ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX9843667 | Lung cancer
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

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◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

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◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

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◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

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◢ SRX1722787: Hippocampus

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◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◣ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Olfr855 ↻ ≫
Olfr854 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Zfp949 ↻ ≫
Shfl ↻ ≫
Ppan ↻ ≫
Angptl6 ↻ ≫
Zbtb32 ↻ ≫
Kmt2b ↻ ≫
Nr4a1 ↻ ≫
Adss ↻ ≫
Polr3h ↻ ≫
Kcnn1 ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Pabpc1 ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Sdf4 ↻ ≫
B3galt6 ↻ ≫
Krt88 ↻ ≫
Krt81 ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Lrr1 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Maml1 ↻ ≫
Qrich1 ↻ ≫
Qars ↻ ≫
Lipt1 ↻ ≫
Etnk2 ↻ ≫
Tsga10 ↻ ≫
Gga1 ↻ ≫
Zfp318 ↻ ≫
Ccnt1 ↻ ≫
4930415O20Rik ↻ ≫
Dguok ↻ ≫
Scrib ↻ ≫
Zfp963 ↻ ≫
Ticam1 ↻ ≫
Mks1 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Ccnt2 ↻ ≫
Scrt1 ↻ ≫
Dgat1 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Pycrl ↻ ≫
Gfus ↻ ≫
Prr5 ↻ ≫
Lmbr1l ↻ ≫
Tmem249 ↻ ≫
Slc52a2 ↻ ≫
Fbxl6 ↻ ≫
Gsta2 ↻ ≫
Vapa ↻ ≫
1700034I23Rik ↻ ≫
Abhd18 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Gm3435 ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Ppp1ca ↻ ≫
Tbc1d10c ↻ ≫
Chrac1 ↻ ≫
Abca3 ↻ ≫
Abca17 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Taok2 ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Mrpl20 ↻ ≫
Ccnl2 ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Rrm2b ↻ ≫
Zbed4 ↻ ≫
Ccpg1os ↻ ≫
Ccpg1 ↻ ≫
Eif4b ↻ ≫
Prcc ↻ ≫
Mphosph9 ↻ ≫
2810006K23Rik ↻ ≫
Calcb ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Csde1 ↻ ≫
Xpnpep3 ↻ ≫
St13 ↻ ≫
Dnajb7 ↻ ≫
Uqcrq ↻ ≫
Leap2 ↻ ≫
Gdf9 ↻ ≫
Fcho2 ↻ ≫
Ctdsp2 ↻ ≫
Vti1b ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Thumpd3 ↻ ≫
Ep400 ↻ ≫
Pus1 ↻ ≫
Etfa ↻ ≫
Cfap20 ↻ ≫
Cyrib ↻ ≫
Lrrc24 ↻ ≫
C030006K11Rik ↻ ≫
Mbd2 ↻ ≫
Mob3a ↻ ≫
Izumo4 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Ahsa2 ↻ ≫
Zyg11b ↻ ≫
Lrrc51 ↻ ≫
Slc35f6 ↻ ≫
Slc35e1 ↻ ≫
Tctex1d4 ↻ ≫
Btbd19 ↻ ≫
Dyrk1a ↻ ≫
Lmnb2 ↻ ≫
Timm13 ↻ ≫
Becn1 ↻ ≫
Srebf2 ↻ ≫
Fam220a ↻ ≫
Rab36 ↻ ≫
Rsph14 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Mefv ↻ ≫
Rnf166 ↻ ≫
E4f1 ↻ ≫
Fam71e1 ↻ ≫
Emc10 ↻ ≫
Nolc1 ↻ ≫
Metap1 ↻ ≫
Abcb9 ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Zbtb4 ↻ ≫
Psmd8 ↻ ≫
Zfp607b ↻ ≫
1700001O22Rik ↻ ≫
Psmb2 ↻ ≫
Armc5 ↻ ≫
9130023H24Rik ↻ ≫
Ntmt1 ↻ ≫
Tgfb1i1 ↻ ≫
Ttc16 ↻ ≫
Ptrh1 ↻ ≫
Cfap157 ↻ ≫
Gm40193 ↻ ≫
Fxr2 ↻ ≫
Iqgap1 ↻ ≫
Pld2 ↻ ≫
Ccdc9 ↻ ≫
Ankrd11 ↻ ≫
Gzmm ↻ ≫
Cdc34 ↻ ≫
Scaf11 ↻ ≫
Prr13 ↻ ≫
Amhr2 ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Grin2d ↻ ≫
Sik1 ↻ ≫
Ehd1 ↻ ≫
Pcx ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
Kcnk6 ↻ ≫
2200002D01Rik ↻ ≫
Zhx1 ↻ ≫
Fancc ↻ ≫
Mrpl45 ↻ ≫
Fam168a ↻ ≫
Ints1 ↻ ≫
9430069I07Rik ↻ ≫
Snap47 ↻ ≫
Jmjd4 ↻ ≫
Nfatc3 ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
Gabarapl2 ↻ ≫
Tmem231 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Yipf2 ↻ ≫
Timm29 ↻ ≫
Opa3 ↻ ≫
Mpst ↻ ≫
Tst ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
Usp36 ↻ ≫
Glis2 ↻ ≫
Mutyh ↻ ≫
Smndc1 ↻ ≫
Toe1 ↻ ≫
Tmem223 ↻ ≫
Papss1 ↻ ≫
Tmem179b ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Gmpr2 ↻ ≫
Nedd8 ↻ ≫
Polr3f ↻ ≫
Dzank1 ↻ ≫
Psmc4 ↻ ≫
Tspan31 ↻ ≫
Marchf9 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Anapc15 ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Sgf29 ↻ ≫
Etfrf1 ↻ ≫
Casc1 ↻ ≫
Limk1 ↻ ≫
Gip ↻ ≫
Tssc4 ↻ ≫
Wdr45b ↻ ≫
Atcay ↻ ≫
Zfr2 ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Dda1 ↻ ≫
Abhd8 ↻ ≫
Tbc1d31 ↻ ≫
Tmem129 ↻ ≫
Tacc3 ↻ ≫
Slbp ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Eppk1 ↻ ≫
Best3 ↻ ≫
BC024139 ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Tmem87b ↻ ≫
Rtn3 ↻ ≫
Map3k14 ↻ ≫
Kdm2a ↻ ≫
Clasrp ↻ ≫
Sfr1 ↻ ≫
Kank2 ↻ ≫
Utp6 ↻ ≫
Rnf216 ↻ ≫
Dnpep ↻ ≫
Irf1 ↻ ≫
Ttll13 ↻ ≫
Mfsd13a ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
H2-K1 ↻ ≫
Fstl3 ↻ ≫
Pik3r1 ↻ ≫
Tbc1d15 ↻ ≫
Zfp319 ↻ ≫
Usb1 ↻ ≫
Prss57 ↻ ≫
Gtdc1 ↻ ≫
Asb6 ↻ ≫
Ccndbp1 ↻ ≫
Rela ↻ ≫
Nol12 ↻ ≫
Lgals1 ↻ ≫
Ubfd1 ↻ ≫
Ears2 ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Cic ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Actn4 ↻ ≫
Tatdn2 ↻ ≫
Hinfp ↻ ≫
Ppcdc ↻ ≫
Rnf44 ↻ ≫
Nubp1 ↻ ≫
Lrtm2 ↻ ≫
Cacna2d4 ↻ ≫
Dctpp1 ↻ ≫
Hagh ↻ ≫
Fahd1 ↻ ≫
Acsl5 ↻ ≫
Crem ↻ ≫
Zfp771 ↻ ≫
Zfp653 ↻ ≫
Arrdc1 ↻ ≫
Myd88 ↻ ≫
Acaa1a ↻ ≫
Hcfc2 ↻ ≫
Glt8d2 ↻ ≫
Stat3 ↻ ≫
Znfx1 ↻ ≫
Ubap2l ↻ ≫
4933434E20Rik ↻ ≫
Ctdsp1 ↻ ≫
Pxmp4 ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Prrt2 ↻ ≫
Zfp341 ↻ ≫
Pagr1a ↻ ≫
Tut1 ↻ ≫
Anapc4 ↻ ≫
Ank1 ↻ ≫
Ptp4a2 ↻ ≫
Rab3gap2 ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Shc1 ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Pygo2 ↻ ≫
Eci2 ↻ ≫
Rheb ↻ ≫
Ldlr ↻ ≫
Pbxip1 ↻ ≫
Tfcp2 ↻ ≫
Mrgbp ↻ ≫
Ogfr ↻ ≫
Ogfod3 ↻ ≫
Hexdc ↻ ≫
Garnl3 ↻ ≫
Exoc3l ↻ ≫
E2f4 ↻ ≫
4931428F04Rik ↻ ≫
Hspbp1 ↻ ≫
Brsk1 ↻ ≫
Zfp791 ↻ ≫
Supt4a ↻ ≫
Ube2n ↻ ≫
Rnf185 ↻ ≫
Taf11 ↻ ≫
Anks1 ↻ ≫
Mycbp ↻ ≫
Tbc1d23 ↻ ≫
Cutc ↻ ≫
Cox15 ↻ ≫
Slc35e3 ↻ ≫
Zc3h3 ↻ ≫
Stk25 ↻ ≫
Zfp90 ↻ ≫
Cdc5l ↻ ≫
Slc25a24 ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
Tcp11l2 ↻ ≫
Inpp5k ↻ ≫
Srsf5 ↻ ≫
Hmgn2 ↻ ≫
Cep112 ↻ ≫
Aff4 ↻ ≫
Xcr1 ↻ ≫
Fyco1 ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
Tmem219 ↻ ≫
Ddhd2 ↻ ≫
P4ha1 ↻ ≫
Csnk1a1 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Kctd5 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Fam229a ↻ ≫
Zfp384 ↻ ≫
Tssk3 ↻ ≫
Snrpg ↻ ≫
Fam136a ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Atxn7l3 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Serinc3 ↻ ≫
Sirt3 ↻ ≫
Psmd13 ↻ ≫
Pole4 ↻ ≫
Setd3 ↻ ≫
Ccnk ↻ ≫
Otud1 ↻ ≫
Tpmt ↻ ≫
Kdm1b ↻ ≫
Gpr19 ↻ ≫
Csnk1g2 ↻ ≫
Dstn ↻ ≫
Tom1l2 ↻ ≫
Drc3 ↻ ≫
Nhp2 ↻ ≫
Gan ↻ ≫
Ubac1 ↻ ≫
Lss ↻ ≫
Dgcr8 ↻ ≫
Tymp ↻ ≫
Sco2 ↻ ≫
Odf3b ↻ ≫
Rasip1 ↻ ≫
Izumo1 ↻ ≫
Ap1m1 ↻ ≫
Hmgxb3 ↻ ≫
Gpatch8 ↻ ≫
Thap12 ↻ ≫
Rbfox2 ↻ ≫
Pcif1 ↻ ≫
Tbl2 ↻ ≫
Lmna ↻ ≫
Gpbp1 ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Wdr27 ↻ ≫
1600012H06Rik ↻ ≫
Rangap1 ↻ ≫
Tcam1 ↻ ≫
Smarcd2 ↻ ≫
Llgl1 ↻ ≫
Polk ↻ ≫
Cert1 ↻ ≫
Gtf2e2 ↻ ≫
Klf16 ↻ ≫
Brd3os ↻ ≫
Prdm9 ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Nop14 ↻ ≫
Grk4 ↻ ≫
Phrf1 ↻ ≫
Rassf7 ↻ ≫
Lmntd2 ↻ ≫
Ranbp3 ↻ ≫
Prss30 ↻ ≫
Unk ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
Arid2 ↻ ≫
Mfsd5 ↻ ≫
Gpr155 ↻ ≫
Ctnnbip1 ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Cdc25a ↻ ≫
Phf19 ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Agrp ↻ ≫
Slc22a5 ↻ ≫
Mief1 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Ccm2 ↻ ≫
Cap1 ↻ ≫
Dazap2 ↻ ≫
Gm3776 ↻ ≫
Wdyhv1 ↻ ≫
Usp42 ↻ ≫
Atad2 ↻ ≫
Cers5 ↻ ≫
Tex261 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Cyth1 ↻ ≫
Ndufv1 ↻ ≫
Amt ↻ ≫
Doc2g ↻ ≫
Tcta ↻ ≫
Rhoa ↻ ≫
Mafk ↻ ≫
Sec61a1 ↻ ≫
Hes3 ↻ ≫
Ssu72 ↻ ≫
Fbxo27 ↻ ≫
Fam171a2 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Slc39a4 ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Sirt6 ↻ ≫
Setx ↻ ≫
Cpsf1 ↻ ≫
Gpr152 ↻ ≫
Cabp4 ↻ ≫
Ptprcap ↻ ≫
Cdk13 ↻ ≫
Tmem65 ↻ ≫
Tmub2 ↻ ≫
Coro1b ↻ ≫
Smg1 ↻ ≫
Tmem43 ↻ ≫
Chchd4 ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Abhd11 ↻ ≫
Ost4 ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Phospho1 ↻ ≫
Ptpa ↻ ≫
Crat ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Ap3d1 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Stap1 ↻ ≫
Scrn3 ↻ ≫
Cir1 ↻ ≫
Fzd5 ↻ ≫
Ap3s2 ↻ ≫
Pde8a ↻ ≫
Mon1a ↻ ≫
Upf1 ↻ ≫
Cenpc1 ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Polr2h ↻ ≫
Clcn2 ↻ ≫
Fbxl3 ↻ ≫
Dalrd3 ↻ ≫
Ndufaf3 ↻ ≫
Impdh2 ↻ ≫
Slc38a2 ↻ ≫
Rapgef2 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Syngr1 ↻ ≫
Flot2 ↻ ≫
Fzr1 ↻ ≫
Dohh ↻ ≫
Rpl3 ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Wdr70 ↻ ≫
Ddx52 ↻ ≫
Nup155 ↻ ≫
Pih1d1 ↻ ≫
Aldh16a1 ↻ ≫
Rnf149 ↻ ≫
Ksr1 ↻ ≫
Ncaph2 ↻ ≫
Lmf2 ↻ ≫
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Slc17a7 ↻ ≫
Dhrs13 ↻ ≫
Cd5 ↻ ≫
Zfp94 ↻ ≫
Snrpd2 ↻ ≫
Qpctl ↻ ≫
Upf3a ↻ ≫
Raf1 ↻ ≫
Rsrp1 ↻ ≫
B4galt1 ↻ ≫
Lima1 ↻ ≫
Syf2 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Smdt1 ↻ ≫
Polg2 ↻ ≫
Ddx5 ↻ ≫
Cep95 ↻ ≫
Lipe ↻ ≫
Bckdk ↻ ≫
Kat8 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Ggnbp1 ↻ ≫
Pheta2 ↻ ≫
Naga ↻ ≫
Bak1 ↻ ≫
Ddx50 ↻ ≫
Kiz ↻ ≫
Tonsl ↻ ≫
9130401M01Rik ↻ ≫
Cdk5r1 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Fam160b1 ↻ ≫
Polr2e ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Usp48 ↻ ≫
Twf1 ↻ ≫
Ube2s ↻ ≫
Sertad3 ↻ ≫
Skiv2l ↻ ≫
Nelfe ↻ ≫
Usp28 ↻ ≫
Csrnp2 ↻ ≫
Cmtr1 ↻ ≫
Csad ↻ ≫
Zfp740 ↻ ≫
Lekr1 ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Tlnrd1 ↻ ≫
Mesd ↻ ≫
Them4 ↻ ≫
Dcaf12 ↻ ≫
Chmp5 ↻ ≫
Bag1 ↻ ≫
Gdpgp1 ↻ ≫
Cib1 ↻ ≫
1810037I17Rik ↻ ≫
Myl6b ↻ ≫
Myl6 ↻ ≫
Oser1 ↻ ≫
Knl1 ↻ ≫
Brpf1 ↻ ≫
Rab6a ↻ ≫
Gna11 ↻ ≫
Adpgk ↻ ≫
Edrf1 ↻ ≫
Cdyl ↻ ≫
Baiap2l1 ↻ ≫
Cnot8 ↻ ≫
Pdap1 ↻ ≫
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