ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1722787 | Hippocampus
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674624: Brown adipose tissue

◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

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◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

◢ SRX1722785: Hippocampus

◣ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

◢ SRX100293: Liver

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◢ SRX2039596: Liver

◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375598: Liver

◢ SRX2375599: Liver

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◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

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◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543271: Liver

◢ SRX5543272: Liver

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◢ SRX997770: Liver

◢ SRX997771: Liver

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◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Ilf3 ↻ ≫
Atp6v0c ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Mfsd1 ↻ ≫
Hexa ↻ ≫
Tcstv3 ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Dpp7 ↻ ≫
Atp6v0b ↻ ≫
B4galt2 ↻ ≫
Dph2 ↻ ≫
Atxn3 ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Spata25 ↻ ≫
Ankrd12 ↻ ≫
Marchf9 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Bax ↻ ≫
Zmym6 ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Phf23 ↻ ≫
Dvl2 ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Kdm4c ↻ ≫
Zfp507 ↻ ≫
Clcn7 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Rragc ↻ ≫
Igf2r ↻ ≫
Vps11 ↻ ≫
Osgep ↻ ≫
Apex1 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Atp6v1c1 ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
Pip4p1 ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
Tpp1 ↻ ≫
Mcoln1 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Hps1 ↻ ≫
P2rx7 ↻ ≫
Wdr81 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Zfp710 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Gns ↻ ≫
Mthfr ↻ ≫
Clcn6 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Sppl3 ↻ ≫
Agrp ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Hps5 ↻ ≫
Gtf2h1 ↻ ≫
Gba ↻ ≫
Dnajc13 ↻ ≫
Zfp607b ↻ ≫
Nudt9 ↻ ≫
Cln3 ↻ ≫
Apobr ↻ ≫
Rcbtb1 ↻ ≫
Supt4a ↻ ≫
Mtdh ↻ ≫
Nfia ↻ ≫
Tom1 ↻ ≫
Ube2b ↻ ≫
Cdkl3 ↻ ≫
Ctsd ↻ ≫
Sumf1 ↻ ≫
Cbr3 ↻ ≫
Lztfl1 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Scyl1 ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
Med28 ↻ ≫
Uvrag ↻ ≫
Nup188 ↻ ≫
Dolk ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
AW549877 ↻ ≫
Syngap1 ↻ ≫
Cuta ↻ ≫
Cep162 ↻ ≫
Nagpa ↻ ≫
Stau2 ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Orai2 ↻ ≫
Cops7a ↻ ≫
Thrap3 ↻ ≫
Trpm7 ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Galm ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Wipf2 ↻ ≫
Natd1 ↻ ≫
Adnp2 ↻ ≫
Gtf2a1 ↻ ≫
Retreg2 ↻ ≫
Cnppd1 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Washc5 ↻ ≫
Nsmce2 ↻ ≫
Rnasek ↻ ≫
0610010K14Rik ↻ ≫
4932438H23Rik ↻ ≫
Zfp655 ↻ ≫
Vps33a ↻ ≫
Crebrf ↻ ≫
Prr5l ↻ ≫
Commd9 ↻ ≫
Commd4 ↻ ≫
Khdrbs1 ↻ ≫
Atp6v1h ↻ ≫
Gpr19 ↻ ≫
Srek1 ↻ ≫
Dchs2 ↻ ≫
Dyrk1b ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Slc25a44 ↻ ≫
Grn ↻ ≫
Ccnyl1 ↻ ≫
Scamp3 ↻ ≫
Lamtor4 ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Cttnbp2nl ↻ ≫
Ccdc9 ↻ ≫
Top3a ↻ ≫
Smcr8 ↻ ≫
Tnpo1 ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Crebzf ↻ ≫
Vamp3 ↻ ≫
Pcdh17 ↻ ≫
Arid1b ↻ ≫
Senp7 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Gabarap ↻ ≫
Tdrd1 ↻ ≫
Ccdc186 ↻ ≫
Wdsub1 ↻ ≫
Gria1 ↻ ≫
Supv3l1 ↻ ≫
Rdh5 ↻ ≫
Bloc1s1 ↻ ≫
Txlna ↻ ≫
Sgo1 ↻ ≫
Ubn1 ↻ ≫
Glyr1 ↻ ≫
Ubap2l ↻ ≫
4933434E20Rik ↻ ≫
Slitrk3 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Sgta ↻ ≫
Gid4 ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Foxred2 ↻ ≫
Zfp119b ↻ ≫
Ctps ↻ ≫
Serf2 ↻ ≫
Nr1d2 ↻ ≫
Sorbs1 ↻ ≫
Psmc3 ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Cul5 ↻ ≫
Marchf8 ↻ ≫
Rmc1 ↻ ≫
Exd2 ↻ ≫
9130401M01Rik ↻ ≫
Pemt ↻ ≫
Gorasp1 ↻ ≫
Ttc21a ↻ ≫
Ypel5 ↻ ≫
Zfp84 ↻ ≫
Unc45a ↻ ≫
Hddc3 ↻ ≫
Ppp2r5c ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Prkar1b ↻ ≫
Dnaaf5 ↻ ≫
Rcc1l ↻ ≫
Shpk ↻ ≫
Ctns ↻ ≫
Myo5c ↻ ≫
Dcaf12 ↻ ≫
Rxrb ↻ ≫
H2-Ke6 ↻ ≫
Slc39a7 ↻ ≫
Ncl ↻ ≫
Sumo3 ↻ ≫
Dnajc11 ↻ ≫
Commd3 ↻ ≫
Bmi1 ↻ ≫
Zcchc9 ↻ ≫
Cand2 ↻ ≫
Arl2 ↻ ≫
Afg3l2 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Lipt2 ↻ ≫
Mrm3 ↻ ≫
Glod4 ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Elovl5 ↻ ≫
Tpcn2 ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Adam10 ↻ ≫
Npm1 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Smdt1 ↻ ≫
Pheta2 ↻ ≫
Tyr ↻ ≫
Tpt1 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Sae1 ↻ ≫
Zfp653 ↻ ≫
Ppp6r1 ↻ ≫
Ifrd1 ↻ ≫
Spg21 ↻ ≫
Map2k2 ↻ ≫
Snapin ↻ ≫
E4f1 ↻ ≫
Cry1 ↻ ≫
Polr3d ↻ ≫
Cpne4 ↻ ≫
Hif1a ↻ ≫
A430005L14Rik ↻ ≫
Tef ↻ ≫
Cdk19 ↻ ≫
Creb1 ↻ ≫
Phf20 ↻ ≫
Gjc1 ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Hsp90aa1 ↻ ≫
Safb2 ↻ ≫
Safb ↻ ≫
Ppp1r32 ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Slc35b2 ↻ ≫
Neu1 ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Pofut2 ↻ ≫
Lrrc36 ↻ ≫
Kctd19 ↻ ≫
Dnajc16 ↻ ≫
Casp9 ↻ ≫
Dgat2 ↻ ≫
Scrt2 ↻ ≫
Cluh ↻ ≫
Tbcel ↻ ≫
Siah2 ↻ ≫
Cep192 ↻ ≫
Khdc4 ↻ ≫
Slc15a4 ↻ ≫
Esco1 ↻ ≫
Rida ↻ ≫
Pop1 ↻ ≫
Immt ↻ ≫
Tmem41b ↻ ≫
Rbm14 ↻ ≫
Gm21992 ↻ ≫
Mapk8ip3 ↻ ≫
Tmem59l ↻ ≫
Stt3b ↻ ≫
Serpinb6a ↻ ≫
Ripk1 ↻ ≫
Hpf1 ↻ ≫
Fam13b ↻ ≫
Hnrnpl ↻ ≫
Mrpl2 ↻ ≫
Klc4 ↻ ≫
Cul7 ↻ ≫
Mcph1 ↻ ≫
Dpp6 ↻ ≫
Abcf1 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Heatr4 ↻ ≫
Acot2 ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Eif2s1 ↻ ≫
Atp6v1d ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Susd6 ↻ ≫
Rheb ↻ ≫
Chrac1 ↻ ≫
Ino80e ↻ ≫
Hirip3 ↻ ≫
Zbtb49 ↻ ≫
Lyar ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Tsg101 ↻ ≫
Rab8b ↻ ≫
Vps37a ↻ ≫
Cnot7 ↻ ≫
Mettl1 ↻ ≫
Eef1akmt3 ↻ ≫
Ddhd2 ↻ ≫
Armc9 ↻ ≫
Smarcd1 ↻ ≫
Gapvd1 ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Vapa ↻ ≫
Gm35339 ↻ ≫
Sharpin ↻ ≫
Maf1 ↻ ≫
Nup133 ↻ ≫
Gtf2ird2 ↻ ≫
Eif3b ↻ ≫
Mettl23 ↻ ≫
Rabl6 ↻ ≫
Hdhd5 ↻ ≫
Dap ↻ ≫
Ubtd1 ↻ ≫
Mms19 ↻ ≫
Phyhipl ↻ ≫
Snrpa ↻ ≫
BC024978 ↻ ≫
Kcnn1 ↻ ≫
Mrpl23 ↻ ≫
Zfp959 ↻ ≫
9230019H11Rik ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Med9 ↻ ≫
Qsox2 ↻ ≫
Hsdl1 ↻ ≫
Dnaaf1 ↻ ≫
Vac14 ↻ ≫
Zfp3 ↻ ≫
Zfp784 ↻ ≫
Zfp622 ↻ ≫
Morc2a ↻ ≫
Kif11 ↻ ≫
Tm9sf1 ↻ ≫
Ilf2 ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Hnrnph3 ↻ ≫
Stx4a ↻ ≫
Ppm1a ↻ ≫
Idh2 ↻ ≫
Prep ↻ ≫
Akap10 ↻ ≫
Wipi2 ↻ ≫
Kansl2 ↻ ≫
Smim14 ↻ ≫
Ube2cbp ↻ ≫
Dop1a ↻ ≫
Cdc20 ↻ ≫
Ppia ↻ ≫
Sec24c ↻ ≫
Slc26a2 ↻ ≫
Per2 ↻ ≫
Cutc ↻ ≫
Cox15 ↻ ≫
Uba6 ↻ ≫
Ccdc171 ↻ ≫
H2bc12 ↻ ≫
H2ac12 ↻ ≫
Arcn1 ↻ ≫
Setx ↻ ≫
Vps26c ↻ ≫
Rpn1 ↻ ≫
Ndel1 ↻ ≫
Ptdss1 ↻ ≫
Mterf3 ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Psme3 ↻ ≫
Slc30a9 ↻ ≫
Fem1b ↻ ≫
Tent4a ↻ ≫
Cfap74 ↻ ≫
Tra2b ↻ ≫
Cbx1 ↻ ≫
Zfp672 ↻ ≫
Rab1a ↻ ≫
Gabra1 ↻ ≫
Nagk ↻ ≫
Ssr1 ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Zfp513 ↻ ≫
Map3k12 ↻ ≫
Tarbp2 ↻ ≫
Eef1e1 ↻ ≫
Rgs7 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Senp8 ↻ ≫
Myo9a ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Cacul1 ↻ ≫
Necap1 ↻ ≫
Slbp ↻ ≫
Cc2d1b ↻ ≫
Pdlim7 ↻ ≫
Fam118a ↻ ≫
Tubb4b ↻ ≫
Mfsd5 ↻ ≫
Alas1 ↻ ≫
Naa40 ↻ ≫
Ybx1 ↻ ≫
Tnpo2 ↻ ≫
Zfp428 ↻ ≫
Map9 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Ppif ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Arf6 ↻ ≫
Klhl12 ↻ ≫
Nsun6 ↻ ≫
Arl5b ↻ ≫
Slc5a6 ↻ ≫
Atraid ↻ ≫
Fbl ↻ ≫
Ciart ↻ ≫
Ptpa ↻ ≫
Crat ↻ ≫
Sart1 ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Csad ↻ ≫
Tbl1x ↻ ≫
Rsad2 ↻ ≫
Ptgds ↻ ≫
Paxip1 ↻ ≫
Smagp ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
Lrrc8d ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Lsm12 ↻ ≫
G6pc3 ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Zfp740 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Fcna ↻ ≫
St6gal1 ↻ ≫
Slc4a4 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Cyp26a1 ↻ ≫
Pdp2 ↻ ≫
Gbp7 ↻ ≫
Wdr89 ↻ ≫
Tmem171 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Gm19774 ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Polg ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Synpo ↻ ≫
Snx21 ↻ ≫
Syne3 ↻ ≫
Tmcc3 ↻ ≫
Mroh2a ↻ ≫
Nup62 ↻ ≫
Il4i1b ↻ ≫
Atf5 ↻ ≫
Ndst1 ↻ ≫
Adcy10 ↻ ≫
Agpat2 ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Insig2 ↻ ≫
Rhobtb1 ↻ ≫
A930033H14Rik ↻ ≫
Tubb2a ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Lrrc8a ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Dcaf1 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Id3 ↻ ≫
Gpx1 ↻ ≫
Sgms1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Rffl ↻ ≫
Fkbp8 ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Prkcsh ↻ ≫
Ccdc151 ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Gale ↻ ≫
Klf3 ↻ ≫
C3 ↻ ≫
Pdk4 ↻ ≫
Slc25a51 ↻ ≫
Sbno2 ↻ ≫
Dmwd ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Raet1d ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Sgk1 ↻ ≫
Inhbe ↻ ≫
Rnf141 ↻ ≫
Ifnar1 ↻ ≫
Fam71e1 ↻ ≫
Emc10 ↻ ≫
Ace3 ↻ ≫
Tmem53 ↻ ≫
Armh1 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Map4k4 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Cmip ↻ ≫
Klf2 ↻ ≫
Osgin1 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Septin9 ↻ ≫
Itih1 ↻ ≫
Irgm2 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Cbfa2t3 ↻ ≫
Rab5if ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Spop ↻ ≫
Myd88 ↻ ≫
Acaa1a ↻ ≫
Gas7 ↻ ≫
Plin2 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Tle1 ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Ccdc38 ↻ ≫
Amdhd1 ↻ ≫
Cbs ↻ ≫
Raet1e ↻ ≫
Ptpn12 ↻ ≫
Raet1c ↻ ≫
Raet1b ↻ ≫
Tymp ↻ ≫
Sco2 ↻ ≫
Cln8 ↻ ≫
Ormdl3 ↻ ≫
Mymx ↻ ≫
Rusc2 ↻ ≫
Lgals9 ↻ ≫
Tsr1 ↻ ≫
Sgsm2 ↻ ≫
Zfp719 ↻ ≫
Lpp ↻ ≫
Ctla2b ↻ ≫
Saa3 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Bcl3 ↻ ≫
Gbp10 ↻ ≫
Slc22a5 ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Ext1 ↻ ≫
Rps28 ↻ ≫
Ndufa7 ↻ ≫
Saraf ↻ ≫
Parvb ↻ ≫
Tmbim6 ↻ ≫
Nr0b2 ↻ ≫
2900026A02Rik ↻ ≫
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Por ↻ ≫
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