ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX997776 | Liver
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

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◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

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◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

◢ SRX100293: Liver

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◢ SRX2039595: Liver

◢ SRX2039596: Liver

◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375598: Liver

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◢ SRX2375604: Liver

◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

◢ SRX5543268: Liver

◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543271: Liver

◢ SRX5543272: Liver

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◢ SRX997770: Liver

◢ SRX997771: Liver

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◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◣ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Atp6v0c ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Dpp7 ↻ ≫
Mfsd1 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Vps11 ↻ ≫
Hexa ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Gba ↻ ≫
Clcn7 ↻ ≫
Mcoln1 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Phf23 ↻ ≫
Dvl2 ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
Ube2b ↻ ≫
Cdkl3 ↻ ≫
Dchs2 ↻ ≫
Tpp1 ↻ ≫
Atxn3 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Marchf9 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Prr5l ↻ ≫
Commd9 ↻ ≫
Adh1 ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Vps33a ↻ ≫
Retreg2 ↻ ≫
Cnppd1 ↻ ≫
Cln3 ↻ ≫
Apobr ↻ ≫
Hps1 ↻ ≫
Dolk ↻ ≫
Sumf1 ↻ ≫
Osgep ↻ ≫
Apex1 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Lsm12 ↻ ≫
G6pc3 ↻ ≫
Nagpa ↻ ≫
Mthfr ↻ ≫
Clcn6 ↻ ≫
Commd4 ↻ ≫
Atp6v1h ↻ ≫
Agrp ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Natd1 ↻ ≫
Zfp507 ↻ ≫
Kdm4c ↻ ≫
Wdr81 ↻ ≫
Tmem267 ↻ ≫
Uvrag ↻ ≫
Med28 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Shpk ↻ ≫
Ctns ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Scamp3 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Rragc ↻ ≫
Atp6v1c1 ↻ ≫
Gm20594 ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Bax ↻ ≫
Mtdh ↻ ≫
Dyrk1b ↻ ≫
Rnasek ↻ ≫
0610010K14Rik ↻ ≫
Vmn2r4 ↻ ≫
Eif2s1 ↻ ≫
Atp6v1d ↻ ≫
Grn ↻ ≫
Marchf8 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Muc3 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Rdh5 ↻ ≫
Bloc1s1 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Hnrnph2 ↻ ≫
Gla ↻ ≫
Apc ↻ ≫
Sgta ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
Thrap3 ↻ ≫
Rpusd4 ↻ ≫
Fam118b ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Crebrf ↻ ≫
Rasgrp2 ↻ ≫
Vps26a ↻ ≫
Vps50 ↻ ≫
Hepacam2 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Usf2 ↻ ≫
Selenop ↻ ≫
Smim17 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
H1f6 ↻ ≫
Fcna ↻ ≫
Sae1 ↻ ≫
Casq1 ↻ ≫
Gbp4 ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Ankrd12 ↻ ≫
Igf2r ↻ ≫
Tbl1x ↻ ≫
Atp6v0b ↻ ≫
B4galt2 ↻ ≫
Dph2 ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Junb ↻ ≫
Ctsd ↻ ≫
P4ha1 ↻ ≫
Zfp655 ↻ ≫
Klf2 ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Commd8 ↻ ≫
Gabarap ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Epg5 ↻ ≫
Klhl17 ↻ ≫
Stmn1 ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H1f4 ↻ ≫
Trim50 ↻ ≫
Cep162 ↻ ≫
Rab1a ↻ ≫
Anapc5 ↻ ≫
Arl2 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Arid1a ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Rbm34 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Taf12 ↻ ≫
Celsr3 ↻ ≫
Maf ↻ ≫
Dnajc13 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Orai2 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Morc2a ↻ ≫
Arl15 ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Ddit4 ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Dusp7 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Sgk1 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Camk2d ↻ ≫
Cited2 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
9230019H11Rik ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Ets2 ↻ ≫
Calm2 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
Jpt1 ↻ ≫
Dyrk1a ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Sdhaf3 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Lrp5 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
H2-Q9 ↻ ≫
H2-Q7 ↻ ≫
Tcn2 ↻ ≫
Baiap2 ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Rptor ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Ctdsp1 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Klhl6 ↻ ≫
Urod ↻ ≫
Hectd3 ↻ ≫
Lamtor4 ↻ ≫
P2rx7 ↻ ≫
Usp3 ↻ ≫
Bin2 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Kctd5 ↻ ≫
Nip7 ↻ ≫
Cog8 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Neurl3 ↻ ≫
Plk2 ↻ ≫
Ephb4 ↻ ≫
Galk2 ↻ ≫
Cops2 ↻ ≫
Cep120 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Smad7 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Eif3g ↻ ≫
Hexim1 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Cds2 ↻ ≫
Chordc1 ↻ ≫
Amotl2 ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Ccnyl1 ↻ ≫
Calcrl ↻ ≫
Cstf2t ↻ ≫
Rnf145 ↻ ≫
Unkl ↻ ≫
Percc1 ↻ ≫
BC003965 ↻ ≫
Zfyve26 ↻ ≫
Rad51b ↻ ≫
Hnrnph1 ↻ ≫
Sgo1 ↻ ≫
Txnip ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Trappc8 ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Ints10 ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Dda1 ↻ ≫
Abhd8 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Kat6a ↻ ≫
Csnk1a1 ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Herc4 ↻ ≫
Dph1 ↻ ≫
Rtn4rl1 ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Ppp1r10 ↻ ≫
Mrps18b ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Atg16l1 ↻ ≫
Rcbtb1 ↻ ≫
Ints6 ↻ ≫
Lin9 ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Camta1 ↻ ≫
Gbp6 ↻ ≫
Ciao2a ↻ ≫
Ndufa10 ↻ ≫
Snx1 ↻ ≫
Garre1 ↻ ≫
Kif20a ↻ ≫
Brd8 ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
Adra2b ↻ ≫
H4f16 ↻ ≫
H2aj ↻ ≫
Commd1 ↻ ≫
Tma16 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Ing1 ↻ ≫
Itpkb ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Padi4 ↻ ≫
Itgb1 ↻ ≫
Zfp36 ↻ ≫
Nup54 ↻ ≫
Spaca6 ↻ ≫
Plin2 ↻ ≫
Hnrnpa2b1 ↻ ≫
Cbx3 ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Gbp9 ↻ ≫
Mex3b ↻ ≫
Tmem203 ↻ ≫
Ndor1 ↻ ≫
Npc2 ↻ ≫
Isca2 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
BC005537 ↻ ≫
Polg ↻ ≫
Por ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Gpr182 ↻ ≫
E2f3 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Nudt9 ↻ ≫
Uba7 ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
H2bc11 ↻ ≫
H2ac11 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Ndufs3 ↻ ≫
Kbtbd4 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Shmt1 ↻ ≫
Smad6 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Ilf2 ↻ ≫
Pmel ↻ ≫
Cdk2 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
9030025P20Rik ↻ ≫
Trmu ↻ ≫
Tubb4b ↻ ≫
Tmx4 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Cxxc1 ↻ ≫
Rpl5 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
E030018B13Rik ↻ ≫
Gtf2b ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Otud6b ↻ ≫
Gpatch4 ↻ ≫
Gpx1 ↻ ≫
Kifc5b ↻ ≫
Leo1 ↻ ≫
Ppp1r9b ↻ ≫
Mrps18c ↻ ≫
Helq ↻ ≫
Eef1a1 ↻ ≫
Csad ↻ ≫
Rsad2 ↻ ≫
Ptgds ↻ ≫
Paxip1 ↻ ≫
Smagp ↻ ≫
Lrrc8d ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Zfp740 ↻ ≫
St6gal1 ↻ ≫
Slc4a4 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Cyp26a1 ↻ ≫
Pdp2 ↻ ≫
Gbp7 ↻ ≫
Tmem171 ↻ ≫
Wdr89 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Gm19774 ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Synpo ↻ ≫
Cluh ↻ ≫
Snx21 ↻ ≫
Syne3 ↻ ≫
Tmcc3 ↻ ≫
Nup62 ↻ ≫
Il4i1b ↻ ≫
Atf5 ↻ ≫
Ndst1 ↻ ≫
Mroh2a ↻ ≫
Adcy10 ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Insig2 ↻ ≫
Agpat2 ↻ ≫
Rhobtb1 ↻ ≫
A930033H14Rik ↻ ≫
Lrrc8a ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Tubb2a ↻ ≫
Dcaf1 ↻ ≫
Id3 ↻ ≫
Sgms1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Fkbp8 ↻ ≫
Rffl ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Prkcsh ↻ ≫
Ccdc151 ↻ ≫
Klf3 ↻ ≫
Gale ↻ ≫
C3 ↻ ≫
Pdk4 ↻ ≫
Dmwd ↻ ≫
Sbno2 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Slc25a51 ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Raet1d ↻ ≫
Inhbe ↻ ≫
Rnf141 ↻ ≫
Ifnar1 ↻ ≫
Fam71e1 ↻ ≫
Emc10 ↻ ≫
Ace3 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Tmem53 ↻ ≫
Armh1 ↻ ≫
Map4k4 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Osgin1 ↻ ≫
Cmip ↻ ≫
Septin9 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Itih1 ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Cbfa2t3 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Rab5if ↻ ≫
Myd88 ↻ ≫
Acaa1a ↻ ≫
Irgm2 ↻ ≫
Spop ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Gas7 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Tle1 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Cbs ↻ ≫
Raet1e ↻ ≫
Ptpn12 ↻ ≫
Ccdc38 ↻ ≫
Amdhd1 ↻ ≫
Raet1c ↻ ≫
Raet1b ↻ ≫
Cln8 ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Mymx ↻ ≫
Rusc2 ↻ ≫
Tymp ↻ ≫
Sco2 ↻ ≫
Ormdl3 ↻ ≫
Oxsr1 ↻ ≫
Ctla2b ↻ ≫
Zfp719 ↻ ≫
Lgals9 ↻ ≫
Tsr1 ↻ ≫
Sgsm2 ↻ ≫
Lpp ↻ ≫
Snrpa ↻ ≫
BC024978 ↻ ≫
Saa3 ↻ ≫
Tmbim6 ↻ ≫
Bcl3 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Ext1 ↻ ≫
Slc22a5 ↻ ≫
Parvb ↻ ≫
Kcnn1 ↻ ≫
Saraf ↻ ≫
Gbp10 ↻ ≫
Rps28 ↻ ≫
Bcl6 ↻ ≫
2900026A02Rik ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Nr0b2 ↻ ≫
Spen ↻ ≫
Celf2 ↻ ≫
Cic ↻ ≫
Zbtb7c ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Rara ↻ ≫
Coq8a ↻ ≫
Cnot8 ↻ ≫
Mfsd6 ↻ ≫
Setd5 ↻ ≫
Fam222a ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Sulf2 ↻ ≫
Plekhg3 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Zpr1 ↻ ≫
Apoa5 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Actn4 ↻ ≫
Tpt1 ↻ ≫
Ehd1 ↻ ≫
Pnpla3 ↻ ≫
Phospho1 ↻ ≫
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Ahcyl1 ↻ ≫
Zfp36l2 ↻ ≫
Psap ↻ ≫
Rnf10 ↻ ≫
Arhgap23 ↻ ≫
Zfp113 ↻ ≫
Nedd4 ↻ ≫
Susd1 ↻ ≫
Atxn7l1 ↻ ≫
Pla2g12a ↻ ≫
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Cenpu ↻ ≫
Slc29a1 ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
Fos ↻ ≫
Coq10a ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Cpa4 ↻ ≫
Rnase10 ↻ ≫
Arap1 ↻ ≫
Cyp4a10 ↻ ≫
Hcar2 ↻ ≫
Btbd19 ↻ ≫
Gpat4 ↻ ≫
Dlat ↻ ≫
Znrd1as ↻ ≫
Gfod1 ↻ ≫
Cipc ↻ ≫
E2f2 ↻ ≫
Myl6b ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
Amacr ↻ ≫
Bri3 ↻ ≫
Il6ra ↻ ≫
Plec ↻ ≫
Serinc3 ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Cry1 ↻ ≫
Slc11a1 ↻ ≫
Trim25 ↻ ≫
Hibch ↻ ≫
Ell ↻ ≫
Mmadhc ↻ ≫
Cox20 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Xrcc1 ↻ ≫
Frat1 ↻ ≫
Inpp5e ↻ ≫
Fam131c ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Aup1 ↻ ≫
Slain2 ↻ ≫
Sorbs3 ↻ ≫
Cd276 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Dido1 ↻ ≫
Cst3 ↻ ≫
Lax1 ↻ ≫
Tle3 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Furin ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Rmi2 ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Gsap ↻ ≫
Slc39a14 ↻ ≫
Ublcp1 ↻ ≫
Hspa1l ↻ ≫
Hspa1a ↻ ≫
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