ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX2400135 | CD4 CD8 double negative cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◣ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Ms4a6d ↻ ≫
Tcstv3 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Azin2 ↻ ≫
Ccr5 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Gsn ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Ramp3 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Trpc4ap ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Ahnak ↻ ≫
Tgfbr1 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Cox6a2 ↻ ≫
Clec2m ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Gsg1 ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Ltb ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Ptk2b ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Capn11 ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Hs3st3b1 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
St8sia1 ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Myoz3 ↻ ≫
Os9 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Thbd ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Tmem247 ↻ ≫
Gsk3a ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Fxyd1 ↻ ≫
Msra ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Ptprj ↻ ≫
Cdc16 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Lmna ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Btnl9 ↻ ≫
Ccr1l1 ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Mdga1 ↻ ≫
Pml ↻ ≫
Nol7 ↻ ≫
Ppil1 ↻ ≫
Prok1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Irf2bp1 ↻ ≫
Olfr222 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Fbxo9 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
Bin3 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Tamm41 ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Rhob ↻ ≫
Epb41l4b ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
S1pr1 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Riox2 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Bcl6 ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Gys2 ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Ccn5 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Mex3b ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Odf3 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Endou ↻ ≫
Celsr1 ↻ ≫
Rfx4 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
Phyhd1 ↻ ≫
Ermn ↻ ≫
Ctsg ↻ ≫
Ncf4 ↻ ≫
Id2 ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Crh ↻ ≫
4930558K02Rik ↻ ≫
Slc25a1 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Agfg1 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Slc7a8 ↻ ≫
C1qtnf9 ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
C1qtnf6 ↻ ≫
Fbp2 ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Ap3m2 ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Ston2 ↻ ≫
S1pr4 ↻ ≫
Trp53i13 ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Camk2g ↻ ≫
Lgals7 ↻ ≫
Enpp5 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Klre1 ↻ ≫
Ifitm3 ↻ ≫
Zp3r ↻ ≫
Bcr ↻ ≫
Cacna1i ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Cd6 ↻ ≫
Csf2 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Setd5 ↻ ≫
Krr1 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Gimap3 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
9330182O14Rik ↻ ≫
Adam6b ↻ ≫
Icosl ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
2610524H06Rik ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Matn1 ↻ ≫
Cela1 ↻ ≫
Ube3b ↻ ≫
Kctd10 ↻ ≫
Pbld1 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Myo15b ↻ ≫
Casq1 ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Rgs3 ↻ ≫
Armc7 ↻ ≫
Cxcr4 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Slc35b1 ↻ ≫
Brf1 ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Ttf2 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Gucy1b2 ↻ ≫
Fcer1g ↻ ≫
Sox8 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Tmem121 ↻ ≫
Parp11 ↻ ≫
B3galt5 ↻ ≫
Trmt12 ↻ ≫
Cabin1 ↻ ≫
Erich6b ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Egln3 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Cyp26b1 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Unc45b ↻ ≫
Lgals1 ↻ ≫
Nol12 ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Tnfaip8 ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Zfp692 ↻ ≫
Cox8b ↻ ≫
Vsig10l ↻ ≫
Plagl1 ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Ern1 ↻ ≫
Dnajc27 ↻ ≫
Ccnd2 ↻ ≫
Lrrc59 ↻ ≫
Lamtor5 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
Irs2 ↻ ≫
Ryr1 ↻ ≫
Slfn10-ps ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Cdk17 ↻ ≫
Ovca2 ↻ ≫
Lyrm7 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Dpm2 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Padi2 ↻ ≫
Lhfpl2 ↻ ≫
Col26a1 ↻ ≫
Spsb1 ↻ ≫
H2-Ob ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Tent5a ↻ ≫
Tctex1d1 ↻ ≫
Phb2 ↻ ≫
Emg1 ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Gimap8 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Sh3bgrl3 ↻ ≫
Ifitm2 ↻ ≫
Ptger3 ↻ ≫
Wnt11 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Mrps23 ↻ ≫
Tubb3 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Cd24a ↻ ≫
Tmem88 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Lrrn3 ↻ ≫
H2-T23 ↻ ≫
Ggt5 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Pnkd ↻ ≫
Aamp ↻ ≫
Acin1 ↻ ≫
Mylk2 ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Scimp ↻ ≫
Zfp930 ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Ffar3 ↻ ≫
Ffar1 ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Adcy4 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Tspan9 ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Ercc1 ↻ ≫
Galr3 ↻ ≫
Diras2 ↻ ≫
Umodl1 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Lrrc51 ↻ ≫
Cdh23 ↻ ≫
Thbs1 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Mtss2 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Gmppb ↻ ≫
Amigo3 ↻ ≫
Rcc1 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Fbxo44 ↻ ≫
Fbxo2 ↻ ≫
Zfp704 ↻ ≫
Arhgap27 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Slc44a3 ↻ ≫
Bcl2l11 ↻ ≫
Vpreb3 ↻ ≫
Gm5134 ↻ ≫
Frmd6 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Ficd ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Vgf ↻ ≫
Tesmin ↻ ≫
Flywch1 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Calcrl ↻ ≫
Slfn1 ↻ ≫
Il20ra ↻ ≫
Fam185a ↻ ≫
Ccdc146 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Spata31d1d ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
Mchr1 ↻ ≫
Stk10 ↻ ≫
Efcab9 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Pfn4 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Nxph4 ↻ ≫
Ctxn1 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Tgm2 ↻ ≫
Erp27 ↻ ≫
Clec1b ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Itgb6 ↻ ≫
Hemk1 ↻ ≫
6430571L13Rik ↻ ≫
Ssh2 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Fam151b ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Arap1 ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Ppa2 ↻ ≫
Hdhd3 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Cd52 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Nob1 ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Prss22 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Tnp2 ↻ ≫
Socs1 ↻ ≫
Mycn ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Tagap ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Olfr1373 ↻ ≫
Mro ↻ ≫
Sytl3 ↻ ≫
Jun ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
Ago2 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Kif23 ↻ ≫
Mapkapk3 ↻ ≫
Xirp1 ↻ ≫
Cish ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Mxd1 ↻ ≫
Snrnp200 ↻ ≫
1810024B03Rik ↻ ≫
Tmem102 ↻ ≫
Fgf11 ↻ ≫
Inhba ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Sirt7 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
2210016F16Rik ↻ ≫
Itga4 ↻ ≫
T2 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Cngb1 ↻ ≫
Inpp5f ↻ ≫
Mapk14 ↻ ≫
Slc26a8 ↻ ≫
Alpk3 ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Mtdh ↻ ≫
Usf2 ↻ ≫
Mei4 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Alox8 ↻ ≫
Capn3 ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Kctd11 ↻ ≫
Hectd4 ↻ ≫
Teddm1a ↻ ≫
Glul ↻ ≫
Spry2 ↻ ≫
Pdpk1 ↻ ≫
Vmn1r234 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Slc17a7 ↻ ≫
Dtwd2 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Cfap77 ↻ ≫
Bcl6b ↻ ≫
Cant1 ↻ ≫
Cbfa2t3 ↻ ≫
Orai1 ↻ ≫
M1ap ↻ ≫
Ceacam1 ↻ ≫
Puf60 ↻ ≫
Phlda1 ↻ ≫
Slc44a4 ↻ ≫
Ifng ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Unc5b ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Smbd1 ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Pdzk1ip1 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Fgf7 ↻ ≫
Tox2 ↻ ≫
Myo1e ↻ ≫
Fam3c ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Xylb ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Dennd2a ↻ ≫
Gnai3 ↻ ≫
Ccdc80 ↻ ≫
Fbxo7 ↻ ≫
Dhrs3 ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Arrb2 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Bcl2 ↻ ≫
4930590J08Rik ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Cd63 ↻ ≫
Adprhl1 ↻ ≫
Gvin1 ↻ ≫
Gm4070 ↻ ≫
Actb ↻ ≫
Spata5l1 ↻ ≫
Fam222a ↻ ≫
Arhgap24 ↻ ≫
Chst2 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Runx3 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Atn1 ↻ ≫
H2-Q8 ↻ ≫
H2-Q6 ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Cd200r1 ↻ ≫
Napg ↻ ≫
Cyp11a1 ↻ ≫
Pacsin2 ↻ ≫
Gm15517 ↻ ≫
Cotl1 ↻ ≫
Nepro ↻ ≫
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