ↻ ≫
ARRDC3 ↻ ≫
ARL14EP ↻ ≫
ARHGAP29 ↻ ≫
BCAR3 ↻ ≫
MRPL16 ↻ ≫
SNRPB2 ↻ ≫
CNOT6 ↻ ≫
MFSD14A ↻ ≫
KMT2E ↻ ≫
DSTYK ↻ ≫
DDX17 ↻ ≫
BCAS4 ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
TEX14 ↻ ≫
RAD51C ↻ ≫
FAM227B ↻ ≫
DTWD1 ↻ ≫
ARL4D ↻ ≫
MTRNR2L8 ↻ ≫
NCOA3 ↻ ≫
IER3 ↻ ≫
FLOT1 ↻ ≫
PTPRN2 ↻ ≫
BMP7 ↻ ≫
KRT8 ↻ ≫
RMND5B ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
TSKU ↻ ≫
TRIM37 ↻ ≫
DHX40 ↻ ≫
ESR1 ↻ ≫
PARD6B ↻ ≫
KMT2C ↻ ≫
COL23A1 ↻ ≫
TFF1 ↻ ≫
N4BP3 ↻ ≫
IGFBP4 ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
ZMYND8 ↻ ≫
BANP ↻ ≫
ZNF217 ↻ ≫
KIF5C ↻ ≫
TIPARP ↻ ≫
PFDN4 ↻ ≫
TMEM229B ↻ ≫
USP32 ↻ ≫
PHRF1 ↻ ≫
PALLD ↻ ≫
SPINK4 ↻ ≫
TPD52L1 ↻ ≫
ARFGEF2 ↻ ≫
APPBP2 ↻ ≫
RARA ↻ ≫
STARD10 ↻ ≫
KRT19 ↻ ≫
MESP2 ↻ ≫
TRPM7 ↻ ≫
HSPB8 ↻ ≫
SLC22A5 ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
NMNAT1 ↻ ≫
LZIC ↻ ≫
PI4K2B ↻ ≫
FAM102B ↻ ≫
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TMEM104 ↻ ≫
NAT9 ↻ ≫
BCAS1 ↻ ≫
HEATR6 ↻ ≫
GDF15 ↻ ≫
BCL3 ↻ ≫
GET4 ↻ ≫
TTC39A ↻ ≫
FBP1 ↻ ≫
CAP2 ↻ ≫
PPP1R12B ↻ ≫
LCMT1 ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
RTEL1 ↻ ≫
SPPL2A ↻ ≫
CST6 ↻ ≫
ACOT6 ↻ ≫
CANT1 ↻ ≫
JUND ↻ ≫
IQCN ↻ ≫
XAB2 ↻ ≫
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LIMS1 ↻ ≫
IL24 ↻ ≫
PCYT1A ↻ ≫
COX16 ↻ ≫
TLR5 ↻ ≫
CDYL ↻ ≫
LONP2 ↻ ≫
ABCC11 ↻ ≫
B4GALNT3 ↻ ≫
EPS15L1 ↻ ≫
TMCC1 ↻ ≫
FKBP4 ↻ ≫
KLRC3 ↻ ≫
CMTR2 ↻ ≫
HAUS1 ↻ ≫
ATP5F1A ↻ ≫
IL20 ↻ ≫
LRCH1 ↻ ≫
SLC7A5 ↻ ≫
C1QTNF6 ↻ ≫
CYRIB ↻ ≫
NBN ↻ ≫
PIM3 ↻ ≫
MAT1A ↻ ≫
JUP ↻ ≫
MYOG ↻ ≫
GREB1 ↻ ≫
HKDC1 ↻ ≫
BRIP1 ↻ ≫
PPP2R2C ↻ ≫
DGKZ ↻ ≫
BATF ↻ ≫
TRIB1 ↻ ≫
SLC29A3 ↻ ≫
RNF223 ↻ ≫
RTN1 ↻ ≫
SLC25A36 ↻ ≫
CCDC125 ↻ ≫
ZNRF2 ↻ ≫
YPEL3 ↻ ≫
H2BC15 ↻ ≫
H2AC15 ↻ ≫
TBX2 ↻ ≫
SMARCD2 ↻ ≫
TMIGD3 ↻ ≫
ADORA3 ↻ ≫
SPOP ↻ ≫
RGPD2 ↻ ≫
RGPD1 ↻ ≫
ACTRT3 ↻ ≫
CRKL ↻ ≫
UBE2H ↻ ≫
C16orf74 ↻ ≫
ZNF185 ↻ ≫
ATP6AP1 ↻ ≫
PRKAG2 ↻ ≫
UBE2T ↻ ≫
RXRA ↻ ≫
SPTBN4 ↻ ≫
CYB561 ↻ ≫
H2BC14 ↻ ≫
H2AC14 ↻ ≫
OPA1 ↻ ≫
MTRNR2L9 ↻ ≫
FAXDC2 ↻ ≫
FAM214A ↻ ≫
SBNO2 ↻ ≫
AFF1 ↻ ≫
SIK1B ↻ ≫
SIK1 ↻ ≫
HSPA4 ↻ ≫
ZFP36 ↻ ≫
UNK ↻ ≫
H3-3B ↻ ≫
PLEKHG2 ↻ ≫
CDC42EP1 ↻ ≫
THEM4 ↻ ≫
JRK ↻ ≫
YIF1B ↻ ≫
KCNK6 ↻ ≫
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EDN1 ↻ ≫
FASN ↻ ≫
MYEOV ↻ ≫
PTPA ↻ ≫
CRAT ↻ ≫
ALG10B ↻ ≫
ELF1 ↻ ≫
RET ↻ ≫
OTUD7B ↻ ≫
BACE1 ↻ ≫
MAPK6 ↻ ≫
RAB15 ↻ ≫
WWP1 ↻ ≫
SSBP1 ↻ ≫
ATP8B1 ↻ ≫
CDH1 ↻ ≫
ZNF79 ↻ ≫
APOC3 ↻ ≫
APOA1 ↻ ≫
GSG1L ↻ ≫
SULT2B1 ↻ ≫
ZNF385B ↻ ≫
HAPLN2 ↻ ≫
BLVRB ↻ ≫
LRATD2 ↻ ≫
CSAD ↻ ≫
LRRC58 ↻ ≫
SKIL ↻ ≫
TACO1 ↻ ≫
PSMD4 ↻ ≫
ZNF282 ↻ ≫
PMF1-BGLAP ↻ ≫
PMF1 ↻ ≫
DNPEP ↻ ≫
PTMA ↻ ≫
SFXN2 ↻ ≫
ARL3 ↻ ≫
IMMP2L ↻ ≫
ZBTB45 ↻ ≫
DNASE1L1 ↻ ≫
VPS26C ↻ ≫
MRFAP1 ↻ ≫
ATP13A3 ↻ ≫
TOR1AIP2 ↻ ≫
TOR1AIP1 ↻ ≫
ATP9B ↻ ≫
KAT6B ↻ ≫
CERS2 ↻ ≫
ANXA9 ↻ ≫
NEFH ↻ ≫
DMRT2 ↻ ≫
SVIL ↻ ≫
OSCAR ↻ ≫
NDUFA3 ↻ ≫
FREM2 ↻ ≫
KRT85 ↻ ≫
SGK3 ↻ ≫
NFKBIA ↻ ≫
PRLH ↻ ≫
NFIB ↻ ≫
TPRKB ↻ ≫
HES1 ↻ ≫
HNRNPA0 ↻ ≫
CACNG1 ↻ ≫
TPRG1 ↻ ≫
LSMEM1 ↻ ≫
CUEDC1 ↻ ≫
TMEM41A ↻ ≫
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