ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX14674622 | Brown adipose tissue
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

◣ SRX14674622: Brown adipose tissue

◢ SRX14674623: Brown adipose tissue

◢ SRX14674624: Brown adipose tissue

◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

◢ SRX1722785: Hippocampus

◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

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◢ SRX2039594: Liver

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◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375598: Liver

◢ SRX2375599: Liver

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◢ SRX2375604: Liver

◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

◢ SRX5543268: Liver

◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543271: Liver

◢ SRX5543272: Liver

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◢ SRX997771: Liver

◢ SRX997772: Liver

◢ SRX997773: Liver

◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Cldn34d ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Rusc2 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Pomp ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Jup ↻ ≫
Git2 ↻ ≫
Ankrd13a ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Dusp7 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Rgcc ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Fkbp1a ↻ ≫
Ssbp4 ↻ ≫
Lalba ↻ ≫
Adam17 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Shank3 ↻ ≫
Ptp4a2 ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Lrrc8a ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Zhx3 ↻ ≫
Gm3488 ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Arpc2 ↻ ≫
Tbl1x ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Tcf4 ↻ ≫
Ltbr ↻ ≫
Nfat5 ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Rps17 ↻ ≫
Rpl29 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Serinc3 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Gbp5 ↻ ≫
Skil ↻ ≫
Arhgap31 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
Zfp786 ↻ ≫
Sh2d3c ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Ctla2b ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Krtcap2 ↻ ≫
Tob1 ↻ ≫
Gm3383 ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Aup1 ↻ ≫
Dnttip2 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Ublcp1 ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Chordc1 ↻ ≫
Eif3g ↻ ≫
Lonp2 ↻ ≫
1700042G07Rik ↻ ≫
Hes1 ↻ ≫
Git1 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Ptprb ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Prex2 ↻ ≫
Dennd6b ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
Itgb1 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Tcte3 ↻ ≫
Ermard ↻ ≫
Inka1 ↻ ≫
Mcf2l ↻ ≫
Pcdh12 ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Dus1l ↻ ≫
Fam124b ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Nsun6 ↻ ≫
Arl5b ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
9030025P20Rik ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Egfl7 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Mef2c ↻ ≫
Gm3411 ↻ ≫
Kcna5 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Pak4 ↻ ≫
Oxsr1 ↻ ≫
Tmem135 ↻ ≫
Arl8b ↻ ≫
Fzd4 ↻ ≫
Ago1 ↻ ≫
Taf4 ↻ ≫
Ak1 ↻ ≫
Mlec ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Cd93 ↻ ≫
Mapk1ip1l ↻ ≫
Prkce ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Nabp1 ↻ ≫
Nova2 ↻ ≫
Fam149b ↻ ≫
Ecd ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Ppip5k2 ↻ ≫
Gin1 ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Bok ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Ptcd1 ↻ ≫
Cpsf4 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Kbtbd2 ↻ ≫
Klhl24 ↻ ≫
Sec24a ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
Ddit4 ↻ ≫
Ctnna3 ↻ ≫
Klf2 ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Map3k6 ↻ ≫
Zfp148 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Btg2 ↻ ≫
Dgkh ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Chaf1a ↻ ≫
Arap3 ↻ ≫
Gm3435 ↻ ≫
Rpl21 ↻ ≫
Gdi2 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Aars2 ↻ ≫
Rrp8 ↻ ≫
Ilk ↻ ≫
Ehd2 ↻ ≫
Gm3667 ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Polr2l ↻ ≫
Junb ↻ ≫
Gm3500 ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Pofut2 ↻ ≫
Slc9a1 ↻ ≫
Ciz1 ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Trp53rkb ↻ ≫
Tjp1 ↻ ≫
Lims2 ↻ ≫
Hlx ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Ep400 ↻ ≫
Mtres1 ↻ ≫
Arcn1 ↻ ≫
Ift46 ↻ ≫
Kifc5b ↻ ≫
Tfb2m ↻ ≫
Cnst ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Abtb1 ↻ ≫
Mpp7 ↻ ≫
Sirt1 ↻ ≫
Arih2 ↻ ≫
Srd5a3 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Uchl5 ↻ ≫
Ro60 ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Taco1 ↻ ≫
Prok1 ↻ ≫
Soga1 ↻ ≫
Jund ↻ ≫
Iqcn ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Mafa ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
Ccndbp1 ↻ ≫
Oaz2 ↻ ≫
Cldn15 ↻ ≫
Smim8 ↻ ≫
Ctnnb1 ↻ ≫
Hivep2 ↻ ≫
Vps13d ↻ ≫
Dcp1a ↻ ≫
Tusc2 ↻ ≫
Hyal2 ↻ ≫
Mrps33 ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Ccdc85a ↻ ≫
Cox7a2 ↻ ≫
Rbm34 ↻ ≫
Fbxw7 ↻ ≫
Klhl20 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Tchp ↻ ≫
Yars ↻ ≫
S100pbp ↻ ≫
Cryzl2 ↻ ≫
Dnajc11 ↻ ≫
Calm3 ↻ ≫
Fus ↻ ≫
Dnajc16 ↻ ≫
Casp9 ↻ ≫
Frg1 ↻ ≫
Lsm5 ↻ ≫
Ablim1 ↻ ≫
App ↻ ≫
Unkl ↻ ≫
Percc1 ↻ ≫
BC003965 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Ap1ar ↻ ≫
Eif2s1 ↻ ≫
Atp6v1d ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Faf1 ↻ ≫
Atp6v0c ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
H1f6 ↻ ≫
Ints10 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Rer1 ↻ ≫
Morn1 ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Zfp623 ↻ ≫
Cdk17 ↻ ≫
Ddost ↻ ≫
Rpl38 ↻ ≫
Setd2 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Smg7 ↻ ≫
Rbsn ↻ ≫
Itpkb ↻ ≫
Pcyt1a ↻ ≫
Gle1 ↻ ≫
Tatdn3 ↻ ≫
Nsl1 ↻ ≫
Znrd1as ↻ ≫
Stat3 ↻ ≫
Elmod2 ↻ ≫
Znrd1 ↻ ≫
Tut7 ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Gm13290 ↻ ≫
Gm13289 ↻ ≫
Nub1 ↻ ≫
Atad2b ↻ ≫
Ccdc107 ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Mcl1 ↻ ≫
Hif1an ↻ ≫
Polr2j ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Elf1 ↻ ≫
Wbp4 ↻ ≫
Ctla2a ↻ ≫
Tpbpa ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Irf9 ↻ ≫
Prkcsh ↻ ≫
Ccdc151 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Pet117 ↻ ≫
Kat14 ↻ ≫
Rplp0 ↻ ≫
Crbn ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Med6 ↻ ≫
Opa1 ↻ ≫
Becn1 ↻ ≫
Tdrd9 ↻ ≫
Atp5mpl ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Usp3 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Cdiptos ↻ ≫
Cdipt ↻ ≫
Myl6b ↻ ≫
Ap4e1 ↻ ≫
Myl6 ↻ ≫
Abhd17a ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
H4c18 ↻ ≫
Fbxo34 ↻ ≫
Brpf1 ↻ ≫
Ints14 ↻ ≫
Srgn ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Prkab1 ↻ ≫
Sass6 ↻ ≫
Plxnd1 ↻ ≫
Csnk2a2 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Pten ↻ ≫
Hexim1 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Cfap20 ↻ ≫
Shoc2 ↻ ≫
Bbip1 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Rbm25 ↻ ≫
Rasip1 ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Ndel1 ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Stk38l ↻ ≫
Kctd5 ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
Sart1 ↻ ≫
Cpsf1 ↻ ≫
Thrap3 ↻ ≫
Pla2g6 ↻ ≫
Prkag1 ↻ ≫
Ndufb7 ↻ ≫
Dcaf10 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Ints6 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Nkap ↻ ≫
Necap2 ↻ ≫
Ier5 ↻ ≫
Rps27l ↻ ≫
Tmem198b ↻ ≫
Dnajc14 ↻ ≫
Ilf2 ↻ ≫
Dele1 ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Ddx46 ↻ ≫
Stn1 ↻ ≫
Rabgef1 ↻ ≫
Taf12 ↻ ≫
Rasal2 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Plk2 ↻ ≫
Tbc1d7 ↻ ≫
Tcea2 ↻ ≫
Sox18 ↻ ≫
Rnf215 ↻ ≫
Amotl2 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Gtf2b ↻ ≫
Prr14l ↻ ≫
Cdh5 ↻ ≫
Fbxl3 ↻ ≫
Tor4a ↻ ≫
Sema4c ↻ ≫
Pigo ↻ ≫
Mettl9 ↻ ≫
Rps20 ↻ ≫
Atxn2l ↻ ≫
Cct4 ↻ ≫
Dohh ↻ ≫
Scml4 ↻ ≫
Eif5 ↻ ≫
Leo1 ↻ ≫
Rhot1 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Cxxc1 ↻ ≫
Mtmr6 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Snx17 ↻ ≫
Eif2b4 ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
Rps6 ↻ ≫
Thumpd3 ↻ ≫
Sertad1 ↻ ≫
Mmp28 ↻ ≫
Ppp1r2 ↻ ≫
Raf1 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Irf2 ↻ ≫
Kmt2e ↻ ≫
Fyco1 ↻ ≫
Arpc3 ↻ ≫
Xpnpep3 ↻ ≫
St13 ↻ ≫
Eif4b ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Depp1 ↻ ≫
Kat6a ↻ ≫
Tbrg4 ↻ ≫
Dnajb1 ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Polr2e ↻ ≫
Eif4a1 ↻ ≫
Peli1 ↻ ≫
Ube4b ↻ ≫
Fscn1 ↻ ≫
Casq1 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Proser1 ↻ ≫
Nhlrc3 ↻ ≫
Naca ↻ ≫
Gm3264 ↻ ≫
Tsen15 ↻ ≫
Gtpbp4 ↻ ≫
Gbp9 ↻ ≫
Ddx55 ↻ ≫
Gm3696 ↻ ≫
Exoc3l ↻ ≫
E2f4 ↻ ≫
Zdhhc4 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Bnip3l ↻ ≫
Dbnl ↻ ≫
Asb6 ↻ ≫
Thbd ↻ ≫
Nemp2 ↻ ≫
Clptm1l ↻ ≫
Ppp2r5b ↻ ≫
C2cd5 ↻ ≫
Ttc14 ↻ ≫
Akap7 ↻ ≫
Podxl ↻ ≫
Dll4 ↻ ≫
Tpt1 ↻ ≫
BC005537 ↻ ≫
Pak1ip1 ↻ ≫
Hipk1 ↻ ≫
Wdr70 ↻ ≫
Hsp90aa1 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Fabp4 ↻ ≫
Med18 ↻ ≫
Esam ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Ccnl1 ↻ ≫
Esyt2 ↻ ≫
Sphk2 ↻ ≫
Rpl18 ↻ ≫
Fam83e ↻ ≫
Oxnad1 ↻ ≫
Dph3 ↻ ≫
Atrn ↻ ≫
Cep120 ↻ ≫
Txnip ↻ ≫
Cfap45 ↻ ≫
Ankrd33 ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Rhog ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Aurkaip1 ↻ ≫
Rnaset2b ↻ ≫
Ppp2cb ↻ ≫
Ptcd2 ↻ ≫
Mrps27 ↻ ≫
Mob4 ↻ ≫
Mfng ↻ ≫
Txnl4b ↻ ≫
Dhx38 ↻ ≫
Pex12 ↻ ≫
Ap2b1 ↻ ≫
Ntn5 ↻ ≫
Hibch ↻ ≫
Rint1 ↻ ≫
Pus7 ↻ ≫
Stau1 ↻ ≫
Nol7 ↻ ≫
Cebpa ↻ ≫
Rbm39 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Kmt2c ↻ ≫
AI413582 ↻ ≫
Cox20 ↻ ≫
Rpl9 ↻ ≫
Lias ↻ ≫
Snx14 ↻ ≫
Ythdc1 ↻ ≫
Kctd12 ↻ ≫
Robo4 ↻ ≫
Tcp11l2 ↻ ≫
Picalm ↻ ≫
Mrps18c ↻ ≫
Helq ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Ncbp2 ↻ ≫
0610012G03Rik ↻ ≫
Galk2 ↻ ≫
Cops2 ↻ ≫
Zyx ↻ ≫
P4ha1 ↻ ≫
Calm2 ↻ ≫
Zfp62 ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
Bod1l ↻ ≫
Sec31a ↻ ≫
Adam10 ↻ ≫
Mvd ↻ ≫
Tbpl1 ↻ ≫
Blmh ↻ ≫
Ppm1f ↻ ≫
Xiap ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Tspan13 ↻ ≫
Zfp113 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Ankrd11 ↻ ≫
Faf2 ↻ ≫
Ifi30 ↻ ≫
Fkbp8 ↻ ≫
Kxd1 ↻ ≫
Tmem101 ↻ ≫
Dnaja1 ↻ ≫
Rad9b ↻ ≫
Pex2 ↻ ≫
Pigt ↻ ≫
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Asah1 ↻ ≫
Osmr ↻ ≫
Sf3b2 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
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Tfip11 ↻ ≫
Bex6 ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Ubb ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
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Ing1 ↻ ≫
Nr4a2 ↻ ≫
Prmt5 ↻ ≫
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Tmem88b ↻ ≫
Mxd4 ↻ ≫
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