ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX26175730 | NIH/3T3
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◣ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Gbx1 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Adgrb1 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Dact2 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Dusp8 ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Endou ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Upk3bl ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Apol7b ↻ ≫
Apol7e ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Timp3 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Col27a1 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Optc ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Slc6a4 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Fyb2 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Rasgef1c ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Cpne8 ↻ ≫
Fabp12 ↻ ≫
Gng7 ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Ago1 ↻ ≫
Mertk ↻ ≫
Slc52a3 ↻ ≫
Hoxc8 ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Col6a2 ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Smim24 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Casq2 ↻ ≫
Myo1b ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Slc14a1 ↻ ≫
Garem1 ↻ ≫
Ncf4 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Wdr61 ↻ ≫
Trpv2 ↻ ≫
Mchr1 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Tmem144 ↻ ≫
E230025N22Rik ↻ ≫
Notum ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Il17b ↻ ≫
Zdhhc19 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Samd5 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Rims3 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Fmnl1 ↻ ≫
Csf2rb ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Fxyd1 ↻ ≫
Cthrc1 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Elmo1 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Pdzk1ip1 ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Ccn5 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Vgf ↻ ≫
Bcr ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Fbxo9 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Mc3r ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Spg20 ↻ ≫
S100a14 ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Ppp1r32 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Fbxo7 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Elovl3 ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Asic4 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Pla2g5 ↻ ≫
Hba-a2 ↻ ≫
Hba-a1 ↻ ≫
Hbq1b ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Ralgds ↻ ≫
Hoxc10 ↻ ≫
Slit3 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Padi2 ↻ ≫
P2rx6 ↻ ≫
Lrrc74b ↻ ≫
Ptprf ↻ ≫
Tbkbp1 ↻ ≫
Nkx3-2 ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Plbd2 ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Ehd2 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Triobp ↻ ≫
Elane ↻ ≫
Prtn3 ↻ ≫
Sox8 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Apbb2 ↻ ≫
Abcc8 ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Unc5b ↻ ≫
Smug1 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Synj2 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Rarres1 ↻ ≫
Plcb1 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Rap1gap ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Syngr1 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Aqp8 ↻ ≫
Penk ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Cnnm4 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Apol8 ↻ ≫
Smbd1 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Zfp334 ↻ ≫
Lurap1l ↻ ≫
Myh4 ↻ ≫
Ccbe1 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Ror1 ↻ ≫
Ift27 ↻ ≫
Ggt7 ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Inip ↻ ≫
Scrn2 ↻ ≫
Mroh6 ↻ ≫
Mylk2 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Ifit2 ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Nos3 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Bcl6b ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Htra3 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Apob ↻ ≫
Prok1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
H2-Ob ↻ ≫
Gm19345 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Adamtsl5 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Exoc3l4 ↻ ≫
Wnt1 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Gata3 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Capn11 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Ache ↻ ≫
Cdh23 ↻ ≫
Ccdc105 ↻ ≫
Scai ↻ ≫
Prss35 ↻ ≫
Plb1 ↻ ≫
Catsper1 ↻ ≫
A530032D15Rik ↻ ≫
Zp3 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Cdx1 ↻ ≫
Pdgfrb ↻ ≫
Ece1 ↻ ≫
Gbp5 ↻ ≫
Slc17a7 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
9330182O14Rik ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Pappa2 ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Gm6569 ↻ ≫
Igfbp4 ↻ ≫
Cd24a ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Matn2 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Sgms2 ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Pik3r5 ↻ ≫
Glipr1l1 ↻ ≫
Dagla ↻ ≫
Becn1 ↻ ≫
Ccn2 ↻ ≫
Fam207a ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Cplx4 ↻ ≫
Hoga1 ↻ ≫
Dact3 ↻ ≫
Bms1 ↻ ≫
Mbp ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Osr2 ↻ ≫
Azin2 ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Trnp1 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Gm17660 ↻ ≫
Runx1 ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Adcy4 ↻ ≫
Ifit1bl2 ↻ ≫
Ifit1 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Fam91a1 ↻ ≫
Tafa3 ↻ ≫
Ppm1j ↻ ≫
Dazap2 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Lamtor5 ↻ ≫
Thbd ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Gnptab ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Slc9a3r2 ↻ ≫
Npw ↻ ≫
Oma1 ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Th ↻ ≫
Igf1 ↻ ≫
Klhl9 ↻ ≫
Nemp2 ↻ ≫
Slc2a13 ↻ ≫
9330159F19Rik ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Tekt4 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Ndufa4l2 ↻ ≫
Dst ↻ ≫
Abcc5 ↻ ≫
Ctdsp2 ↻ ≫
Tmem151b ↻ ≫
Nfkbie ↻ ≫
Fndc5 ↻ ≫
Ptgfr ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
4930558K02Rik ↻ ≫
Cldn11 ↻ ≫
Tnfaip8l1 ↻ ≫
Foxs1 ↻ ≫
Stim1 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Rnf215 ↻ ≫
Ror2 ↻ ≫
Fam136a ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Tpd52 ↻ ≫
Nos2 ↻ ≫
Dpys ↻ ≫
Cx3cr1 ↻ ≫
Ppy ↻ ≫
S1pr4 ↻ ≫
Pyy ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Klc3 ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Kcnj9 ↻ ≫
Ramp3 ↻ ≫
Bpi ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Pfdn4 ↻ ≫
Psd ↻ ≫
Fbxl15 ↻ ≫
Nrxn2 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Hipk4 ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
C1rb ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Ntn5 ↻ ≫
Gm11127 ↻ ≫
Trappc5 ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Mmgt2 ↻ ≫
Lrrc75a ↻ ≫
Slc2a1 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Tmem139 ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Casp2 ↻ ≫
Napg ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Brf1 ↻ ≫
Cblc ↻ ≫
Olfr225 ↻ ≫
Tctex1d1 ↻ ≫
Cr1l ↻ ≫
Nxph4 ↻ ≫
Igfbp3 ↻ ≫
Epha4 ↻ ≫
Npr1 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Gys2 ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Pkd2l1 ↻ ≫
1700016H13Rik ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
Igsf23 ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Dpysl3 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Adamts16 ↻ ≫
Wdr38 ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Ghrh ↻ ≫
Ddx24 ↻ ≫
Efna3 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Adam19 ↻ ≫
Galnt18 ↻ ≫
Mei1 ↻ ≫
Parp10 ↻ ≫
Angptl8 ↻ ≫
Bambi ↻ ≫
Chd5 ↻ ≫
Gna15 ↻ ≫
Armc12 ↻ ≫
Tspan32 ↻ ≫
Man2b2 ↻ ≫
Haus7 ↻ ≫
Mdga1 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Cacna1i ↻ ≫
Sult2b1 ↻ ≫
Prnd ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Trappc3l ↻ ≫
Mecr ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Tha1 ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
1600014C23Rik ↻ ≫
Cacnb3 ↻ ≫
Tnfaip8l2 ↻ ≫
Arhgap45 ↻ ≫
Caly ↻ ≫
Loxhd1 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Amhr2 ↻ ≫
Zfp65 ↻ ≫
Gm3402 ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Adgrf1 ↻ ≫
Slc12a9 ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Commd4 ↻ ≫
Vamp1 ↻ ≫
Car13 ↻ ≫
Pvalb ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Lipg ↻ ≫
Dpep1 ↻ ≫
Fbxo48 ↻ ≫
Pfkfb3 ↻ ≫
Nrg1 ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Pfn3 ↻ ≫
Dcdc5 ↻ ≫
Mt2 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Rps19bp1 ↻ ≫
Vsig10l ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Hoxc6 ↻ ≫
Hoxc5 ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Dgcr6 ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Arhgef18 ↻ ≫
C2cd4d ↻ ≫
Cfd ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Sptbn4 ↻ ≫
Gm3415 ↻ ≫
4930449I24Rik ↻ ≫
Grifin ↻ ≫
Gpaa1 ↻ ≫
Ugt1a7c ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Dlx5 ↻ ≫
F3 ↻ ≫
Mroh4 ↻ ≫
Eml1 ↻ ≫
Minpp1 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Cd300lg ↻ ≫
Dtna ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Pmp22 ↻ ≫
Ggnbp1 ↻ ≫
Bak1 ↻ ≫
Axin2 ↻ ≫
Mast4 ↻ ≫
Hgfac ↻ ≫
Fam53b ↻ ≫
Tmem163 ↻ ≫
Calhm5 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Kirrel ↻ ≫
Slc39a3 ↻ ≫
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Gm6408 ↻ ≫
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