ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1668642 | Quadriceps Muscle
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

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◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

◢ SRX100293: Liver

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◢ SRX2039596: Liver

◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

◢ SRX206481: Liver

◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

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◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543271: Liver

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◢ SRX997770: Liver

◢ SRX997771: Liver

◢ SRX997772: Liver

◢ SRX997773: Liver

◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◣ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Atp6v0c ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Hexa ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Tcstv3 ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Mfsd1 ↻ ≫
Mcoln1 ↻ ≫
Dpp7 ↻ ≫
Gba ↻ ≫
Zfp507 ↻ ≫
Phf23 ↻ ≫
Dvl2 ↻ ≫
Vps11 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Hoxa7 ↻ ≫
Hoxa3 ↻ ≫
Clcn7 ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Tpp1 ↻ ≫
Prr5l ↻ ≫
Commd9 ↻ ≫
Cln3 ↻ ≫
Apobr ↻ ≫
Bax ↻ ≫
Atp6v0b ↻ ≫
B4galt2 ↻ ≫
Dph2 ↻ ≫
Retreg2 ↻ ≫
Cnppd1 ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Osgep ↻ ≫
Apex1 ↻ ≫
Wdr81 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Agrp ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Marchf9 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
Ube2b ↻ ≫
Cdkl3 ↻ ≫
Atp6v1c1 ↻ ≫
Lsm12 ↻ ≫
G6pc3 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Atxn3 ↻ ≫
Nagpa ↻ ≫
Nup188 ↻ ≫
Dolk ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Commd4 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Hnrnph2 ↻ ≫
Gla ↻ ≫
Tnc ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Zfp142 ↻ ≫
Bcs1l ↻ ≫
Scamp3 ↻ ≫
Mthfr ↻ ≫
Clcn6 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Vps33a ↻ ≫
Uvrag ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Lztfl1 ↻ ≫
Kdm4c ↻ ≫
Marchf8 ↻ ≫
Thrap3 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Sgo1 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Rragc ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Natd1 ↻ ≫
Med28 ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
Sumf1 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Fam187a ↻ ≫
Eftud2 ↻ ≫
Ccdc103 ↻ ≫
Tbl1x ↻ ≫
Mtdh ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Ankrd12 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Ruvbl2 ↻ ≫
Gys1 ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Hivep2 ↻ ≫
Eif2s1 ↻ ≫
Atp6v1d ↻ ≫
Nup54 ↻ ≫
Stmn4 ↻ ≫
Zmym6 ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Cradd ↻ ≫
Ctsd ↻ ≫
Dus1l ↻ ≫
E030018B13Rik ↻ ≫
Mettl25 ↻ ≫
Ccdc59 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Ntf5 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Tchp ↻ ≫
Pip4p1 ↻ ≫
Adcy7 ↻ ≫
Tex14 ↻ ≫
Stat3 ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Ehd2 ↻ ≫
Zfp672 ↻ ≫
Sh3bp5l ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Pak4 ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Dusp7 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Taf12 ↻ ≫
Igf2r ↻ ≫
Ltbp4 ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Serinc3 ↻ ≫
Prss52 ↻ ≫
Grn ↻ ≫
Sgta ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Arid5a ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Amotl2 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Taco1 ↻ ≫
Wsb1 ↻ ≫
Nfat5 ↻ ≫
Akt1 ↻ ≫
Fbxo48 ↻ ≫
Ptp4a3 ↻ ≫
Gadd45a ↻ ≫
Cd63 ↻ ≫
Gorab ↻ ≫
Phf14 ↻ ≫
Ndufa4 ↻ ≫
Zfp474 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Smarcd2 ↻ ≫
Tcam1 ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Zfp655 ↻ ≫
Tmem182 ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
Trpm7 ↻ ≫
Adh1 ↻ ≫
Nrbf2 ↻ ≫
Pex3 ↻ ≫
Adat2 ↻ ≫
Kctd5 ↻ ≫
Mrln ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Prkag2 ↻ ≫
Acin1 ↻ ≫
1700123O20Rik ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Smad7 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Slbp ↻ ≫
Kcna5 ↻ ≫
Mmp28 ↻ ≫
Atp6v1h ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Abhd4 ↻ ≫
Dad1 ↻ ≫
Lrrc8a ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Arid1a ↻ ≫
Rab33b ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Rdh5 ↻ ≫
Bloc1s1 ↻ ≫
Chac1 ↻ ≫
Ndufs4 ↻ ≫
Top3a ↻ ≫
Smcr8 ↻ ≫
Prex2 ↻ ≫
Zfyve16 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Pomp ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Akt2 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Ipo13 ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
Pdk4 ↻ ≫
Srsf7 ↻ ≫
Evi5 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Tnfaip1 ↻ ≫
P4ha1 ↻ ≫
Rab11b ↻ ≫
Rps23 ↻ ≫
2410002F23Rik ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Ryr1 ↻ ≫
Zhx3 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Gm20594 ↻ ≫
Dchs2 ↻ ≫
Gm10710 ↻ ≫
Mvd ↻ ≫
Mrpl12 ↻ ≫
Khdrbs1 ↻ ≫
Shpk ↻ ≫
Ctns ↻ ≫
Tab1 ↻ ≫
Dcp1a ↻ ≫
Ccar2 ↻ ≫
Egfl7 ↻ ≫
Sh2d4b ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Tnpo2 ↻ ≫
Gm13290 ↻ ≫
Gm13289 ↻ ≫
Usp3 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Polr2l ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Chordc1 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Elf1 ↻ ≫
Wbp4 ↻ ≫
Mob4 ↻ ≫
Dmwd ↻ ≫
Klf15 ↻ ≫
Nvl ↻ ≫
Cdc14a ↻ ≫
Rsad2 ↻ ≫
Trp53rkb ↻ ≫
Shoc2 ↻ ≫
Bbip1 ↻ ≫
Lztr1 ↻ ≫
Shank3 ↻ ≫
Ppp2r5a ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Vps13d ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
Lnx1 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Arhgef37 ↻ ≫
Hspb1 ↻ ≫
Creb1 ↻ ≫
Akap7 ↻ ≫
Tmem86a ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
Rgcc ↻ ≫
Cd93 ↻ ≫
Polr3b ↻ ≫
Tmem216 ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Mbnl1 ↻ ≫
Rmc1 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Ssrp1 ↻ ≫
P2rx3 ↻ ≫
Kat6b ↻ ≫
Hps1 ↻ ≫
Wdr92 ↻ ≫
Pno1 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Rasgrp3 ↻ ≫
Ankrd40 ↻ ≫
Snrnp27 ↻ ≫
Chchd2 ↻ ≫
Zbtb37 ↻ ≫
Fbxo42 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Sae1 ↻ ≫
Mrpl53 ↻ ≫
Kcnj12 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Actr3 ↻ ≫
Depp1 ↻ ≫
Fam149b ↻ ≫
Ecd ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Txlnb ↻ ≫
Acadm ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Gbp4 ↻ ≫
Yaf2 ↻ ≫
Sipa1 ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Arid2 ↻ ≫
Taf13 ↻ ≫
Ndufa5 ↻ ≫
Asb15 ↻ ≫
Phlda1 ↻ ≫
Nsun3 ↻ ≫
Mycbp2 ↻ ≫
Acyp2 ↻ ≫
Tnfrsf21 ↻ ≫
Myoc ↻ ≫
Coq10b ↻ ≫
Tor1aip2 ↻ ≫
Tor1aip1 ↻ ≫
Slfn5 ↻ ≫
Dmap1 ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Itgb1 ↻ ≫
Pdap1 ↻ ≫
Bud31 ↻ ≫
Mpp7 ↻ ≫
Cox18 ↻ ≫
Atad2b ↻ ≫
Jun ↻ ≫
Rab3a ↻ ≫
Mlf1 ↻ ≫
Gale ↻ ≫
Klf2 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
H1f6 ↻ ≫
Fscn1 ↻ ≫
Tbx3 ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Itpkb ↻ ≫
Cacybp ↻ ≫
Ociad1 ↻ ≫
Srsf3 ↻ ≫
Gpd2 ↻ ≫
Lamb2 ↻ ≫
Ctla2b ↻ ≫
Dyrk1b ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Tbkbp1 ↻ ≫
Mturn ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Hip1 ↻ ≫
Kmt2a ↻ ≫
Rab11fip3 ↻ ≫
Gorasp2 ↻ ≫
Cfap97 ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Arhgap31 ↻ ≫
Cfap20 ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Kif3b ↻ ≫
Jarid2 ↻ ≫
Stam ↻ ≫
Rbsn ↻ ≫
Baalc ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Chaf1a ↻ ≫
Slc35b2 ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Rplp0 ↻ ≫
Wwp2 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Thumpd3 ↻ ≫
Tie1 ↻ ≫
Hoxa4 ↻ ≫
Snrpa ↻ ≫
BC024978 ↻ ≫
Gtf2b ↻ ≫
Per1 ↻ ≫
Ubl3 ↻ ≫
Hhatl ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Tbc1d13 ↻ ≫
Abhd11 ↻ ≫
Scarf1 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Aggf1 ↻ ≫
Fam227b ↻ ≫
Dtwd1 ↻ ≫
Acp2 ↻ ≫
Esyt2 ↻ ≫
Xiap ↻ ≫
Vhl ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Ublcp1 ↻ ≫
Hes1 ↻ ≫
Hivep1 ↻ ≫
Ulk2 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Fnip2 ↻ ≫
Pmp22 ↻ ≫
Dync1li2 ↻ ≫
Hif3a ↻ ≫
Trim25 ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Klhl9 ↻ ≫
Uros ↻ ≫
Bccip ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Pde4b ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Rpl21 ↻ ≫
Zer1 ↻ ≫
Crebrf ↻ ≫
Vcl ↻ ≫
Srd5a1 ↻ ≫
Nsun2 ↻ ≫
Virma ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Hcar2 ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Zfp623 ↻ ≫
Rab11a ↻ ≫
Cited2 ↻ ≫
Rps7 ↻ ≫
Zfp868 ↻ ≫
Sec14l1 ↻ ≫
Zfp386 ↻ ≫
Lrr1 ↻ ≫
Snx12 ↻ ≫
Cd276 ↻ ≫
Rrn3 ↻ ≫
Rpl9 ↻ ≫
Lias ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Gabarap ↻ ≫
Cstf2t ↻ ≫
Ciart ↻ ≫
Por ↻ ≫
Il6ra ↻ ≫
Cox20 ↻ ≫
Casq1 ↻ ≫
Sh2d3c ↻ ≫
Pfkfb3 ↻ ≫
Trmt11 ↻ ≫
9930021J03Rik ↻ ≫
Klf6 ↻ ≫
Bicd2 ↻ ≫
Hif1a ↻ ≫
Mef2a ↻ ≫
Mars1 ↻ ≫
Slc10a6 ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Cep162 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Lims2 ↻ ≫
Usp48 ↻ ≫
Clec9a ↻ ≫
Cdk5rap1 ↻ ≫
Usp32 ↻ ≫
Fbxo31 ↻ ≫
Gorasp1 ↻ ≫
Ttc21a ↻ ≫
Gvin1 ↻ ≫
Gm4070 ↻ ≫
Agbl1 ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Camk2d ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Hlx ↻ ≫
Rpl15 ↻ ≫
Nkiras1 ↻ ≫
Ppp1r3c ↻ ≫
Il11ra2 ↻ ≫
Gm2002 ↻ ≫
Gm13305 ↻ ≫
LOC100861969 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Ifnar1 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Mcf2l ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Nabp1 ↻ ≫
Vps37b ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Ptcd2 ↻ ≫
Mrps27 ↻ ≫
Hdlbp ↻ ≫
Septin2 ↻ ≫
Slc2a4 ↻ ≫
Egr1 ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Rpl34-ps1 ↻ ≫
Rpl34 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Klhl18 ↻ ≫
Kif9 ↻ ≫
Hnrnpa3 ↻ ≫
Nudt9 ↻ ≫
Lair1 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Gatd3a ↻ ≫
Ccnl1 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Lipe ↻ ≫
Irgq ↻ ≫
Fam102b ↻ ≫
Srsf4 ↻ ≫
Tbck ↻ ≫
Aimp1 ↻ ≫
Spaca6 ↻ ≫
Myot ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Yars ↻ ≫
S100pbp ↻ ≫
Mrpl11 ↻ ≫
Isoc2a ↻ ≫
Mafa ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Dnajc16 ↻ ≫
Casp9 ↻ ≫
Tlr4 ↻ ≫
Bsdc1 ↻ ≫
Trmt61a ↻ ≫
Rnf14 ↻ ≫
Chrdl2 ↻ ≫
St3gal6 ↻ ≫
Pla2g6 ↻ ≫
Irf9 ↻ ≫
Zfat ↻ ≫
Washc5 ↻ ≫
Nsmce2 ↻ ≫
Arl2 ↻ ≫
Sra1 ↻ ≫
Rasal2 ↻ ≫
Chd8 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Lalba ↻ ≫
Mknk2 ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Bcl10 ↻ ≫
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Ddost ↻ ≫
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