ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX9843668 | Lung cancer
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

◢ SRX14674622: Brown adipose tissue

◢ SRX14674623: Brown adipose tissue

◢ SRX14674624: Brown adipose tissue

◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

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◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

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◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375610: Liver

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◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543271: Liver

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◢ SRX997770: Liver

◢ SRX997771: Liver

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◢ SRX997773: Liver

◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◣ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Nr4a1 ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Kcnn1 ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Ap3d1 ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Mefv ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Kctd11 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Cd5 ↻ ≫
Snap47 ↻ ≫
Jmjd4 ↻ ≫
Tcstv3 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Cdk18 ↻ ≫
Tmprss11f ↻ ≫
Tmem179 ↻ ≫
Nnat ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Hif1a ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Etnk2 ↻ ≫
Pmm1 ↻ ≫
Iffo2 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Pycr2 ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Gstp1 ↻ ≫
Gstp2 ↻ ≫
Setx ↻ ≫
Lss ↻ ≫
Apon ↻ ≫
Polr3h ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Tm2d1 ↻ ≫
Lmna ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Plek2 ↻ ≫
Brpf1 ↻ ≫
Sim2 ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Fam180a ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
4933428G20Rik ↻ ≫
Sparc ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Per3 ↻ ≫
Zfp105 ↻ ≫
Zfp706 ↻ ≫
Gip ↻ ≫
Atf3 ↻ ≫
Xrcc1 ↻ ≫
Pinlyp ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Opa3 ↻ ≫
Irgq ↻ ≫
Ubtd1 ↻ ≫
Mms19 ↻ ≫
Lax1 ↻ ≫
Etfa ↻ ≫
1700034I23Rik ↻ ≫
Abhd18 ↻ ≫
Bcl3 ↻ ≫
Fosb ↻ ≫
Hagh ↻ ≫
Fahd1 ↻ ≫
Dab2ip ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Herpud1 ↻ ≫
Kif5c ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
Actn4 ↻ ≫
Arih2 ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Snx5 ↻ ≫
Mgme1 ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Rhov ↻ ≫
Morn4 ↻ ≫
Pacsin2 ↻ ≫
Frat2 ↻ ≫
Lsm14b ↻ ≫
Adgrg3 ↻ ≫
Gm14137 ↻ ≫
Gchfr ↻ ≫
Pan2 ↻ ≫
Il23a ↻ ≫
Fxr2 ↻ ≫
Supt4a ↻ ≫
Ifi204 ↻ ≫
Eci2 ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
St3gal2 ↻ ≫
Ndufb8 ↻ ≫
Hif1an ↻ ≫
Slc25a25 ↻ ≫
Naif1 ↻ ≫
Tcf4 ↻ ≫
Brms1 ↻ ≫
Rin1 ↻ ≫
Gabarapl2 ↻ ≫
Tmem231 ↻ ≫
Ms4a15 ↻ ≫
Eif4b ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Tmcc3 ↻ ≫
Ell3 ↻ ≫
Serinc4 ↻ ≫
Serf2 ↻ ≫
Hypk ↻ ≫
Anxa6 ↻ ≫
Btbd16 ↻ ≫
P2rx7 ↻ ≫
Inpp5e ↻ ≫
Gga1 ↻ ≫
Zfp213 ↻ ≫
Gm29733 ↻ ≫
Ncapg2 ↻ ≫
Phldb2 ↻ ≫
Tmprss4 ↻ ≫
Puf60 ↻ ≫
Rab8a ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
H2-K1 ↻ ≫
Eid2 ↻ ≫
Hilpda ↻ ≫
Glis2 ↻ ≫
Fam71f2 ↻ ≫
Zbtb10 ↻ ≫
Rer1 ↻ ≫
Morn1 ↻ ≫
Cables2 ↻ ≫
Fer1l6 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
1810058I24Rik ↻ ≫
Mks1 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Frmd8 ↻ ≫
Prss8 ↻ ≫
Bach1 ↻ ≫
Sema3e ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Rab3gap2 ↻ ≫
Ndufv1 ↻ ≫
Doc2g ↻ ≫
Lipe ↻ ≫
Dus2 ↻ ≫
Ddx28 ↻ ≫
Flt4 ↻ ≫
Adgre5 ↻ ≫
Ocstamp ↻ ≫
Rps16 ↻ ≫
Krt88 ↻ ≫
Krt81 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Csad ↻ ≫
Zfp740 ↻ ≫
Prr5 ↻ ≫
Ankrd1 ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Prr13 ↻ ≫
Faf1 ↻ ≫
Cdkn2c ↻ ≫
Cyp19a1 ↻ ≫
Ifnlr1 ↻ ≫
9430069I07Rik ↻ ≫
1110002E22Rik ↻ ≫
Mrpl45 ↻ ≫
Ccnt1 ↻ ≫
4930415O20Rik ↻ ≫
Kank3 ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Txndc5 ↻ ≫
Asb5 ↻ ≫
Tbc1d31 ↻ ≫
Echdc3 ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Clpp ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Synpo ↻ ≫
Cbl ↻ ≫
Hsp90aa1 ↻ ≫
Ccdc153 ↻ ≫
Nolc1 ↻ ≫
Nptxr ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Abhd11 ↻ ≫
Ppp1r11 ↻ ≫
Rnf39 ↻ ≫
Sfr1 ↻ ≫
Seh1l ↻ ≫
Cltb ↻ ≫
Prl2c2 ↻ ≫
Slc35f6 ↻ ≫
Actg1 ↻ ≫
Fscn2 ↻ ≫
Man1b1 ↻ ≫
Setd1b ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Polr2e ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Scrt1 ↻ ≫
Dgat1 ↻ ≫
Tspan8 ↻ ≫
R3hdml ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Xpnpep3 ↻ ≫
St13 ↻ ≫
Prtg ↻ ≫
Dnajb7 ↻ ≫
Muc3 ↻ ≫
Acer3 ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Tcte3 ↻ ≫
Ermard ↻ ≫
Htra3 ↻ ≫
Mbtps1 ↻ ≫
Il1rap ↻ ≫
Ctdsp1 ↻ ≫
Ptp4a2 ↻ ≫
Polk ↻ ≫
Cert1 ↻ ≫
Cxcl17 ↻ ≫
Ankrd40 ↻ ≫
Cyrib ↻ ≫
Mall ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Tmem229b ↻ ≫
Tctex1d4 ↻ ≫
Btbd19 ↻ ≫
Cxcl10 ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Lpcat4 ↻ ≫
Otud1 ↻ ≫
Ndrg1 ↻ ≫
Fcho2 ↻ ≫
Gtf2f1 ↻ ≫
1700001K19Rik ↻ ≫
Cd2ap ↻ ≫
Hyal1 ↻ ≫
Cfap20 ↻ ≫
Hyal3 ↻ ≫
Naa80 ↻ ≫
Hyal2 ↻ ≫
Map3k20 ↻ ≫
Flrt1 ↻ ≫
Gprc5a ↻ ≫
Prl2c4 ↻ ≫
Prl2c3 ↻ ≫
Cops6 ↻ ≫
Zfp113 ↻ ≫
Proc ↻ ≫
Nr4a2 ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Mcrs1 ↻ ≫
Limk1 ↻ ≫
Nol12 ↻ ≫
Lgals1 ↻ ≫
Amhr2 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Tspan31 ↻ ≫
Marchf9 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Tns1 ↻ ≫
Rufy4 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
5031439G07Rik ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Pold3 ↻ ≫
Abcg1 ↻ ≫
Phykpl ↻ ≫
Ncaph2 ↻ ≫
Lmf2 ↻ ≫
Padi1 ↻ ≫
Plekhf2 ↻ ≫
Ppia ↻ ≫
Pabpc1 ↻ ≫
Naa40 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Gxylt1 ↻ ≫
Lman1l ↻ ≫
Scaf11 ↻ ≫
Ptges ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Map3k12 ↻ ≫
Tarbp2 ↻ ≫
Npff ↻ ≫
Krtap1-5 ↻ ≫
Krtap1-4 ↻ ≫
Krtap1-3 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Anapc15 ↻ ≫
Zfp623 ↻ ≫
Fam107b ↻ ≫
Dst ↻ ≫
Bend6 ↻ ≫
Hspa9 ↻ ≫
Rnf166 ↻ ≫
Ctu2 ↻ ≫
Numbl ↻ ≫
Dusp18 ↻ ≫
4921536K21Rik ↻ ≫
Bcas3 ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Sqstm1 ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Akap1 ↻ ≫
Lin54 ↻ ≫
Shfl ↻ ≫
Ppan ↻ ≫
Angptl6 ↻ ≫
Sgk2 ↻ ≫
Zbed4 ↻ ≫
Hinfp ↻ ≫
Srebf2 ↻ ≫
Ttc26 ↻ ≫
Rhbdl2 ↻ ≫
Gpbp1 ↻ ≫
Rab7b ↻ ≫
Edrf1 ↻ ≫
Cnih1 ↻ ≫
Klk9 ↻ ≫
Klk10 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Klk8 ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
Kcnk6 ↻ ≫
Ep400 ↻ ≫
Pus1 ↻ ≫
2200002D01Rik ↻ ≫
Zyx ↻ ≫
Orc4 ↻ ≫
Mbd5 ↻ ≫
Creb3l3 ↻ ≫
Fam32a ↻ ≫
Cib3 ↻ ≫
Map2k2 ↻ ≫
Fbxo31 ↻ ≫
Tsku ↻ ≫
Ncor2 ↻ ≫
Msl1 ↻ ≫
Gm3776 ↻ ≫
Tomm40 ↻ ≫
Nrxn1 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Strada ↻ ≫
Kdm2a ↻ ≫
Ngf ↻ ≫
Myd88 ↻ ≫
Acaa1a ↻ ≫
Exoc3l ↻ ≫
E2f4 ↻ ≫
4931428F04Rik ↻ ≫
Krt13 ↻ ≫
Krt36 ↻ ≫
H2-L ↻ ≫
H2-D1 ↻ ≫
Vgll4 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Dph5 ↻ ≫
Paqr5 ↻ ≫
Spen ↻ ≫
Fam160b1 ↻ ≫
Irf2bpl ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Sirt6 ↻ ≫
Kat6a ↻ ≫
Uqcc2 ↻ ≫
Tff1 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Bax ↻ ≫
Il17ra ↻ ≫
Tmem65 ↻ ≫
Kng2 ↻ ≫
Bcl2l13 ↻ ≫
Ank1 ↻ ≫
Gm33887 ↻ ≫
Calcb ↻ ≫
Prss30 ↻ ≫
Yipf2 ↻ ≫
Timm29 ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
Aqp3 ↻ ≫
Bmper ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Klhl9 ↻ ≫
Arid2 ↻ ≫
Ldlr ↻ ≫
1700029I15Rik ↻ ≫
Pex16 ↻ ≫
Large2 ↻ ≫
Gal ↻ ≫
Aspa ↻ ≫
Spata22 ↻ ≫
Sh3bp2 ↻ ≫
Tom1l2 ↻ ≫
Drc3 ↻ ≫
Hic2 ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Acvr1b ↻ ≫
Cars ↻ ≫
Ccn6 ↻ ≫
Wdyhv1 ↻ ≫
Atad2 ↻ ≫
Metap1 ↻ ≫
Tmem63a ↻ ≫
Arid5a ↻ ≫
Als2cl ↻ ≫
Tmie ↻ ≫
Fbrsl1 ↻ ≫
Ap5b1 ↻ ≫
Ovol1 ↻ ≫
Naa11 ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Gsg1 ↻ ≫
Sptan1 ↻ ≫
Sult1a1 ↻ ≫
Sh2d5 ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Ppp2ca ↻ ≫
Ier3 ↻ ≫
Flot1 ↻ ≫
Elovl5 ↻ ≫
Cox18 ↻ ≫
Tnfaip8 ↻ ≫
Chrac1 ↻ ≫
Mplkip ↻ ≫
Trim37 ↻ ≫
Efcab5 ↻ ≫
Drap1 ↻ ≫
AI837181 ↻ ≫
Prr7 ↻ ≫
Nrbp2 ↻ ≫
Usp53 ↻ ≫
Mfap3l ↻ ≫
Sbno2 ↻ ≫
Grk2 ↻ ≫
Syngap1 ↻ ≫
Phf1 ↻ ≫
Cuta ↻ ≫
Fbxl13 ↻ ≫
Armc10 ↻ ≫
Slc25a24 ↻ ≫
Micall1 ↻ ≫
Creld2 ↻ ≫
Alg12 ↻ ≫
Adprh ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Zfp821 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Elp5 ↻ ≫
Ctdnep1 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Slc39a1 ↻ ≫
Trir ↻ ≫
Tnpo2 ↻ ≫
Cd80 ↻ ≫
Tmco4 ↻ ≫
Rnf186 ↻ ≫
Unk ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Get3 ↻ ≫
Rnf38 ↻ ≫
Btg2 ↻ ≫
Aspscr1 ↻ ≫
Siglecg ↻ ≫
Snx15 ↻ ≫
Sac3d1 ↻ ≫
Wdr60 ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Thumpd3 ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
Pcf11 ↻ ≫
Noc4l ↻ ≫
Ddx51 ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Baiap2 ↻ ≫
Hspa4 ↻ ≫
Vapa ↻ ≫
Cep170 ↻ ≫
Sdccag8 ↻ ≫
Rrm2b ↻ ≫
Hip1r ↻ ≫
Rufy1 ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Pofut2 ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Tbc1d14 ↻ ≫
Rac1 ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Tnfrsf26 ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Mapkapk3 ↻ ≫
Zfp119b ↻ ≫
Ebi3 ↻ ≫
Cish ↻ ≫
Bnip3l ↻ ≫
Ppp1r15a ↻ ≫
Plekha4 ↻ ≫
Fam71f1 ↻ ≫
Zfp511 ↻ ≫
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Gnas ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Zbtb4 ↻ ≫
Serinc3 ↻ ≫
Sra1 ↻ ≫
Slc35a4 ↻ ≫
Apbb3 ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Acot1 ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Chaf1a ↻ ≫
Mvd ↻ ≫
Fzr1 ↻ ≫
Dohh ↻ ≫
Prdx1 ↻ ≫
Uqcc3 ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Usp36 ↻ ≫
Ticam1 ↻ ≫
P2ry14 ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Cd109 ↻ ≫
Sprr1a ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Ppp1ca ↻ ≫
Mief1 ↻ ≫
Gpaa1 ↻ ≫
Exosc4 ↻ ≫
Rtn4 ↻ ≫
Ulbp1 ↻ ≫
Nudt9 ↻ ≫
Tcam1 ↻ ≫
Smarcd2 ↻ ≫
Tcim ↻ ≫
Ccl20 ↻ ≫
Col6a3 ↻ ≫
Tmco6 ↻ ≫
Cd14 ↻ ≫
Dok3 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Ndufa2 ↻ ≫
Ik ↻ ≫
Hspbp1 ↻ ≫
Brsk1 ↻ ≫
Pdgfb ↻ ≫
Cep63 ↻ ≫
Anapc13 ↻ ≫
Pcbp3 ↻ ≫
Dusp7 ↻ ≫
Emp1 ↻ ≫
Rela ↻ ≫
Vapb ↻ ≫
Zswim4 ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Mrpl24 ↻ ≫
Tmem107 ↻ ≫
Hdgf ↻ ≫
Rab21 ↻ ≫
Nol8 ↻ ≫
Cenpp ↻ ≫
Rab33b ↻ ≫
Traf1 ↻ ≫
Ogfod3 ↻ ≫
Hexdc ↻ ≫
Hipk2 ↻ ≫
Ccdc84 ↻ ≫
Ube4b ↻ ≫
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