ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3946275 | C2C12
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◣ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Jph2 ↻ ≫
Arhgap22 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Foxc2 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Tcstv3 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Spz1 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Mylk2 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Endou ↻ ≫
Mybpc3 ↻ ≫
Ccl17 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Sdc3 ↻ ≫
Plxdc1 ↻ ≫
Galnt15 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Myoz3 ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Teddm1a ↻ ≫
Glul ↻ ≫
Sgca ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Sost ↻ ≫
Art4 ↻ ≫
Spsb1 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
4930579F01Rik ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Gsg1 ↻ ≫
Sytl3 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
A430057M04Rik ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Crip1 ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Padi2 ↻ ≫
Ncf4 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Nkx3-2 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Ppid ↻ ≫
Tanc2 ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Ramp3 ↻ ≫
Colec10 ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Chrna1 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Vpreb3 ↻ ≫
Gm5134 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Pmp22 ↻ ≫
Ttf2 ↻ ≫
Il27ra ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Lsmem2 ↻ ≫
Il17b ↻ ≫
Dpys ↻ ≫
Gata2 ↻ ≫
Col6a2 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Gm21885 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Dst ↻ ≫
Kirrel ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Prok1 ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Slc14a1 ↻ ≫
Adamts16 ↻ ≫
Usp42 ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Ankdd1a ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Fpgs ↻ ≫
C2cd4d ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Ccl1 ↻ ≫
Bfsp1 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Nfam1 ↻ ≫
9330182O14Rik ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Clec1b ↻ ≫
Hoxc8 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Gp1bb ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Casq2 ↻ ≫
Apob ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
4930558K02Rik ↻ ≫
Prss35 ↻ ≫
Ctnnbip1 ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Wdr38 ↻ ≫
Rgs3 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Wnt7b ↻ ≫
Cd7 ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Trmt12 ↻ ≫
Fam91a1 ↻ ≫
Mapk14 ↻ ≫
Slc26a8 ↻ ≫
Gramd4 ↻ ≫
Rad18 ↻ ≫
Prkrip1 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Armc12 ↻ ≫
Pcdh1 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Ccdc80 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Chit1 ↻ ≫
Spi1 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Ptk2b ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Lactbl1 ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Cd24a ↻ ≫
Brf1 ↻ ≫
Gpr84 ↻ ≫
Slc52a3 ↻ ≫
Rab17 ↻ ≫
Dact2 ↻ ≫
Neil2 ↻ ≫
Gm5544 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Alox8 ↻ ≫
Nudt6 ↻ ≫
Slc5a10 ↻ ≫
Cables2 ↻ ≫
Elovl3 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Fbxo48 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Ptprf ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Spg20 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Plxna1 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Gucy1b2 ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Timm10 ↻ ≫
Ptprj ↻ ≫
Mt2 ↻ ≫
Sema7a ↻ ≫
Apobec4 ↻ ≫
Lrrc45 ↻ ≫
Cenpx ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Frmd8 ↻ ≫
H2-T23 ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Tmem211 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Ift43 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Mecr ↻ ≫
C1qtnf6 ↻ ≫
Hoxa7 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Cant1 ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Net1 ↻ ≫
Prss22 ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Ralgds ↻ ≫
Rhob ↻ ≫
Mrps23 ↻ ≫
Rps19bp1 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Id2 ↻ ≫
Fam207a ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Cyp26b1 ↻ ≫
Igfbp4 ↻ ≫
Sik1 ↻ ≫
Spire1 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Gpc1 ↻ ≫
Sh3rf3 ↻ ≫
Adora3 ↻ ≫
Tnfsf4 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Phyhd1 ↻ ≫
Myc ↻ ≫
Mdga1 ↻ ≫
Sema5a ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Apbb2 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Spata5l1 ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Apeh ↻ ≫
Mertk ↻ ≫
Col27a1 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Tesk2 ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
Upk3bl ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Pts ↻ ≫
Pla2g5 ↻ ≫
Fmnl1 ↻ ≫
Timp3 ↻ ≫
Arhgap29 ↻ ≫
Tafa5 ↻ ≫
Tspan32 ↻ ≫
Cdc42ep2 ↻ ≫
Fam131c ↻ ≫
S100z ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Ehd3 ↻ ≫
Atp5o ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Tmem220 ↻ ≫
Dlx3 ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
Sulf2 ↻ ≫
Nop9 ↻ ≫
Dhrs1 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
AI413582 ↻ ≫
Cebpe ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Slc45a1 ↻ ≫
Ckb ↻ ≫
Smbd1 ↻ ≫
Klf1 ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Bod1 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Vwa7 ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Cdc16 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Thbd ↻ ≫
Becn1 ↻ ≫
Ccr7 ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Tent5b ↻ ≫
Accsl ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Tomm5 ↻ ≫
Krt28 ↻ ≫
Gnai3 ↻ ≫
Mttp ↻ ≫
Trmt10a ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Odf3l2 ↻ ≫
Ggt5 ↻ ≫
Pam16 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Adgrf1 ↻ ≫
A630023A22Rik ↻ ≫
Prlh ↻ ≫
Slc4a9 ↻ ≫
Tac4 ↻ ≫
Cd276 ↻ ≫
Afap1l2 ↻ ≫
Bmper ↻ ≫
Ghrh ↻ ≫
Rnf215 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Dennd2a ↻ ≫
Vmo1 ↻ ≫
Gltpd2 ↻ ≫
Lrig2 ↻ ≫
Eml1 ↻ ≫
Flnb ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Cd200r1 ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
Caly ↻ ≫
Gm29825 ↻ ≫
Gja1 ↻ ≫
Wdr95 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Pgls ↻ ≫
Niban3 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Bcl11b ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
4930590J08Rik ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Nuak1 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Tmigd1 ↻ ≫
Fam43a ↻ ≫
Catsper1 ↻ ≫
Klhdc10 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Ephb1 ↻ ≫
Arap1 ↻ ≫
Pmf1 ↻ ≫
Lexm ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Hoxb6 ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Gfap ↻ ≫
Trnp1 ↻ ≫
Nectin1 ↻ ≫
Asf1b ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Cndp2 ↻ ≫
Pold4 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Ern1 ↻ ≫
Msra ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Rgs2 ↻ ≫
Foxa2 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Gm3336 ↻ ≫
Pde4c ↻ ≫
Bcr ↻ ≫
Gdf5 ↻ ≫
Neto2 ↻ ≫
Ago2 ↻ ≫
Tm4sf5 ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
S100a7a ↻ ≫
Tekt4 ↻ ≫
Slc12a3 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Bcl2 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Slc7a5 ↻ ≫
S1pr4 ↻ ≫
Xirp1 ↻ ≫
Inip ↻ ≫
Napg ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Snrpf ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
Mllt3 ↻ ≫
Sox4 ↻ ≫
Nuak2 ↻ ≫
Penk ↻ ≫
Rce1 ↻ ≫
Dpm2 ↻ ≫
Kctd15 ↻ ≫
Nos3 ↻ ≫
Aoc2 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Gfra2 ↻ ≫
Tspan9 ↻ ≫
Dazap2 ↻ ≫
Ggnbp1 ↻ ≫
Bak1 ↻ ≫
Dph1 ↻ ≫
Rtn4rl1 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Uevld ↻ ≫
Tmem106c ↻ ≫
Reep4 ↻ ≫
Hr ↻ ≫
Wdr61 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Ybx2 ↻ ≫
Kcnj11 ↻ ≫
Ppil1 ↻ ≫
Ttll1 ↻ ≫
BC004004 ↻ ≫
1600014C23Rik ↻ ≫
Chmp6 ↻ ≫
Ddx24 ↻ ≫
Spesp1 ↻ ≫
Ppp1r32 ↻ ≫
Tnfrsf21 ↻ ≫
Rrp9 ↻ ≫
Parp3 ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Slc16a11 ↻ ≫
Dazl ↻ ≫
Adcy7 ↻ ≫
Aqp6 ↻ ≫
Cldn11 ↻ ≫
Aqp5 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Grk2 ↻ ≫
Osr2 ↻ ≫
Fen1 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
C1rb ↻ ≫
Mro ↻ ≫
Ror1 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Grasp ↻ ≫
Cthrc1 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Mtcl1 ↻ ≫
Gypa ↻ ≫
Asgr1 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Tmem139 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Cpne8 ↻ ≫
Osr1 ↻ ≫
Casp2 ↻ ≫
Odf3 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Astl ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Dusp2 ↻ ≫
Cx3cr1 ↻ ≫
Pds5b ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Phlda1 ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Atoh8 ↻ ≫
Ankrd44 ↻ ≫
Cdx1 ↻ ≫
Pdgfrb ↻ ≫
Nrg1 ↻ ≫
Rpp30 ↻ ≫
Capn1 ↻ ≫
Art3 ↻ ≫
Epha4 ↻ ≫
Ngdn ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Fes ↻ ≫
Plcl1 ↻ ≫
Hao1 ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Rxfp3 ↻ ≫
Lrrk1 ↻ ≫
Ctdsp2 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Nfkbil1 ↻ ≫
Atp6v1g2 ↻ ≫
Tmem247 ↻ ≫
Adra2b ↻ ≫
Azin2 ↻ ≫
Pcdhga12 ↻ ≫
Pcdhgb8 ↻ ≫
Hsd17b6 ↻ ≫
Irx3 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Mark2 ↻ ≫
Lamtor5 ↻ ≫
Gdf7 ↻ ≫
Gpx8 ↻ ≫
Syt17 ↻ ≫
Ssh2 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Zp3 ↻ ≫
Fam166b ↻ ≫
Ccl7 ↻ ≫
Prxl2c ↻ ≫
Armc7 ↻ ≫
Ccdc194 ↻ ≫
Inpp5f ↻ ≫
N4bp2l2 ↻ ≫
Epc1 ↻ ≫
Pdxp ↻ ≫
Ccser2 ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Pop5 ↻ ≫
Tmem87b ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Dhx58 ↻ ≫
H2-Ob ↻ ≫
Tor4a ↻ ≫
Gata3 ↻ ≫
Apol8 ↻ ≫
Matn1 ↻ ≫
Dusp8 ↻ ≫
Gng7 ↻ ≫
Snai2 ↻ ≫
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