ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX4887838 | ES cells
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

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◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◣ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

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◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

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◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

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◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX2375599: Liver

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◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

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◢ SRX5543269: Liver

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◢ SRX5543271: Liver

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◢ SRX997771: Liver

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◢ SRX997773: Liver

◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Slc39a14 ↻ ≫
Porcn ↻ ≫
Cdx1 ↻ ≫
Ccdc194 ↻ ≫
Etv5 ↻ ≫
Slc7a3 ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Gadd45g ↻ ≫
Cdc42ep4 ↻ ≫
Mapk4 ↻ ≫
Hdx ↻ ≫
Wnt8a ↻ ≫
Rhpn2 ↻ ≫
Tiparp ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Pkia ↻ ≫
Dhx32 ↻ ≫
Wnt5b ↻ ≫
Tmcc1 ↻ ≫
Slc25a1 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Zfp658 ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Dido1 ↻ ≫
Gid8 ↻ ≫
Colgalt1 ↻ ≫
Gpc4 ↻ ≫
Pccb ↻ ≫
Spry4 ↻ ≫
Il33 ↻ ≫
Thbs2 ↻ ≫
Rgs12 ↻ ≫
Dppa2 ↻ ≫
Lpar1 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Slc15a1 ↻ ≫
Trim36 ↻ ≫
Oas1g ↻ ≫
1810020O05Rik ↻ ≫
Lpp ↻ ≫
Gprin1 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Etv1 ↻ ≫
Gm1966 ↻ ≫
Robo4 ↻ ≫
Cacng2 ↻ ≫
Nlrc4 ↻ ≫
Cnpy1 ↻ ≫
Mobp ↻ ≫
Upp1 ↻ ≫
Rbm14 ↻ ≫
Gm21992 ↻ ≫
Shc4 ↻ ≫
Gjc1 ↻ ≫
Lrrn2 ↻ ≫
Fubp3 ↻ ≫
Slc25a53 ↻ ≫
Ccl20 ↻ ≫
Pla2g4e ↻ ≫
Zfp719 ↻ ≫
Med12 ↻ ≫
Cst3 ↻ ≫
Eif4e1b ↻ ≫
Gm14393 ↻ ≫
Sgk3 ↻ ≫
Usp48 ↻ ≫
Stat4 ↻ ≫
Fundc1 ↻ ≫
Zkscan17 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Foxh1 ↻ ≫
Armcx1 ↻ ≫
Lsm14b ↻ ≫
Tfe3 ↻ ≫
Rif1 ↻ ≫
Itga9 ↻ ≫
Muc13 ↻ ≫
Cxcl11 ↻ ≫
Car14 ↻ ≫
Cd38 ↻ ≫
Tex264 ↻ ≫
Liph ↻ ≫
Lrmp ↻ ≫
Calm5 ↻ ≫
Stk38 ↻ ≫
Scmh1 ↻ ≫
Vrtn ↻ ≫
Rtbdn ↻ ≫
Pde7b ↻ ≫
Zyg11a ↻ ≫
Rlim ↻ ≫
Tfpi ↻ ≫
Rbm41 ↻ ≫
Ccdc60 ↻ ≫
Sms ↻ ≫
Rbbp7 ↻ ≫
Rfx4 ↻ ≫
Slc12a4 ↻ ≫
Gbp4 ↻ ≫
Hmgxb4 ↻ ≫
B4gat1 ↻ ≫
Slc12a9 ↻ ≫
Rpe ↻ ≫
Adgra2 ↻ ≫
Golga7b ↻ ≫
Scd1 ↻ ≫
Lrriq4 ↻ ≫
Lrrc34 ↻ ≫
Ppp2r2b ↻ ≫
Prex1 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Spred1 ↻ ≫
Slc43a1 ↻ ≫
Vstm2l ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Etv4 ↻ ≫
Cpsf4l ↻ ≫
Scrt1 ↻ ≫
Tmem171 ↻ ≫
Bcap31 ↻ ≫
Abcd1 ↻ ≫
Rassf1 ↻ ≫
Erdr1 ↻ ≫
Krt23 ↻ ≫
Mcts1 ↻ ≫
Shf ↻ ≫
Wdfy1 ↻ ≫
Slc7a1 ↻ ≫
Amt ↻ ≫
Slc16a9 ↻ ≫
Ptprz1 ↻ ≫
Defb1 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Prps1 ↻ ≫
Smad7 ↻ ≫
Ifitm1 ↻ ≫
Ly96 ↻ ≫
Abcg2 ↻ ≫
Nudt1 ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Map2k6 ↻ ≫
Terf1 ↻ ≫
Rpusd2 ↻ ≫
Scn1a ↻ ≫
Ntmt1 ↻ ≫
Rac1 ↻ ≫
Plcxd1 ↻ ≫
Midn ↻ ≫
Fbxo27 ↻ ≫
Gipc2 ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
1700008O03Rik ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Acp6 ↻ ≫
Tex50 ↻ ≫
Bnip1 ↻ ≫
Snx10 ↻ ≫
Praf2 ↻ ≫
Il1rapl1 ↻ ≫
Pmpcb ↻ ≫
Atoh1 ↻ ≫
Elovl6 ↻ ≫
Phldb2 ↻ ≫
Klhl34 ↻ ≫
Iqsec3 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Msl2 ↻ ≫
Susd6 ↻ ≫
Trpm1 ↻ ≫
Chd7 ↻ ≫
Lypd11 ↻ ≫
Akap11 ↻ ≫
Lhx1 ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Eif2b5 ↻ ≫
Trp53bp1 ↻ ≫
Serinc5 ↻ ≫
Bcat1 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Celsr3 ↻ ≫
Mob3c ↻ ≫
Plpp1 ↻ ≫
Cdkl4 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Arhgef39 ↻ ≫
Gjb3 ↻ ≫
Tpcn2 ↻ ≫
Smarca5 ↻ ≫
Mcf2 ↻ ≫
Mib2 ↻ ≫
Mylpf ↻ ≫
Mb21d2 ↻ ≫
Ptp4a3 ↻ ≫
Prmt6 ↻ ≫
Rab34 ↻ ≫
Xkr7 ↻ ≫
Dlgap3 ↻ ≫
Slc9a3r1 ↻ ≫
Tjp2 ↻ ≫
Arl15 ↻ ≫
Rnf182 ↻ ≫
Hivep3 ↻ ≫
Pipox ↻ ≫
Sh2d4b ↻ ≫
Usp9x ↻ ≫
Tmem220 ↻ ≫
Mymx ↻ ≫
1700102P08Rik ↻ ≫
Znrf1 ↻ ≫
L3mbtl2 ↻ ≫
Enpp4 ↻ ≫
H2bc22 ↻ ≫
H2ac22 ↻ ≫
Klhl4 ↻ ≫
Zfp609 ↻ ≫
Zcrb1 ↻ ≫
Pphln1 ↻ ≫
Pgap6 ↻ ≫
Ido1 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Hmces ↻ ≫
Ift46 ↻ ≫
Impdh2 ↻ ≫
Clk1 ↻ ≫
Cped1 ↻ ≫
Fbxo15 ↻ ≫
Slc7a9 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Cysltr1 ↻ ≫
Tcea3 ↻ ≫
Tle6 ↻ ≫
Ubr5 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Wfikkn1 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Ly6g6e ↻ ≫
Zfp33b ↻ ≫
Fndc11 ↻ ≫
Srms ↻ ≫
Kcnj8 ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Lrrn4 ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Vgf ↻ ≫
Noct ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Fam118a ↻ ≫
Sema5b ↻ ≫
Cyb5r4 ↻ ≫
Bmp4 ↻ ≫
Wdr82 ↻ ≫
Myo10 ↻ ≫
Mreg ↻ ≫
Dennd2c ↻ ≫
1700019D03Rik ↻ ≫
Pou5f1 ↻ ≫
Nup153 ↻ ≫
Triml2 ↻ ≫
1190007I07Rik ↻ ≫
Klhdc7a ↻ ≫
Dusp4 ↻ ≫
Dnah1 ↻ ≫
Fblim1 ↻ ≫
Mad1l1 ↻ ≫
Tulp2 ↻ ≫
Ino80c ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Amd2 ↻ ≫
Amd1 ↻ ≫
Tgm3 ↻ ≫
Stmn1 ↻ ≫
Phc2 ↻ ≫
Glra1 ↻ ≫
Cluh ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
Syncrip ↻ ≫
Lactb2 ↻ ≫
Pde7a ↻ ≫
Otx2 ↻ ≫
Zfp819 ↻ ≫
Slc12a8 ↻ ≫
Fam169b ↻ ≫
Slc6a7 ↻ ≫
Flot1 ↻ ≫
Soga3 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Gnpnat1 ↻ ≫
Cast ↻ ≫
Spp1 ↻ ≫
Mroh6 ↻ ≫
Smc6 ↻ ≫
Gen1 ↻ ≫
Pcdhgc4 ↻ ≫
Trim66 ↻ ≫
Rnf145 ↻ ≫
Morf4l2 ↻ ≫
Runx1t1 ↻ ≫
Prrt3 ↻ ≫
Cbx1 ↻ ≫
Adgrg6 ↻ ≫
Mllt6 ↻ ≫
Icam1 ↻ ≫
Tulp4 ↻ ≫
Sulf1 ↻ ≫
Tspan9 ↻ ≫
Gpx1 ↻ ≫
Dennd6a ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Lrpap1 ↻ ≫
Pmvk ↻ ≫
Ryr2 ↻ ≫
Csnk1a1 ↻ ≫
Pgk1 ↻ ≫
Rarres1 ↻ ≫
Hic2 ↻ ≫
Qars ↻ ≫
Sbk1 ↻ ≫
Lcor ↻ ≫
Slc12a2 ↻ ≫
Dmc1 ↻ ≫
Tango2 ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Stk38l ↻ ≫
Mkrn1 ↻ ≫
Neurog1 ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Dhcr7 ↻ ≫
Gm13275 ↻ ≫
Nadsyn1 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Wsb2 ↻ ≫
Barhl1 ↻ ≫
Hax1 ↻ ≫
Fmr1nb ↻ ≫
Spint1 ↻ ≫
Zfp608 ↻ ≫
Gm11563 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Nrd1 ↻ ≫
C330007P06Rik ↻ ≫
Slc27a3 ↻ ≫
Pkd2 ↻ ≫
Rasgef1a ↻ ≫
Ube2d2a ↻ ≫
Ccdc28b ↻ ≫
Olfr884 ↻ ≫
Lamb2 ↻ ≫
Fam189a1 ↻ ≫
Rep15 ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Uba2 ↻ ≫
Zfp977 ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
Tdrd7 ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Oplah ↻ ≫
Wdr45 ↻ ≫
Tbrg1 ↻ ≫
Letmd1 ↻ ≫
Gm1070 ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Fam111a ↻ ≫
Sst ↻ ≫
Cdh10 ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Rnf125 ↻ ≫
Epc1 ↻ ≫
Sox12 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Pglyrp1 ↻ ≫
Igdcc3 ↻ ≫
Slc31a2 ↻ ≫
Ywhaz ↻ ≫
Rnasel ↻ ≫
Adap1 ↻ ≫
Emilin2 ↻ ≫
Zfp182 ↻ ≫
Trim6 ↻ ≫
Fbxw10 ↻ ≫
Nrsn2 ↻ ≫
Set ↻ ≫
Cecr2 ↻ ≫
Serpina3i ↻ ≫
Laptm4b ↻ ≫
Tvp23a ↻ ≫
Tg ↻ ≫
Snap25 ↻ ≫
Cox17 ↻ ≫
Top3a ↻ ≫
Smcr8 ↻ ≫
2410141K09Rik ↻ ≫
Slc23a2 ↻ ≫
Sft2d1 ↻ ≫
Nqo2 ↻ ≫
Ndrg4 ↻ ≫
Fbxl3 ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Cep112 ↻ ≫
Tigd2 ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
Prdm14 ↻ ≫
Kdm3a ↻ ≫
Vegfc ↻ ≫
Anapc4 ↻ ≫
Ccni ↻ ≫
2010109A12Rik ↻ ≫
H2-L ↻ ≫
H2-D1 ↻ ≫
Rps23rg1 ↻ ≫
Fam168a ↻ ≫
Cd63 ↻ ≫
Mpc1 ↻ ≫
Usp27x ↻ ≫
Rasgrp2 ↻ ≫
Emd ↻ ≫
Gpx8 ↻ ≫
Zp3 ↻ ≫
Fam162a ↻ ≫
Ccdc58 ↻ ≫
Mrpl37 ↻ ≫
Cyb5rl ↻ ≫
Nid2 ↻ ≫
Gdi1 ↻ ≫
Mdk ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Slc35f2 ↻ ≫
Dctn2 ↻ ≫
4921509C19Rik ↻ ≫
N4bp2 ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
B230307C23Rik ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Patj ↻ ≫
Syt11 ↻ ≫
Dhrs3 ↻ ≫
Phyhd1 ↻ ≫
Sp5 ↻ ≫
Hspb1 ↻ ≫
Zfp87 ↻ ≫
Zfp27 ↻ ≫
Ntn4 ↻ ≫
Chgb ↻ ≫
Bmpr1b ↻ ≫
Polm ↻ ≫
Trmt44 ↻ ≫
Spry2 ↻ ≫
Frrs1 ↻ ≫
Akt2 ↻ ≫
Nras ↻ ≫
Kat6a ↻ ≫
Serpinb6c ↻ ≫
Mrps15 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Ripk3 ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Thoc2 ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Tmem131l ↻ ≫
Gpkow ↻ ≫
Donson ↻ ≫
Notch4 ↻ ≫
Tbc1d9 ↻ ≫
Fbp2 ↻ ≫
Trap1a ↻ ≫
Cxcr3 ↻ ≫
Zfp57 ↻ ≫
Palm3 ↻ ≫
Myadml2 ↻ ≫
Zfp948 ↻ ≫
Dennd10 ↻ ≫
Nfu1 ↻ ≫
Dusp5 ↻ ≫
Serpinh1 ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
Spsb4 ↻ ≫
Syngr1 ↻ ≫
Dhrs13 ↻ ≫
Lcorl ↻ ≫
Pip4p2 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Msh6 ↻ ≫
Frzb ↻ ≫
Tada1 ↻ ≫
Itgb6 ↻ ≫
Lrrtm3 ↻ ≫
Mageb16 ↻ ≫
Stk40 ↻ ≫
Shc1 ↻ ≫
Cks1b ↻ ≫
Habp4 ↻ ≫
Nhsl1 ↻ ≫
Pvr ↻ ≫
Wbp11 ↻ ≫
Micos10 ↻ ≫
Mri1 ↻ ≫
Efcab2 ↻ ≫
Ccdc71 ↻ ≫
Klhdc8b ↻ ≫
Nucks1 ↻ ≫
Smc1a ↻ ≫
Ribc1 ↻ ≫
BC028528 ↻ ≫
Tafa3 ↻ ≫
1700001P01Rik ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Tbc1d15 ↻ ≫
Sirt3 ↻ ≫
Psmd13 ↻ ≫
Slc39a4 ↻ ≫
Ndufaf3 ↻ ≫
Myrf ↻ ≫
Fam81a ↻ ≫
Birc6 ↻ ≫
Sntb2 ↻ ≫
Cryba4 ↻ ≫
Trim71 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Klf7 ↻ ≫
Alpk1 ↻ ≫
Ptpn9 ↻ ≫
Msh2 ↻ ≫
Sh3kbp1 ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Mrps33 ↻ ≫
Dock7 ↻ ≫
Rdx ↻ ≫
Fzd2 ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Dusp9 ↻ ≫
BC003965 ↻ ≫
Asb16 ↻ ≫
Lmntd1 ↻ ≫
Slc25a3 ↻ ≫
Grk3 ↻ ≫
Abcb7 ↻ ≫
Il17rd ↻ ≫
Kank1 ↻ ≫
Mob4 ↻ ≫
Zmynd12 ↻ ≫
Ppcs ↻ ≫
Bmp8a ↻ ≫
Gtf2i ↻ ≫
Nanog ↻ ≫
Ccdc158 ↻ ≫
Pik3ca ↻ ≫
Cilp2 ↻ ≫
Dppa4 ↻ ≫
Ptpn6 ↻ ≫
Tbc1d5 ↻ ≫
Insyn2b ↻ ≫
Glra2 ↻ ≫
Slc16a13 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Cpeb3 ↻ ≫
Naa50 ↻ ≫
Cyba ↻ ≫
Atp6v1a ↻ ≫
Nos1ap ↻ ≫
Pdlim5 ↻ ≫
Scn2b ↻ ≫
Gpr1 ↻ ≫
Pstpip1 ↻ ≫
Nppb ↻ ≫
Dppa5a ↻ ≫
Aasdh ↻ ≫
Cyb561 ↻ ≫
Gm527 ↻ ≫
Dusp10 ↻ ≫
1700056E22Rik ↻ ≫
Kiz ↻ ≫
Gsta4 ↻ ≫
Spen ↻ ≫
Dtd1 ↻ ≫
Cabcoco1 ↻ ≫
Afap1l1 ↻ ≫
Timm17b ↻ ≫
Pqbp1 ↻ ≫
4833439L19Rik ↻ ≫
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