ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX7248105 | CD4 CD8 double positive cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◣ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Cldn34d ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Tro ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Ltb ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Pitpnm1 ↻ ≫
Cdk2ap2 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Vps13d ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Gnb5 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Runx1 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Rgcc ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Astl ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Gtf3c6 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Endou ↻ ≫
Tgfbr1 ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
H2-Ob ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Trp53i13 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Cbfa2t3 ↻ ≫
Col26a1 ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Gimap8 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Pfn3 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Carmil2 ↻ ≫
Actb ↻ ≫
Tmem88 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Gys2 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Armc12 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Actl10 ↻ ≫
1700003F12Rik ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Tnfaip8 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Spsb1 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Kctd11 ↻ ≫
Odf3 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Akirin2 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Brf1 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Gsn ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Ifi30 ↻ ≫
Zfp36l2 ↻ ≫
Ctrl ↻ ≫
Tmem221 ↻ ≫
Nxnl1 ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Car14 ↻ ≫
Spats1 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Ptk2b ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Ms4a6d ↻ ≫
Cacna1i ↻ ≫
Nos3 ↻ ≫
Gsk3a ↻ ≫
Nfkbil1 ↻ ≫
Atp6v1g2 ↻ ≫
Ndufa4l2 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Ddah2 ↻ ≫
Ppp1r3b ↻ ≫
Tnp2 ↻ ≫
Socs1 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Aip ↻ ≫
Tmem134 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Clec2m ↻ ≫
Igsf23 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Pdpk1 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Camk2g ↻ ≫
Pkn3 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Ccr4 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Cox8b ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Gsg1 ↻ ≫
Atn1 ↻ ≫
Aen ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
2210016F16Rik ↻ ≫
Bcl2l11 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
P2rx1 ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Egfl8 ↻ ≫
Id2 ↻ ≫
Gimap3 ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Os9 ↻ ≫
Ap4e1 ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Cox6a2 ↻ ≫
Bcl6 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Ppil1 ↻ ≫
Eif3g ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Fh1 ↻ ≫
Ccr7 ↻ ≫
Slfn1 ↻ ≫
Crocc ↻ ≫
Dhx58 ↻ ≫
Tmem151b ↻ ≫
Nfkbie ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Sorbs1 ↻ ≫
Lgals1 ↻ ≫
Nol12 ↻ ≫
Unc45b ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Mdga1 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Slc35b1 ↻ ≫
B3gnt9 ↻ ≫
Grk2 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Timeless ↻ ≫
Atp6v1g3 ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Tlk1 ↻ ≫
Sh3bgrl3 ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Slc26a8 ↻ ≫
Mapk14 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Gucy1b2 ↻ ≫
Kctd18 ↻ ≫
Ptprj ↻ ≫
Pex26 ↻ ≫
Fjx1 ↻ ≫
Ago2 ↻ ≫
Klf4 ↻ ≫
Ankrd6 ↻ ≫
Aox1 ↻ ≫
Rbp7 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Muc3 ↻ ≫
Trim29 ↻ ≫
Mien1 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Mrpl23 ↻ ≫
Ap1ar ↻ ≫
Hsd17b14 ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Dhcr7 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Bcl11b ↻ ≫
Slc9a8 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Scn2b ↻ ≫
Rrp1 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
Zfp341 ↻ ≫
Lrig2 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Galr3 ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
Timp2 ↻ ≫
Trub1 ↻ ≫
Camta2 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Armc7 ↻ ≫
Tex14 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Pigv ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Trpc4ap ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Crb2 ↻ ≫
Gnai3 ↻ ≫
C2cd4d ↻ ≫
Acin1 ↻ ≫
Scrn2 ↻ ≫
Ermn ↻ ≫
Cacnb3 ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Timm10 ↻ ≫
4931428F04Rik ↻ ≫
Exoc3l ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Hbb-bt ↻ ≫
Hbb-b2 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Cd52 ↻ ≫
Lsmem1 ↻ ≫
Sirt5 ↻ ≫
Cyp11a1 ↻ ≫
Nyap1 ↻ ≫
Tsc22d4 ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Ppfibp2 ↻ ≫
Sh3pxd2a ↻ ≫
Ctnnbip1 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
H13 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Dhx30 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Msra ↻ ≫
Pdlim7 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Atp1a1 ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Dbt ↻ ≫
Rtca ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Itga4 ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Hoxb6 ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Trim17 ↻ ≫
Pnkd ↻ ≫
Aamp ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Erap1 ↻ ≫
Ube4a ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Ahnak2 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Ccnd1 ↻ ≫
Jak2 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Gpr3 ↻ ≫
Slit3 ↻ ≫
St8sia1 ↻ ≫
Endov ↻ ≫
Ggt5 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Il17rc ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Dhrs3 ↻ ≫
Abcg4 ↻ ≫
Vsir ↻ ≫
Crbn ↻ ≫
Extl3 ↻ ≫
Utp25 ↻ ≫
Fbxo9 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Napg ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Tap2 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Ly6d ↻ ≫
B3gnt2 ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Cutc ↻ ≫
Cox15 ↻ ≫
Lyrm9 ↻ ≫
Tmem121 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Pmm1 ↻ ≫
Ifit2 ↻ ≫
Bcl2 ↻ ≫
Lpcat4 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Cfd ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Sephs2 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Cnih2 ↻ ≫
Stat4 ↻ ≫
Pdxp ↻ ≫
Prpf38b ↻ ≫
Tha1 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Vgf ↻ ≫
Klhdc9 ↻ ≫
Cxcr4 ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
Zfp786 ↻ ≫
Fam222a ↻ ≫
Cbl ↻ ≫
Sirt4 ↻ ≫
Ppm1f ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
Tex44 ↻ ≫
Ccdc63 ↻ ≫
Uchl5 ↻ ≫
Ro60 ↻ ≫
H2-T23 ↻ ≫
Cd164l2 ↻ ≫
Tlcd3b ↻ ≫
Nos2 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Eif1b ↻ ≫
Mafb ↻ ≫
Fam3c ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Bcl9l ↻ ≫
Mars1 ↻ ≫
Ddx46 ↻ ≫
Teddm2 ↻ ≫
Rgsl1 ↻ ≫
Abcg3 ↻ ≫
Tex22 ↻ ≫
S1pr4 ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Nfatc2ip ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Matn1 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Mfhas1 ↻ ≫
Arl5c ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Ints7 ↻ ≫
Dtl ↻ ≫
Adam6b ↻ ≫
Zpbp ↻ ≫
Spata48 ↻ ≫
Gabpb2 ↻ ≫
Prrt2 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Nemp2 ↻ ≫
Arhgap27 ↻ ≫
Tmem102 ↻ ≫
Fgf11 ↻ ≫
Epc1 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Lrrc51 ↻ ≫
Cdkl4 ↻ ≫
Cfl1 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Calcrl ↻ ≫
Slc14a1 ↻ ≫
Tctex1d1 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Capn11 ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Dtx1 ↻ ≫
H2-T3 ↻ ≫
Syngr1 ↻ ≫
Arap1 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Ptprf ↻ ≫
Naglu ↻ ≫
Gna15 ↻ ≫
Nfkb2 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
Angptl6 ↻ ≫
Adamtsl5 ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Hba-a2 ↻ ≫
Hba-a1 ↻ ≫
Slc9a3r2 ↻ ≫
Npw ↻ ≫
Hbq1b ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Cenpc1 ↻ ≫
Stap1 ↻ ≫
Psors1c2 ↻ ≫
2200002D01Rik ↻ ≫
Fads6 ↻ ≫
Atl2 ↻ ≫
Gh ↻ ≫
Ankrd46 ↻ ≫
Tomm34 ↻ ≫
Stk4 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Clpsl2 ↻ ≫
Dusp8 ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Ggt7 ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Ccnd2 ↻ ≫
Dusp16 ↻ ≫
Nabp2 ↻ ≫
St6galnac6 ↻ ≫
Ryr1 ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Ccr5 ↻ ≫
Ap3m2 ↻ ≫
Dazap2 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Ccdc194 ↻ ≫
Tubb3 ↻ ≫
Psma6 ↻ ≫
Flywch1 ↻ ≫
Trim8 ↻ ≫
Vim ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Rnh1 ↻ ≫
Hectd4 ↻ ≫
Lmna ↻ ≫
Fam220a ↻ ≫
Tmem259 ↻ ≫
Cnn2 ↻ ≫
Grap2 ↻ ≫
Nek8 ↻ ≫
Tlcd1 ↻ ≫
Glrx5 ↻ ≫
Limd2 ↻ ≫
Prrc2a ↻ ≫
Rpl28 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Gm3336 ↻ ≫
Cisd3 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Tmprss9 ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Cdc16 ↻ ≫
Mrps14 ↻ ≫
Xkr5 ↻ ≫
Gmppb ↻ ≫
Amigo3 ↻ ≫
Btbd2 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Ggnbp1 ↻ ≫
Bak1 ↻ ≫
Dlx2 ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Pde4c ↻ ≫
C1qtnf12 ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Crip1 ↻ ≫
Scai ↻ ≫
N4bp2l2 ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Smbd1 ↻ ≫
Ldlrad4 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Lrrc3c ↻ ≫
Plbd2 ↻ ≫
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Fxyd1 ↻ ≫
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