ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX9843668 | Lung cancer
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

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◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

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◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

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◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543272: Liver

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◢ SRX997771: Liver

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◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◣ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Nr4a1 ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Kcnn1 ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Kctd11 ↻ ≫
Cd5 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Etnk2 ↻ ≫
Iffo2 ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Gstp2 ↻ ≫
Polr3h ↻ ≫
Setx ↻ ≫
Apon ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Plek2 ↻ ≫
Brpf1 ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Fam180a ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Per3 ↻ ≫
Zfp105 ↻ ≫
Zfp706 ↻ ≫
Atf3 ↻ ≫
Opa3 ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Ubtd1 ↻ ≫
Mms19 ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Etfa ↻ ≫
Abhd18 ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Bcl3 ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Actn4 ↻ ≫
St3gal2 ↻ ≫
Lsm14b ↻ ≫
Adgrg3 ↻ ≫
Gm14137 ↻ ≫
Pan2 ↻ ≫
Il23a ↻ ≫
Fxr2 ↻ ≫
Eci2 ↻ ≫
Supt4a ↻ ≫
Ifi204 ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Hif1an ↻ ≫
Tmcc3 ↻ ≫
Tcf4 ↻ ≫
Zfp213 ↻ ≫
Rab8a ↻ ≫
Rin1 ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Eif4b ↻ ≫
Gabarapl2 ↻ ≫
Zbtb10 ↻ ≫
Serf2 ↻ ≫
Cables2 ↻ ≫
Gm29733 ↻ ≫
Gga1 ↻ ≫
Ncapg2 ↻ ≫
Puf60 ↻ ≫
H2-K1 ↻ ≫
Prss8 ↻ ≫
Hilpda ↻ ≫
Eid2 ↻ ≫
Rer1 ↻ ≫
Morn1 ↻ ≫
Cyp19a1 ↻ ≫
Mks1 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Frmd8 ↻ ≫
Csad ↻ ≫
Zfp740 ↻ ≫
Ndufv1 ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Lipe ↻ ≫
Dus2 ↻ ≫
Ddx28 ↻ ≫
Adgre5 ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Ocstamp ↻ ≫
Rab3gap2 ↻ ≫
Faf1 ↻ ≫
Ankrd1 ↻ ≫
Prr13 ↻ ≫
Mrpl45 ↻ ≫
1110002E22Rik ↻ ≫
Ccnt1 ↻ ≫
4930415O20Rik ↻ ≫
Slc35f6 ↻ ≫
Dgat1 ↻ ≫
Asb5 ↻ ≫
Echdc3 ↻ ≫
Kank3 ↻ ≫
Nolc1 ↻ ≫
Cbl ↻ ≫
Synpo ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Seh1l ↻ ≫
Rnf39 ↻ ≫
Ptp4a2 ↻ ≫
Sfr1 ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Xpnpep3 ↻ ≫
St13 ↻ ≫
Setd1b ↻ ≫
Man1b1 ↻ ≫
Prtg ↻ ≫
Tspan8 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Tcte3 ↻ ≫
Ermard ↻ ≫
Cd2ap ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Mbtps1 ↻ ≫
Fcho2 ↻ ≫
R3hdml ↻ ≫
Ankrd40 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Cxcl17 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Tmem229b ↻ ≫
Limk1 ↻ ≫
Cxcl10 ↻ ≫
Tns1 ↻ ≫
Rufy4 ↻ ≫
Zfp113 ↻ ≫
Btbd19 ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Gtf2f1 ↻ ≫
Otud1 ↻ ≫
Ndrg1 ↻ ≫
5031439G07Rik ↻ ≫
Cfap20 ↻ ≫
Naa80 ↻ ≫
Hyal1 ↻ ≫
Pold3 ↻ ≫
Flrt1 ↻ ≫
Gprc5a ↻ ≫
Nr4a2 ↻ ≫
Map3k20 ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Mcrs1 ↻ ≫
Lgals1 ↻ ≫
Marchf9 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Bcas3 ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Hinfp ↻ ≫
Sgk2 ↻ ≫
Tmem179 ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Gpbp1 ↻ ≫
Gxylt1 ↻ ≫
Plekhf2 ↻ ≫
Ep400 ↻ ≫
Ncaph2 ↻ ≫
Lmf2 ↻ ≫
Naa40 ↻ ≫
Ppia ↻ ≫
Pabpc1 ↻ ≫
Scaf11 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Zfp623 ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Map3k12 ↻ ≫
Tarbp2 ↻ ≫
Krtap1-5 ↻ ≫
Krtap1-4 ↻ ≫
Lman1l ↻ ≫
Fam107b ↻ ≫
Ptges ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Zyx ↻ ≫
Hspa9 ↻ ≫
Rab7b ↻ ≫
Rnf166 ↻ ≫
Sqstm1 ↻ ≫
Zbed4 ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Akap1 ↻ ≫
Lin54 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Fam32a ↻ ≫
Angptl6 ↻ ≫
Edrf1 ↻ ≫
Cnih1 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Klk9 ↻ ≫
Srebf2 ↻ ≫
Fbxo31 ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
Orc4 ↻ ≫
Mbd5 ↻ ≫
Abhd11 ↻ ≫
Rps16 ↻ ≫
Gm3776 ↻ ≫
Tomm40 ↻ ≫
Map2k2 ↻ ≫
Gal ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Nrxn1 ↻ ≫
Tsku ↻ ≫
Strada ↻ ≫
Kdm2a ↻ ≫
Ngf ↻ ≫
Myd88 ↻ ≫
Acaa1a ↻ ≫
Dph5 ↻ ≫
4931428F04Rik ↻ ≫
H2-L ↻ ≫
H2-D1 ↻ ≫
LOC547349 ↻ ≫
Arid2 ↻ ≫
Kat6a ↻ ≫
Paqr5 ↻ ≫
Spen ↻ ≫
Yipf2 ↻ ≫
Timm29 ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Fam160b1 ↻ ≫
Irf2bpl ↻ ≫
Tmem65 ↻ ≫
Bcl2l13 ↻ ≫
Kng2 ↻ ≫
Prss30 ↻ ≫
Ank1 ↻ ≫
Bmper ↻ ≫
Oxsr1 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Aqp3 ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Aspa ↻ ≫
Spata22 ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Klhl9 ↻ ≫
Pex16 ↻ ≫
Large2 ↻ ≫
Hic2 ↻ ≫
Gm33887 ↻ ≫
Metap1 ↻ ≫
Sbno2 ↻ ≫
Cars ↻ ≫
Fbrsl1 ↻ ≫
Tom1l2 ↻ ≫
Drc3 ↻ ≫
Wdyhv1 ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
Sptan1 ↻ ≫
Sf1 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Tmie ↻ ≫
Als2cl ↻ ≫
Sac3d1 ↻ ≫
Ovol1 ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Sult1a1 ↻ ≫
Ppp2ca ↻ ≫
Sh2d5 ↻ ≫
Gsg1 ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Chrac1 ↻ ≫
Dennd3 ↻ ≫
Efcab5 ↻ ≫
Drap1 ↻ ≫
AI837181 ↻ ≫
Usp53 ↻ ≫
Nrbp2 ↻ ≫
Trim37 ↻ ≫
Fbxl13 ↻ ≫
Armc10 ↻ ≫
Adprh ↻ ≫
Tmco4 ↻ ≫
Trir ↻ ≫
Get3 ↻ ≫
Fzr1 ↻ ≫
Micall1 ↻ ≫
Zfp821 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Gpaa1 ↻ ≫
Exosc4 ↻ ≫
Elp5 ↻ ≫
Ctdnep1 ↻ ≫
Btg2 ↻ ≫
Pcf11 ↻ ≫
Crtc2 ↻ ≫
Thumpd3 ↻ ≫
Creld2 ↻ ≫
Alg12 ↻ ≫
Hspa4 ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
Rnf38 ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Cenpp ↻ ≫
Rtn4 ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Vapa ↻ ≫
Cep170 ↻ ≫
Sdccag8 ↻ ≫
Aspscr1 ↻ ≫
Rrm2b ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Tnfrsf26 ↻ ≫
Tbc1d14 ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Bnip3l ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Tmem107 ↻ ≫
Zfp511 ↻ ≫
Tubgcp2 ↻ ≫
Serinc3 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Slc35a4 ↻ ≫
Apbb3 ↻ ≫
Cish ↻ ≫
Rel ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Mvd ↻ ≫
Ubap2l ↻ ≫
4933434E20Rik ↻ ≫
Ppp1r15a ↻ ≫
Plekha4 ↻ ≫
Fosb ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Chaf1a ↻ ≫
Mief1 ↻ ≫
Usp36 ↻ ≫
Zfp119b ↻ ≫
Ticam1 ↻ ≫
Tmem54 ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Prdx1 ↻ ≫
Ccnt2 ↻ ≫
Smarcd2 ↻ ≫
Tcam1 ↻ ≫
Ccl20 ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Tmco6 ↻ ≫
Rab21 ↻ ≫
Vps26c ↻ ≫
Cep63 ↻ ≫
Anapc13 ↻ ≫
Ogfod3 ↻ ≫
Hexdc ↻ ≫
Zswim4 ↻ ≫
Pcbp3 ↻ ≫
Sprr1a ↻ ≫
Emp1 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Hspbp1 ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Rab33b ↻ ≫
Dclk1 ↻ ≫
Ccdc84 ↻ ≫
Rela ↻ ≫
Traf1 ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Hdgf ↻ ≫
Hspe1 ↻ ≫
Hspd1 ↻ ≫
Ube4b ↻ ≫
Tsga10 ↻ ≫
Idh1 ↻ ≫
Psmd8 ↻ ≫
Eprs ↻ ≫
Coro1b ↻ ≫
Taf5 ↻ ≫
1810037I17Rik ↻ ≫
Gdpd5 ↻ ≫
Lgals3 ↻ ≫
Cdip1 ↻ ≫
B3gnt3 ↻ ≫
Glrp1 ↻ ≫
Polr2e ↻ ≫
Gm3435 ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Isca1 ↻ ≫
Ppm1a ↻ ≫
Slc5a6 ↻ ≫
Atraid ↻ ≫
Uap1l1 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Tmem205 ↻ ≫
Ccdc159 ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
Gar1 ↻ ≫
Atp2b1 ↻ ≫
Ppp1cb ↻ ≫
Prkab2 ↻ ≫
Lgals7 ↻ ≫
Larp4b ↻ ≫
Taf6 ↻ ≫
Cnpy4 ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
1190007I07Rik ↻ ≫
Zdhhc12 ↻ ≫
Gpn3 ↻ ≫
Fam216a ↻ ≫
Blnk ↻ ≫
Cops8 ↻ ≫
Hspa8 ↻ ≫
Eif3d ↻ ≫
Itgb2 ↻ ≫
Cdsn ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Isyna1 ↻ ≫
Myo5c ↻ ≫
Sdc4 ↻ ≫
Cdk13 ↻ ≫
Sertad1 ↻ ≫
Kif23 ↻ ≫
Pcnx4 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Cdc34 ↻ ≫
Fam214b ↻ ≫
Mrps15 ↻ ≫
Lamb2 ↻ ≫
Krt19 ↻ ≫
Tmprss11e ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Dohh ↻ ≫
Smim14 ↻ ≫
Casp8ap2 ↻ ≫
Wdr27 ↻ ≫
1600012H06Rik ↻ ≫
Fam220a ↻ ≫
Kcnmb3 ↻ ≫
Cacfd1 ↻ ≫
Slc25a35 ↻ ≫
Fam71e1 ↻ ≫
Emc10 ↻ ≫
Myl6b ↻ ≫
Myl6 ↻ ≫
Bcl2l15 ↻ ≫
Osbpl2 ↻ ≫
Smim26 ↻ ≫
Ankrd55 ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Nudt1 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Stk19 ↻ ≫
Dxo ↻ ≫
Ranbp3 ↻ ≫
Rassf6 ↻ ≫
Agrp ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Tmem198b ↻ ≫
Dnajc14 ↻ ≫
Ruvbl2 ↻ ≫
Gys1 ↻ ≫
Sf3b1 ↻ ≫
Lrrc51 ↻ ≫
Gpt ↻ ≫
Coa7 ↻ ≫
Rab5c ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Fst ↻ ≫
Sgms2 ↻ ≫
Zfp628 ↻ ≫
Plekhg4 ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
Coq10b ↻ ≫
Esyt2 ↻ ≫
Chchd5 ↻ ≫
Tob1 ↻ ≫
Odc1 ↻ ≫
Frat2 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Cdk12 ↻ ≫
Tcta ↻ ≫
Rhoa ↻ ≫
Zfp438 ↻ ≫
Ptma ↻ ≫
Spg7 ↻ ≫
Maff ↻ ≫
Mlst8 ↻ ≫
Bricd5 ↻ ≫
Esrra ↻ ≫
Catsperz ↻ ≫
Rhebl1 ↻ ≫
Tmem160 ↻ ≫
Lrtm2 ↻ ≫
Cacna2d4 ↻ ≫
Fermt1 ↻ ≫
Osbpl9 ↻ ≫
Mars1 ↻ ≫
G2e3 ↻ ≫
Sfxn2 ↻ ≫
Arl3 ↻ ≫
Rad18 ↻ ≫
9030025P20Rik ↻ ≫
Ccdc12 ↻ ≫
Nudt9 ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Nbeal2 ↻ ≫
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Tcf25 ↻ ≫
Tst ↻ ≫
Mpst ↻ ≫
Sectm1a ↻ ≫
Ptpn1 ↻ ≫
Med16 ↻ ≫
Irak3 ↻ ≫
Fbxl21 ↻ ≫
Slc35e1 ↻ ≫
2310022A10Rik ↻ ≫
Pygo2 ↻ ≫
Pld3 ↻ ≫
Clcf1 ↻ ≫
Zbtb2 ↻ ≫
Pskh1 ↻ ≫
Gstt4 ↻ ≫
Ccm2 ↻ ≫
Get4 ↻ ≫
Tmub2 ↻ ≫
Myo6 ↻ ≫
Tbc1d23 ↻ ≫
Ythdc1 ↻ ≫
Trmu ↻ ≫
Cct2 ↻ ≫
Gsta1 ↻ ≫
Mtres1 ↻ ≫
Pts ↻ ≫
Tbc1d10c ↻ ≫
Ppp1ca ↻ ≫
Gcnt2 ↻ ≫
Prkag1 ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Atg5 ↻ ≫
Dnajb6 ↻ ≫
Smndc1 ↻ ≫
Eef1g ↻ ≫
Coa3 ↻ ≫
Cntd1 ↻ ≫
Chaf1b ↻ ≫
Ptbp3 ↻ ≫
Zfp647 ↻ ≫
Add2 ↻ ≫
Setd5 ↻ ≫
Ccdc107 ↻ ≫
Tnrc6c ↻ ≫
Usp4 ↻ ≫
Ccar1 ↻ ≫
Abcf1 ↻ ≫
Srek1 ↻ ≫
Ddx50 ↻ ≫
Rpsa ↻ ≫
Guk1 ↻ ≫
Taf6l ↻ ≫
Snx11 ↻ ≫
Morc2a ↻ ≫
Adora2a ↻ ≫
Maml1 ↻ ≫
Tfcp2 ↻ ≫
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