ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1722787 | Hippocampus
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

◢ SRX14674622: Brown adipose tissue

◢ SRX14674623: Brown adipose tissue

◢ SRX14674624: Brown adipose tissue

◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

◢ SRX1722785: Hippocampus

◣ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

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◢ SRX2039595: Liver

◢ SRX2039596: Liver

◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375598: Liver

◢ SRX2375599: Liver

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◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

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◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543271: Liver

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◢ SRX679441: Liver

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◢ SRX997770: Liver

◢ SRX997771: Liver

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◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Txndc11 ↻ ≫
Atp6v0c ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Mfsd1 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Hexa ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Chrnb2 ↻ ≫
Atxn3 ↻ ≫
Dph2 ↻ ≫
B4galt2 ↻ ≫
Atp6v0b ↻ ≫
Uap1l1 ↻ ≫
Dpp7 ↻ ≫
Dync1h1 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Spata25 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Ankrd12 ↻ ≫
Tspan31 ↻ ≫
Marchf9 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Bax ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Gabarap ↻ ≫
Phf23 ↻ ≫
Dvl2 ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Zfp507 ↻ ≫
Kdm4c ↻ ≫
Vps11 ↻ ≫
Clcn7 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Rragc ↻ ≫
Pip4p1 ↻ ≫
Osgep ↻ ≫
Apex1 ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Anapc15 ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Igf2r ↻ ≫
Zfp358 ↻ ≫
Mcoln1 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
Atp6v1c1 ↻ ≫
Taf10 ↻ ≫
Tpp1 ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Mettl23 ↻ ≫
Jmjd6 ↻ ≫
P2rx7 ↻ ≫
Gns ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Sppl3 ↻ ≫
Hps1 ↻ ≫
Wdr81 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Lat ↻ ≫
Mthfr ↻ ≫
Clcn6 ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Agrp ↻ ≫
Hexb ↻ ≫
Gba ↻ ≫
Dnajc13 ↻ ≫
Nudt9 ↻ ≫
Hps5 ↻ ≫
Gtf2h1 ↻ ≫
Mtdh ↻ ≫
Zfp607b ↻ ≫
Zfp710 ↻ ≫
Supt4a ↻ ≫
Aldh9a1 ↻ ≫
Rcbtb1 ↻ ≫
Serpina11 ↻ ≫
Cln3 ↻ ≫
Apobr ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
Ctsd ↻ ≫
Sumf1 ↻ ≫
Tom1 ↻ ≫
Uvrag ↻ ≫
Syngap1 ↻ ≫
Cuta ↻ ≫
Nagpa ↻ ≫
Nfia ↻ ≫
Ube2b ↻ ≫
Cdkl3 ↻ ≫
Thrap3 ↻ ≫
Nkx2-6 ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
Dolk ↻ ≫
Cbr3 ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Unc13d ↻ ≫
Med28 ↻ ≫
AW549877 ↻ ≫
Scyl1 ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Ppp1ca ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
E030030I06Rik ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Stau2 ↻ ≫
Cops7a ↻ ≫
Retreg2 ↻ ≫
Cnppd1 ↻ ≫
Slc23a3 ↻ ≫
Trpm7 ↻ ≫
Cep162 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Natd1 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Vps33a ↻ ≫
Orai2 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Adnp2 ↻ ≫
Srsf9 ↻ ≫
Gpr22 ↻ ≫
Mylip ↻ ≫
B4galt3 ↻ ≫
Zfp655 ↻ ≫
Washc5 ↻ ≫
Nsmce2 ↻ ≫
Rnasek ↻ ≫
0610010K14Rik ↻ ≫
Commd4 ↻ ≫
Neil1 ↻ ≫
4932438H23Rik ↻ ≫
Fbxw4 ↻ ≫
Gm10710 ↻ ≫
Dchs2 ↻ ≫
Gria1 ↻ ≫
Crebrf ↻ ≫
Map11 ↻ ≫
Lamtor4 ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Slc25a44 ↻ ≫
Top3a ↻ ≫
Smcr8 ↻ ≫
Prr5l ↻ ≫
Commd9 ↻ ≫
Gpr19 ↻ ≫
Srek1 ↻ ≫
Gtf2a1 ↻ ≫
Galm ↻ ≫
Ccnyl1 ↻ ≫
Olfr1274 ↻ ≫
Senp7 ↻ ≫
Psmc3 ↻ ≫
Arid1b ↻ ≫
Grn ↻ ≫
Afg3l1 ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Dyrk1b ↻ ≫
Fbl ↻ ≫
Atp6v1h ↻ ≫
Tnpo1 ↻ ≫
Cttnbp2nl ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Pcdh17 ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Wdsub1 ↻ ≫
Vamp3 ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Scamp3 ↻ ≫
Fam189b ↻ ≫
Sgo1 ↻ ≫
Ubn1 ↻ ≫
Glyr1 ↻ ≫
Supv3l1 ↻ ≫
Rdh5 ↻ ≫
Bloc1s1 ↻ ≫
Wipf2 ↻ ≫
Ccdc9 ↻ ≫
Marchf8 ↻ ≫
Thop1 ↻ ≫
Sgta ↻ ≫
Ell3 ↻ ≫
Serinc4 ↻ ≫
Serf2 ↻ ≫
Hypk ↻ ≫
Dnajc11 ↻ ≫
Tdrd1 ↻ ≫
Ccdc186 ↻ ≫
Tyr ↻ ≫
Zfp119b ↻ ≫
Ebi3 ↻ ≫
Elp5 ↻ ≫
Ctdnep1 ↻ ≫
Exd2 ↻ ≫
Ttc21a ↻ ≫
Gorasp1 ↻ ≫
Txlna ↻ ≫
Cul5 ↻ ≫
Ubap2l ↻ ≫
4933434E20Rik ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Gm525 ↻ ≫
Cerk ↻ ≫
Frmpd4 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Nr1d2 ↻ ≫
Iqsec1 ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Ypel5 ↻ ≫
Foxred2 ↻ ≫
Zfp84 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Tpt1 ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Gid4 ↻ ≫
Cand2 ↻ ≫
Ncl ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Zic4 ↻ ≫
Zic1 ↻ ≫
Dcaf12 ↻ ≫
9230019H11Rik ↻ ≫
Commd3 ↻ ≫
Bmi1 ↻ ≫
Snapin ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Zfp653 ↻ ≫
Sorbs1 ↻ ≫
Npm1 ↻ ≫
Shpk ↻ ≫
Ctns ↻ ≫
Rcc1l ↻ ≫
Gtf2ird2 ↻ ≫
Prkar1b ↻ ≫
Dnaaf5 ↻ ≫
Nr1h4 ↻ ≫
Gm51573 ↻ ≫
Sumo3 ↻ ≫
Pemt ↻ ≫
Piwil2 ↻ ≫
Polr3d ↻ ≫
Elovl5 ↻ ≫
Adam10 ↻ ≫
Rmc1 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Afg3l2 ↻ ≫
Xndc1 ↻ ≫
Rnf121 ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
A430005L14Rik ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Lrr1 ↻ ≫
Col6a6 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Smdt1 ↻ ≫
Sae1 ↻ ≫
Pheta2 ↻ ≫
Naga ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Creb3l3 ↻ ≫
Map2k2 ↻ ≫
Slitrk3 ↻ ≫
Col11a2 ↻ ≫
Slc39a7 ↻ ≫
Rxrb ↻ ≫
H2-Ke6 ↻ ≫
Ring1 ↻ ≫
Wdr35 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Exosc8 ↻ ≫
Alg5 ↻ ≫
Lipt2 ↻ ≫
E4f1 ↻ ≫
Arl2 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Puf60 ↻ ≫
Ctps ↻ ≫
Lrrc36 ↻ ≫
Safb2 ↻ ≫
Safb ↻ ≫
Kctd19 ↻ ≫
Cd209g ↻ ≫
Phf20 ↻ ≫
Hsp90aa1 ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Tbcel ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Unc45a ↻ ≫
Hddc3 ↻ ≫
9130401M01Rik ↻ ≫
Mrm3 ↻ ≫
Glod4 ↻ ≫
Hif1a ↻ ≫
Neu1 ↻ ≫
Acot2 ↻ ≫
Heatr4 ↻ ≫
Dnajc16 ↻ ≫
Casp9 ↻ ≫
Dpp6 ↻ ≫
Ifrd1 ↻ ≫
Creb1 ↻ ≫
Scrt2 ↻ ≫
Cpne4 ↻ ≫
Slc25a37 ↻ ≫
Synb ↻ ≫
Snrpd1 ↻ ≫
Esco1 ↻ ≫
Rbm14 ↻ ≫
Gm21992 ↻ ≫
Ppp6r1 ↻ ≫
Stt3b ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Fam13b ↻ ≫
Tef ↻ ≫
Ankhd1 ↻ ≫
Spg21 ↻ ≫
Hnrnpl ↻ ≫
Serpinb6a ↻ ≫
Ripk1 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Pramel32 ↻ ≫
Tmem41b ↻ ≫
Khdc4 ↻ ≫
Cry1 ↻ ≫
Pofut2 ↻ ≫
Cdk19 ↻ ≫
Mrpl2 ↻ ≫
Klc4 ↻ ≫
Cul7 ↻ ≫
Wwc1 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Susd6 ↻ ≫
Ino80e ↻ ≫
Hirip3 ↻ ≫
Cyth2 ↻ ≫
Gapvd1 ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Immt ↻ ≫
Mrpl35 ↻ ≫
Chrac1 ↻ ≫
Slc15a4 ↻ ≫
Hpf1 ↻ ≫
H2-DMa ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Hnrnph3 ↻ ≫
Brd2 ↻ ≫
Hdhd5 ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Mmel1 ↻ ≫
Rab8b ↻ ≫
Ubtd1 ↻ ≫
Mms19 ↻ ≫
Rheb ↻ ≫
Mrpl23 ↻ ≫
Kcnn1 ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Mcph1 ↻ ≫
Tsg101 ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Zfp959 ↻ ≫
Tmem59l ↻ ≫
Crlf1 ↻ ≫
Snrpa ↻ ≫
BC024978 ↻ ≫
Wdr62 ↻ ≫
Zbtb49 ↻ ≫
Lyar ↻ ≫
Ift46 ↻ ≫
Arcn1 ↻ ≫
Vapa ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Lmbr1l ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Ndel1 ↻ ≫
Tm9sf1 ↻ ≫
Ipo4 ↻ ≫
Med9 ↻ ≫
Tssk4 ↻ ≫
Ier5 ↻ ≫
Akap10 ↻ ≫
Elovl1 ↻ ≫
Cdc20 ↻ ≫
Sharpin ↻ ≫
Maf1 ↻ ≫
Cyc1 ↻ ≫
Gm35339 ↻ ≫
Stx4a ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
H2bc11 ↻ ≫
H2ac11 ↻ ≫
H2bc12 ↻ ≫
H2ac12 ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Zcchc9 ↻ ≫
Eif2s1 ↻ ≫
Atp6v1d ↻ ≫
Entpd4b ↻ ≫
Entpd4 ↻ ≫
Prr3 ↻ ≫
Abcf1 ↻ ≫
Dap ↻ ≫
Kansl2 ↻ ≫
Cbx1 ↻ ≫
Tm7sf3 ↻ ≫
Med21 ↻ ≫
Armc9 ↻ ≫
Gabra1 ↻ ≫
Smarcd1 ↻ ≫
Ddhd2 ↻ ≫
Mtor ↻ ≫
Ubiad1 ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Ptdss1 ↻ ≫
Mterf3 ↻ ≫
Qsox2 ↻ ≫
Hsdl1 ↻ ≫
Dnaaf1 ↻ ≫
Ubfd1 ↻ ≫
Ears2 ↻ ≫
Cfap74 ↻ ≫
Ccdc183 ↻ ≫
Rabl6 ↻ ≫
Smim14 ↻ ≫
Vps26c ↻ ≫
Fam166a ↻ ≫
Stpg3 ↻ ≫
Slc34a3 ↻ ≫
Tubb4b ↻ ≫
Ppm1a ↻ ≫
Dctpp1 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Unk ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Adh5 ↻ ≫
Zfp771 ↻ ≫
Ddx27 ↻ ≫
Uba6 ↻ ≫
2410002F23Rik ↻ ≫
Zfp622 ↻ ≫
Lrfn4 ↻ ≫
Rce1 ↻ ≫
Dop1a ↻ ≫
Ube2cbp ↻ ≫
Zfp148 ↻ ≫
Ssr1 ↻ ≫
Fem1b ↻ ≫
Tra2b ↻ ≫
Cc2d1b ↻ ≫
Pdpr ↻ ≫
Rab1a ↻ ≫
Tmem42 ↻ ≫
Synpo2l ↻ ≫
Sec24c ↻ ≫
Alas1 ↻ ≫
Slc30a9 ↻ ≫
Ppif ↻ ≫
Aktip ↻ ≫
Eef1e1 ↻ ≫
Trir ↻ ≫
Tnpo2 ↻ ≫
Mfsd5 ↻ ≫
Ppp2r5b ↻ ≫
Atg2a ↻ ≫
Naa40 ↻ ≫
S1pr5 ↻ ≫
Keap1 ↻ ≫
Senp8 ↻ ≫
Myo9a ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Rnase10 ↻ ≫
Ube2g2 ↻ ≫
Csad ↻ ≫
Ptgds ↻ ≫
Tbl1x ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Rsad2 ↻ ≫
Cmpk2 ↻ ≫
1700010I14Rik ↻ ≫
Cpeb4 ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Dhrs9 ↻ ≫
Pknox1 ↻ ≫
Smagp ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Paxip1 ↻ ≫
Olfr855 ↻ ≫
Olfr854 ↻ ≫
Hrob ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Lrrc8d ↻ ≫
Slc29a1 ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Cyp26a1 ↻ ≫
Bcl6 ↻ ≫
Plpp5 ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Zfp740 ↻ ≫
Ece1 ↻ ≫
Lsm12 ↻ ≫
G6pc3 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Tmem141 ↻ ≫
Fcna ↻ ≫
Bcl3 ↻ ≫
Gpd1 ↻ ≫
St6gal1 ↻ ≫
Tle1 ↻ ≫
Osgin1 ↻ ≫
Slc4a4 ↻ ≫
Pim3 ↻ ≫
Osbpl1a ↻ ≫
Ergic1 ↻ ≫
Mapk13 ↻ ≫
Acot1 ↻ ≫
Abhd11 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Sgk1 ↻ ≫
Klf3 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Pla2g6 ↻ ≫
Rhobtb1 ↻ ≫
A930033H14Rik ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Slc8b1 ↻ ≫
Cmip ↻ ≫
Pdp2 ↻ ≫
Tmcc3 ↻ ≫
Actn4 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Gbp7 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Sbno2 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Tmem171 ↻ ≫
Wdr89 ↻ ≫
Sik1 ↻ ≫
Nek4 ↻ ≫
Itih1 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Neu3 ↻ ≫
Fam214a ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Clpp ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Gm19774 ↻ ≫
Polg ↻ ≫
Sgms1 ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Mef2d ↻ ≫
Phc2 ↻ ≫
Mymx ↻ ≫
Arhgef7 ↻ ≫
Tpst2 ↻ ≫
Trp53inp1 ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Synpo ↻ ≫
Ephx1 ↻ ≫
Oaz1 ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Snx21 ↻ ≫
Tmem217 ↻ ≫
Tbc1d22b ↻ ≫
Cluh ↻ ≫
Acot4 ↻ ≫
Por ↻ ≫
Syne3 ↻ ≫
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