ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc1a

Query protein: Smc1a
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX4546348 | Trophoblast stem cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc1a's Target genes

◢ Smc1a: Average

◢ SRX2599821: 3T3-L1

◢ SRX2599822: 3T3-L1

◢ SRX2599823: 3T3-L1

◢ SRX2599824: 3T3-L1

◢ SRX2599825: 3T3-L1

◢ SRX2599826: 3T3-L1

◢ SRX2599827: 3T3-L1

◢ SRX2599828: 3T3-L1

◢ SRX2599829: 3T3-L1

◢ SRX2599830: 3T3-L1

◢ SRX2957352: AtT-20

◢ SRX218284: B cells

◢ SRX218288: B cells

◢ SRX700951: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX700952: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348143: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348144: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348145: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348146: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX6988645: Cerebellum

◢ SRX6988646: Cerebellum

◢ SRX6988647: Cerebellum

◢ SRX6988648: Cerebellum

◢ SRX20793618: Cortical neuron

◢ SRX20793619: Cortical neuron

◢ SRX20793622: Cortical neuron

◢ SRX20793623: Cortical neuron

◢ SRX12601724: Dendritic Cells

◢ SRX12601725: Dendritic Cells

◢ SRX12601726: Dendritic Cells

◢ SRX12601727: Dendritic Cells

◢ SRX204343: Embryonic brains

◢ SRX4395347: Embryonic brains

◢ SRX4395356: Embryonic brains

◢ DRX021197: Embryonic head

◢ DRX021198: Embryonic limb

◢ SRX204337: Embryonic limb

◢ SRX204338: Embryonic limb

◢ SRX2440040: EpiSC

◢ SRX2440041: EpiSC

◢ SRX2440050: EpiSC

◢ SRX2440051: EpiSC

◢ SRX2440060: EpiSC

◢ SRX2440061: EpiSC

◢ SRX022688: ES cells

◢ SRX022689: ES cells

◢ SRX085109: ES cells

◢ SRX085110: ES cells

◢ SRX10560008: ES cells

◢ SRX10560009: ES cells

◢ SRX10560010: ES cells

◢ SRX10560011: ES cells

◢ SRX11237495: ES cells

◢ SRX11237501: ES cells

◢ SRX11237507: ES cells

◢ SRX11237513: ES cells

◢ SRX11237519: ES cells

◢ SRX11237525: ES cells

◢ SRX11237531: ES cells

◢ SRX11237537: ES cells

◢ SRX12204127: ES cells

◢ SRX12204128: ES cells

◢ SRX12204129: ES cells

◢ SRX12204130: ES cells

◢ SRX12204137: ES cells

◢ SRX12204138: ES cells

◢ SRX12204139: ES cells

◢ SRX12204140: ES cells

◢ SRX12204141: ES cells

◢ SRX12204142: ES cells

◢ SRX12204149: ES cells

◢ SRX12204150: ES cells

◢ SRX12204151: ES cells

◢ SRX12204152: ES cells

◢ SRX12204153: ES cells

◢ SRX12204154: ES cells

◢ SRX12963303: ES cells

◢ SRX13439102: ES cells

◢ SRX13439103: ES cells

◢ SRX13439104: ES cells

◢ SRX13439130: ES cells

◢ SRX17024519: ES cells

◢ SRX17024520: ES cells

◢ SRX17024521: ES cells

◢ SRX17024522: ES cells

◢ SRX2440036: ES cells

◢ SRX2440037: ES cells

◢ SRX2440070: ES cells

◢ SRX2440071: ES cells

◢ SRX2440080: ES cells

◢ SRX2440081: ES cells

◢ SRX3197475: ES cells

◢ SRX3197480: ES cells

◢ SRX4167137: ES cells

◢ SRX5088234: ES cells

◢ SRX5088236: ES cells

◢ SRX5125620: ES cells

◢ SRX5125624: ES cells

◢ SRX5401524: ES cells

◢ SRX5401525: ES cells

◢ SRX5401526: ES cells

◢ SRX5401527: ES cells

◢ SRX5401528: ES cells

◢ SRX5401529: ES cells

◢ SRX5436004: ES cells

◢ SRX5858855: ES cells

◢ SRX5858856: ES cells

◢ SRX5858857: ES cells

◢ SRX5858858: ES cells

◢ SRX6831866: ES cells

◢ SRX6831867: ES cells

◢ SRX7786279: ES cells

◢ SRX7786280: ES cells

◢ SRX7786281: ES cells

◢ SRX7786282: ES cells

◢ SRX3024490: Forelimb

◢ SRX8820366: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820367: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903169: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903170: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903174: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903175: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX2436121: Mammary glands

◢ SRX2564298: Mammary glands

◢ SRX2564307: Mammary glands

◢ SRX2564312: Mammary glands

◢ SRX2564313: Mammary glands

◢ SRX022702: MEF

◢ SRX022703: MEF

◢ SRX120168: MEF

◢ SRX120169: MEF

◢ SRX120170: MEF

◢ SRX17241102: MEF

◢ SRX17241103: MEF

◢ SRX17241104: MEF

◢ SRX17241105: MEF

◢ SRX17241107: MEF

◢ SRX17241108: MEF

◢ SRX17241109: MEF

◢ SRX17241110: MEF

◢ SRX17241113: MEF

◢ SRX17241114: MEF

◢ SRX17241115: MEF

◢ SRX17241116: MEF

◢ SRX17241117: MEF

◢ SRX17241118: MEF

◢ SRX17241119: MEF

◢ SRX17241120: MEF

◢ SRX17241123: MEF

◢ SRX17241125: MEF

◢ SRX976733: MEF

◢ SRX976734: MEF

◢ SRX5358275: mESCs, differentiated

◢ SRX5358276: mESCs, differentiated

◢ SRX5358277: mESCs, differentiated

◢ SRX5358278: mESCs, differentiated

◢ SRX5358279: mESCs, differentiated

◢ SRX5358280: mESCs, differentiated

◢ SRX125273: mESC derived neural cells

◢ SRX8693946: Neutrophils

◢ SRX8693947: Neutrophils

◢ SRX8693948: Neutrophils

◢ SRX8693949: Neutrophils

◢ SRX8693950: Neutrophils

◢ SRX8693951: Neutrophils

◢ SRX8694033: Neutrophils

◢ SRX8694034: Neutrophils

◢ SRX8694041: Neutrophils

◢ SRX8694042: Neutrophils

◢ SRX11169408: NIH/3T3

◢ SRX11169409: NIH/3T3

◢ SRX26175725: NIH/3T3

◢ SRX26175728: NIH/3T3

◢ SRX20340931: Pre-B cells

◢ SRX20340932: Pre-B cells

◢ SRX20340933: Pre-B cells

◢ SRX20340934: Pre-B cells

◢ SRX11169415: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169416: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169417: Scid.adh.2c2

◢ SRX11169418: Scid.adh.2c2

◢ SRX1631901: Sperm

◢ SRX2370885: Sperm

◢ SRX7348141: Thymocytes

◢ SRX7348142: Thymocytes

◣ SRX4546348: Trophoblast stem cells

◢ SRX4546349: Trophoblast stem cells

◢ SRX1306535: T cells

◢ SRX5318290: Uterus

◢ SRX5318291: Uterus

◢ SRX5318292: Uterus

◢ Smc1a: STRING
Cldn34d ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Sytl3 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Gm3667 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Cebpe ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Nuak2 ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Optc ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Fxyd1 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Ppy ↻ ≫
Pyy ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
S100a2 ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Fyb2 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Rbbp8nl ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Olfr1373 ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Sgms2 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Zfp385c ↻ ≫
Padi2 ↻ ≫
H2-T23 ↻ ≫
Nat9 ↻ ≫
Tmem104 ↻ ≫
Tmc5 ↻ ≫
Gm15517 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Aqp8 ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Gm29797 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Cldn15 ↻ ≫
Nos2 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Cmtm5 ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Shbg ↻ ≫
Vmn1r2 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Gm11127 ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Crh ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Gsg1 ↻ ≫
Cables2 ↻ ≫
Zbtb32 ↻ ≫
Kmt2b ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Nlrp10 ↻ ≫
Eif3f ↻ ≫
Col26a1 ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Prkrip1 ↻ ≫
Vamp1 ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Slc5a10 ↻ ≫
Ncf4 ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Rab37 ↻ ≫
Kcnc1 ↻ ≫
Afap1l2 ↻ ≫
P2rx1 ↻ ≫
Plp1 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Spock1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Ifitm3 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Cthrc1 ↻ ≫
4930590J08Rik ↻ ≫
Cd6 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Tmigd1 ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Dst ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Efna3 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Wnt7a ↻ ≫
Gsta4 ↻ ≫
Wnt3a ↻ ≫
Myo15b ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
H2-Ob ↻ ≫
Phactr3 ↻ ≫
Cd63 ↻ ≫
Trpc4ap ↻ ≫
Cyp4f15 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Krt8 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Slc9a3r1 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Clec4g ↻ ≫
Casq1 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Slc12a9 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Atmin ↻ ≫
B3galt5 ↻ ≫
Tent5b ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
Sipa1l2 ↻ ≫
Ache ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Mt2 ↻ ≫
Nkiras2 ↻ ≫
H2-L ↻ ≫
H2-D1 ↻ ≫
Apoa1 ↻ ≫
Nol12 ↻ ≫
Lgals1 ↻ ≫
Igfbp4 ↻ ≫
Upk3bl ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Aoc2 ↻ ≫
Apmap ↻ ≫
Hpx ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Slc7a8 ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Usp42 ↻ ≫
Ngfr ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Abcc8 ↻ ≫
Mmgt2 ↻ ≫
Lrrc75a ↻ ≫
Icosl ↻ ≫
Cntnap1 ↻ ≫
Ccr10 ↻ ≫
Plekhh3 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Unc45b ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Apobec4 ↻ ≫
Ybx2 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Odf3 ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Zfp334 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Tmem250-ps ↻ ≫
Ctnnbip1 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Hemk1 ↻ ≫
6430571L13Rik ↻ ≫
Tor4a ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
4930579F01Rik ↻ ≫
Trim69 ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Nxph4 ↻ ≫
Mgst3 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Tbkbp1 ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Il17b ↻ ≫
Cdc73 ↻ ≫
Bicd2 ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Ccr4 ↻ ≫
Tnfsf13 ↻ ≫
Senp3 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Gnat1 ↻ ≫
Alox8 ↻ ≫
Spats1 ↻ ≫
Pmp22 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Kcnma1 ↻ ≫
Ccl7 ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Ccl17 ↻ ≫
Slc30a1 ↻ ≫
Mafb ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Dmtn ↻ ≫
Gimap3 ↻ ≫
Phyhd1 ↻ ≫
Igf1 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Exoc3l4 ↻ ≫
Slc10a2 ↻ ≫
Prok1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Foxi1 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Bptf ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Uevld ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Ceacam1 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Gm2832 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Rab3a ↻ ≫
Ctdsp2 ↻ ≫
Myof ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Atoh8 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Aanat ↻ ≫
Prlh ↻ ≫
Flvcr2 ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Adcy4 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Dact2 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Pcp4 ↻ ≫
Fam53b ↻ ≫
Kirrel ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Tekt4 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Sntg2 ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Efna4 ↻ ≫
Nxf7 ↻ ≫
Sema6a ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Arhgap29 ↻ ≫
Pfn3 ↻ ≫
Naglu ↻ ≫
Mei1 ↻ ≫
Unc5b ↻ ≫
Elmo1 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Tmem88 ↻ ≫
Lgals7 ↻ ≫
Tnfsf4 ↻ ≫
Ece1 ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
Mapk9 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Btnl9 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Hs3st3b1 ↻ ≫
H2-Q8 ↻ ≫
H2-Q6 ↻ ≫
Samd5 ↻ ≫
Apoe ↻ ≫
Rimbp3 ↻ ≫
Cx3cr1 ↻ ≫
Prokr2 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Smim24 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Trnp1 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Gm5796 ↻ ≫
Bcr ↻ ≫
Prss35 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Epb41l4b ↻ ≫
Axin2 ↻ ≫
Atp5o ↻ ≫
Lexm ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Fmnl1 ↻ ≫
Rbsn ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Zfp930 ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Il17rc ↻ ≫
Rph3al ↻ ≫
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1810024B03Rik ↻ ≫
Fbl ↻ ≫
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S1pr1 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Ap5b1 ↻ ≫
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Scarf1 ↻ ≫
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Aplp1 ↻ ≫
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Itga9 ↻ ≫
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Th ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
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Ap3m2 ↻ ≫
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Lrfn2 ↻ ≫
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Adm ↻ ≫
Cish ↻ ≫
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Kdelr1 ↻ ≫
Mettl21a ↻ ≫
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4930558K02Rik ↻ ≫
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Kctd10 ↻ ≫
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Cemip ↻ ≫
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Ccdc126 ↻ ≫
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Fadd ↻ ≫
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Cenpx ↻ ≫
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Ptk2b ↻ ≫
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Acrbp ↻ ≫
Cebpa ↻ ≫
Asgr1 ↻ ≫
Myh4 ↻ ≫
Tmem221 ↻ ≫
Nxnl1 ↻ ≫
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Ext2 ↻ ≫
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Cmtm3 ↻ ≫
Thbd ↻ ≫
Plbd2 ↻ ≫
Spin1 ↻ ≫
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Hoxd3 ↻ ≫
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Mertk ↻ ≫
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Vsig10l ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Clec2m ↻ ≫
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Slc52a3 ↻ ≫
Erp27 ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Tnfaip8 ↻ ≫
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Mrpl38 ↻ ≫
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Nob1 ↻ ≫
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Artn ↻ ≫
Ambp ↻ ≫
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Myc ↻ ≫
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