ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1688261 | ES cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◣ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Cldn34d ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Crym ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Aadacl2fm1 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Dchs2 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Csf2ra ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Kcnma1 ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
P2rx1 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Ephb1 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Gm3336 ↻ ≫
Pde4c ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
4930590J08Rik ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Zfp143 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Cox6a2 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Gpr37l1 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Tent5c ↻ ≫
Tent5a ↻ ≫
9330182O14Rik ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Krt28 ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Cables2 ↻ ≫
A530032D15Rik ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Dnajc27 ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Fxyd1 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Dlx2 ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Tnfrsf21 ↻ ≫
Olfr1373 ↻ ≫
Wnt7a ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Kcnk9 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Ptprf ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Aqp8 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Shh ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Pmp22 ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mdga1 ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Spz1 ↻ ≫
Ttc12 ↻ ≫
Necab2 ↻ ≫
Ccdc80 ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
Ppp1r32 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Bcl11b ↻ ≫
Ache ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Ramp3 ↻ ≫
Pfdn4 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Ppy ↻ ≫
Pyy ↻ ≫
Arhgap29 ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Fmnl1 ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Cebpe ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
C1qa ↻ ≫
C1qc ↻ ≫
Sox1 ↻ ≫
Adam19 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Nuak1 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Gja3 ↻ ≫
Esr1 ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Sgms2 ↻ ≫
Pcp4 ↻ ≫
Gm3667 ↻ ≫
Ccr4 ↻ ≫
Gm15517 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Shbg ↻ ≫
Efnb1 ↻ ≫
Nkx3-2 ↻ ≫
Slc14a1 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Cyp26b1 ↻ ≫
Samd5 ↻ ≫
Carhsp1 ↻ ≫
Tekt4 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Olfr1410 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Med24 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Zfp385c ↻ ≫
Hgfac ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Teddm1a ↻ ≫
Glul ↻ ≫
Prok1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Lims2 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Frmd8 ↻ ≫
Igsf23 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Smim24 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Foxi1 ↻ ≫
Gdnf ↻ ≫
Olfr313 ↻ ≫
Zfp930 ↻ ≫
Apob ↻ ≫
Cyp19a1 ↻ ≫
Spsb1 ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Ghrh ↻ ≫
Wnt3a ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Slc9a3r1 ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Ttf2 ↻ ≫
Clec4g ↻ ≫
Akr1c12 ↻ ≫
Penk ↻ ≫
Olfr1499 ↻ ≫
Tmprss9 ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Chrna3 ↻ ≫
Ehd2 ↻ ≫
Ffar3 ↻ ≫
Ffar1 ↻ ≫
Pcdhga12 ↻ ≫
Pcdhgb8 ↻ ≫
Adgrb1 ↻ ≫
Ren2 ↻ ≫
Ren1 ↻ ≫
Pappa2 ↻ ≫
Rxfp2 ↻ ≫
Tm9sf4 ↻ ≫
Ceacam1 ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Mrps23 ↻ ≫
Fbxo9 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Dpp6 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Trank1 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Gm5544 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Kcnj11 ↻ ≫
Deptor ↻ ≫
Gm10406 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
Dcdc5 ↻ ≫
Gtf2ird2 ↻ ≫
Adam6b ↻ ≫
Gfra2 ↻ ≫
Ltb ↻ ≫
Dact2 ↻ ≫
Bdnf ↻ ≫
Gabrb2 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Id2 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Epha4 ↻ ≫
Parp11 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Plxna4 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Scn5a ↻ ≫
Pnliprp2 ↻ ≫
Cntnap1 ↻ ≫
Odf3 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Il20ra ↻ ≫
Adamts8 ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Naglu ↻ ≫
Lrrc72 ↻ ≫
Mybpc2 ↻ ≫
Ttc21b ↻ ≫
Snf8 ↻ ≫
Fam50b ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Ifit1bl2 ↻ ≫
Ifit1 ↻ ≫
Wdr61 ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Crygs ↻ ≫
Irx3 ↻ ≫
Ppp1r3c ↻ ≫
Pbld1 ↻ ≫
Gypa ↻ ≫
Slc35f1 ↻ ≫
Rbp1 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Btnl9 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Klc3 ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
Ly6d ↻ ≫
Gm11100 ↻ ≫
Phlda1 ↻ ≫
Myc ↻ ≫
Runx3 ↻ ≫
4933421I07Rik ↻ ≫
Tmem132b ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Cd24a ↻ ≫
Fam43a ↻ ≫
Topbp1 ↻ ≫
Rbsn ↻ ≫
Tmem144 ↻ ≫
Afap1 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Crb2 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Rad18 ↻ ≫
Sh3rf3 ↻ ≫
Dtx1 ↻ ≫
Procr ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
A630023A22Rik ↻ ≫
Cacna1e ↻ ≫
Cacna1c ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Fmo2 ↻ ≫
Gm10634 ↻ ≫
Gm2396 ↻ ≫
Asgr1 ↻ ≫
Ypel2 ↻ ≫
Prkrip1 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Myo1e ↻ ≫
Hunk ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Inip ↻ ≫
Prlh ↻ ≫
Cdc16 ↻ ≫
Faiml ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Rab3a ↻ ≫
Cox7a1 ↻ ≫
Apmap ↻ ≫
Dlx5 ↻ ≫
Disp3 ↻ ≫
Cd207 ↻ ≫
Satb2 ↻ ≫
Spag11a ↻ ≫
Clcnkb ↻ ≫
Atoh8 ↻ ≫
Fam32a ↻ ≫
Cib3 ↻ ≫
Cdkn1c ↻ ≫
Kcnc4 ↻ ≫
2610042L04Rik ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Optc ↻ ≫
Ybx2 ↻ ≫
Zfp703 ↻ ≫
Pak4 ↻ ≫
Chrna1 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Apobec4 ↻ ≫
Elovl3 ↻ ≫
Plagl1 ↻ ≫
Smbd1 ↻ ≫
Iah1 ↻ ≫
Itga9 ↻ ≫
Crebl2 ↻ ≫
Hoxd3 ↻ ≫
Git1 ↻ ≫
Ankrd13b ↻ ≫
Gnat1 ↻ ≫
Gopc ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Ccl1 ↻ ≫
Fam207a ↻ ≫
Mllt1 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Nkiras2 ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Cldn11 ↻ ≫
Slc45a1 ↻ ≫
Rspo3 ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Tmem221 ↻ ≫
Nxnl1 ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Crybg1 ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Olfr557 ↻ ≫
Plcb1 ↻ ≫
Cxcl12 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Zfp345 ↻ ≫
Ube2cbp ↻ ≫
Dop1a ↻ ≫
Pcdhac1 ↻ ≫
Cntnap4 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Riox2 ↻ ≫
Rgs3 ↻ ≫
Nxpe5 ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Ctnnbip1 ↻ ≫
Spesp1 ↻ ≫
Hoxb8 ↻ ≫
Trpm5 ↻ ≫
Pitx2 ↻ ≫
Sema6a ↻ ≫
Pla2g2f ↻ ≫
Hrh2 ↻ ≫
Nrp1 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Armc12 ↻ ≫
Tlr2 ↻ ≫
Znhit1 ↻ ≫
Plod3 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Il17b ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Myo15b ↻ ≫
Mapkapk3 ↻ ≫
Trim61 ↻ ≫
Trim60 ↻ ≫
Stra8 ↻ ≫
Gpr162 ↻ ≫
Fam205c ↻ ≫
Castor1 ↻ ≫
Hemk1 ↻ ≫
6430571L13Rik ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Rnasel ↻ ≫
Znhit3 ↻ ≫
Mllt3 ↻ ≫
Irgm1 ↻ ≫
Adprhl1 ↻ ≫
Neto2 ↻ ≫
Hapln2 ↻ ≫
Kcnk15 ↻ ≫
Stoml3 ↻ ≫
Calcb ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Ficd ↻ ≫
Cndp2 ↻ ≫
Tlcd3b ↻ ≫
Mrs2 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Snrnp200 ↻ ≫
1810024B03Rik ↻ ≫
Hoxc8 ↻ ≫
Adamts16 ↻ ≫
Pick1 ↻ ≫
Tfap2c ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Ms4a6d ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Upk3bl ↻ ≫
Tmem250-ps ↻ ≫
Zfp36l2 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Rnd3 ↻ ≫
Dsel ↻ ≫
Glipr1l3 ↻ ≫
Caps2 ↻ ≫
Fam174c ↻ ≫
Efna2 ↻ ≫
Nupl2 ↻ ≫
Alox8 ↻ ≫
Cd52 ↻ ≫
Gm11127 ↻ ≫
Tpsb2 ↻ ≫
Ngfr ↻ ≫
Cd276 ↻ ≫
Capn11 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Hoxc6 ↻ ≫
Hoxc5 ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Tmtc2 ↻ ≫
Adra2a ↻ ≫
Gm6569 ↻ ≫
Gm3411 ↻ ≫
1700016H13Rik ↻ ≫
Dpm2 ↻ ≫
Zfp639 ↻ ≫
Msi1 ↻ ≫
Kcnip2 ↻ ≫
Calb2 ↻ ≫
Igsf3 ↻ ≫
Rph3al ↻ ≫
Igfbp7 ↻ ≫
1700019D03Rik ↻ ≫
Tal2 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Ccnd1 ↻ ≫
Tmem151b ↻ ≫
Nfkbie ↻ ≫
Fxyd2 ↻ ≫
Phactr3 ↻ ≫
Trmu ↻ ≫
Emx2 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
C1qtnf9 ↻ ≫
Napg ↻ ≫
Mark2 ↻ ≫
Eif1b ↻ ≫
Sptbn1 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Phyhd1 ↻ ≫
Fam91a1 ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Notum ↻ ≫
Mei1 ↻ ≫
P2rx6 ↻ ≫
Lrrc74b ↻ ≫
Aqp6 ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Kctd11 ↻ ≫
Adgrf1 ↻ ≫
Ntrk1 ↻ ≫
Insrr ↻ ≫
Tafa5 ↻ ≫
Maats1 ↻ ≫
Cox17 ↻ ≫
Ece1 ↻ ≫
Tnrc6b ↻ ≫
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