ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX4887836 | ES cells
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674623: Brown adipose tissue

◢ SRX14674624: Brown adipose tissue

◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◣ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

◢ SRX1722785: Hippocampus

◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

◢ SRX100293: Liver

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◢ SRX2039596: Liver

◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

◢ SRX206481: Liver

◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

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◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543271: Liver

◢ SRX5543272: Liver

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◢ SRX997770: Liver

◢ SRX997771: Liver

◢ SRX997772: Liver

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◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Porcn ↻ ≫
Slc39a14 ↻ ≫
Cdx1 ↻ ≫
Cdc42ep4 ↻ ≫
Rhpn2 ↻ ≫
Etv5 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Hdx ↻ ≫
Ccdc194 ↻ ≫
Lrrn2 ↻ ≫
Pkia ↻ ≫
Zfp658 ↻ ≫
Slc15a1 ↻ ≫
Gadd45g ↻ ≫
Vrtn ↻ ≫
Wnt8a ↻ ≫
Upp1 ↻ ≫
Il33 ↻ ≫
Pccb ↻ ≫
Gpc4 ↻ ≫
Lpar1 ↻ ≫
Gm45915 ↻ ≫
Lpp ↻ ≫
Oas1g ↻ ≫
Thbs2 ↻ ≫
Fubp3 ↻ ≫
Tmcc1 ↻ ≫
Itga9 ↻ ≫
Rbm14 ↻ ≫
Gm21992 ↻ ≫
Gm1966 ↻ ≫
Trim36 ↻ ≫
Slc7a3 ↻ ≫
Slc25a53 ↻ ≫
Zbtb24 ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Mobp ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Cnpy1 ↻ ≫
Rgs12 ↻ ≫
Med12 ↻ ≫
Wnt5b ↻ ≫
Robo4 ↻ ≫
Spred1 ↻ ≫
Dido1 ↻ ≫
Gid8 ↻ ≫
Calm5 ↻ ≫
Zkscan17 ↻ ≫
Terf1 ↻ ≫
Usp48 ↻ ≫
Timp4 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Tfe3 ↻ ≫
Tiparp ↻ ≫
B4gat1 ↻ ≫
Mapk4 ↻ ≫
Dhx32 ↻ ≫
Sms ↻ ≫
Slc25a1 ↻ ≫
Muc13 ↻ ≫
Rbbp7 ↻ ≫
Cd38 ↻ ≫
Scd1 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Etv1 ↻ ≫
Gm14393 ↻ ≫
Gprin1 ↻ ≫
Cst3 ↻ ≫
1700008O03Rik ↻ ≫
Shc4 ↻ ≫
Scmh1 ↻ ≫
Rbm41 ↻ ≫
Gjc1 ↻ ≫
Colgalt1 ↻ ≫
Prex1 ↻ ≫
Susd6 ↻ ≫
Cxcl11 ↻ ≫
Ppp2r2b ↻ ≫
Sgk3 ↻ ≫
Pde7b ↻ ≫
Nlrc4 ↻ ≫
Spry4 ↻ ≫
Bod1l ↻ ≫
Lrmp ↻ ≫
Rlim ↻ ≫
Trp53bp1 ↻ ≫
Tfpi ↻ ≫
Hmgxb4 ↻ ≫
Rif1 ↻ ≫
Stk38 ↻ ≫
1810020O05Rik ↻ ≫
Gbp4 ↻ ≫
Tex264 ↻ ≫
Golga7b ↻ ≫
Slc12a4 ↻ ≫
Rfx4 ↻ ≫
Foxh1 ↻ ≫
Ccl20 ↻ ≫
Liph ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Pou5f1 ↻ ≫
Chd7 ↻ ≫
L3mbtl2 ↻ ≫
Car14 ↻ ≫
Adgra2 ↻ ≫
Slc43a1 ↻ ≫
Slc12a9 ↻ ≫
Rpe ↻ ≫
Prps1 ↻ ≫
Ptprz1 ↻ ≫
Ly96 ↻ ≫
Slc7a9 ↻ ≫
Stat4 ↻ ≫
Lrriq4 ↻ ≫
Lrrc34 ↻ ≫
Slc7a1 ↻ ≫
Shf ↻ ≫
Cacng2 ↻ ≫
Fbxo27 ↻ ≫
Ccdc60 ↻ ≫
Sapcd1 ↻ ≫
Plpp1 ↻ ≫
Otx2 ↻ ≫
Zyg11a ↻ ≫
Noct ↻ ≫
Znrf1 ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Amt ↻ ≫
Vstm2l ↻ ≫
Fbxo15 ↻ ≫
Mylpf ↻ ≫
Muc3 ↻ ≫
Ifitm1 ↻ ≫
Slc16a9 ↻ ≫
Krt23 ↻ ≫
Lsm14b ↻ ≫
Ntmt1 ↻ ≫
Tmem220 ↻ ≫
Bnip1 ↻ ≫
Xkr7 ↻ ≫
Map2k6 ↻ ≫
Cpsf4l ↻ ≫
Mb21d2 ↻ ≫
Tango2 ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Nudt1 ↻ ≫
Snx10 ↻ ≫
Tex50 ↻ ≫
Rab34 ↻ ≫
Tpcn2 ↻ ≫
Eif2b5 ↻ ≫
Il1rapl1 ↻ ≫
Pgap6 ↻ ≫
Tcea3 ↻ ≫
Abcg2 ↻ ≫
Slc12a8 ↻ ≫
Mib2 ↻ ≫
Cdkl4 ↻ ≫
Scn1a ↻ ≫
Ubr5 ↻ ≫
Fam189a1 ↻ ≫
Myo10 ↻ ≫
Pde7a ↻ ≫
Rpusd2 ↻ ≫
Cped1 ↻ ≫
Pmpcb ↻ ≫
Tm7sf3 ↻ ≫
Gipc2 ↻ ≫
Elovl6 ↻ ≫
Lrrn4 ↻ ≫
Rnf182 ↻ ≫
Rassf1 ↻ ≫
Plcxd1 ↻ ≫
Ift46 ↻ ≫
Rtbdn ↻ ≫
Lhx1 ↻ ≫
Zfp719 ↻ ≫
Wsb2 ↻ ≫
Akap11 ↻ ≫
Spta1 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Efcab2 ↻ ≫
Rac1 ↻ ≫
Slc31a2 ↻ ≫
Fam118a ↻ ≫
Bmp4 ↻ ≫
Adap1 ↻ ≫
Rbm12 ↻ ≫
Cpne1 ↻ ≫
Bcat1 ↻ ≫
Pglyrp1 ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
Atoh1 ↻ ≫
N4bp2 ↻ ≫
Mcts1 ↻ ≫
Uba2 ↻ ≫
Dctn2 ↻ ≫
Slc12a2 ↻ ≫
Smc6 ↻ ≫
Gen1 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Mcf2 ↻ ≫
Hmces ↻ ≫
Syncrip ↻ ≫
Lypd11 ↻ ≫
Fblim1 ↻ ≫
Tmem171 ↻ ≫
Cep112 ↻ ≫
Arhgef39 ↻ ≫
Rarres1 ↻ ≫
Pkd2 ↻ ≫
Zfp40 ↻ ≫
Tgm3 ↻ ≫
Amd2 ↻ ≫
Amd1 ↻ ≫
Sp5 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Tdrd7 ↻ ≫
Ube2d2a ↻ ≫
Tjp2 ↻ ≫
Midn ↻ ≫
Csnk1a1 ↻ ≫
Celsr3 ↻ ≫
Ywhaz ↻ ≫
1700019D03Rik ↻ ≫
Wfikkn1 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Fam169b ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Ly6g6e ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Etv4 ↻ ≫
Fundc1 ↻ ≫
Flot1 ↻ ≫
Smad7 ↻ ≫
Zfp608 ↻ ≫
Dock11 ↻ ≫
Zfp976 ↻ ≫
Dusp5 ↻ ≫
Rnaseh2a ↻ ≫
Itgb6 ↻ ≫
Armcx1 ↻ ≫
Phc2 ↻ ≫
Slc23a2 ↻ ≫
Clk1 ↻ ≫
Slc9a3r1 ↻ ≫
Fam111a ↻ ≫
Dennd2c ↻ ≫
Pcdhgc4 ↻ ≫
Scrt1 ↻ ≫
Sema5b ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Ino80c ↻ ≫
Cysltr1 ↻ ≫
Nhsl1 ↻ ≫
Myrf ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Hax1 ↻ ≫
Asb8 ↻ ≫
Rdx ↻ ≫
Hivep3 ↻ ≫
Soga3 ↻ ≫
Cilp2 ↻ ≫
Serinc5 ↻ ≫
Dmc1 ↻ ≫
Grk3 ↻ ≫
H2bc22 ↻ ≫
H2ac22 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Sulf1 ↻ ≫
Sft2d1 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Ptp4a3 ↻ ≫
Tle6 ↻ ≫
Nr5a2 ↻ ≫
Zcrb1 ↻ ≫
Pphln1 ↻ ≫
C330007P06Rik ↻ ≫
Mob3c ↻ ≫
Cast ↻ ≫
Neurog1 ↻ ≫
Wdfy1 ↻ ≫
Bcap31 ↻ ≫
Abcd1 ↻ ≫
Phldb2 ↻ ≫
Slc35f2 ↻ ≫
Adamts6 ↻ ≫
Iqsec3 ↻ ≫
Tg ↻ ≫
Cdh10 ↻ ≫
Btla ↻ ≫
Rhox9 ↻ ≫
Adgrg6 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Defb1 ↻ ≫
Mymx ↻ ≫
Palm3 ↻ ≫
Triml2 ↻ ≫
Ripply1 ↻ ≫
Stmn1 ↻ ≫
Trpm1 ↻ ≫
Pelp1 ↻ ≫
Laptm4b ↻ ≫
Dppa2 ↻ ≫
Sh2d4b ↻ ≫
Msl2 ↻ ≫
Hic2 ↻ ≫
Habp4 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Fam110a ↻ ≫
Dnah1 ↻ ≫
Rasgef1a ↻ ≫
Hhla1 ↻ ≫
Zfp182 ↻ ≫
Gjb3 ↻ ≫
Sbk1 ↻ ≫
Gm11563 ↻ ≫
Frzb ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Lrpap1 ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Ifngr2 ↻ ≫
Tafa3 ↻ ≫
Dock7 ↻ ≫
Lamb2 ↻ ≫
Prmt6 ↻ ≫
Fam162a ↻ ≫
Ccdc58 ↻ ≫
Zfp33b ↻ ≫
Stk40 ↻ ≫
Serpina3i ↻ ≫
Cyb5r4 ↻ ≫
Kcnj8 ↻ ≫
Ceacam13 ↻ ≫
2410141K09Rik ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Hlf ↻ ≫
Sybu ↻ ≫
Gpr1 ↻ ≫
Gm13275 ↻ ≫
Spint1 ↻ ≫
Cd109 ↻ ≫
Rnf125 ↻ ≫
Vegfc ↻ ≫
Sars ↻ ≫
Ido1 ↻ ≫
Rbm47 ↻ ≫
Arhgap42 ↻ ≫
Runx1t1 ↻ ≫
Lmntd1 ↻ ≫
Notch4 ↻ ≫
Glra1 ↻ ≫
Klhl4 ↻ ≫
Olfr884 ↻ ≫
Sst ↻ ≫
Barhl1 ↻ ≫
Cited4 ↻ ≫
Gpr83 ↻ ≫
Tspan9 ↻ ≫
Trim66 ↻ ≫
Slc29a1 ↻ ≫
Calm2 ↻ ≫
Nfu1 ↻ ≫
Gpx8 ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Hesx1 ↻ ≫
Plod1 ↻ ≫
Klhl34 ↻ ≫
Mdk ↻ ≫
Klhdc7a ↻ ≫
Il17rd ↻ ≫
Mkrn1 ↻ ≫
Hsd17b11 ↻ ≫
Dennd6a ↻ ≫
Plekhf2 ↻ ≫
Trmt44 ↻ ≫
Lrrtm3 ↻ ≫
Slc39a4 ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
Cdc20 ↻ ≫
Pmvk ↻ ≫
Mad1l1 ↻ ≫
Fbp2 ↻ ≫
1700102P08Rik ↻ ≫
Rep15 ↻ ≫
Arl15 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Pvr ↻ ≫
Zp3 ↻ ≫
Foxr2 ↻ ≫
Gm3752 ↻ ≫
Prrt3 ↻ ≫
Rusc2 ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Gm1070 ↻ ≫
Krt17 ↻ ≫
Tigd2 ↻ ≫
Phf10 ↻ ≫
Slc6a7 ↻ ≫
Nanog ↻ ≫
Anapc4 ↻ ≫
Brd2 ↻ ≫
Rnf145 ↻ ≫
H2-DMa ↻ ≫
Cldn5 ↻ ≫
Nrd1 ↻ ≫
Dnajc6 ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Slc27a2 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Lekr1 ↻ ≫
Ripk3 ↻ ≫
Rln1 ↻ ≫
Dhcr7 ↻ ≫
Nadsyn1 ↻ ≫
Fndc3b ↻ ≫
Rps23rg1 ↻ ≫
Rln3 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Fis1 ↻ ≫
Spry2 ↻ ≫
Vgf ↻ ≫
Oas1a ↻ ≫
Wipf1 ↻ ≫
Letmd1 ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Gba ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Dpp7 ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Mfsd1 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Vps11 ↻ ≫
Clcn7 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
Paxip1 ↻ ≫
Dvl2 ↻ ≫
Ube2b ↻ ≫
Tpp1 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Commd9 ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Mcoln1 ↻ ≫
G6pc3 ↻ ≫
Hexa ↻ ≫
Fcna ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Pdp2 ↻ ≫
Gbp7 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Osgep ↻ ≫
Apex1 ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Polg ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Adcy10 ↻ ≫
Scamp3 ↻ ≫
Rhobtb1 ↻ ≫
Tmcc3 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Tubb2a ↻ ≫
Prkcsh ↻ ≫
Ccdc151 ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Dcaf1 ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Commd4 ↻ ≫
C3 ↻ ≫
Cluh ↻ ≫
Rab5if ↻ ≫
Cln3 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Cbs ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Mthfr ↻ ≫
Dyrk1b ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Fam71e1 ↻ ≫
Emc10 ↻ ≫
Gbp10 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Cnppd1 ↻ ≫
Retreg2 ↻ ≫
Kdm4c ↻ ≫
Ctla2b ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Spen ↻ ≫
Clcn6 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Tpt1 ↻ ≫
Oxsr1 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Pnpla3 ↻ ≫
Aox1 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Pla2g12a ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
Vps33a ↻ ≫
Eif2s1 ↻ ≫
Atp6v1d ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Rffl ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Acaa1a ↻ ≫
Cox20 ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Aup1 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Rnase10 ↻ ≫
Adh1 ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Ublcp1 ↻ ≫
Coq8a ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Frat1 ↻ ≫
Xrcc1 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Rabgef1 ↻ ≫
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Ifnar1 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Kxd1 ↻ ≫
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Rara ↻ ≫
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A630076J17Rik ↻ ≫
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Cep120 ↻ ≫
Clp1 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
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Mrpl44 ↻ ≫
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Ilrun ↻ ≫
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Vta1 ↻ ≫
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Mrpl34 ↻ ≫
Uvrag ↻ ≫
Snrpa ↻ ≫
BC024978 ↻ ≫
Myd88 ↻ ≫
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