ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX2580296 | CD4 CD8 double negative cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◣ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Cldn34d ↻ ≫
Cdh12 ↻ ≫
Vmn2r4 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Tmem267 ↻ ≫
Zfp143 ↻ ≫
Csf2ra ↻ ≫
Muc3 ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Ankar ↻ ≫
Eef2 ↻ ≫
Dapk3 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
9230019H11Rik ↻ ≫
Klhl17 ↻ ≫
Trim50 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Sost ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Fbxo9 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Fxyd1 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Crym ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Trpc4ap ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Gm15517 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Tmem198 ↻ ≫
Chpf ↻ ≫
Cables2 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Azin2 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Odf3 ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Ncf4 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
C1qtnf9 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Capn11 ↻ ≫
Zfp385c ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Ramp3 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Pnkd ↻ ≫
Aamp ↻ ≫
Ifitm3 ↻ ≫
Gsn ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Col26a1 ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Smim24 ↻ ≫
Msra ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
9330182O14Rik ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Ms4a6d ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Tmprss9 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Ptprj ↻ ≫
Optc ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
Endou ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Ppy ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
4930590J08Rik ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
S1pr4 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Matn1 ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Cyp26b1 ↻ ≫
Nuak2 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Id2 ↻ ≫
Gm3336 ↻ ≫
Cox6a2 ↻ ≫
Plbd2 ↻ ≫
Prss35 ↻ ≫
H2-T23 ↻ ≫
Pyy ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Ceacam1 ↻ ≫
Ctrl ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Cox8b ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Ptprf ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Cacna1i ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Ltb ↻ ≫
Gsg1 ↻ ≫
Neil2 ↻ ≫
Crb2 ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Prkrip1 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
4930558K02Rik ↻ ≫
Phyhd1 ↻ ≫
Pde4c ↻ ≫
1700016H13Rik ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Irf2bp1 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Ccl17 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Cebpe ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Tesk2 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Tmem221 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Slc52a3 ↻ ≫
Bin3 ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
P2rx1 ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Crip1 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Naglu ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Nxnl1 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Spsb1 ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Adam19 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Apobec4 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Gm19345 ↻ ≫
Adcy4 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Ifi30 ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Notum ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Fmnl1 ↻ ≫
Tekt4 ↻ ≫
Zp3r ↻ ≫
Upk3bl ↻ ≫
Mdga1 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Ube3b ↻ ≫
Kctd10 ↻ ≫
Unc45b ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Padi2 ↻ ≫
Snrnp200 ↻ ≫
1810024B03Rik ↻ ≫
Gatd1 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Frmd8 ↻ ≫
Uevld ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Fam131c ↻ ≫
Vsig10l ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Elovl3 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Dnajc27 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Ralgds ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Nos3 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Lgals7 ↻ ≫
Mylk2 ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
Ccr5 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Clpsl2 ↻ ≫
Ptk2b ↻ ≫
Zfp930 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Il17b ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Pmp22 ↻ ≫
Atp5o ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Dusp8 ↻ ≫
Btnl9 ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
H2-T-ps ↻ ≫
Pitpnm1 ↻ ≫
Cdk2ap2 ↻ ≫
Hipk4 ↻ ≫
Unc5b ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Riox2 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Ppil1 ↻ ≫
Nob1 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Fbxo34 ↻ ≫
Clec2m ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Arhgap27 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Spz1 ↻ ≫
Pigv ↻ ≫
Armc12 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Runx1 ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Rnf20 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Casq1 ↻ ≫
Castor1 ↻ ≫
Hemk1 ↻ ≫
6430571L13Rik ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Lrrc51 ↻ ≫
Cyp4f15 ↻ ≫
Mei1 ↻ ≫
Flywch1 ↻ ≫
Pdpk1 ↻ ≫
Pfn3 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Slc17a7 ↻ ≫
Dst ↻ ≫
Hoxd3 ↻ ≫
Cdc16 ↻ ≫
Slc6a19 ↻ ≫
Dact2 ↻ ≫
Ficd ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
Ap3m2 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Teddm1a ↻ ≫
Glul ↻ ≫
Tmem250-ps ↻ ≫
Slc9a8 ↻ ≫
Syngr1 ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Ghrh ↻ ≫
Cnih2 ↻ ≫
Pla2g5 ↻ ≫
Nkiras2 ↻ ≫
Dmtn ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Prok1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Dhx58 ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
Dazap2 ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Hoxc8 ↻ ≫
Ppp1r32 ↻ ≫
Vpreb3 ↻ ≫
Gm5134 ↻ ≫
Inip ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Lrrc27 ↻ ≫
Acsl6 ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Napg ↻ ≫
Alox8 ↻ ≫
Zfp36l2 ↻ ≫
Catsper1 ↻ ≫
Gucy1b2 ↻ ≫
Rgs3 ↻ ≫
Plagl1 ↻ ≫
Reep4 ↻ ≫
Hr ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Xkr5 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Asgr1 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Ctnnbip1 ↻ ≫
Gna15 ↻ ≫
Dpys ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Crh ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Dgcr6 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Ggt7 ↻ ≫
Ache ↻ ≫
Cd24a ↻ ≫
Pmm1 ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Ptpro ↻ ≫
Rab27a ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Tbkbp1 ↻ ≫
C1qtnf6 ↻ ≫
Camk2g ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Nxph4 ↻ ≫
Aen ↻ ≫
Pigbos1 ↻ ≫
Pigb ↻ ≫
Irs2 ↻ ≫
Trnp1 ↻ ≫
Hsd17b14 ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Stat4 ↻ ≫
Tac4 ↻ ≫
Ssh2 ↻ ≫
Hgfac ↻ ≫
H2-Ob ↻ ≫
Stk32c ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Ybx2 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Trappc5 ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Fbp2 ↻ ≫
Pfdn4 ↻ ≫
Cyb5d1 ↻ ≫
Cthrc1 ↻ ≫
Pml ↻ ≫
Trpv2 ↻ ≫
Brf1 ↻ ≫
Ctdsp2 ↻ ≫
Smbd1 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Ggnbp1 ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Fcer1g ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Lamtor5 ↻ ≫
Mark2 ↻ ≫
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