ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX9843666 | Lung cancer
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

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◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

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◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

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◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

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◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

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◢ SRX1158927: Hippocampus

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◢ SRX1722787: Hippocampus

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◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◣ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Nr4a1 ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Tsku ↻ ≫
Kctd11 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Il23a ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Polr3h ↻ ≫
1110002E22Rik ↻ ≫
Tpmt ↻ ≫
Kdm1b ↻ ≫
Etnk2 ↻ ≫
Etfa ↻ ≫
Sdf4 ↻ ≫
B3galt6 ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Ddit3 ↻ ≫
Eci2 ↻ ≫
Hif1an ↻ ≫
Gm14137 ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Gabarapl2 ↻ ≫
Mief1 ↻ ≫
Ccnt1 ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Atf3 ↻ ≫
Arih1 ↻ ≫
Ep400 ↻ ≫
Qars ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Coq10b ↻ ≫
Brpf1 ↻ ≫
Zbtb10 ↻ ≫
Nppb ↻ ≫
Cdc34 ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
Opa3 ↻ ≫
Fxr2 ↻ ≫
Nras ↻ ≫
Ptp4a2 ↻ ≫
Ndc80 ↻ ≫
Map9 ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Dgat1 ↻ ≫
Zfp511 ↻ ≫
Tubgcp2 ↻ ≫
Krtap1-5 ↻ ≫
Srp19 ↻ ≫
Lsm14b ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Tomm40 ↻ ≫
Tarbp2 ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Krt19 ↻ ≫
Smpdl3b ↻ ≫
Ndrg1 ↻ ≫
Gpbp1 ↻ ≫
Gm3776 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Rpl3 ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Ube2n ↻ ≫
D2hgdh ↻ ≫
Zfp622 ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Fcho2 ↻ ≫
Dennd6b ↻ ≫
Ccnt2 ↻ ≫
Rab3gap2 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Zfp959 ↻ ≫
Rassf7 ↻ ≫
Tatdn1 ↻ ≫
Ndufb9 ↻ ≫
Dhx32 ↻ ≫
Usp36 ↻ ≫
Zfp119b ↻ ≫
Slc38a2 ↻ ≫
Igsf23 ↻ ≫
Fosl1 ↻ ≫
4933405O20Rik ↻ ≫
Setx ↻ ≫
Cdca4 ↻ ≫
Fam160b1 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Atxn7l2 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Smndc1 ↻ ≫
Tst ↻ ≫
Mpst ↻ ≫
Hilpda ↻ ≫
Myl6b ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Ifi204 ↻ ≫
Eif4e ↻ ≫
Tatdn2 ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
Phlpp1 ↻ ≫
Eif4b ↻ ≫
Coro6 ↻ ≫
Sprr1a ↻ ≫
Spen ↻ ≫
Pold3 ↻ ≫
Ankrd40 ↻ ≫
Emp1 ↻ ≫
Rin1 ↻ ≫
Abhd18 ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Egr1 ↻ ≫
Rhebl1 ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Gpatch8 ↻ ≫
Ccl20 ↻ ≫
Tmie ↻ ≫
Als2cl ↻ ≫
Cluh ↻ ≫
Mvd ↻ ≫
Tmem65 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Fosb ↻ ≫
Zfp94 ↻ ≫
Hspa4 ↻ ≫
Tmem229b ↻ ≫
Echdc3 ↻ ≫
Egfl7 ↻ ≫
Cnot11 ↻ ≫
Mgat1 ↻ ≫
Zbed4 ↻ ≫
Vamp8 ↻ ≫
Per3 ↻ ≫
Syf2 ↻ ≫
Setdb1 ↻ ≫
Cc2d1b ↻ ≫
Tigit ↻ ≫
Rab11a ↻ ≫
Coro1b ↻ ≫
1810037I17Rik ↻ ≫
Supt4a ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Tnk2 ↻ ≫
Mbtps1 ↻ ≫
Ptpn12 ↻ ≫
Psmd8 ↻ ≫
Atxn2l ↻ ≫
Npc1 ↻ ≫
Nfkbie ↻ ≫
Arrb2 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
Atr ↻ ≫
1700065D16Rik ↻ ≫
Erich1 ↻ ≫
Chrac1 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Otud1 ↻ ≫
Osbpl9 ↻ ≫
Crlf3 ↻ ≫
Thap7 ↻ ≫
Hmgn2 ↻ ≫
B4galt1 ↻ ≫
Frat2 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Slc52a2 ↻ ≫
Fbxl6 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Atg16l2 ↻ ≫
Dennd3 ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Fbp2 ↻ ≫
Fermt1 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Scrn3 ↻ ≫
Cir1 ↻ ≫
Uqcrq ↻ ≫
Vps26c ↻ ≫
5031439G07Rik ↻ ≫
Aifm2 ↻ ≫
Hnrnpm ↻ ≫
Avpi1 ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Nudt8 ↻ ≫
Bclaf1 ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Tgoln2 ↻ ≫
Tgoln1 ↻ ≫
Isca1 ↻ ≫
Chrnb1 ↻ ≫
Myo5a ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Pigt ↻ ≫
Ddx50 ↻ ≫
Mphosph9 ↻ ≫
2810006K23Rik ↻ ≫
Samd1 ↻ ≫
Drg1 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Gm3435 ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Zfp623 ↻ ≫
Acy1 ↻ ≫
Mfsd5 ↻ ≫
Hdac5 ↻ ≫
Sdhb ↻ ≫
Errfi1 ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
Hinfp ↻ ≫
Lmbr1l ↻ ≫
Camta1 ↻ ≫
Srebf2 ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Ushbp1 ↻ ≫
Babam1 ↻ ≫
Zcwpw1 ↻ ≫
Mepce ↻ ≫
2310022A10Rik ↻ ≫
Pld3 ↻ ≫
Ankrd37 ↻ ≫
Vgll4 ↻ ≫
Bud13 ↻ ≫
Osbpl8 ↻ ≫
Josd1 ↻ ≫
Baiap2l1 ↻ ≫
Thumpd3 ↻ ≫
Erich2 ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
H2-L ↻ ≫
H2-D1 ↻ ≫
Zc3h10 ↻ ≫
Susd6 ↻ ≫
Nolc1 ↻ ≫
Cxcl10 ↻ ≫
Ccdc62 ↻ ≫
Six5 ↻ ≫
Zfp653 ↻ ≫
Hyal1 ↻ ≫
Surf6 ↻ ≫
Atp6v1c1 ↻ ≫
Rnf38 ↻ ≫
Eif3d ↻ ≫
Smg9 ↻ ≫
Fubp3 ↻ ≫
Tada1 ↻ ≫
Srr ↻ ≫
Smg6 ↻ ≫
Pofut2 ↻ ≫
Mms19 ↻ ≫
Ubtd1 ↻ ≫
Gigyf2 ↻ ≫
Vti1b ↻ ≫
Ywhaz ↻ ≫
Dck ↻ ≫
Mypop ↻ ≫
Csgalnact2 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
Serf2 ↻ ≫
Sart1 ↻ ≫
Camkk2 ↻ ≫
Ddx5 ↻ ≫
Cep95 ↻ ≫
Puf60 ↻ ≫
Mthfsd ↻ ≫
Gprc5a ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Dnajc14 ↻ ≫
Tmem198b ↻ ≫
Hps5 ↻ ≫
Gtf2h1 ↻ ≫
Toe1 ↻ ≫
Mutyh ↻ ≫
Nhej1 ↻ ≫
Med21 ↻ ≫
Zfp523 ↻ ≫
4931406C07Rik ↻ ≫
Kifc5b ↻ ≫
Sirt6 ↻ ≫
Sf3b1 ↻ ≫
Fam110a ↻ ≫
Fchsd2 ↻ ≫
Polg2 ↻ ≫
G2e3 ↻ ≫
Sdhaf2 ↻ ≫
Cpsf7 ↻ ≫
Taf1d ↻ ≫
Tecpr2 ↻ ≫
Cinp ↻ ≫
Cacul1 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Zfp740 ↻ ≫
Srp14 ↻ ≫
Arf3 ↻ ≫
Isyna1 ↻ ≫
Ankrd1 ↻ ≫
Fam71e1 ↻ ≫
Emc10 ↻ ≫
Dnajc16 ↻ ≫
Oser1 ↻ ≫
Prr13 ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Fblim1 ↻ ≫
Isy1 ↻ ≫
Txnip ↻ ≫
Inf2 ↻ ≫
Trir ↻ ≫
Capn10 ↻ ≫
Parp16 ↻ ≫
Mndal ↻ ≫
Ythdf2 ↻ ≫
Arfip1 ↻ ≫
Enthd1 ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Coq8b ↻ ≫
Tgfa ↻ ≫
Slc25a32 ↻ ≫
Dcaf13 ↻ ≫
Mrpl45 ↻ ≫
Zc3h18 ↻ ≫
Bcl7b ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Telo2 ↻ ≫
Fzr1 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Gpr155 ↻ ≫
Bag6 ↻ ≫
Ccdc84 ↻ ≫
Pip4p2 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Tpp2 ↻ ≫
Slc1a4 ↻ ≫
Ppp1r16a ↻ ≫
Wdyhv1 ↻ ≫
Rex1bd ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Micu1 ↻ ≫
Wee1 ↻ ≫
Pa2g4 ↻ ≫
Kdm2a ↻ ≫
Rab8a ↻ ≫
Heatr5a ↻ ≫
Atl2 ↻ ≫
Ctc1 ↻ ≫
Ralgapa2 ↻ ≫
Pgm2l1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Eloa ↻ ≫
Atg5 ↻ ≫
Vars ↻ ≫
D17H6S56E-5 ↻ ≫
Narf ↻ ≫
Txndc11 ↻ ≫
Coa7 ↻ ≫
Zfp7 ↻ ≫
Dnajb2 ↻ ≫
Hsdl1 ↻ ≫
Dnaaf1 ↻ ≫
Prr5 ↻ ≫
Ifnar1 ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
Btg1 ↻ ≫
Tmem30a ↻ ≫
Pcmtd1 ↻ ≫
Rab33b ↻ ≫
Cald1 ↻ ≫
Nudt5 ↻ ≫
Cdc123 ↻ ≫
Coasy ↻ ≫
Mlst8 ↻ ≫
Rev3l ↻ ≫
Edem1 ↻ ≫
Npat ↻ ≫
Atm ↻ ≫
Tns1 ↻ ≫
Rufy4 ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Timm13 ↻ ≫
Faf1 ↻ ≫
Smim14 ↻ ≫
Usp19 ↻ ≫
Twnk ↻ ≫
Hspe1 ↻ ≫
Hspd1 ↻ ≫
Mrpl43 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Klf3 ↻ ≫
Fsip1 ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Sgta ↻ ≫
Zer1 ↻ ≫
Scaf11 ↻ ≫
Tbc1d14 ↻ ≫
Clptm1 ↻ ≫
Nsrp1 ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Rps8 ↻ ≫
Dnpep ↻ ≫
Dap ↻ ≫
Abtb1 ↻ ≫
Zswim6 ↻ ≫
Msl2 ↻ ≫
Ablim1 ↻ ≫
Birc5 ↻ ≫
Nsun4 ↻ ≫
Eif3a ↻ ≫
Pik3r3 ↻ ≫
Pmf1 ↻ ≫
4931428F04Rik ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Ubr4 ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Klf2 ↻ ≫
Fam107b ↻ ≫
Usp38 ↻ ≫
Ranbp3 ↻ ≫
Uhrf2 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Maff ↻ ≫
Parp6 ↻ ≫
Lrp8 ↻ ≫
Dyrk1b ↻ ≫
Tcf4 ↻ ≫
Acadl ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Lcorl ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Rps21 ↻ ≫
Bcl2l11 ↻ ≫
Etf1 ↻ ≫
Kiz ↻ ≫
Mcat ↻ ≫
Bspry ↻ ≫
Krt80 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Neil1 ↻ ≫
Btg2 ↻ ≫
Epn1 ↻ ≫
Sf3b2 ↻ ≫
Mesd ↻ ≫
Tmem87a ↻ ≫
Ganc ↻ ≫
Nfyc ↻ ≫
Fam214b ↻ ≫
Utp15 ↻ ≫
Ankra2 ↻ ≫
Frmd6 ↻ ≫
Txn2 ↻ ≫
1700030J22Rik ↻ ≫
Osbpl2 ↻ ≫
Afg3l1 ↻ ≫
Elf3 ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Srd5a3 ↻ ≫
Cdk7 ↻ ≫
Ntmt1 ↻ ≫
Csnk1a1 ↻ ≫
Efcab14 ↻ ≫
Sema4b ↻ ≫
Tmem127 ↻ ≫
Ciao1 ↻ ≫
Prkab2 ↻ ≫
Poln ↻ ≫
Haus3 ↻ ≫
Phf20 ↻ ≫
Bola3 ↻ ≫
Rnf139 ↻ ≫
Zfp532 ↻ ≫
Rbm39 ↻ ≫
Myl12a ↻ ≫
Aldh9a1 ↻ ≫
Cyfip1 ↻ ≫
Brf1 ↻ ≫
Nxf1 ↻ ≫
Naaa ↻ ≫
Specc1l ↻ ≫
Pgap3 ↻ ≫
Gm4861 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Prss22 ↻ ≫
Glt8d2 ↻ ≫
Rrm2b ↻ ≫
Kdm5c ↻ ≫
Map4k2 ↻ ≫
Mthfd1l ↻ ≫
Kctd20 ↻ ≫
Cep72 ↻ ≫
Acaa1a ↻ ≫
Ccm2 ↻ ≫
Elp5 ↻ ≫
Ctdnep1 ↻ ≫
Ankrd11 ↻ ≫
Tbc1d17 ↻ ≫
Akt1s1 ↻ ≫
Dhrs11 ↻ ≫
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Tmem203 ↻ ≫
Ndor1 ↻ ≫
Rbx1 ↻ ≫
Snapin ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Als2 ↻ ≫
Herc2 ↻ ≫
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Ttll12 ↻ ≫
Gnl2 ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Crtc2 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
Cdk12 ↻ ≫
Unc50 ↻ ≫
Coa5 ↻ ≫
Fam32a ↻ ≫
Marchf8 ↻ ≫
Gga1 ↻ ≫
Nup62 ↻ ≫
Il4i1b ↻ ≫
Atf5 ↻ ≫
Dusp10 ↻ ≫
1700056E22Rik ↻ ≫
Stk32c ↻ ≫
Lrrc27 ↻ ≫
Tecr ↻ ≫
Tulp4 ↻ ≫
Tgfbrap1 ↻ ≫
AI597479 ↻ ≫
Mpp4 ↻ ≫
Pak1 ↻ ≫
Lrtm2 ↻ ≫
Celsr1 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Fam227b ↻ ≫
Dtwd1 ↻ ≫
Tmco4 ↻ ≫
Tab1 ↻ ≫
Rnf7 ↻ ≫
Gm10509 ↻ ≫
Pex11g ↻ ≫
Rnf19a ↻ ≫
Glt28d2 ↻ ≫
Siva1 ↻ ≫
Myo1d ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
Ctla2b ↻ ≫
Exosc4 ↻ ≫
Rrn3 ↻ ≫
Ubald1 ↻ ≫
Itgb1 ↻ ≫
Srsf5 ↻ ≫
Mtch2 ↻ ≫
Ctdsp2 ↻ ≫
Hic2 ↻ ≫
Bcl6 ↻ ≫
Lsm2 ↻ ≫
Tbc1d20 ↻ ≫
Rps27l ↻ ≫
Fkbp1a ↻ ≫
Srrm2 ↻ ≫
Sptan1 ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Ubap2l ↻ ≫
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