ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3197476 | ES cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◣ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Tcstv3 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Crym ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Tmem198 ↻ ≫
Chpf ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Zfp385c ↻ ≫
Gm3336 ↻ ≫
Pde4c ↻ ≫
A530032D15Rik ↻ ≫
Nkiras2 ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
C1qtnf9 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Shbg ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Sytl3 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Trpc4ap ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Crb2 ↻ ≫
Wnt3a ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Lrfn2 ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Snf8 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
4930590J08Rik ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Cables2 ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Frg1 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Ppy ↻ ≫
Pyy ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Pfdn4 ↻ ≫
Lsmem2 ↻ ≫
Prss35 ↻ ≫
Hils1 ↻ ≫
Kcnk9 ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Ece1 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Tph2 ↻ ≫
Cfap77 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
1700016H13Rik ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
Ccl17 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Trappc5 ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Sox1 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Ctrl ↻ ≫
Anxa9 ↻ ≫
Cers2 ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Sipa1l2 ↻ ≫
Slc5a10 ↻ ≫
Plbd2 ↻ ≫
Naglu ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Cmtm3 ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Ceacam1 ↻ ≫
Lgals7 ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Slc10a2 ↻ ≫
Cldn15 ↻ ≫
Fbp2 ↻ ≫
Cyp4f15 ↻ ≫
Zfp930 ↻ ≫
Ramp3 ↻ ≫
Nuak2 ↻ ≫
Clpsl2 ↻ ≫
Dtna ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Ptpro ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Tcerg1l ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Cdc16 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Puf60 ↻ ≫
Fbxo9 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Fxyd1 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Tmprss9 ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Notum ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Mrps23 ↻ ≫
Fam32a ↻ ≫
Cib3 ↻ ≫
Cbll1 ↻ ≫
Adam19 ↻ ≫
Slc9a3r1 ↻ ≫
Hoxd3 ↻ ≫
Aadat ↻ ≫
Pnkd ↻ ≫
Aamp ↻ ≫
Dtx1 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Dact2 ↻ ≫
Rbsn ↻ ≫
Optc ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Smim24 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Ncf4 ↻ ≫
Znrd2 ↻ ≫
Fam89b ↻ ≫
Ehbp1l1 ↻ ≫
Fam151b ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Foxi1 ↻ ≫
Capn11 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Necab2 ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Atp5o ↻ ≫
Aif1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Slc6a19 ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
C1qa ↻ ≫
C1qc ↻ ≫
Uevld ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Git1 ↻ ≫
Ankrd13b ↻ ≫
Fxyd2 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Tekt4 ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Sec11c ↻ ≫
Dpf1 ↻ ≫
Scn5a ↻ ≫
Mt2 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Flywch1 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Azin2 ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Ficd ↻ ≫
Ptprj ↻ ≫
BC048507 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
Adprhl1 ↻ ≫
Dact3 ↻ ≫
2410004P03Rik ↻ ≫
Tmem250-ps ↻ ≫
Chmp6 ↻ ≫
Gpr107 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Mdga1 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Frmd8 ↻ ≫
Ccnd2 ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Dnase1l3 ↻ ≫
Ap3m2 ↻ ≫
Opcml ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
9330182O14Rik ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Kcnma1 ↻ ≫
Alox12e ↻ ≫
Col26a1 ↻ ≫
Rab37 ↻ ≫
Clec4g ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Faiml ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Cd248 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Asgr1 ↻ ≫
Slc7a8 ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Dner ↻ ≫
Ptprf ↻ ≫
Catsper1 ↻ ≫
Aqp8 ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Gpr37l1 ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Pcp2 ↻ ≫
Stxbp2 ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Neil2 ↻ ≫
Dst ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Adcy4 ↻ ≫
Bin3 ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
Muc13 ↻ ≫
Gc ↻ ≫
Irf2bp1 ↻ ≫
P2rx1 ↻ ≫
Tesk2 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Tubb3 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Scarf1 ↻ ≫
Mgst3 ↻ ≫
Rnd3 ↻ ≫
Gsdma ↻ ≫
Artn ↻ ≫
Efna5 ↻ ≫
Cthrc1 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Gpr137 ↻ ≫
Kcnk4 ↻ ≫
Dsel ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Msra ↻ ≫
Ccr5 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Gm15517 ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Nob1 ↻ ≫
Fh1 ↻ ≫
Aanat ↻ ≫
Ffar3 ↻ ≫
Ffar1 ↻ ≫
Chrna3 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Arhgef18 ↻ ≫
Junb ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Igf1 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
Ralgds ↻ ≫
Rgs3 ↻ ≫
Car14 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Kcnj11 ↻ ≫
Cisd3 ↻ ≫
Nagpa ↻ ≫
Scimp ↻ ≫
Zfp36l2 ↻ ≫
Nxph4 ↻ ≫
Hgfac ↻ ≫
Cdkn1c ↻ ≫
Tmem221 ↻ ≫
Nxnl1 ↻ ≫
Efna3 ↻ ≫
Acsl6 ↻ ≫
Pdlim7 ↻ ≫
Snrnp200 ↻ ≫
1810024B03Rik ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Map1lc3a ↻ ≫
C1s2 ↻ ≫
Lrrc27 ↻ ≫
Stk32c ↻ ≫
Ttf2 ↻ ≫
Sptbn4 ↻ ≫
Mark2 ↻ ≫
Adam8 ↻ ≫
H2-T3 ↻ ≫
Lmx1b ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
H2-T23 ↻ ≫
Ctnnbip1 ↻ ≫
Gnat1 ↻ ≫
Ythdf1 ↻ ≫
Birc7 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Hoxc6 ↻ ≫
Hoxc5 ↻ ≫
Trnp1 ↻ ≫
Mc3r ↻ ≫
Dnajc27 ↻ ≫
Olfr1373 ↻ ≫
Wnt7a ↻ ≫
B3galt5 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Ctxn1 ↻ ≫
Ocm ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Fyb2 ↻ ≫
Kirrel ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Prkrip1 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Ppp1r32 ↻ ≫
Shh ↻ ≫
Ybx2 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Npr1 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Vsig10l ↻ ≫
Scn4b ↻ ≫
Fam161a ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Ghrh ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Riox2 ↻ ≫
Ldhd ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Nrp1 ↻ ≫
Th ↻ ≫
Galnt18 ↻ ≫
Kctd15 ↻ ≫
Trim69 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
H2-T-ps ↻ ≫
Spire1 ↻ ≫
Dok4 ↻ ≫
Trpm5 ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Sh3rf3 ↻ ≫
Cd300lg ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Casq2 ↻ ≫
Olfr957 ↻ ≫
Atoh8 ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
Sh3bp2 ↻ ≫
Myo1e ↻ ≫
Sema5b ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
D6Ertd527e ↻ ≫
Gatd1 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Il17b ↻ ≫
Deptor ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Igsf3 ↻ ≫
Gm19345 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Smim12 ↻ ≫
Trim50 ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Mllt3 ↻ ≫
Bcl11b ↻ ≫
Dync1h1 ↻ ≫
Fndc5 ↻ ≫
Inhbb ↻ ≫
Ccr7 ↻ ≫
Aqp6 ↻ ≫
Ccr4 ↻ ≫
Pomk ↻ ≫
Aqp5 ↻ ≫
Mei1 ↻ ≫
Dcdc5 ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Epb41 ↻ ≫
Bbs1 ↻ ≫
Pigv ↻ ≫
Tbkbp1 ↻ ≫
Ephb1 ↻ ≫
Twistnb ↻ ≫
Slc17a7 ↻ ≫
Plec ↻ ≫
Apmap ↻ ≫
Gm11100 ↻ ≫
Mycn ↻ ≫
Irs2 ↻ ≫
Igfbp3 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Cmtm5 ↻ ≫
Fam131c ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Fntb ↻ ≫
Il27ra ↻ ≫
Adgrb2 ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Gtsf1l ↻ ≫
5730507C01Rik ↻ ≫
Nat9 ↻ ≫
Tmem104 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Cnih2 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Fstl4 ↻ ≫
Gm45337 ↻ ≫
Inip ↻ ≫
Pmm1 ↻ ≫
Epha4 ↻ ≫
Irf2 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Smug1 ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Ctnnd1 ↻ ≫
Btbd18 ↻ ≫
Plpp3 ↻ ≫
Padi6 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Cngb1 ↻ ≫
Rph3al ↻ ≫
Zfp652 ↻ ≫
Rap1gap ↻ ≫
Zfp345 ↻ ≫
Rfx7 ↻ ≫
Ercc1 ↻ ≫
S100a14 ↻ ≫
Dlx2 ↻ ≫
Btnl9 ↻ ≫
Pold2 ↻ ≫
Adam15 ↻ ≫
Mfsd6l ↻ ≫
Gm29797 ↻ ≫
Ttc12 ↻ ≫
Tmem200a ↻ ≫
Cldn13 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Phyhd1 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Lrrc51 ↻ ≫
Tent5b ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Rab27a ↻ ≫
Pigbos1 ↻ ≫
Pigb ↻ ≫
Tspan32 ↻ ≫
Camk2g ↻ ≫
Kcnc1 ↻ ≫
Adgrf1 ↻ ≫
Gm3776 ↻ ≫
Atxn7l3 ↻ ≫
Cacna1i ↻ ≫
Esrp2 ↻ ≫
Sgms2 ↻ ≫
Pitx2 ↻ ≫
Derl3 ↻ ≫
1700018F24Rik ↻ ≫
Cfap99 ↻ ≫
Olfr1499 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Fmnl1 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Hs3st3b1 ↻ ≫
Ly6d ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
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