ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1722787 | Hippocampus
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

◢ SRX14674622: Brown adipose tissue

◢ SRX14674623: Brown adipose tissue

◢ SRX14674624: Brown adipose tissue

◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

◢ SRX1722785: Hippocampus

◣ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

◢ SRX100293: Liver

◢ SRX2039594: Liver

◢ SRX2039595: Liver

◢ SRX2039596: Liver

◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

◢ SRX206481: Liver

◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375598: Liver

◢ SRX2375599: Liver

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◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

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◢ SRX5543269: Liver

◢ SRX5543270: Liver

◢ SRX5543271: Liver

◢ SRX5543272: Liver

◢ SRX5543273: Liver

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◢ SRX679441: Liver

◢ SRX679442: Liver

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◢ SRX997769: Liver

◢ SRX997770: Liver

◢ SRX997771: Liver

◢ SRX997772: Liver

◢ SRX997773: Liver

◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Amdhd2 ↻ ≫
Mfsd1 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Hexa ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Atxn3 ↻ ≫
Atp6v0b ↻ ≫
Dpp7 ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Ankrd12 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Bax ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Dvl2 ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Zfp507 ↻ ≫
Kdm4c ↻ ≫
Vps11 ↻ ≫
Clcn7 ↻ ≫
Rragc ↻ ≫
Osgep ↻ ≫
Apex1 ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Igf2r ↻ ≫
Mcoln1 ↻ ≫
Pip4p1 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
Atp6v1c1 ↻ ≫
Tpp1 ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Gns ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Sppl3 ↻ ≫
Hps1 ↻ ≫
Wdr81 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Mthfr ↻ ≫
Clcn6 ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Gba ↻ ≫
Dnajc13 ↻ ≫
Nudt9 ↻ ≫
Hps5 ↻ ≫
Gtf2h1 ↻ ≫
Mtdh ↻ ≫
Zfp607b ↻ ≫
Zfp710 ↻ ≫
Supt4a ↻ ≫
Rcbtb1 ↻ ≫
Cln3 ↻ ≫
Ptprs ↻ ≫
Ctsd ↻ ≫
Sumf1 ↻ ≫
Tom1 ↻ ≫
Uvrag ↻ ≫
Cuta ↻ ≫
Nagpa ↻ ≫
Ube2b ↻ ≫
Thrap3 ↻ ≫
Dolk ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Med28 ↻ ≫
AW549877 ↻ ≫
Scyl1 ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Stau2 ↻ ≫
Cops7a ↻ ≫
Cnppd1 ↻ ≫
Retreg2 ↻ ≫
Trpm7 ↻ ≫
Cep162 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Natd1 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Vps33a ↻ ≫
Orai2 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Adnp2 ↻ ≫
Zfp655 ↻ ≫
Washc5 ↻ ≫
Nsmce2 ↻ ≫
Rnasek ↻ ≫
Commd4 ↻ ≫
Gria1 ↻ ≫
Crebrf ↻ ≫
Lamtor4 ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Slc25a44 ↻ ≫
Top3a ↻ ≫
Smcr8 ↻ ≫
Commd9 ↻ ≫
Gpr19 ↻ ≫
Srek1 ↻ ≫
Galm ↻ ≫
Gtf2a1 ↻ ≫
Ccnyl1 ↻ ≫
Senp7 ↻ ≫
Psmc3 ↻ ≫
Arid1b ↻ ≫
Grn ↻ ≫
Afg3l1 ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Dyrk1b ↻ ≫
Atp6v1h ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Cttnbp2nl ↻ ≫
Pcdh17 ↻ ≫
Vamp3 ↻ ≫
Wdsub1 ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Scamp3 ↻ ≫
Sgo1 ↻ ≫
Ubn1 ↻ ≫
Glyr1 ↻ ≫
Supv3l1 ↻ ≫
Bloc1s1 ↻ ≫
Wipf2 ↻ ≫
Ccdc9 ↻ ≫
Marchf8 ↻ ≫
Sgta ↻ ≫
Serf2 ↻ ≫
Dnajc11 ↻ ≫
Ccdc186 ↻ ≫
Tyr ↻ ≫
Zfp119b ↻ ≫
Gabarap ↻ ≫
Exd2 ↻ ≫
Txlna ↻ ≫
Ttc21a ↻ ≫
Gorasp1 ↻ ≫
Cul5 ↻ ≫
Ubap2l ↻ ≫
4933434E20Rik ↻ ≫
Nr1d2 ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Ypel5 ↻ ≫
Foxred2 ↻ ≫
Zfp84 ↻ ≫
Tpt1 ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Gid4 ↻ ≫
Ncl ↻ ≫
Cand2 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Zic4 ↻ ≫
Dcaf12 ↻ ≫
Commd3 ↻ ≫
Snapin ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Zfp653 ↻ ≫
Npm1 ↻ ≫
Rcc1l ↻ ≫
Shpk ↻ ≫
Ctns ↻ ≫
Prkar1b ↻ ≫
Dnaaf5 ↻ ≫
Pemt ↻ ≫
Sumo3 ↻ ≫
Polr3d ↻ ≫
Elovl5 ↻ ≫
Adam10 ↻ ≫
Rmc1 ↻ ≫
Afg3l2 ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
A430005L14Rik ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Sae1 ↻ ≫
Smdt1 ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Map2k2 ↻ ≫
Slitrk3 ↻ ≫
Slc39a7 ↻ ≫
Rxrb ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Exosc8 ↻ ≫
Alg5 ↻ ≫
E4f1 ↻ ≫
Lipt2 ↻ ≫
Arl2 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Puf60 ↻ ≫
Ctps ↻ ≫
Safb2 ↻ ≫
Safb ↻ ≫
Phf20 ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Tbcel ↻ ≫
Hsp90aa1 ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Unc45a ↻ ≫
9130401M01Rik ↻ ≫
Mrm3 ↻ ≫
Glod4 ↻ ≫
Hif1a ↻ ≫
Neu1 ↻ ≫
Acot2 ↻ ≫
Dnajc16 ↻ ≫
Ifrd1 ↻ ≫
Creb1 ↻ ≫
Scrt2 ↻ ≫
Cpne4 ↻ ≫
Slc25a37 ↻ ≫
Esco1 ↻ ≫
Rbm14 ↻ ≫
Gm21992 ↻ ≫
Stt3b ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Ppp6r1 ↻ ≫
Tef ↻ ≫
Spg21 ↻ ≫
Fam13b ↻ ≫
Ankhd1 ↻ ≫
Hnrnpl ↻ ≫
Mtx1 ↻ ≫
Serpinb6a ↻ ≫
Ripk1 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Tmem41b ↻ ≫
Khdc4 ↻ ≫
Pofut2 ↻ ≫
Cdk19 ↻ ≫
Mrpl2 ↻ ≫
Klc4 ↻ ≫
Cry1 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Susd6 ↻ ≫
Ino80e ↻ ≫
Hirip3 ↻ ≫
Cyth2 ↻ ≫
Gapvd1 ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Immt ↻ ≫
Chrac1 ↻ ≫
Slc15a4 ↻ ≫
Hpf1 ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Hnrnph3 ↻ ≫
Brd2 ↻ ≫
H2-DMa ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Rab8b ↻ ≫
Hdhd5 ↻ ≫
Rheb ↻ ≫
Mettl23 ↻ ≫
Jmjd6 ↻ ≫
Mms19 ↻ ≫
Ubtd1 ↻ ≫
Mrpl23 ↻ ≫
Mcph1 ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Zfp959 ↻ ≫
Tsg101 ↻ ≫
Tmem59l ↻ ≫
Snrpa ↻ ≫
BC024978 ↻ ≫
Wdr62 ↻ ≫
Zbtb49 ↻ ≫
Lyar ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Vapa ↻ ≫
Arcn1 ↻ ≫
Ndel1 ↻ ≫
Lmbr1l ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Med9 ↻ ≫
Tm9sf1 ↻ ≫
Akap10 ↻ ≫
Cdc20 ↻ ≫
Sharpin ↻ ≫
Maf1 ↻ ≫
Stx4a ↻ ≫
Gtf2ird2 ↻ ≫
H2ac12 ↻ ≫
H2bc12 ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Zcchc9 ↻ ≫
Eif2s1 ↻ ≫
Atp6v1d ↻ ≫
Abcf1 ↻ ≫
Entpd4b ↻ ≫
Entpd4 ↻ ≫
Kansl2 ↻ ≫
Dap ↻ ≫
Cbx1 ↻ ≫
Armc9 ↻ ≫
Tm7sf3 ↻ ≫
Smarcd1 ↻ ≫
Mtor ↻ ≫
Ddhd2 ↻ ≫
Ptdss1 ↻ ≫
Mterf3 ↻ ≫
Qsox2 ↻ ≫
Ubfd1 ↻ ≫
Ears2 ↻ ≫
Hsdl1 ↻ ≫
Dnaaf1 ↻ ≫
Cfap74 ↻ ≫
Rabl6 ↻ ≫
Smim14 ↻ ≫
Vps26c ↻ ≫
Tubb4b ↻ ≫
Ppm1a ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Adh5 ↻ ≫
Ddx27 ↻ ≫
Uba6 ↻ ≫
2410002F23Rik ↻ ≫
Zfp622 ↻ ≫
Ube2cbp ↻ ≫
Lrfn4 ↻ ≫
Zfp148 ↻ ≫
Ssr1 ↻ ≫
Fem1b ↻ ≫
Tra2b ↻ ≫
Cc2d1b ↻ ≫
Pdpr ↻ ≫
Rab1a ↻ ≫
Tmem42 ↻ ≫
Sec24c ↻ ≫
Alas1 ↻ ≫
Slc30a9 ↻ ≫
Ppif ↻ ≫
Aktip ↻ ≫
Eef1e1 ↻ ≫
Tnpo2 ↻ ≫
Mfsd5 ↻ ≫
Atg2a ↻ ≫
Naa40 ↻ ≫
Keap1 ↻ ≫
Senp8 ↻ ≫
Myo9a ↻ ≫
Paxip1 ↻ ≫
G6pc3 ↻ ≫
Fcna ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Pdp2 ↻ ≫
Gbp7 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Polg ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Adcy10 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Rhobtb1 ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Tmcc3 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Tubb2a ↻ ≫
Prkcsh ↻ ≫
Ccdc151 ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Dcaf1 ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
C3 ↻ ≫
Tmem171 ↻ ≫
Cluh ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Rab5if ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Cbs ↻ ≫
Zfp719 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Fam71e1 ↻ ≫
Emc10 ↻ ≫
Gbp10 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Ctla2b ↻ ≫
Spen ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Oxsr1 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Pnpla3 ↻ ≫
Aox1 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Pla2g12a ↻ ≫
Lpp ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Rffl ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Acaa1a ↻ ≫
Cox20 ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Aup1 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Rnase10 ↻ ≫
Adh1 ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Cst3 ↻ ≫
Ublcp1 ↻ ≫
Coq8a ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Frat1 ↻ ≫
Xrcc1 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Rabgef1 ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Ifnar1 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Kxd1 ↻ ≫
Irgm2 ↻ ≫
Rara ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
4931406C07Rik ↻ ≫
A630076J17Rik ↻ ≫
Arsg ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Idh1 ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Rbm25 ↻ ≫
Cep120 ↻ ≫
Clp1 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Ptgr2 ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Coq10b ↻ ≫
Ccdc107 ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Tchhl1 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Lgals3bp ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Myd88 ↻ ≫
Gatd1 ↻ ≫
Arih2 ↻ ≫
H2-Q9 ↻ ≫
H2-Q7 ↻ ≫
Lemd2 ↻ ≫
Tmem53 ↻ ≫
Dlat ↻ ≫
Osgin1 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Polr2e ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Nup54 ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Slx4ip ↻ ≫
Mkks ↻ ≫
Zbtb21 ↻ ≫
Zfp113 ↻ ≫
Gbp6 ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Tcf4 ↻ ≫
Rchy1 ↻ ≫
Dyrk1a ↻ ≫
Acadm ↻ ≫
Tiparp ↻ ≫
Cd276 ↻ ≫
Hal ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
BC003965 ↻ ≫
St6gal1 ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Rptor ↻ ≫
Stat3 ↻ ≫
Med6 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Mgst1 ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
Kctd5 ↻ ≫
Rpl29 ↻ ≫
Ehd1 ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
Pum3 ↻ ≫
Ptp4a2 ↻ ≫
Elmod2 ↻ ≫
Nip7 ↻ ≫
Cog8 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Armh1 ↻ ≫
Psap ↻ ≫
Wdfy2 ↻ ≫
Gpn3 ↻ ≫
Fam216a ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Gclm ↻ ≫
Tatdn2 ↻ ≫
Pomp ↻ ≫
Arhgap23 ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Ahctf1 ↻ ≫
Selenop ↻ ≫
Gtpbp4 ↻ ≫
Ndufs2 ↻ ≫
Dbi ↻ ≫
3110009E18Rik ↻ ≫
Ints10 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Epg5 ↻ ≫
Ccnt1 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Gstm7 ↻ ≫
Phb2 ↻ ≫
Emg1 ↻ ≫
Ptpn12 ↻ ≫
Zfp36l2 ↻ ≫
Hpn ↻ ≫
Acnat2 ↻ ≫
Cd300lf ↻ ≫
Flot1 ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
H2-Q8 ↻ ≫
H2-Q6 ↻ ≫
Dnttip2 ↻ ≫
Por ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Krr1 ↻ ≫
Exosc4 ↻ ≫
Ptk2 ↻ ≫
Rrn3 ↻ ≫
Prkag1 ↻ ≫
Fblim1 ↻ ≫
Dcp1a ↻ ≫
Ap4e1 ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Ift46 ↻ ≫
Hif1an ↻ ≫
Spink10 ↻ ≫
Fbxo38 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Crem ↻ ≫
Il1rn ↻ ≫
Kifc5b ↻ ≫
H2-L ↻ ≫
H2-D1 ↻ ≫
Fam210a ↻ ≫
Mief1 ↻ ≫
Isy1 ↻ ≫
Slc39a14 ↻ ≫
9030025P20Rik ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Eif4ebp1 ↻ ≫
Smad6 ↻ ≫
Znrf1 ↻ ≫
Pigm ↻ ≫
Nlrp1b ↻ ≫
Gapdh ↻ ≫
Nudt1 ↻ ≫
Dohh ↻ ≫
Zfp658 ↻ ≫
Akap1 ↻ ≫
Rbm34 ↻ ≫
Rnmt ↻ ≫
Stk38 ↻ ≫
Prkab1 ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
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Yipf2 ↻ ≫
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