ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for HDAC4

Query protein: HDAC4
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX2140208 | MM.1S
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
HDAC4's Target genes

◢ HDAC4: Average

◣ SRX2140208: MM.1S

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◢ SRX13466113: SK-UT-1

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◢ SRX6054277: SK-UT-1

◢ HDAC4: STRING
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MTRNR2L8 ↻ ≫
RGPD2 ↻ ≫
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FUT10 ↻ ≫
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MRPS18C ↻ ≫
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MDM2 ↻ ≫
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CCL5 ↻ ≫
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MNT ↻ ≫
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BOLA2 ↻ ≫
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PRR11 ↻ ≫
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DRAP1 ↻ ≫
C11orf68 ↻ ≫
COMMD2 ↻ ≫
USP3 ↻ ≫
MRPS23 ↻ ≫
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CDYL ↻ ≫
CDC20 ↻ ≫
USP30 ↻ ≫
PSMD4 ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
SMARCD2 ↻ ≫
FSD2 ↻ ≫
AURKAIP1 ↻ ≫
FMO4 ↻ ≫
TP63 ↻ ≫
BBX ↻ ≫
FOXK1 ↻ ≫
FAAP24 ↻ ≫
CEP89 ↻ ≫
CMSS1 ↻ ≫
TEPSIN ↻ ≫
NDUFAF8 ↻ ≫
HOOK1 ↻ ≫
AQR ↻ ≫
LSG1 ↻ ≫
RAD51AP2 ↻ ≫
C2orf42 ↻ ≫
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TPST1 ↻ ≫
RAD51AP1 ↻ ≫
C16orf72 ↻ ≫
C12orf4 ↻ ≫
WBP1L ↻ ≫
WAPL ↻ ≫
SELENOH ↻ ≫
NOTCH2NLC ↻ ≫
NOTCH2NLB ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
INSR ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
GBA ↻ ≫
KDSR ↻ ≫
H4C3 ↻ ≫
CRB1 ↻ ≫
TACO1 ↻ ≫
SPTLC3 ↻ ≫
KIF16B ↻ ≫
TIMM22 ↻ ≫
LRRC14B ↻ ≫
PRPF18 ↻ ≫
INTS1 ↻ ≫
SLC33A1 ↻ ≫
NR1H2 ↻ ≫
CCDC77 ↻ ≫
PWWP2A ↻ ≫
MPND ↻ ≫
DHX8 ↻ ≫
LUC7L2 ↻ ≫
GALK2 ↻ ≫
FMC1-LUC7L2 ↻ ≫
FMC1 ↻ ≫
COPS2 ↻ ≫
POLR3F ↻ ≫
DZANK1 ↻ ≫
ARHGEF1 ↻ ≫
STOML2 ↻ ≫
MFAP3L ↻ ≫
COPZ1 ↻ ≫
ZNF451 ↻ ≫
TYK2 ↻ ≫
RBM28 ↻ ≫
SCNM1 ↻ ≫
LYSMD1 ↻ ≫
ZNF609 ↻ ≫
TLR5 ↻ ≫
ZMYND8 ↻ ≫
RAP2A ↻ ≫
MYCBP2 ↻ ≫
EPRS1 ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
KBTBD4 ↻ ≫
DHX16 ↻ ≫
CLEC7A ↻ ≫
CHD6 ↻ ≫
RHOT2 ↻ ≫
PNISR ↻ ≫
GORAB ↻ ≫
KHSRP ↻ ≫
PPP6R1 ↻ ≫
RPL35A ↻ ≫
IQCG ↻ ≫
ZSWIM1 ↻ ≫
UNC93B1 ↻ ≫
RAB40B ↻ ≫
HAX1 ↻ ≫
ECT2 ↻ ≫
NUF2 ↻ ≫
COMMD1 ↻ ≫
CCT4 ↻ ≫
SLC9A1 ↻ ≫
KLHL20 ↻ ≫
DMAP1 ↻ ≫
ARNTL ↻ ≫
ACBD4 ↻ ≫
LTA4H ↻ ≫
TDRKH ↻ ≫
IFIT1 ↻ ≫
MGP ↻ ≫
SSR3 ↻ ≫
NLK ↻ ≫
TSC1 ↻ ≫
PSAP ↻ ≫
MTFR2 ↻ ≫
GFI1B ↻ ≫
TOMM40 ↻ ≫
TUT1 ↻ ≫
UTP3 ↻ ≫
ZNF668 ↻ ≫
ZNF646 ↻ ≫
SH3GL1 ↻ ≫
DAPK3 ↻ ≫
EVI5L ↻ ≫
NSMCE3 ↻ ≫
FAM207A ↻ ≫
TFB2M ↻ ≫
CYP2R1 ↻ ≫
CNST ↻ ≫
CCDC61 ↻ ≫
KIF22 ↻ ≫
ITGB1BP1 ↻ ≫
CPSF3 ↻ ≫
ZBTB5 ↻ ≫
YJU2 ↻ ≫
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PGP ↻ ≫
FLAD1 ↻ ≫
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RAB11A ↻ ≫
LOC101927572 ↻ ≫
GTF2H2C_2 ↻ ≫
GTF2H2C ↻ ≫
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TMEM218 ↻ ≫
GGCT ↻ ≫
PRR14 ↻ ≫
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KCNN3 ↻ ≫
KAT7 ↻ ≫
DNAJC14 ↻ ≫
CCDC167 ↻ ≫
PRRG2 ↻ ≫
NOSIP ↻ ≫
NAA35 ↻ ≫
ATP5MC2 ↻ ≫
OSBPL2 ↻ ≫
ADRM1 ↻ ≫
SNAP47 ↻ ≫
SACM1L ↻ ≫
JMJD4 ↻ ≫
FRYL ↻ ≫
FDXR ↻ ≫
DDI2 ↻ ≫
CDC23 ↻ ≫
NBEAL2 ↻ ≫
KCNH1 ↻ ≫
DDX1 ↻ ≫
CCNC ↻ ≫
RFX1 ↻ ≫
SMARCE1 ↻ ≫
ISOC2 ↻ ≫
GOLPH3L ↻ ≫
RPS27 ↻ ≫
NUCKS1 ↻ ≫
HSD17B4 ↻ ≫
SF3B6 ↻ ≫
FAM228B ↻ ≫
NCBP2AS2 ↻ ≫
NCBP2 ↻ ≫
MORC3 ↻ ≫
HARBI1 ↻ ≫
DCP1A ↻ ≫
ATG13 ↻ ≫
CCNL1 ↻ ≫
TLDC2 ↻ ≫
TAF3 ↻ ≫
BABAM1 ↻ ≫
AP2M1 ↻ ≫
PAFAH2 ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
UBE2T ↻ ≫
INTS4 ↻ ≫
CHD9 ↻ ≫
AK2 ↻ ≫
RPL27 ↻ ≫
GABPB2 ↻ ≫
ZNF519 ↻ ≫
TRAPPC6A ↻ ≫
MRPS17 ↻ ≫
MKNK2 ↻ ≫
BLOC1S3 ↻ ≫
ALG10B ↻ ≫
PRICKLE4 ↻ ≫
LRRC45 ↻ ≫
FRS3 ↻ ≫
FBXO11 ↻ ≫
CENPX ↻ ≫
ARL1 ↻ ≫
TNFRSF17 ↻ ≫
TLR4 ↻ ≫
TAB1 ↻ ≫
NPIPB2 ↻ ≫
MLLT1 ↻ ≫
GTF2H2 ↻ ≫
FLT3LG ↻ ≫
PSMD5 ↻ ≫
FAM72D ↻ ≫
FAM72C ↻ ≫
KRR1 ↻ ≫
TATDN3 ↻ ≫
NSL1 ↻ ≫
TSACC ↻ ≫
THADA ↻ ≫
STIL ↻ ≫
CCT3 ↻ ≫
RABEP1 ↻ ≫
PXMP4 ↻ ≫
FBXO40 ↻ ≫
EIF4A2 ↻ ≫
PPP1R37 ↻ ≫
PARP8 ↻ ≫
LY9 ↻ ≫
GOT1 ↻ ≫
DNM2 ↻ ≫
SLC39A3 ↻ ≫
RBSN ↻ ≫
P4HB ↻ ≫
NOTCH2 ↻ ≫
NOL6 ↻ ≫
TIPRL ↻ ≫
SOD1 ↻ ≫
PDE12 ↻ ≫
KNL1 ↻ ≫
TPD52L2 ↻ ≫
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UCHL5 ↻ ≫
RPL26 ↻ ≫
RO60 ↻ ≫
PRDM10 ↻ ≫
GPR89A ↻ ≫
SP2 ↻ ≫
GPR108 ↻ ≫
FBXO8 ↻ ≫
CEP44 ↻ ≫
AFF3 ↻ ≫
PMVK ↻ ≫
KAT6A ↻ ≫
ZSWIM4 ↻ ≫
WWOX ↻ ≫
TRMT2A ↻ ≫
TRAF3IP3 ↻ ≫
SMG6 ↻ ≫
RER1 ↻ ≫
RANBP1 ↻ ≫
PRMT5 ↻ ≫
PIK3C2A ↻ ≫
MORN1 ↻ ≫
BARHL1 ↻ ≫
SSBP2 ↻ ≫
STK17A ↻ ≫
LARP4 ↻ ≫
RUVBL1 ↻ ≫
KLHDC10 ↻ ≫
SLC35B1 ↻ ≫
TBC1D10B ↻ ≫
MYLPF ↻ ≫
RPL37 ↻ ≫
REEP6 ↻ ≫
PCSK4 ↻ ≫
EPS8 ↻ ≫
DNAJC24 ↻ ≫
DCDC1 ↻ ≫
CASP8AP2 ↻ ≫
ATF7IP ↻ ≫
TSSC4 ↻ ≫
LARS1 ↻ ≫
RFX5 ↻ ≫
MAP1LC3B2 ↻ ≫
PHF1 ↻ ≫
OPA3 ↻ ≫
HUS1 ↻ ≫
LOC645177 ↻ ≫
C12orf77 ↻ ≫
PSMD3 ↻ ≫
OAT ↻ ≫
NOTCH1 ↻ ≫
CCAR2 ↻ ≫
WDR24 ↻ ≫
NELFB ↻ ≫
ATP5MC1 ↻ ≫
TRUB2 ↻ ≫
LAX1 ↻ ≫
ETV5 ↻ ≫
COQ4 ↻ ≫
CDK5RAP3 ↻ ≫
ATG5 ↻ ≫
ACTR2 ↻ ≫
MRPL1 ↻ ≫
TMEM259 ↻ ≫
UFC1 ↻ ≫
DNAJC19 ↻ ≫
KDM4D ↻ ≫
CWC15 ↻ ≫
ZNF286A ↻ ≫
MTOR ↻ ≫
ZNF443 ↻ ≫
PM20D1 ↻ ≫
TMCO1 ↻ ≫
RGS1 ↻ ≫
NIP7 ↻ ≫
COG8 ↻ ≫
TNFRSF19 ↻ ≫
SNX16 ↻ ≫
ADAMTSL1 ↻ ≫
CLPB ↻ ≫
UNK ↻ ≫
FEM1A ↻ ≫
H4C11 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
BOD1 ↻ ≫
DDX49 ↻ ≫
COPE ↻ ≫
PHF12 ↻ ≫
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VPS50 ↻ ≫
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FBXL19 ↻ ≫
AP2S1 ↻ ≫
PHB ↻ ≫
SP1 ↻ ≫
TCEA2 ↻ ≫
RAB5B ↻ ≫
IFTAP ↻ ≫
CIC ↻ ≫
SUCLG1 ↻ ≫
H4C2 ↻ ≫
H2BC4 ↻ ≫
MMACHC ↻ ≫
TMEM115 ↻ ≫
DDX23 ↻ ≫
MAPKAPK5 ↻ ≫
SLC25A25 ↻ ≫
NAIF1 ↻ ≫
WDPCP ↻ ≫
MDH1 ↻ ≫
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ANKHD1 ↻ ≫
MRPL24 ↻ ≫
PAK1IP1 ↻ ≫
C6orf52 ↻ ≫
THRAP3 ↻ ≫
PES1 ↻ ≫
NEBL ↻ ≫
DFFA ↻ ≫
TBL1X ↻ ≫
PPP1R12B ↻ ≫
MRPL11 ↻ ≫
ING4 ↻ ≫
NCLN ↻ ≫
USP17L5 ↻ ≫
USP17L30 ↻ ≫
USP17L29 ↻ ≫
USP17L28 ↻ ≫
USP17L27 ↻ ≫
USP17L26 ↻ ≫
USP17L25 ↻ ≫
USP17L24 ↻ ≫
CALR3 ↻ ≫
C19orf44 ↻ ≫
PRCC ↻ ≫
GSPT1 ↻ ≫
BANP ↻ ≫
ZFYVE1 ↻ ≫
TSNAXIP1 ↻ ≫
RANBP10 ↻ ≫
VIPAS39 ↻ ≫
AHSA1 ↻ ≫
SMPD3 ↻ ≫
PEMT ↻ ≫
RPS7 ↻ ≫
TOM1L2 ↻ ≫
DRC3 ↻ ≫
FAP ↻ ≫
GALM ↻ ≫
RPS20 ↻ ≫
TSC2 ↻ ≫
NTHL1 ↻ ≫
OSBP ↻ ≫
TSN ↻ ≫
C16orf91 ↻ ≫
GTF2H4 ↻ ≫
LRRC29 ↻ ≫
ST3GAL2 ↻ ≫
PNKD ↻ ≫
AAMP ↻ ≫
PNPLA6 ↻ ≫
INTS9 ↻ ≫
HMBOX1 ↻ ≫
ZNF547 ↻ ≫
TRAPPC2B ↻ ≫
HNRNPC ↻ ≫
NUP205 ↻ ≫
ELOC ↻ ≫
CCDC90B ↻ ≫
RPS3 ↻ ≫
RPL32 ↻ ≫
SYMPK ↻ ≫
FOXA3 ↻ ≫
PPRC1 ↻ ≫
LRCH4 ↻ ≫
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INVS ↻ ≫
ERP44 ↻ ≫
UBQLN4 ↻ ≫
LAMTOR2 ↻ ≫
ZNF268 ↻ ≫
ZNF225 ↻ ≫
C19orf53 ↻ ≫
ORMDL3 ↻ ≫
SCAF1 ↻ ≫
BUB1B ↻ ≫
POLDIP3 ↻ ≫
CACTIN ↻ ≫
ZNF143 ↻ ≫
H2AC6 ↻ ≫
SUPV3L1 ↻ ≫
C1orf159 ↻ ≫
RANBP2 ↻ ≫
ZNF165 ↻ ≫
FASTKD1 ↻ ≫
PIN4 ↻ ≫
PSMD11 ↻ ≫
NUDCD1 ↻ ≫
SLC35E2B ↻ ≫
FAM168A ↻ ≫
ZNF17 ↻ ≫
CCDC146 ↻ ≫
H4C5 ↻ ≫
TBL3 ↻ ≫
TMEM94 ↻ ≫
NDC80 ↻ ≫
METTL4 ↻ ≫
DYNC1I2 ↻ ≫
ZNF687 ↻ ≫
ZNF383 ↻ ≫
GPR137 ↻ ≫
GATB ↻ ≫
SPSB3 ↻ ≫
NUBP2 ↻ ≫
UFD1 ↻ ≫
CDC45 ↻ ≫
OAZ3 ↻ ≫
ZNF335 ↻ ≫
SNX17 ↻ ≫
EIF2B4 ↻ ≫
NPRL2 ↻ ≫
CYB561D2 ↻ ≫
STT3A ↻ ≫
TFPT ↻ ≫
PRPF31 ↻ ≫
ZSCAN22 ↻ ≫
STAM ↻ ≫
VCPIP1 ↻ ≫
C8orf44-SGK3 ↻ ≫
G3BP1 ↻ ≫
UBAC1 ↻ ≫
SIRT2 ↻ ≫
SCRIB ↻ ≫
NFKBIB ↻ ≫
UFSP2 ↻ ≫
BMF ↻ ≫
SP5 ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
MICOS13 ↻ ≫
HSD11B1L ↻ ≫
CYCS ↻ ≫
TSNAX ↻ ≫
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GGA3 ↻ ≫
SART3 ↻ ≫
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CRTC2 ↻ ≫
TIMM21 ↻ ≫
FBXO15 ↻ ≫
COMMD9 ↻ ≫
NR6A1 ↻ ≫
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STIP1 ↻ ≫
RNASEH2A ↻ ≫
DDX39B ↻ ≫
NUP107 ↻ ≫
THOC6 ↻ ≫
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VTI1B ↻ ≫
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RPIA ↻ ≫
ZNF691 ↻ ≫
EHF ↻ ≫
LMAN2 ↻ ≫
CCDC174 ↻ ≫
ZNF417 ↻ ≫
MRPL53 ↻ ≫
WDR46 ↻ ≫
PFDN6 ↻ ≫
ZNF235 ↻ ≫
E2F4 ↻ ≫
ZNF444 ↻ ≫
DSTYK ↻ ≫
ACTR1A ↻ ≫
PIGL ↻ ≫
FARSB ↻ ≫
UBR2 ↻ ≫
DDX41 ↻ ≫
NUCB1 ↻ ≫
KBTBD6 ↻ ≫
CNIH4 ↻ ≫
PANK4 ↻ ≫
MED27 ↻ ≫
GOSR2 ↻ ≫
SPHK2 ↻ ≫
RPL18 ↻ ≫
TRDMT1 ↻ ≫
EXOSC5 ↻ ≫
BCKDHA ↻ ≫
ANAPC5 ↻ ≫
SUPT7L ↻ ≫
SLC4A1AP ↻ ≫
METTL3 ↻ ≫
EFTUD2 ↻ ≫
CCDC103 ↻ ≫
SRSF11 ↻ ≫
LRRC40 ↻ ≫
SLX4IP ↻ ≫
TMTC3 ↻ ≫
REXO1 ↻ ≫
CEP290 ↻ ≫
SEC11C ↻ ≫
PSMC5 ↻ ≫
FTSJ3 ↻ ≫
ISY1-RAB43 ↻ ≫
ISY1 ↻ ≫
VEZT ↻ ≫
FGD6 ↻ ≫
TTI2 ↻ ≫
HEXIM2 ↻ ≫
EIF3F ↻ ≫
NMT1 ↻ ≫
DCAKD ↻ ≫
LIN37 ↻ ≫
SMG8 ↻ ≫
MRPL21 ↻ ≫
IGHMBP2 ↻ ≫
NME1 ↻ ≫
TMEM242 ↻ ≫
C19orf48 ↻ ≫
ZSWIM3 ↻ ≫
ACOT8 ↻ ≫
PHB2 ↻ ≫
NUDT13 ↻ ≫
AHCYL2 ↻ ≫
NFIB ↻ ≫
HNRNPL ↻ ≫
CCP110 ↻ ≫
RNF121 ↻ ≫
LOC100133315 ↻ ≫
ATP5F1B ↻ ≫
ZNF337 ↻ ≫
ING3 ↻ ≫
COX7C ↻ ≫
RPGRIP1L ↻ ≫
FTO ↻ ≫
SLC8A1 ↻ ≫
PSMB6 ↻ ≫
CDK5RAP2 ↻ ≫
SEC61B ↻ ≫
SUGP1 ↻ ≫
MAU2 ↻ ≫
TCERG1 ↻ ≫
VWA5A ↻ ≫
GTF3C3 ↻ ≫
ZFPL1 ↻ ≫
CDCA5 ↻ ≫
ZNF576 ↻ ≫
IRGQ ↻ ≫
BUB3 ↻ ≫
KRT15 ↻ ≫
ZNF548 ↻ ≫
NEDD8-MDP1 ↻ ≫
NEDD8 ↻ ≫
IPO13 ↻ ≫
GMPR2 ↻ ≫
RPS27A ↻ ≫
H4C8 ↻ ≫
CLHC1 ↻ ≫
MRPL28 ↻ ≫
GSK3A ↻ ≫
CLN3 ↻ ≫
ATG4C ↻ ≫
RPS6KB2 ↻ ≫
ZMAT2 ↻ ≫
ZBTB45 ↻ ≫
MRPL30 ↻ ≫
MITD1 ↻ ≫
CAND1 ↻ ≫
NOC4L ↻ ≫
DDX51 ↻ ≫
SEL1L ↻ ≫
POLR2E ↻ ≫
C12orf43 ↻ ≫
NDUFAF5 ↻ ≫
ESF1 ↻ ≫
EMC4 ↻ ≫
TRAF7 ↻ ≫
ZC3H10 ↻ ≫
CTU1 ↻ ≫
CCDC124 ↻ ≫
KRT23 ↻ ≫
EXD2 ↻ ≫
CAPN15 ↻ ≫
CTDP1 ↻ ≫
RPL9 ↻ ≫
RBL1 ↻ ≫
LIAS ↻ ≫
STK36 ↻ ≫
RNF25 ↻ ≫
ZNF500 ↻ ≫
SEC13 ↻ ≫
RPL18A ↻ ≫
ZNF776 ↻ ≫
EXOC4 ↻ ≫
GSTO2 ↻ ≫
VPS25 ↻ ≫
SMARCAL1 ↻ ≫
PPP1R12C ↻ ≫
TRMO ↻ ≫
PABPN1 ↻ ≫
SRD5A1 ↻ ≫
NSUN2 ↻ ≫
GUF1 ↻ ≫
ZNF773 ↻ ≫
NOP16 ↻ ≫
HIGD2A ↻ ≫
DLGAP1 ↻ ≫
ZNF140 ↻ ≫
ZFYVE19 ↻ ≫
DNAJC17 ↻ ≫
TXNRD1 ↻ ≫
TMEM160 ↻ ≫
ATP5MG ↻ ≫
CIAO2A ↻ ≫
CD2BP2 ↻ ≫
SMAD3 ↻ ≫
CRADD ↻ ≫
MTRF1 ↻ ≫
STAM2 ↻ ≫
RCAN1 ↻ ≫
FBXW11 ↻ ≫
COPS7B ↻ ≫
PNN ↻ ≫
ZNF211 ↻ ≫
DYNC2I2 ↻ ≫
COPS7A ↻ ≫
ZCCHC4 ↻ ≫
SLC39A9 ↻ ≫
PCBP1 ↻ ≫
ERH ↻ ≫
SUFU ↻ ≫
PRORP ↻ ≫
PPP2R3C ↻ ≫
CENPA ↻ ≫
TBP ↻ ≫
PSMB1 ↻ ≫
H2AC19 ↻ ≫
H2AC18 ↻ ≫
GET3 ↻ ≫
FCF1 ↻ ≫
AREL1 ↻ ≫
STK25 ↻ ≫
SLC25A19 ↻ ≫
NDUFB3 ↻ ≫
FAM126B ↻ ≫
ABT1 ↻ ≫
RARB ↻ ≫
ZNF688 ↻ ≫
JOSD2 ↻ ≫
MAF1 ↻ ≫
DMAC1 ↻ ≫
ZNF628 ↻ ≫
SESN1 ↻ ≫
CEP57L1 ↻ ≫
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TM9SF4 ↻ ≫
RABAC1 ↻ ≫
SHPK ↻ ≫
CTNS ↻ ≫
NDUFB5 ↻ ≫
MRPL47 ↻ ≫
TOR1AIP1 ↻ ≫
HEMK1 ↻ ≫
GBF1 ↻ ≫
SF3B3 ↻ ≫
COG4 ↻ ≫
RPL14 ↻ ≫
VRK1 ↻ ≫
NR1H3 ↻ ≫
HSPA9 ↻ ≫
ACP2 ↻ ≫
SREK1IP1 ↻ ≫
CWC27 ↻ ≫
ZSCAN5A ↻ ≫
C1orf109 ↻ ≫
NVL ↻ ≫
TMEM63C ↻ ≫
BMERB1 ↻ ≫
UTP11 ↻ ≫
ATP6V1G1 ↻ ≫
TXNL4B ↻ ≫
THYN1 ↻ ≫
DHX38 ↻ ≫
ACAD8 ↻ ≫
PEX3 ↻ ≫
ALKBH3 ↻ ≫
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