ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX9326773 | ES cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◣ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Cldn34d ↻ ≫
Tcstv3 ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Crym ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Tmem198 ↻ ≫
Chpf ↻ ≫
Dnah2 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Grin2c ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Gdf15 ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Ddo ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Trim50 ↻ ≫
Cdc73 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Scarf1 ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Lrfn2 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Adcy5 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Pmm1 ↻ ≫
Rnf220 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Cfap45 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Acsl6 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Myrf ↻ ≫
Tmem200a ↻ ≫
Zfp385c ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Snf8 ↻ ≫
Itgbl1 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Dmtn ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Ppy ↻ ≫
Pyy ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Rab3a ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Fbxo9 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Fra10ac1 ↻ ≫
Dst ↻ ≫
Nkiras2 ↻ ≫
1700016H13Rik ↻ ≫
Ceacam1 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
Jph2 ↻ ≫
Boll ↻ ≫
Gbx1 ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Ece1 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
Map3k15 ↻ ≫
Pnkd ↻ ≫
Aamp ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Sox1 ↻ ≫
Rfc5 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Tfap2b ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Necab2 ↻ ≫
Ppp1r14a ↻ ≫
Crb2 ↻ ≫
Myo15b ↻ ≫
5730507C01Rik ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Med24 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Prss35 ↻ ≫
Bbs1 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Cbll1 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Tmem221 ↻ ≫
Nxnl1 ↻ ≫
Cfap77 ↻ ≫
Ifi30 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Tmprss9 ↻ ≫
Kcnma1 ↻ ≫
Ube3b ↻ ≫
Kctd10 ↻ ≫
Phb2 ↻ ≫
Emg1 ↻ ≫
Satb2 ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
Tmem250-ps ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Ctnnd1 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Rex1bd ↻ ≫
Ifitm3 ↻ ≫
Gm29797 ↻ ≫
Grb10 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Epha4 ↻ ≫
Marcksl1 ↻ ≫
Adam19 ↻ ≫
Olfr1499 ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Ptpro ↻ ≫
Slc30a1 ↻ ≫
Smim24 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Igf1r ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Mrpl10 ↻ ≫
Lrrc46 ↻ ≫
Osbpl7 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Osgin1 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Gabrp ↻ ≫
Naglu ↻ ≫
Slc9a3r1 ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
H4c6 ↻ ≫
H1f3 ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Sec16a ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Zp3r ↻ ≫
Alox8 ↻ ≫
Plekhg4 ↻ ≫
Plbd2 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Fxyd1 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Anxa9 ↻ ≫
Cers2 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Igfbp7 ↻ ≫
Dtna ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H1f4 ↻ ≫
Carmil2 ↻ ≫
Trim61 ↻ ≫
Trim60 ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Optc ↻ ≫
Mrpl16 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
C1rl ↻ ≫
H2bc1 ↻ ≫
H2ac1 ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Vsig10l ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Acod1 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
C1rb ↻ ≫
Mycn ↻ ≫
Dsel ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Tcerg1l ↻ ≫
Kcnk15 ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Slc6a19 ↻ ≫
Rai14 ↻ ≫
Elovl2 ↻ ≫
Htr1a ↻ ≫
C1qtnf9 ↻ ≫
Aoc2 ↻ ≫
Sptbn4 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Atp5o ↻ ≫
Klhdc9 ↻ ≫
Faiml ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Ascl5 ↻ ≫
Tgm2 ↻ ≫
Rexo4 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Capn11 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Nuak2 ↻ ≫
Dner ↻ ≫
Fndc1 ↻ ≫
Kcnb1 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Samd9l ↻ ≫
Sytl3 ↻ ≫
Git1 ↻ ≫
Ankrd13b ↻ ≫
Tspan9 ↻ ≫
Defa38 ↻ ≫
Gm15517 ↻ ≫
Ctxn1 ↻ ≫
Hes1 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Ltb ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
H4c17 ↻ ≫
Irgc1 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Btnl9 ↻ ≫
Slc9a3r2 ↻ ≫
Npw ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Znrd2 ↻ ≫
Fam89b ↻ ≫
Ehbp1l1 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Xkr5 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Slc17a7 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Kcnj11 ↻ ≫
Sgms2 ↻ ≫
Fxyd2 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Usp29 ↻ ≫
Peg3 ↻ ≫
Clpsl2 ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Fh1 ↻ ≫
H3c6 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Atoh8 ↻ ≫
Epb41l4b ↻ ≫
H3c10 ↻ ≫
H2bc13 ↻ ≫
H2ac13 ↻ ≫
Ror2 ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Bcar1 ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
Cav1 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Sipa1l2 ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Irf2bp1 ↻ ≫
Pomk ↻ ≫
Abcc9 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Kcnk9 ↻ ≫
Ctsg ↻ ≫
Cipc ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Clec2m ↻ ≫
Stum ↻ ≫
Patz1 ↻ ≫
Ppp1r32 ↻ ≫
Rimbp3 ↻ ≫
Cntnap1 ↻ ≫
Ccr10 ↻ ≫
Plekhh3 ↻ ≫
Apold1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Igsf3 ↻ ≫
Fam161a ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Rgs16 ↻ ≫
Ebf4 ↻ ≫
Rnf20 ↻ ≫
Camta2 ↻ ≫
Pcdhb10 ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Wscd2 ↻ ≫
Snai2 ↻ ≫
Ncoa2 ↻ ≫
4930590J08Rik ↻ ≫
Golt1a ↻ ≫
Iah1 ↻ ≫
Tead4 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Riox2 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Cd9 ↻ ≫
Gpr137 ↻ ≫
Kcnk4 ↻ ≫
Sec11c ↻ ≫
Nxph1 ↻ ≫
Slco5a1 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Hebp2 ↻ ≫
Cand2 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Ctrl ↻ ≫
Fmo2 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Sema5a ↻ ≫
F3 ↻ ≫
H2-T-ps ↻ ≫
Foxi1 ↻ ≫
Clk4 ↻ ≫
BC049762 ↻ ≫
Tsacc ↻ ≫
Cct3 ↻ ≫
Pml ↻ ≫
Dnah7a ↻ ≫
Nkap ↻ ≫
Ncoa3 ↻ ≫
Pmp22 ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Atmin ↻ ≫
Runx1 ↻ ≫
Ccdc85a ↻ ≫
Itga3 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Neto2 ↻ ≫
Cxcr1 ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
Cacna1i ↻ ≫
2700062C07Rik ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Id2 ↻ ≫
Alox12e ↻ ≫
Dlx5 ↻ ≫
Lpl ↻ ≫
Notum ↻ ≫
H4c18 ↻ ≫
Car14 ↻ ≫
Il20ra ↻ ≫
Flywch1 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Pdpk1 ↻ ≫
Hey1 ↻ ≫
Aox1 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Grin2a ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Slurp2 ↻ ≫
Lynx1 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Pigv ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Gm19345 ↻ ≫
Hoxd3 ↻ ≫
Cnih2 ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Ybx2 ↻ ≫
Trappc5 ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Mmgt2 ↻ ≫
Lrrc75a ↻ ≫
Crybg1 ↻ ≫
Ptgdr2 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Scn5a ↻ ≫
Mettl21a ↻ ≫
Atp8b1 ↻ ≫
Myod1 ↻ ≫
Tesk2 ↻ ≫
Frmd6 ↻ ≫
Gm3383 ↻ ≫
H2bc14 ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
Cyp4f15 ↻ ≫
Trappc3l ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Gsn ↻ ≫
9330182O14Rik ↻ ≫
Ptprf ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Hipk4 ↻ ≫
B4galt6 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Fbp2 ↻ ≫
Axin2 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Eno1 ↻ ≫
Slc38a8 ↻ ≫
Cbr3 ↻ ≫
Polg2 ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
Zfp786 ↻ ≫
Dixdc1 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Elovl3 ↻ ≫
Tmem139 ↻ ≫
Tnfrsf21 ↻ ≫
Ntrk1 ↻ ≫
Insrr ↻ ≫
Cep43 ↻ ≫
Ago1 ↻ ≫
Rpl38 ↻ ≫
Pcdh8 ↻ ≫
Ttyh2 ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
Fer ↻ ≫
Vpreb3 ↻ ≫
Gm5134 ↻ ≫
Nxph4 ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
Fcer1g ↻ ≫
Rbsn ↻ ≫
Ctdsp2 ↻ ≫
Hs3st3b1 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Cd300lg ↻ ≫
Trp53i13 ↻ ≫
Cdk6 ↻ ≫
Ficd ↻ ≫
Tbkbp1 ↻ ≫
Sh3bp2 ↻ ≫
Rbis ↻ ≫
Rpl18a ↻ ≫
Timp2 ↻ ≫
Slc5a5 ↻ ≫
Tns2 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Lgals7 ↻ ≫
Ap3m2 ↻ ≫
Fam53b ↻ ≫
Gm11100 ↻ ≫
Rasip1 ↻ ≫
S1pr3 ↻ ≫
B4galnt3 ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Cfap126 ↻ ≫
Olig2 ↻ ≫
Hoxb6 ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Gm10406 ↻ ≫
Zfp830 ↻ ≫
Cct6b ↻ ≫
Msra ↻ ≫
Ccl17 ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Krt28 ↻ ≫
BC048507 ↻ ≫
Tmem210 ↻ ≫
Lrrc26 ↻ ≫
H2-T3 ↻ ≫
Dnmt3l ↻ ≫
Aire ↻ ≫
Dact2 ↻ ≫
Endov ↻ ≫
Pkd2l1 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Dhx58 ↻ ≫
Cmtm3 ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Tpbgl ↻ ≫
Syt17 ↻ ≫
H2bc3 ↻ ≫
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Htr3b ↻ ≫
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