ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1668642 | Quadriceps Muscle
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674624: Brown adipose tissue

◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

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◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

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◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

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◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543271: Liver

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◢ SRX997771: Liver

◢ SRX997772: Liver

◢ SRX997773: Liver

◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◣ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Atp6v0c ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Dync1h1 ↻ ≫
Hexa ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Tcstv3 ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Mfsd1 ↻ ≫
Zfp358 ↻ ≫
Mcoln1 ↻ ≫
Dpp7 ↻ ≫
Gba ↻ ≫
Zfp507 ↻ ≫
Gabarap ↻ ≫
Phf23 ↻ ≫
Dvl2 ↻ ≫
Vps11 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Hoxa3 ↻ ≫
Hoxa7 ↻ ≫
Hoxa6 ↻ ≫
Hoxa9 ↻ ≫
Clcn7 ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Taf10 ↻ ≫
Tpp1 ↻ ≫
Prr5l ↻ ≫
Commd9 ↻ ≫
Cln3 ↻ ≫
Apobr ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Bax ↻ ≫
Dph2 ↻ ≫
B4galt2 ↻ ≫
Atp6v0b ↻ ≫
Retreg2 ↻ ≫
Cnppd1 ↻ ≫
Slc23a3 ↻ ≫
Spata25 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Lat ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Pip4p1 ↻ ≫
Osgep ↻ ≫
Apex1 ↻ ≫
Wdr81 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Txndc11 ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Chrnb2 ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Agrp ↻ ≫
Tspan31 ↻ ≫
Marchf9 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Nkx2-6 ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
Ube2b ↻ ≫
Cdkl3 ↻ ≫
Atp6v1c1 ↻ ≫
Klhl24 ↻ ≫
Lsm12 ↻ ≫
G6pc3 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Atxn3 ↻ ≫
Nagpa ↻ ≫
Nup188 ↻ ≫
Dolk ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Commd4 ↻ ≫
Neil1 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Hnrnph2 ↻ ≫
Gla ↻ ≫
Tnc ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Zfp142 ↻ ≫
Bcs1l ↻ ≫
Scamp3 ↻ ≫
Fam189b ↻ ≫
Ucp3 ↻ ≫
Hexb ↻ ≫
Mthfr ↻ ≫
Clcn6 ↻ ≫
Arl4d ↻ ≫
A530021J07Rik ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Anapc15 ↻ ≫
Uvrag ↻ ≫
Vps33a ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Lztfl1 ↻ ≫
Kdm4c ↻ ≫
Marchf8 ↻ ≫
Thrap3 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Sgo1 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Ppp1ca ↻ ≫
Rragc ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Natd1 ↻ ≫
Med28 ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
Sumf1 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Fam187a ↻ ≫
Eftud2 ↻ ≫
Ccdc103 ↻ ≫
Tbl1x ↻ ≫
Mtdh ↻ ≫
Stat1 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
C1qtnf6 ↻ ≫
1700010I14Rik ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Apol6 ↻ ≫
E030030I06Rik ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Ankrd12 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Pik3ca ↻ ≫
Ruvbl2 ↻ ≫
Gys1 ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Hivep2 ↻ ≫
Olfr855 ↻ ≫
Olfr854 ↻ ≫
Eif2s1 ↻ ≫
Atp6v1d ↻ ≫
Sec22c ↻ ≫
Nup54 ↻ ≫
Sesn1 ↻ ≫
Stmn4 ↻ ≫
Zmym6 ↻ ≫
Cd209a ↻ ≫
Aldh9a1 ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Cradd ↻ ≫
Ctsd ↻ ≫
Dus1l ↻ ≫
E030018B13Rik ↻ ≫
Mettl25 ↻ ≫
Ccdc59 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Ripor2 ↻ ≫
Kcna7 ↻ ≫
Ntf5 ↻ ≫
Lhb ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Ttpal ↻ ≫
Tchp ↻ ≫
Adcy7 ↻ ≫
Tex14 ↻ ≫
Stat3 ↻ ≫
Gm525 ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Ehd2 ↻ ≫
Zfp672 ↻ ≫
Sh3bp5l ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Pak4 ↻ ≫
Fryl ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Mafa ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Fermt2 ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Dusp7 ↻ ≫
Mvd ↻ ≫
Snai3 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Rsph3b ↻ ≫
Gm11634 ↻ ≫
LOC666331 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Taf12 ↻ ≫
Gmeb1 ↻ ≫
Igf2r ↻ ≫
Ltbp4 ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Serinc3 ↻ ≫
Prss52 ↻ ≫
Prss51 ↻ ≫
Grn ↻ ≫
Thop1 ↻ ≫
Sgta ↻ ≫
Ubb ↻ ≫
Foxo6 ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Zbtb4 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Arid5a ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Amotl2 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Taco1 ↻ ≫
Wsb1 ↻ ≫
Nfat5 ↻ ≫
Fbxo48 ↻ ≫
Akt1 ↻ ≫
Zbtb42 ↻ ≫
Cerk ↻ ≫
Ptp4a3 ↻ ≫
Gadd45a ↻ ≫
Rdh5 ↻ ≫
Cd63 ↻ ≫
Gorab ↻ ≫
Phf14 ↻ ≫
Ndufa4 ↻ ≫
Zfp474 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Tcam1 ↻ ≫
Smarcd2 ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Zfp655 ↻ ≫
Tmem182 ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
Trpm7 ↻ ≫
Nrbf2 ↻ ≫
Adh1 ↻ ≫
Pex3 ↻ ≫
Adat2 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Kctd5 ↻ ≫
Slc28a1 ↻ ≫
Mrln ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Jup ↻ ≫
Cyp11a1 ↻ ≫
Prkag2 ↻ ≫
Acin1 ↻ ≫
1700123O20Rik ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Smad7 ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Kcna5 ↻ ≫
Tmem129 ↻ ≫
Tacc3 ↻ ≫
Slbp ↻ ≫
Aqp8 ↻ ≫
Mmp28 ↻ ≫
Taf15 ↻ ≫
Atp6v1h ↻ ≫
Eng ↻ ≫
Klf9 ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Dad1 ↻ ≫
Abhd4 ↻ ≫
Lrrc8a ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Arid1a ↻ ≫
Rab33b ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Bloc1s1 ↻ ≫
Chac1 ↻ ≫
Rpn1 ↻ ≫
Ndufs4 ↻ ≫
Top3a ↻ ≫
Smcr8 ↻ ≫
Prex2 ↻ ≫
Zfyve16 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Pomp ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Akt2 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Ipo13 ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
Pdk4 ↻ ≫
Evi5 ↻ ≫
Ttc39d ↻ ≫
Srsf7 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Tnfaip1 ↻ ≫
Ift20 ↻ ≫
P4ha1 ↻ ≫
Rab11b ↻ ≫
Rps23 ↻ ≫
2410002F23Rik ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Ryr1 ↻ ≫
Zhx3 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Lpin3 ↻ ≫
Cgrrf1 ↻ ≫
Gm20594 ↻ ≫
Gm10710 ↻ ≫
Dchs2 ↻ ≫
Khdrbs1 ↻ ≫
Slc25a10 ↻ ≫
Shpk ↻ ≫
Ctns ↻ ≫
Mrpl12 ↻ ≫
Tab1 ↻ ≫
Ccdc9 ↻ ≫
Dcp1a ↻ ≫
9930012K11Rik ↻ ≫
Ccar2 ↻ ≫
Egfl7 ↻ ≫
Eno1b ↻ ≫
Usp3 ↻ ≫
Trir ↻ ≫
Tnpo2 ↻ ≫
Sh2d4b ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Gm13290 ↻ ≫
Gm13289 ↻ ≫
Ifnz ↻ ≫
Gm13272 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Prrt2 ↻ ≫
Cd151 ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Polr2l ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Pagr1a ↻ ≫
Unc13d ↻ ≫
Elf1 ↻ ≫
Chordc1 ↻ ≫
Wbp4 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Mob4 ↻ ≫
Gdpd4 ↻ ≫
Dmpk ↻ ≫
Dmwd ↻ ≫
Luzp1 ↻ ≫
Fam83a ↻ ≫
Klf15 ↻ ≫
Nvl ↻ ≫
Cnih4 ↻ ≫
Cdc14a ↻ ≫
Rsad2 ↻ ≫
Cmpk2 ↻ ≫
Dnah7b ↻ ≫
Col6a6 ↻ ≫
Trp53rkb ↻ ≫
Shoc2 ↻ ≫
Bbip1 ↻ ≫
Lztr1 ↻ ≫
Fam120c ↻ ≫
Vsir ↻ ≫
Shank3 ↻ ≫
Ppp2r5a ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Phc2 ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
Vps13d ↻ ≫
Lnx1 ↻ ≫
Arhgef37 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Hspb1 ↻ ≫
Impa2 ↻ ≫
Creb1 ↻ ≫
Tmem86a ↻ ≫
Akap7 ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Ifi35 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
Rgcc ↻ ≫
Cd93 ↻ ≫
Polr3b ↻ ≫
Tmem216 ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Rusc2 ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Mbnl1 ↻ ≫
Neurl3 ↻ ≫
Rmc1 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Ssrp1 ↻ ≫
P2rx3 ↻ ≫
Kat6b ↻ ≫
Hps1 ↻ ≫
Wdr92 ↻ ≫
Pno1 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Slc50a1 ↻ ≫
Rasgrp3 ↻ ≫
Ankrd40 ↻ ≫
Szrd1 ↻ ≫
Snrnp27 ↻ ≫
Fbxo42 ↻ ≫
Phkg1 ↻ ≫
Chchd2 ↻ ≫
Zbed5 ↻ ≫
Zbtb37 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Dgkd ↻ ≫
Sae1 ↻ ≫
Mrpl53 ↻ ≫
Ccdc142 ↻ ≫
Mogs ↻ ≫
Kcnj12 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Zmynd15 ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Cox8c ↻ ≫
Actr3 ↻ ≫
Depp1 ↻ ≫
Fam149b ↻ ≫
Ecd ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Txlnb ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Acadm ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Gbp4 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Rfng ↻ ≫
Gps1 ↻ ≫
Zdhhc11 ↻ ≫
Yaf2 ↻ ≫
Sipa1 ↻ ≫
Tectb ↻ ≫
Tmem167b ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Taf13 ↻ ≫
Phlda1 ↻ ≫
Arid2 ↻ ≫
Ndufa5 ↻ ≫
Asb15 ↻ ≫
Nsun3 ↻ ≫
Mycbp2 ↻ ≫
Acyp2 ↻ ≫
Tnfrsf21 ↻ ≫
Myoc ↻ ≫
Tor1aip2 ↻ ≫
Tor1aip1 ↻ ≫
Coq10b ↻ ≫
Slfn5 ↻ ≫
Dmap1 ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Itgb1 ↻ ≫
Pdap1 ↻ ≫
Bud31 ↻ ≫
Mpp7 ↻ ≫
Gm5737 ↻ ≫
Cox18 ↻ ≫
Atad2b ↻ ≫
Ubxn2a ↻ ≫
Mpv17l2 ↻ ≫
Jun ↻ ≫
Rab3a ↻ ≫
Mlf1 ↻ ≫
Syne3 ↻ ≫
Gale ↻ ≫
Klf2 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
H1f6 ↻ ≫
Lypla2 ↻ ≫
Tbx3 ↻ ≫
Fscn1 ↻ ≫
Afap1l1 ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Itpkb ↻ ≫
Ociad1 ↻ ≫
Srsf3 ↻ ≫
Gpd2 ↻ ≫
Cacybp ↻ ≫
Lamb2 ↻ ≫
Sumo3 ↻ ≫
Ube2g2 ↻ ≫
Dyrk1b ↻ ≫
Ctla2b ↻ ≫
Fbl ↻ ≫
Tpbpb ↻ ≫
Tbkbp1 ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Trmt61a ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Mturn ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Hspa4 ↻ ≫
Hip1 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Kmt2a ↻ ≫
Rab11fip3 ↻ ≫
Gorasp2 ↻ ≫
Cfap97 ↻ ≫
Polr2f ↻ ≫
1700088E04Rik ↻ ≫
Acsl1 ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
Sphk2 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Cfap20 ↻ ≫
Arhgap31 ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Car11 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Kif3b ↻ ≫
Zglp1 ↻ ≫
Jarid2 ↻ ≫
Stam ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
Rbsn ↻ ≫
Tek ↻ ≫
Baalc ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Chaf1a ↻ ≫
Slc35b2 ↻ ≫
Hsp90ab1 ↻ ≫
Nfkbie ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
Mafk ↻ ≫
Gcn1 ↻ ≫
Rplp0 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Wwp2 ↻ ≫
Prok1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Thumpd3 ↻ ≫
Rin3 ↻ ≫
Tie1 ↻ ≫
Hoxa4 ↻ ≫
Snrpa ↻ ≫
BC024978 ↻ ≫
Vamp2 ↻ ≫
Ubl3 ↻ ≫
Gtf2b ↻ ≫
Per1 ↻ ≫
Hhatl ↻ ≫
Abhd11 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Zer1 ↻ ≫
Tbc1d13 ↻ ≫
Aggf1 ↻ ≫
Scarf1 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Fam227b ↻ ≫
Dtwd1 ↻ ≫
Acp2 ↻ ≫
Nr1h3 ↻ ≫
Esyt2 ↻ ≫
Scgb1a1 ↻ ≫
Xiap ↻ ≫
Vhl ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Clpp ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Gle1 ↻ ≫
Ublcp1 ↻ ≫
Slc26a1 ↻ ≫
Ulk2 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
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