ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc1a

Query protein: Smc1a
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX17241119 | MEF
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc1a's Target genes

◢ Smc1a: Average

◢ SRX2599821: 3T3-L1

◢ SRX2599822: 3T3-L1

◢ SRX2599823: 3T3-L1

◢ SRX2599824: 3T3-L1

◢ SRX2599825: 3T3-L1

◢ SRX2599826: 3T3-L1

◢ SRX2599827: 3T3-L1

◢ SRX2599828: 3T3-L1

◢ SRX2599829: 3T3-L1

◢ SRX2599830: 3T3-L1

◢ SRX2957352: AtT-20

◢ SRX218284: B cells

◢ SRX218288: B cells

◢ SRX700951: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX700952: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348143: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348144: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348145: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348146: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX6988645: Cerebellum

◢ SRX6988646: Cerebellum

◢ SRX6988647: Cerebellum

◢ SRX6988648: Cerebellum

◢ SRX20793618: Cortical neuron

◢ SRX20793619: Cortical neuron

◢ SRX20793622: Cortical neuron

◢ SRX20793623: Cortical neuron

◢ SRX12601724: Dendritic Cells

◢ SRX12601725: Dendritic Cells

◢ SRX12601726: Dendritic Cells

◢ SRX12601727: Dendritic Cells

◢ SRX204343: Embryonic brains

◢ SRX4395347: Embryonic brains

◢ SRX4395356: Embryonic brains

◢ DRX021197: Embryonic head

◢ DRX021198: Embryonic limb

◢ SRX204337: Embryonic limb

◢ SRX204338: Embryonic limb

◢ SRX2440040: EpiSC

◢ SRX2440041: EpiSC

◢ SRX2440050: EpiSC

◢ SRX2440051: EpiSC

◢ SRX2440060: EpiSC

◢ SRX2440061: EpiSC

◢ SRX022688: ES cells

◢ SRX022689: ES cells

◢ SRX085109: ES cells

◢ SRX085110: ES cells

◢ SRX10560008: ES cells

◢ SRX10560009: ES cells

◢ SRX10560010: ES cells

◢ SRX10560011: ES cells

◢ SRX11237495: ES cells

◢ SRX11237501: ES cells

◢ SRX11237507: ES cells

◢ SRX11237513: ES cells

◢ SRX11237519: ES cells

◢ SRX11237525: ES cells

◢ SRX11237531: ES cells

◢ SRX11237537: ES cells

◢ SRX12204127: ES cells

◢ SRX12204128: ES cells

◢ SRX12204129: ES cells

◢ SRX12204130: ES cells

◢ SRX12204137: ES cells

◢ SRX12204138: ES cells

◢ SRX12204139: ES cells

◢ SRX12204140: ES cells

◢ SRX12204141: ES cells

◢ SRX12204142: ES cells

◢ SRX12204149: ES cells

◢ SRX12204150: ES cells

◢ SRX12204151: ES cells

◢ SRX12204152: ES cells

◢ SRX12204153: ES cells

◢ SRX12204154: ES cells

◢ SRX12963303: ES cells

◢ SRX13439102: ES cells

◢ SRX13439103: ES cells

◢ SRX13439104: ES cells

◢ SRX13439130: ES cells

◢ SRX17024519: ES cells

◢ SRX17024520: ES cells

◢ SRX17024521: ES cells

◢ SRX17024522: ES cells

◢ SRX2440036: ES cells

◢ SRX2440037: ES cells

◢ SRX2440070: ES cells

◢ SRX2440071: ES cells

◢ SRX2440080: ES cells

◢ SRX2440081: ES cells

◢ SRX3197475: ES cells

◢ SRX3197480: ES cells

◢ SRX4167137: ES cells

◢ SRX5088234: ES cells

◢ SRX5088236: ES cells

◢ SRX5125620: ES cells

◢ SRX5125624: ES cells

◢ SRX5401524: ES cells

◢ SRX5401525: ES cells

◢ SRX5401526: ES cells

◢ SRX5401527: ES cells

◢ SRX5401528: ES cells

◢ SRX5401529: ES cells

◢ SRX5436004: ES cells

◢ SRX5858855: ES cells

◢ SRX5858856: ES cells

◢ SRX5858857: ES cells

◢ SRX5858858: ES cells

◢ SRX6831866: ES cells

◢ SRX6831867: ES cells

◢ SRX7786279: ES cells

◢ SRX7786280: ES cells

◢ SRX7786281: ES cells

◢ SRX7786282: ES cells

◢ SRX3024490: Forelimb

◢ SRX8820366: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820367: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903169: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903170: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903174: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903175: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX2436121: Mammary glands

◢ SRX2564298: Mammary glands

◢ SRX2564307: Mammary glands

◢ SRX2564312: Mammary glands

◢ SRX2564313: Mammary glands

◢ SRX022702: MEF

◢ SRX022703: MEF

◢ SRX120168: MEF

◢ SRX120169: MEF

◢ SRX120170: MEF

◢ SRX17241102: MEF

◢ SRX17241103: MEF

◢ SRX17241104: MEF

◢ SRX17241105: MEF

◢ SRX17241107: MEF

◢ SRX17241108: MEF

◢ SRX17241109: MEF

◢ SRX17241110: MEF

◢ SRX17241113: MEF

◢ SRX17241114: MEF

◢ SRX17241115: MEF

◢ SRX17241116: MEF

◢ SRX17241117: MEF

◢ SRX17241118: MEF

◣ SRX17241119: MEF

◢ SRX17241120: MEF

◢ SRX17241123: MEF

◢ SRX17241125: MEF

◢ SRX976733: MEF

◢ SRX976734: MEF

◢ SRX5358275: mESCs, differentiated

◢ SRX5358276: mESCs, differentiated

◢ SRX5358277: mESCs, differentiated

◢ SRX5358278: mESCs, differentiated

◢ SRX5358279: mESCs, differentiated

◢ SRX5358280: mESCs, differentiated

◢ SRX125273: mESC derived neural cells

◢ SRX8693946: Neutrophils

◢ SRX8693947: Neutrophils

◢ SRX8693948: Neutrophils

◢ SRX8693949: Neutrophils

◢ SRX8693950: Neutrophils

◢ SRX8693951: Neutrophils

◢ SRX8694033: Neutrophils

◢ SRX8694034: Neutrophils

◢ SRX8694041: Neutrophils

◢ SRX8694042: Neutrophils

◢ SRX11169408: NIH/3T3

◢ SRX11169409: NIH/3T3

◢ SRX26175725: NIH/3T3

◢ SRX26175728: NIH/3T3

◢ SRX20340931: Pre-B cells

◢ SRX20340932: Pre-B cells

◢ SRX20340933: Pre-B cells

◢ SRX20340934: Pre-B cells

◢ SRX11169415: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169416: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169417: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169418: Scid.adh.2c2

◢ SRX1631901: Sperm

◢ SRX2370885: Sperm

◢ SRX7348141: Thymocytes

◢ SRX7348142: Thymocytes

◢ SRX4546348: Trophoblast stem cells

◢ SRX4546349: Trophoblast stem cells

◢ SRX1306535: T cells

◢ SRX5318290: Uterus

◢ SRX5318291: Uterus

◢ SRX5318292: Uterus

◢ Smc1a: STRING
Tcstv3 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Hcn1 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
Carmil1 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Neil2 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Lrrc24 ↻ ≫
C030006K11Rik ↻ ≫
Tmem250-ps ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Kcnma1 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Unc5b ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Rpl7 ↻ ≫
Rdh10 ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Hipk4 ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Ehmt1 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Crym ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Nxph3 ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
P2rx6 ↻ ≫
Lrrc74b ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Dact2 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Pcp4 ↻ ≫
Itga9 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Gnptab ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Tmem211 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Ccl1 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
Ifitm3 ↻ ≫
Smim24 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
1600014C23Rik ↻ ≫
Irs2 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Cav1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Rnf215 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Plbd2 ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Ppy ↻ ≫
Pyy ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Ppfibp2 ↻ ≫
Tekt4 ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Mecr ↻ ≫
Cd300lg ↻ ≫
Rprm ↻ ≫
Nppc ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Fzd8 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Dpys ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Igsf8 ↻ ≫
Gnat1 ↻ ≫
Igf1r ↻ ≫
H2-T23 ↻ ≫
Wnt11 ↻ ≫
Gata3 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Bin3 ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Cyp26b1 ↻ ≫
S1pr4 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Syngr1 ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Rex1bd ↻ ≫
Bambi ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Tspan32 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Mmp17 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Neto2 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Ficd ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Dusp8 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Endou ↻ ≫
Ms4a6d ↻ ≫
Prkrip1 ↻ ≫
Apbb2 ↻ ≫
Lrrc8c ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
Pnliprp2 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Cntnap1 ↻ ≫
Ccr10 ↻ ≫
Plekhh3 ↻ ≫
Mfhas1 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Trappc3l ↻ ≫
Zfp653 ↻ ≫
Alpi ↻ ≫
Csf2 ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Sema5a ↻ ≫
Erp27 ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Ccnd1 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Slit3 ↻ ≫
Tpbgl ↻ ≫
Endov ↻ ≫
Ddx24 ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
4930558K02Rik ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Slc45a1 ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Bcr ↻ ≫
Clec1b ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Ifi30 ↻ ≫
Slc52a3 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Upk3bl ↻ ≫
Ubr4 ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Car2 ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Timp3 ↻ ≫
Pmp22 ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Lrrc51 ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Adgrb1 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Arhgap27 ↻ ≫
Myo15b ↻ ≫
Ctrl ↻ ≫
Gm3336 ↻ ≫
Pde4c ↻ ≫
Prss35 ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Spry2 ↻ ≫
Ackr3 ↻ ≫
Ttpal ↻ ≫
Cmtm5 ↻ ≫
Exoc3l4 ↻ ≫
Myoz3 ↻ ≫
Trpc4ap ↻ ≫
Adat1 ↻ ≫
Cep43 ↻ ≫
Garem1 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Plxna1 ↻ ≫
Zfp334 ↻ ≫
Gimap3 ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Cldn1 ↻ ≫
Tmem221 ↻ ≫
Nxnl1 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Col26a1 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Nkx3-2 ↻ ≫
Tmem167b ↻ ≫
Ercc1 ↻ ≫
Fbxo7 ↻ ≫
Smco4 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Tm4sf5 ↻ ≫
Rasgef1c ↻ ≫
Elovl3 ↻ ≫
Aqp8 ↻ ≫
Inip ↻ ≫
Grin2a ↻ ≫
Dlx5 ↻ ≫
Ror2 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Lsmem2 ↻ ≫
Kirrel ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Casq2 ↻ ≫
Hey1 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Dazap2 ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Prdm8 ↻ ≫
Slc39a10 ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Fmo2 ↻ ≫
Sik1 ↻ ≫
Cdc73 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Il17b ↻ ≫
Rspo3 ↻ ≫
Htra3 ↻ ≫
Pcdh12 ↻ ≫
Hr ↻ ≫
Reep4 ↻ ≫
Ass1 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Pitpnm1 ↻ ≫
Cdk2ap2 ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Padi2 ↻ ≫
Cenps ↻ ≫
Marcks ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Guk1 ↻ ≫
Gjc2 ↻ ≫
Man1c1 ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Vmo1 ↻ ≫
Axin2 ↻ ≫
Chst2 ↻ ≫
Fmnl1 ↻ ≫
Cacna1i ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Pigv ↻ ≫
Irx5 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Ints7 ↻ ≫
Dtl ↻ ≫
Carm1 ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Kbtbd13 ↻ ≫
Ankrd44 ↻ ≫
Dazl ↻ ≫
Nfe2 ↻ ≫
Thbd ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Ehd2 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Chrna3 ↻ ≫
Art3 ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Msra ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Tac4 ↻ ≫
1700016H13Rik ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Diras2 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Plcb1 ↻ ≫
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Opcml ↻ ≫
Csk ↻ ≫
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Hgfac ↻ ≫
Apob ↻ ≫
Sptbn5 ↻ ≫
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Caskin2 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Tfap2b ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
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2900026A02Rik ↻ ≫
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Dst ↻ ≫
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Kdelr1 ↻ ≫
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App ↻ ≫
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Adcy5 ↻ ≫
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Ptprm ↻ ≫
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Naglu ↻ ≫
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Astl ↻ ≫
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Myof ↻ ≫
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Syt17 ↻ ≫
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Nck1 ↻ ≫
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Xylb ↻ ≫
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Ttf2 ↻ ≫
Prmt3 ↻ ≫
Synpo2 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Ankrd63 ↻ ≫
Pcgf1 ↻ ≫
Slc2a13 ↻ ≫
Cdkal1 ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
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Pitx2 ↻ ≫
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Cd200r1 ↻ ≫
Nfkbil1 ↻ ≫
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Apobec4 ↻ ≫
Cdc42ep2 ↻ ≫
Cyp2w1 ↻ ≫
Elmo1 ↻ ≫
Mpp6 ↻ ≫
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Mtss2 ↻ ≫
Lsm2 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
H2-Ob ↻ ≫
Crh ↻ ≫
Wdr38 ↻ ≫
Cebpd ↻ ≫
Trpc3 ↻ ≫
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Ngrn ↻ ≫
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Rae1 ↻ ≫
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Gng8 ↻ ≫
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Glul ↻ ≫
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Pts ↻ ≫
Cthrc1 ↻ ≫
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Ckb ↻ ≫
Trpv2 ↻ ≫
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